Molecular Characterization of Some Selected Landrace Green Bean (Phaseolus vulgaris L.) Genotypes

Year 2012, Volume: 18 Issue: 4, 277 - 286, 04.12.2012

Kamile Ulukapı , Ahmet Onus

https://doi.org/10.1501/Tarimbil_0000001216

Cited By: 1

Abstract

Molecular markers are widely used to investigate the genetic diversity among bean species. This study was conducted to reveal the molecular characterization of 33 dwarf green bean landraces selected by Karadeniz Agricultural Research Institute. Genotypes were evaluated using Sequence Characterized Amplified Region (SCAR) and Simple Sequence Repeat (SSR) markers. Approximately 73% of the SSR markers gave polymorphic bands and the polymorphism information content (PIC) was between 0.047 and 0.373. All of the SCAR markers were polymorphic and the PIC showed variation from 0.071 to 0.379. Genetic similarity index among green bean genotypes varied between 0.52 and 0.98. Principle coordinate analysis indicated that genetic diversity among the genotypes was not high and all selected genotypes had a close genetic relationship with Andean gene pool. 

Keywords

Green bean, Molecular analysis, SSR

Selekte Edilmiş Bazı Yerel Yeşil Fasulye (Phaseolus vulgarıs L.) Genotiplerinin Moleküler Karakterizasyonu

Abstract

Moleküler işaretleyicilerle fasulyede yapılan genetik benzerlik ve farklılık çalışmalarında yaygın olarak kullanılmaktadır. Bu çalışmada da Karadeniz Tarımsal Araştırma Enstitüsü tarafından selekte edilen 33 bodur fasulye hattının moleküler karakterizasyonu yapılmıştır. Fasulye hatlarının moleküler karakterizasyonu için Karakterize Edilmiş Çoğaltılan Alanlar (SCAR) ve Basit Tekrarlı Sekanslar (SSR) DNA moleküler analiz teknikleri kullanılmıştır. Kullanılan SSR primer çiftlerinin yaklaşık % 73’ü polimorfik sonuçlar vermiş ve primer çiftlerinin polimorfizm bilgi içeriği (PBİ) 0.047- 0.373 arasında değişim göstermiştir. SCAR primer çiflerinin tamamı araştırma yapılan bitkiler için polimorfik bulunurken SCAR primer çiflerinin PBİ değerleri 0.071- 0.379 arasında bulunmuştur. Genotipler arası genetik benzerlik indeksi ise 0.52–0.98 arasında gerçekleşmiştir. Kümeleme analizinin sonuçlarına göre, üzerinde çalışılan genotipler arasındaki genetik farklılığın yüksek olmadığı ve tüm genotiplerin And dağları gen havuzu ile daha yakın bir genetik ilişkiye sahip olabileceği sonucuna varılmıştır.

Keywords

-