Determination of Bean Common Mosaik Virus in Bean Growing Areas of Burdur Province by Serological and Molecular Methods

Yıl 2014, Cilt: 1 Sayı: 2, 289 - 294, 26.07.2014

Handan Çulal Kılıç Nejla Yardımcı

Öz

The aim of this study was to determine the presence of Bean common mosaic virus; BCMV of bean plants grown in Burdur province. Throughout surveys, a total of 102 leaf samples was collected from plants showing disease symptoms. By employing Double Antibody Sandwich Enzyme Linked Immunosorbent Assay (DAS-ELISA) and Immunocapture Reverse Transcriptase-Polimerase Chain Reaction (IC-RT-PCR) methods, Bean common mosaic virus was identified. Based on research results, BCMV have been found in 24 samples (23.52 %) and all of the 24 infected samples were detected IC-RT-PCR methods. Besides as a results of DAS-ELISA tests it was observed that 18 samples out of 102 were infected with BCMV. IC-RT-PCR was carried out by using spesific primer which amplified a 850 bp fragment of coat protein of BCMV in samples. Thus, BCMV product of expected size in leaf samples were observed.

Anahtar Kelimeler

Burdur, Bean, BCMV, DAS-ELISA, IC-RT-PCR

Burdur İli Fasulye Üretim Alanlarında Fasulye Adi Mozayik Virüsü’nün Serolojik ve Moleküler Yöntemlerle Belirlenmesi

Öz

Bu çalışma, Burdur ili fasulye yetiştiriciliği yapılan alanlarda Fasulye adi mozayik virüsü (Bean common mosaic virüs: BCMV)’ünün belirlenmesi amacıyla gerçekleştirilmiştir. Sürvey çalışmalarında virüs simptomu gösteren bitkilerden 102 yaprak örneği alınmıştır. Örneklere Double Antibody Sandwich Enzyme Linked Immunosorbent Assay (DAS-ELISA) ve Immunocapture Reverse Transcriptase-Polimerase Chain Reaction (IC-RT-PCR) testleri uygulanarak Bean common mosaic virüsü (BCMV) tanılanmıştır. Yürütülen çalışmalar sonucunda toplam 24 yaprak örneğinde (% 23.52) BCMV belirlenmiştir. IC-RT-PCR yöntemi ile enfekteli olan bu 24 örneğin tamamı, DAS-ELISA yöntemi ile ise 18’i saptanmıştır. IC-RT-PCR yönteminde spesifik primerler ile kılıf protein geninin yaklaşık 850 bp’lik bir kısmı amplifiye edilmiş ve BCMV’ne özgü beklenen seviyede bant elde edilmiştir.

