Year 2017, Volume 38, Issue 3, Pages 525 - 534 2017-09-30

Antikanser İlaç Olan Epirubicin’in DNA ile Etkileşiminin DNA Biyosensörleri ile Elektrokimyasal Tayini
Electrochemical Determination of Interaction between Anticancer Drug Epirubicin and DNA by DNA Biosensors

Adil ELİK [1] , Gültekin GÖKÇE [2] , Ebru BOSTANCI [3] , Derya KIZILOLUK [4]

237 597

Anti kanser ilaçların DNA ile etkileşimlerinin biyosensörler ile tespit edilmesine yönelik çalışmalar son yıllarda önem kazanmıştır. Çalışmamızda antikanser ilaç olan Epirubicin’in DNA ile etkileşmesi elektrokimyasal yöntemlerle; kalem grafit elektrot (PGE) kullanılarak incelendi. Epirubicin’in Calph Thymus’dan (ct) izole edilmiş tek sarmal ct-DNA (ct-ssDNA) ve çift sarmal ct-DNA (ct-dsDNA) ile elektrot yüzeyinde veya çözelti ortamında etkileşimleri ct-DNA’larda bulunan guanin bazındaki yükseltgenme sinyalinde meydana gelen değişimler izlenerek incelendi. Çalışmamızda difarensiyel puls voltametri tekniği kullanıldı. Elektrotlara immobilize edilen ct-DNA’ların derişimleri, ct-DNA ile etkileşen ilaç derişimi ve etkileşim süresi gibi parametreler PGE ile optimize edildi, tayin sınırları belirlendi ve sonuçlar yorumlandı. Tayin sınırı (DL) ct-dsDNA ve ct-ssDNA etkileşimi için sırasıyla 0.556 μg/mL ve 0.059 μg/mL bulunmuştur. Çalışmamızda elde edilen sonuçların, üretimi yapılacak olan ilaçların tasarımına fayda sağlayacağına ve yeni sentezlenen ilaçların DNA ile olan etkileşim mekanizmalarının aydınlatılmasına imkan sağlayacağına inanılmaktadır., Anaplasma Phagocytophilum, Diferansiyel PulsVoltametrisi.

Studies that deal with the confirming the interaction of anticancer drugs with DNA have gained much more importance in recent years. In our study,the interaction of Epirubicin, an anticancer drug, with DNA was examined with electrochemical methods using pencil graphite electrode. Differential pulse voltammetry technique (DPV) was employed in our study. The parameters such as the concentrations of ct-DNA immobilized on electrodes Drug concentrations interacting with ct-DNA and its interaction periods of time were optimized using pencil graphite electrode and the limit of detection was determined and the result were explicated. To estimate the detection limit (DL) target sequences were found for ct-dsDNA and ct-ssDNA 0.556  μg/mL  and 0.059 μg/mL , respectively. The study aims to contribute to the designing process of the drugs to be produced and to the illumination of the interaction mechanisms between the newly- synthesised drugs and DNA.

  • [1]. Erdem, A., in Comprehensive Analytical Chemistry (Ed: D.Barcelo), Electrochemical Sensor Analysis (Eds: S. Alegret, A. Merkoci) Elsevier, Amsterdam, 2007, 19, 403-411.
  • [2]. Wang J.,Anal. Chim.Acta.,2002, 469, 63.
  • [3]. Wang, J.,Anal. Chim.Acta,, 1997, 347, 1.
  • [4]. Erdem, A., Talanta,,2007,74, 318.
  • [5]. Wang, J.,Biosensors & Bioelectronics, 1998, 13, 757.
  • [6]. Erdem A., Ozsoz M.,Electroanalysis, 2002, 14, 965.
  • [7]. S. Rauf, J.J. Gooding, K. Akhtar, M.A. Ghauri, M. Rahman, M.A. Anwar, A.M. Khalid, J. Pharm. Biomed.Anal.,2005, 37, 205.
  • [8]. Erdem, A., Özsöz, M., Anal. Chim.Acta,, 2001, 437, 107.
  • [9]. Wang, J.; Rivas, G.; Fernandes, J. R.; Paz, J. L. L.; Jiang, M.; Waymire, R.,Anal. Chim.Acta, 1998, 375, 197.
  • [10]. Mikkelsen, S. R. Electroanalysis, 1996, 1, 8.
  • [11]. Wang, L., Lin, L., Ye, B., Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, 2006, 42, 625.
  • [12]. Nawaz, H., Rauf, S., Akhtar, K., Khalid, A. M., Analytical Biochemistry, 2006, 354, 28.
  • [13]. Richardson, C. L., Springfield, G.E.S. et al., "Intercalation inhibition assay compounds that interact with DNA or RNA", Amerikan patent no; 4,257,774 / 24 March, 1981.
  • [14]. Marin, D., Perez, P., Teijeiro, C., Palecek, E., Biophysical Chemistry,1998, 75, 87.
  • [15]. 0liveira Brett, A.M., Macedo, T.R.A., Raimundo, D., Marques, M.H., Serrano, S.H.P.,Biosensors and Bioelectronics, , 1998, 13, 861.
  • [16]. Perez, P., Teijeiro, C., Marin, D., Chemico-Biological Interactions, 1999, 117, 65.
  • [17]. Wang, J., Rivas, G., Cai, X., , Shiraishi, H., Farias, A.M.P., Dontha, N., Luo, D., Anal. Chim. Acta,, 1996, 332, 139.
  • [18]. Wang, J., Rivas, G., Luo, D., Cai, X., Valera, F.S., Dontha, N., Anal. Chem., (1996), 68, 4365.
  • [19]. Karadeniz, H., Erdem, A., Caliskan, A., Pereira, C.M., Pereira, E.M.,Ribiero, J.A., Electrochem.Commun., 2007, 9, 2167.
  • [20]. Erdem, A., 2007, 74, 318.
  • [21]. Wang, J., Kawde, A. N. , Erdem, A., Salazar, M., 2001, Analyst, 126, 2020.
  • [22]. Kuralay, F., Erdem, A., Abacı, S. Ozyoruk, H. Yıldız, A., Electrochem. Commun., 2009, 11(6) 1242.
Subjects Basic Sciences
Journal Section Articles
Authors

