SSR analysis on some susceptible and resistant wheat varieties and lines against to stripe rust

Yıl 2009, Cilt: 46 Sayı: 1, 1 - 8, 01.03.2009

M. Alp Furan Süer Yüce

Öz

Anahtar Kelimeler

-

Buğdayda Sarı Pasa Dayanıklı ve Duyarlı Bazı Çeşit ve Hatların SSR Analizleri

Öz

B u çalışmada amaç, sarı pasa dayanıklı ve duyarlı bazı ekmeklik buğday genotipleri arasında pasa dayanıklılık açısından DNA düzeyinde SSR markörleri yardımıyla genetik analizlerin incelenmesidir. Sarı pasa dayanıklı ve duyarlı olan bu genotiplerin arasındaki genetik ilişki SSR (Simple Sequence Repeat) markörlerinin kullanılması ile incelenerek belirlenmeye çalışılmıştır. Araştırmada sarı pasa duyarlı yerli çeşit ile dayanıklılık geni barındıran yakın izogenik test hattı melezlenmiş, ebeveynler ile bunların F1 ve F2 dölleri üzerinde SSR moleküler markörleri kullanılarak genetik analizleri yapılmıştır. Çalışmanın SSR analizleri forward ve reverse olmak üzere 5 SSR primeri kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Yapılan moleküler markör analizi sonucunda sarı pasa duyarlı yerli çeşit ile tek gen dayanıklı hat arasındaki genetik benzerlik ve farklılıklar moleküler düzeyde ortaya konmuştur. Ayrıca bu çalışmayla moleküler markör kullanımının dayanıklılık ıslahındaki önemi ve gerekliliği birkez daha vurgulanmıştır

Anahtar Kelimeler

-

Kaynakça

• Bariana H.S., 2001, Marker-Assisted selection for rust resistance in wheat in Australia: Meeting the challenge of yellow rust in cereal crops: Proceedings of the first regional conference on yellow rust in the central and west Asia and North Africa region, 8-14 may , Karaj, Iran.
• Chelkowski, J., Golka, L. and Stepien, L., 2003, Application of STS markers for leaf rust resistance genes in near- isogenic lines of spring wheat cv. thatcher, J. Appl. Genet. 44(3):323-338.
• Demir, İ., Yüce, S., Bilgen, G., Tanyolaç, B. ve Akçalı Can, R., 1999, Arpa, buğday ve mısır çeşitleri ve biber hatlarının RAPD markörleri ile tanımlanması üzerine bir araştırma, E.Ü. Araştırma Fonu Projesi, Proje No:98-ZRF/018/1, E.Ü.Z.F. Tarla Bitkileri Bölümü, Bornova/İzmir, 29s
• Doyle J.J. and Doyle J.L., 1987, A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissues, Phytochemical Bulletin, 19(1):11-15.
• Fahima, T., Röder, M.S., Grama A. and Nevo, E., 1998, Microsatellite DNA Polymorphism Divergence in Triticum dicoccoides Accessions Highly Resistant to Yellow Rust. Theor. Appl. Genet., 96: 187-195.
• Gold, J., Harder, D., Townley-Smith, F., Aung T. and Procunier, J., 1999, Development of a Molecular Marker for Rust Resistance Genes Sr39 and Lr35 in Wheat Breeding Lines, EJB Electronic Joırnal of Biotechnology Vol:2, No:1, Issue of April 15.
• Gupta, R.B., Paul, J.G., Cornish, G.B., Palmer, G.A., Bekes, F., and Rathjen, A.J., 1994, Allelic variation at glutenin subunit and gliadin loci, Glu-1, Glu-3 and Gli-1, of common wheats. I. Its additive and interaction effects on dough propertiesb J. Cereal Sci. 19:9-17.
• Gupta, P. K., Balyan, H. S., Edwards, K. J., Isaac, P., Korzun, V., Röder, M., Gautier, M.-F., Joudrier, P., Schlatter, A. R., Dubcovsky, J., De la Pena, R. C., Khairallah, M., Penner, G., Hayden, M. J., Sharp, P., Keller, B., Wang, R. C. C., Hardouin, J. P., Jack, P. and Leroy, P., 2002, Genetic mapping of 66 microsatellite (SSR) loci in bread wheat, Theor. Appl. Genet. 105:413-422.
• Gupta, P., Varshney, R., Sharma, P. and Ramesh, B., 1999, Molecular markersand their applications in wheat breeding, Plant Breed. 118: 369-390.
• Roy, J.K. Bandopadhyay, R., Rustgi, S., Balyan, H.S. and Gupta, P.K. 1991. Association analysis of agronomically important traits using SSR, SAMPL and AFLP markers in bread wheat.Department of Plant Pathology, University of Minnesota, 495 Borlaug Hall, 1991 Upper Buford Circle, St. Paul, MN 55108, USA
• Korzun, V., 2002, Use of moleculer markers in cereal breeding, Cellular &Molecular Biology Letters 7:811-820.
• Ma, J., R. Zhou, Y. Dong, L. Wang, X. Wang and J. Jia, 2001, MolecularMapping and Detection of the Yellow Rust Resistance Gene Yr26 in Wheat Transferred from Triticum turgidum L. Using Microsatellite Markers, Euphytica 120: 219–226, 2001.
• Mohan, M., Nair, S., Bhagwat, A., Krishna, T. G., Yano, M., Bhatia, C. R. and Sasaki, T., 1997, Genome mapping, moleculer markers and marker-assisted selection in crop plants, Molecular Breeding 3:87-103.
• Nei, M., and Li, W.H., 1979, Mathematical model for studying variation in terms of restriction endonucleases. Proc. Nat. Acad. Sci. 76:5269-5273.
• Rohlf, F.J., 1998, NTSYS-pc: Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System, Version 2.0, User's Guide. New York: Exeter Software.
• Röder, M. S., Korzun, V., Gill, B. S. and Ganal, M. W., 1998a, The physical mapping of microsatellites markers in wheat, Genome 41:278-283.
• Röder, M.S., Korzun,V., Wendehake, K., Plaschke, J., Tixier, M-H., Leroy, P., and Ganal, M.V., 1998b. A microsatellite map of wheat. Genetics Society of America 149: 2007-2023 August
• Staub, J.E. and Serquen, F.C., 1996, Genetic markers, map construction, and their application in plant breeding, Hort Science, 31(5):729-740.
• Xia, X.C., Li, Z.F., Li, G.Q., He, Z.H. and Singh, R.P., 2007, Stripe Rust Resistance in Chinese Bread Wheat Cultivars and Lines, Wheat Production in Stressed Environments, 77–82.
• Xu, X.,Bai, G., Carver, B. F., Shaner, G. E. and Hunger, R. M., 2005, Molecular characterization of slow leaf-rusting resistance in wheat, Crop Sci. 45:758–765.
• Yıldırım, A. ve Kandemir, N., 2001, Genetik markörler ve analiz metodları, 334-363, Bitki Bitoteknolojisi II-Genetik Mühendisliği ve Uygulamaları, S.Özcan, E.Gürel ve M.Babaoğlu (Derl.), Selçuk Üniversitesi Yayınları, Konya, 456s.
• URL1 http://www.cdl.umn.edu/res_gene/wstr_loc.html Wheat Stripe Rust Resistance Genes: Source, Genome Location, Low Infection Type and Tester Lines. 2001, Euphytica 120:219-226.