Anahtar Kelimeler

Burdur, fasulye, BCMV, DAS-ELISA, IC-RT-PCR

Kaynakça

• Abtahi, F.S., Hbibi, M.K., Motlagh, M.K., 2009. Some biological and molecular characterization of Bean common mosaic necrosis virus isolated from soybean in Tehran Province, Iran. World Academy of Science, Engineering and Technology, 49.
• Açıkgöz, S., 1984. Erzincan ve Erzurum yörelerinde Phaseolus vulgaris üzerinde virüslerin tanılanması, yayılışları ve zararları üzerinde araştırmalar. Atatürk Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Doktora Tezi, Erzurum.
• Anonim, 2011., TUİK. Bitkisel üretim istatistikleri. Internet Sitesi. http://tuikrapor.tuik.gov.tr/reports. (Erişim tarihi: 17.10. 2013).
• Anonim, 20 Internet Sitesi. http://www.baka.org.tr/ekonomi-S80.html. (Erişim tarihi: 14.09.2012).
• Arlı-Sökmen, M., Deligöz, I., Kutluk-Yılmaz, N.D., 20 Türkiye’de Bean common mosaic virus (BCMV) ve Bean common mosaic necrosis virus izolatlarının streyn düzeyinde ayrımı ve BCMV’nin yeni nekrotik izolatlarının belirlenmesi. Türkiye IV. Bitki Koruma Kongresi, 28-30 Haziran, Kahramanmaraş, s. 54 Bhadramurthy, V., Bhat A.I., 2009. Biological and molecular characterization of Bean common mosaic virus associated with vanilla in India. Indian Journal of Virology, 20(2): 70-77.
• Bozoğlu, H., 1995. Kuru fasulyede bazı tarımsal özelliklerin genotip X çevre interaksiyonu ve kalıtım derecelerinin belirlenmesi üzerine bir araştırma. 19 Mayıs Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Doktora Tezi, Samsun 99s.
• Choi, S.K., Choi, J.K., Park, W.M., Ryu, K.H., 1999. RT-PCR detection and identification of three species of cucumoviruses with a genusspecific single pair of primers. Journal of Virological Methods, 83: 67-73.
• Clark, M.F., Adams, A.N., 1977. Characteristic of the microplate method of enzyme linked immunosorbent assay for the detection of plant viruses. Journal of General Virology, 34: 475-483.
• Çulal-Kılıç, H., Yardımcı, N., 2012. Burdur Çine ovası Fasulye alanlarında hıyar mozayik virüsü. Mehmet Akif Ersoy Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 3(2): 12-15.
• Fidan, Ü., Yorgancı, Ü., 1990. Investigation on the detection and seed transmission of the virus diseases occuring on the pulse crops in Aegean Region. Seed transmission of virus diseases by grower seeds and seeds of artificial infected pulse crops. Journal of Turkish Phytopathology, 19 (1): 1-6.
• Ghorbani, S.G.M., Shahraeena, N., Elahinia, S.A., 20 Distribution and impact of virus associated diseases of common bean (Phaseolus vulgaris L.) in northern Iran. Archives of Phytopathology and Plant Protection, 43(12): 1183–1189
• Gümüş, M., Erkan, S., Yorgancı, Ü., Duman, I., 200 Bazı sebzelerin tohumlarında bulunan viral etmenlerin saptanması üzerine araştırmalar. Türkiye IX. Fitopatoloji Kongresi, 3-8 Eylül, Tekirdağ, s. 190-197. Güzel, Ö., Arlı-Sökmen, M., 2003. Determination of some viruses infecting common bean (Phaseoulus vulgaris L.) and their incidences in seed lots in Samsun Province. Journal of Turkish Phytopathology, 32 ( 2): 99-106.
• Hall, R., 1991. Compendium of bean diseases. St Paul (MN): APS Press Publishers, 102p.
• Kumar, C.A., Khetarpal, R.K., Parakh, D.B., Singh, S., Nath, R., 1994. Check list on seed transmitted viruses: Leguminous hosts. National Bureau of Plant Genetic Resources, New Delhi.
• Kutluk-Yılmaz, N.D., Gümüş, M., Erkan, S., 2002. Tokat ilinde fasulye tohumlarındaki viral etmenlerin saptanması üzerinde araştırmalar. Ege Üniversitesi, Ziraat Fakültesi Dergisi, 38 (3): 49-55.
• Loebenstein, G., Thottappilly, G., 2004. Virus and virus-like diseases of major crops in developing countries. Dordrecht: Kluwer Academic Publishers, 840 p.
• Makkouk, K.M., Azzam, O.I., 1986. Detection of broad bean stain virus in lentil seed groups. Lens Newsletter, 13(2): 37–38.
• Matthews, R.E.F., 1991. Plant Virology, 3. San Diego, Academic, 835p.
• Naghavi, A., Habibi, M.K., Firouzabadi, F.N., 2008. Detection and identification of some soybean viral mosaic viruses, using molecular techniques in Lorestan Province, Southwest of Iran. Asian Journal of Plant Sciences, 7 (6): 557-562.
• Nyvall, R.F., 1989. Field Crop Diseases Handbook. New York: Van Nostrand Reinhold. 791.
• Petrovic, D., Maja, I., Zorica, N., Milka, V., Mirjana, V., Mirjana, M., Ksenija, T.A., 2010. Occurrence and Distribution of viruses infecting the bean in Serbia. Archives Biological Science, 62 (3): 595-601.
• Shahraeen, N., Ghotbi, T., Dezaji, A., Sahandi, A., 200 A survey of viruses affecting French bean (Phaseolus vulgaris) in Iran includes a first report of Southern bean mosaic virus and Bean pod mottle virus. Plant Disease, 80: 1012.
• Şehirali, S., 1988. Yemeklik Dane Baklagiller, Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Yayınları, No: 1089. Ders Kitabı, Ankara, 314s.