TY  - JOUR
T1  - Çip-Üstü-Laboratuvar (ÇÜL) Teknolojisinin Gıda Mikrobiyolojisindeki Uygulamaları
TT  - Lab-On-A-Chip (LOC) Technology Applications in Food Microbiology
AU  - Kışla, Duygu
AU  - Düven, Gamze
AU  - Çetin, Barbaros
PY  - 2018
DA  - April
DO  - 10.24323/akademik-gida.417895
JF  - Akademik Gıda
JO  - Akademik Gıda
PB  - Sidas Medya Ltd. Şti.
WT  - DergiPark
SN  - 1304-7582
SP  - 78
EP  - 87
VL  - 16
IS  - 1
LA  - tr
AB  - Son 20 yılda ortaya çıkan mikro-kanal yapılarında mikro-litrelermertebesinde akışkanın proses edilmesi için kullanılan çip-üstü-laboratuvar(ÇÜL) sistemleri konvansiyonel yöntemlere bir alternatif oluşturmaktadır.Mikro-yapıların kendine has özelliklerinden dolayı ÇÜL sistemleri, karmaşıkanalizleri geleneksel yöntemlerle karşılaştırıldığında daha düşük maliyette, daha düşük enerji, daha düşük kimyasal sarfiyatıile daha verimli bir şekilde yapabilmekte ve bu yönleriyle birçokalanda (biyomedikal, gıda, kimya, tıp, eczacılık, tarım vb.) çok değerli birseçenek oluşturmaktadır. Ayrıca bu sistemler otomasyona uygundur ve taşınabilirolma potansiyelleri vardır. Özellikle gıda endüstrisinde bazı durumlarda analizsonuçlarının hızlı alınabilmesi işletme için büyük önem taşımaktadır. Çip-üstülaboratuvar teknolojisi bu nedenle gıda endüstrisinde özellikle mikrobiyolojikanalizlerde hızlı sonuç vermesi, uzman personel gerektirmemesi, az örneğeihtiyaç duyması vb. özellikleri ile son zamanlarda oldukça önem taşımaktadır. Buçalışmada, ÇÜL cihazlarının çalışma prensipleri, polimeraz zincir reaksiyonu(PZR), akış sitometrisi ve biyosensörler ile birlikte kullanıldığı entegresistemler ve bu sistemlerin gıda mikrobiyolojisindeki uygulamalarıanlatılmıştır.
KW  - Çip-üstü-laboratuvar
KW  - Gıda mikrobiyolojisi
KW  - Mikro-akışkan sistemler
KW  - Hızlı mikrobiyolojik yöntemler
N2  - Lab-on-a-chip (LOC) systems, which have emerged in the last two decadesand used for fluid processing in a micro-channel structure at microliter levels,are alternatives to conventional methods. Because of the unique properties ofmicrostructures, LOC systems can make complex analyses more efficient withlower cost, energy and chemical consumption than conventional systems, and theybecome a valuable option for many applications such as biomedical, food, chemistry,medicine, pharmacy and agriculture in these aspects. In addition, these systemsare suitable for automation and have a potential to be portable. Especially insome cases of food industry, obtaining analysis results quickly has a greatimportance for food plants. For this reason, recently developed LOC technology hasbecome important in food industry because of their features such as quickresponse in microbiological analysis, no requirement for skilled personnel, andsmall sample needed. In this study, principles of LOC devices, integratedsystems used with polymerase chain reaction (PCR), flow cytometry, biosensorsand application of these systems in food microbiology are reviewed.
CR  - [1]	Wen-Ming, L., Li, L., Li, R., Jian-Chun, W., Qin, T., Xue-Qin, W., Jin-Yi, W., 2012. Diversification of microfluidic chip for applications in cell based bioanalysis. Chinese Journal of Analytical Chemistry 40(1): 24-31.
CR  - [2]	Ürkmez, B., 2014a. Minyatür Laboratuvarlar-2. http://www.acikbilim.com/2014/02/dosyalar/minyatur-laboratuvarlar-2.html, Erişim Tarihi: 21.08.2016.
CR  - [3]	Erickson, D., Li, D., 2004. Integrated microfluidic devices. Analytica Chimica Acta 507: 11-26.