Author: Adil ELİK

Author: Gültekin GÖKÇE

Author: Ebru BOSTANCI

Author: Derya KIZILOLUK

Bibtex @research article { csj340503, journal = {Cumhuriyet Science Journal}, issn = {2587-2680}, eissn = {2587-246X}, address = {Cumhuriyet University}, year = {2017}, volume = {38}, pages = {525 - 534}, doi = {10.17776/csj.340503}, title = {Electrochemical Determination of Interaction between Anticancer Drug Epirubicin and DNA by DNA Biosensors}, key = {cite}, author = {ELİK, Adil and GÖKÇE, Gültekin and BOSTANCI, Ebru and KIZILOLUK, Derya} }
APA ELİK, A , GÖKÇE, G , BOSTANCI, E , KIZILOLUK, D . (2017). Electrochemical Determination of Interaction between Anticancer Drug Epirubicin and DNA by DNA Biosensors. Cumhuriyet Science Journal, 38 (3), 525-534. DOI: 10.17776/csj.340503
MLA ELİK, A , GÖKÇE, G , BOSTANCI, E , KIZILOLUK, D . "Electrochemical Determination of Interaction between Anticancer Drug Epirubicin and DNA by DNA Biosensors". Cumhuriyet Science Journal 38 (2017): 525-534 <http://dergipark.org.tr/csj/issue/31252/340503>
Chicago ELİK, A , GÖKÇE, G , BOSTANCI, E , KIZILOLUK, D . "Electrochemical Determination of Interaction between Anticancer Drug Epirubicin and DNA by DNA Biosensors". Cumhuriyet Science Journal 38 (2017): 525-534
RIS TY - JOUR T1 - Electrochemical Determination of Interaction between Anticancer Drug Epirubicin and DNA by DNA Biosensors AU - Adil ELİK , Gültekin GÖKÇE , Ebru BOSTANCI , Derya KIZILOLUK Y1 - 2017 PY - 2017 N1 - doi: 10.17776/csj.340503 DO - 10.17776/csj.340503 T2 - Cumhuriyet Science Journal JF - Journal JO - JOR SP - 525 EP - 534 VL - 38 IS - 3 SN - 2587-2680-2587-246X M3 - doi: 10.17776/csj.340503 UR - https://doi.org/10.17776/csj.340503 Y2 - 2017 ER -
EndNote %0 Cumhuriyet Science Journal Electrochemical Determination of Interaction between Anticancer Drug Epirubicin and DNA by DNA Biosensors %A Adil ELİK , Gültekin GÖKÇE , Ebru BOSTANCI , Derya KIZILOLUK %T Electrochemical Determination of Interaction between Anticancer Drug Epirubicin and DNA by DNA Biosensors %D 2017 %J Cumhuriyet Science Journal %P 2587-2680-2587-246X %V 38 %N 3 %R doi: 10.17776/csj.340503 %U 10.17776/csj.340503
ISNAD ELİK, Adil , GÖKÇE, Gültekin , BOSTANCI, Ebru , KIZILOLUK, Derya . "Electrochemical Determination of Interaction between Anticancer Drug Epirubicin and DNA by DNA Biosensors". Cumhuriyet Science Journal 38 / 3 (September 2017): 525-534. https://doi.org/10.17776/csj.340503