TY  - JOUR
T1  - SETBP1 Geninde Mental Retardasyon Tip 29 Sendromuyla Ilişkili Yeni Mutasyon Tanımlanması: Olgu Sunumu
AU  - Alagoz, Meryem
AU  - Gunger, Ezgi
AU  - Yuksel, Adnan
PY  - 2019
DA  - December
DO  - 10.31832/smj.589375
JF  - Sakarya Tıp Dergisi
PB  - Sakarya University
WT  - DergiPark
SN  - 2146-409X
SP  - 715
EP  - 720
VL  - 9
IS  - 4
LA  - tr
AB  - ÖzetAmaç:Mental retardasyon genetik ve çevresel faktörlerin etkilileri sonucu ortayaçıkan konjenital anomalilerdir. Genetik bozuklukların Mental retardasyonungelişmesindeki etkinliği göz önüne alındığında genetik tanın hastalığın teşhisive tedavisideki rolü büyük önem taşımaktadır. Bu çalışmada amacımız zihinselengelli tanısı konulan hastada, hastalığın genetik sebeplerinin detaylı birşekilde araştırılmasıdır. Gereçve yöntemler: Bu çalışmada Yeni Nesil Dizileme (NGS)teknolojisi kullanılmıştır. İnsanlardaki 60MB'lık ekzom bölgeleri," AgilentSure Select Human All Exon V6" kiti kullanılarak zenginleştirilmiştir.Zenginleştirilen kütüphane, Illumina yeni nesil dizileme platformunda ortalama100X kapsama ile dizilenmiştir. Sonuçların biyoinformatik analiziBurrows-Wheeler Aligner programı ile GRCh37/hg19 genom hizalaması kullanılarakyapılmış. Bulgular:Yeni nesil dizileme yöntemi (NGS) kullanılarakhastanın tüm genomundaki protein kodlayan genlerin (WES) dizilenmesi sonucunda,klinik bulgularla ilişkili olarak SETBP1 geninde heterezigot otomozmal baskındeğişim saptanmıştır. ACMG kriterlerine göre bu değişim klinik etkisi henüzbilinmeyen (VUS) yeni bir mutasyon c.3515G>T olarak sınıflandırılmıştır.Hastada bulunan bu yeni mutasyon Sanger dizileme ile doğrulanmıştır. SETbağlayıcı protein 1’ in (SET binding protein 1), beyin hücrelerinin gelişimindeve işlevinde son derece önemli bir rolü olabileceği öngörülmektedir.Sonuç:Mental retardasyonda erken dönemde teşhis koyulması ve müdahale edilmesidurumunda hastalığın seyrinin daha olumlu yönde gitmesi sağlanabilir vetedavisinde büyük farklar yaratılabilir. Hastada SETBP1 geninde heterozigotolarak saptanmış olan yeni mutasyon, hastanın verilen klinik bulguları ileilişki göstermektedir. Bu çalışma, SET bağlayıcı protein 1'in (SETBP1), beyinhücrelerinin gelişiminde ve fonksiyonunda önemli bir rol oynayabileceğini,dolayısıyla fonksiyonunu bozulmuş bu proteinin, hastanın zihinsel gelişiminde geriliğeneden olduğunu öne sürülmektedir.
KW  - Anahtar Kelimeler: Mental retardasyon
KW  - SETBP1
KW  - Yeni nesil dizileme (NGS)
CR  - KAYNAKLAR:1. DeSilva M, Munoz FM, Mcmillan M, et al. Congenital anomalies: Case definition and guidelines for data collection, analysis, and presentation of immunization safety data. Vaccine. 2016;34(49):6015-6026.
CR  - 2. Salvador-Carulla L, Reed GM, Vaez-Azizi LM, et al. Intellectual developmental disorders: towards a new name, definition and framework for “mental retardation/intellectual disability” in ICD-11. World Psychiatry. 2011;10(3):175-180.
CR  - 3. Huang J, Zhu T, Qu Y, Mu D. Prenatal, perinatal and neonatal risk factors for intellectual disability: A systemic review and meta- Analysis. PLoS One. 2016;11(4):1-12. doi:10.1371/journal.pone.0153655
CR  - 4. Nemerimana M, Chege MN, Odhiambo EA. Risk Factors Associated with Severity of Nongenetic Intellectual Disability (Mental Retardation) among Children Aged 2–18 Years Attending Kenyatta National Hospital. Neurol Res Int. 2018;2018:1-11.
CR  - 5. Maria Puiu, Simona Dumitriu, Adela Chiriță-Emandi, Raluca Grădinaru and Smaranda Arghirescu (January 9th 2013). The Genetics of Mental Retardation, Genetic Disorders, Maria Puiu, IntechOpen
CR  - 6. . Chiurazzi P, Schwartz CE, Gecz J, Neri G. XLMR genes: update 2007. Eur J Hum Genet 2008; 16: 422–434.
CR  - 7. Antonarakis SE, Van Aelst L. Mind the GAP, Rho, Rab and GDI. Nat Genet 1998; 19: 106–108.
CR  - 8. Higgins, J. J., Rosen, D. R., Loveless, J. M., Clyman, J. C., Grau, M. J. A gene for nonsyndromic mental retardation maps to chromosome 3p25-pter. Neurology 55: 335-340, 2000.
CR  - 9. Al-Amri, A., Al Saegh, A., Al-Mamari, W., El-Asrag, M. E., Ivorra, J. L., Cardno, A. G., Inglehearn, C. F., Clapcote, S. J., Ali, M. Homozygous single base deletion in TUSC3 causes intellectual disability with developmental delay in an Omani family. Am. J. Med. Genet. 170A: 1826-1831, 2016
CR  - 10. Poirier, K., Lebrun, N., Broix, L., Tian, G., Saillour, Y., Boscheron, C., Parrini, E., Valence, S., Saint Pierre, B., Oger, M., Lacombe, D., Genevieve, D., and 23 others. Mutations in TUBG1, DYNC1H1, KIF5C and KIF2A cause malformations of cortical development and microcephaly. Nature Genet. 45: 639-647, 2013. Note: Erratum: Nature Genet. 45: 962 only, 2013.
CR  - 11.Hoischen A, Van Bon BWM, Gilissen C, et al. De novo mutations of SETBP1 cause Schinzel-Giedion syndrome. Nat Genet. 2010;42(6):483-485.
CR  - 12. Piazza R, Magistroni V, Redaelli S, et al. SETBP1 induces transcription of a network of development genes by acting as an epigenetic hub. Nat Commun. 2018;9
UR  - https://doi.org/10.31832/smj.589375
L1  - https://dergipark.org.tr/en/download/article-file/883238
ER  -