CR  - [4]	Ürkmez, B., 2014b. Minyatür Laboratuvarlar-1. http://www.acikbilim.com/2014/01/dosyalar/minyatur-laboratuvarlar-1.html, Erişim Tarihi: 23.08.2016.
CR  - [5]	Yoon, J., Kim, B., 2012. Lab-on-chip pathogen sensors for food safety. Sensors 12: 10713-10741.
CR  - [6]	Liu, W., Zhu, L., 2005. Environmental microbiology-on-a-chip and its feature impacts. Trends in Biotechnology 23(4): 174-179.
CR  - [7]	Mortari, A., Lorenzelli, L., 2014. Recent sensing technologies for pathogen detection in milk: a review. Biosensors and Bioelectronics 60: 8-21.
CR  - [8]	Sakamoto, C., Yamaguchi, N., Yamada, M., Nagase, H., Seki, M., Nasu, M., 2007. Rapid quantification of bacterial cells in potable water using a simplified microfluidic device. Journal of Microbiological Methods 68: 643-647.
CR  - [9]	Skurtys, O., Aguilera, J., M., 2008. Applications of microfluidic devices in food engineering. Food Biophysics 3: 1-15.
CR  - [10]	Timur, S., 2010. Protein Analitiği Bölüm: Protein Chip’leri, Editörler A., Telefoncu, A. Kılınç, Ege Üniversitesi Basımevi, Bornova, İzmir.
CR  - [11]	Anonymous, 2015. Lab-on-a-chip. http://www.epa.gov/radiation/docs/cleanup/nanotechnology/chapter-3-lab-on-a-chip.pdf, Erişim Rarihi: 21.05.2015.
CR  - [12]	Guo, L., Feng, J., Fang, Z., Xu, J. and Lu, X., 2015. Application of microfluidic ”lab-on-a-chip” for the detection of mycotoxins in foods. Trends in Food Science & Technology 46: 252-263.
CR  - [13]	Anonymous, 2016a. Polymerase Chain Reaction (PCR). http://www.ncbi.nlm.nih.gov/probe/docs/techpcr/, Erişim Tarihi: 30.08.2016.
CR  - [14]	Anonymous, 2016b, Thermo scientific Standard PCR protocol reaction set up.
CR  - [15]	Koop, M.U., de Mello, A.J., Manz, A., 1998. Chemical amplification: Continuous-flow PCR on a chip. Science 280: 1046-1047.
CR  - [16]	Li, Y., Zhang, C., Xing, D., 2011. Integrated microfluidic reverse transcription-polymerase chain reaction for rapid detection of food or waterborn pathogenic rotavirus. Analytical Biochemistry 415: 87-96.
CR  - [17]	Delibato, E., Gattuso, A., Minucci, A., Auricchio, B., De Medici, D., Toti, L., Castagnola, M., Capoluongo, E., Gianfranceschi, M.V., 2009. PCR experion automated electrophoresis system to detect Listeria monocytogenes in foods. Journal of Separation Science 32: 3817-3821.
CR  - [18]	Jin, S., Yin, B., Ye, B., 2009. Multiplexed bead- based mesofluidic system for detection of food-borne pathogenic bacteria. Applied and Environmental Microbiology 75(21): 6647-6654.
CR  - [19]	Sayad, A.A., Ibrahim, F., Uddin, S.M., Pei, K.X., Mohktar, M.S., Madou, M., Thong, K.L., 2016. A microfluidic lab-on-a-disc integrated loop mediated isothermal amplification of foodborne pathogen detection. Sensors and Actuators B: Chemical 227: 600-609.
CR  - [20]	Zourob, M., Elwary, S., Turner, A., 2008. Principles of Bacterial Detection: Biosensors, Recognition Receptors and Microsystems. Part IV Chapter 33: Microfabricated Flow Cytometers for Bacterial Detection. Edited by, S., Yang, G., Lee, Springer Science and Business Media, USA, 869-890p.
CR  - [21]	Kang, Y., Wu, X., Wang, Y., Li, D., 2008. On-chip fluorescence-activated particle counting and sorting system. Analytica Chimica Acta 626: 97-103.
CR  - [22]	Karaboz, İ, Kayar, E., Akar, S., 2008. Flow sitometri ve kullanım alanları. Elektronik Mikrobiyoloji Dergisi 6(2): 1-18.
CR  - [23]	Yamaguchi, N., Ohba, H., Nasu, M., 2006. Simple detection of small amounts of Pseudomonas cells in milk by using a microfluidic device. Letters in Applied Microbiology 43: 631-636.
CR  - [24]	Fernandes, A.C., Duarte, C.M., Cardoso, F.A., Bexiga, R., Cardoso, S., Freitas, P.P., 2014. Lab-on-chip cytometry based on magnetoresistive sensors for bacteria detection in milk. Sensors 14: 15496-15524.
CR  - [25]	Yıldırım, A., Bardakçı, F., Karataş, M., Tanyolaç, B., 2010. Moleküler Biyoloji. Bölüm 16: Biyoteknoloji ve Biyoinformatik, Editörler B., Tanyolaç, H., B., Kaya, S., Soya, C. Akkale, Nobel Yayın Dağıtım, Ankara, Türkiye, 601s.
CR  - [26]	Leonard, P., Hearty, S., Brennan, J., Dunne, L., Quinn, J., Chakraborty, T., O’Kennedy, R., 2003. Advances in biosensors for detection of pathogens in food and water. Enzyme and Microbial Technology 32: 3-13.
CR  - [27]	Erkmen, O., 2011. Gıda Mikrobiyolojisi. 7. Kısım Bölüm 26: Hızlı Mikrobiyolojik Gıda Analiz Yöntemleri, Editörler: F., Y., Ekinci, A., Sofu, Efil Yayınevi, Ankara, Türkiye, 484 s.
CR  - [28]	Lafleur, J.P., Jönsson, A., Senkbeil, S., Kutter, J., P., 2016. Recent advances in lab-on-a-chip for biosensing applications. Biosensors and Bioelectronics 76: 213-233.
CR  - [29]	Pöhlmann, C., Wang, Y., Humenik, M., Heidenreich, B., Gareis, M., Sprinzl, M., 2009. Rapid, specific and sensitive electrochemical detection of foodborne bacteria. Biosensors and Bioelectronics 24: 2766-2771.
CR  - [30]	Carmen Morant-Mińana, M., Elizalde, J., 2015. Microscale electrodes integrated on COP for real sample Camplyobacter spp. detection. Biosensors and Bioelectronics 70: 491-497.
CR  - [31]	 Luka, G., Ahmadi, A., Najjaran, H., Alocilja, E., DeRosa, M., Wolthers, K., Malki, A., Aziz, H., Althani, A., Hoorfar, M., 2015. Microfluidics integrated biosensors: a leading technology towards lab-on-a-chip and sensing applications. Sensors 15: 30011-30031.
CR  - [32]	www.genmarkdx.com, Erişim Tarihi: 10.05.2017.
CR  - [33]	http://www.perkinelmer.com/catalog/category/id/labchip%20systems, Erişim Tarihi: 10.05.2017.
CR  - [34]	http://www.nugeninc.com/nugen/index.cfm/products/msp/, Erişim Tarihi: 10.05.2017.
CR  - [35]	www.vereduslabs.com, Erişim tarihi: 10.05.2017.
CR  - [36]	www.genomics.agilent.com, Erişim tarihi: 10.05.2017.
CR  - [37]	Streets, A.M., Huang, Y., 2013. Chip in a lab: Microfluidics for next generation life science research, Biomicrofluidics 7: (011302) 1-23.
CR  - [38]	Çetin, B., Özer, M.B., Solmaz, M.E., 2014. Microfluidic bio-particle manipulation for biotechnology, Biochemical Engineering Journal 92: 63-82.
CR  - [39]	 Yeşil-Çeliktaş, Ö., Çetin, B., Yıldırım, E., 2016. Mikroakışkan Sistemlere Yönelik Gelecek Tahminleri. Mikroakışkan Teknolojilerin Temelleri ve Uygulamaları, Editör: Ö., Yeşil Çeliktaş, Ege Üniversitesi Yayınevi, Bornova, İzmir.
UR  - https://doi.org/10.24323/akademik-gida.417895
L1  - https://dergipark.org.tr/en/download/article-file/462238
ER  -