İnvazivve İnvaziv Olmayan Örneklerden İzole Edilen Candida albicans Suşlarının Genotip Dağılımı Genotype Distribution OfCandida albicans Strains Isolated From Invasive And Noninvasive Samples

Year 2007, Volume: 60 Issue: 2, 53 - 56, 01.02.2007

Esra Koyuncu İştar Dolapçı , Ceren Karahan Alper Tekeli Özay Arıkan Akan

https://doi.org/10.1501/Tipfak_0000000233

Abstract

Keywords

-

İnvazivve İnvaziv Olmayan Örneklerden İzole Edilen Candida albicans Suşlarının Genotip Dağılımı

Abstract

Amaç: Bu çalışmada, sepsisli hastaların kanından izole edilen invaziv C. albicans izolatları ile, sağlıklı ve Human-Immunodeficiency Virus (HIV) ile infekte kişilerin boğazlarından izole edilen invaziv olmayan C. albicans izolatlarının genotip dağılımlarının belirlenmesi ve aynı bölgeyi hedef alan iki ayrı primer çifti kullanılarak elde edilen sonuçların karşılaştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya, kandan izole edilen 42 adet C. albicans suşu (invaziv izolatlar) ile HIV pozitif hastaların boğaz çalkantı sularından elde edilen 38, sağlıklı erişkinlerin boğaz çalkantı sularından izole edilen 30 adet C. albicans suşu (invaziv olmayan izolatlar) dahil edilmiştir. C. albicans identifikasyonu konvansiyonel mikrobiyolojik yöntemlerle gerçekleştirilmiş ve polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yöntemi ile doğrulanmıştır. 25S intron genotiplendirmesi, CaLSU-F ve CaLSU-R ile CA-INT-L ve CA-INT-R primerleri kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Bulgular: Kandan izole edilen 42 adet C. albicans suşunun 12’si genotip A (%28.5), 17’si genotip B (%40.5) ve 13’ü genotip C (%31) olarak bulunurken, sağlıklı kontrollerden izole edilen 30 adet C. albicans suşunun 9’unun genotip A (% 30), 12’sinin genotip B (% 40) ve 9’unun genotip C (%30) dağılımında olduğu gösterilmiştir. HIV pozitif bireylerden elde edilen 38 adet C. albicans suşunun 15’i genotip A (%39.5), 7’si genotip B (%18.4) ve 16’sı genotip C (%42.1) olarak bulunmuştur. Her iki primer ile de elde edilen sonuçlar birbirleriyle uyumlu bulunmuştur. Sonuç: İnvaziv ve non-invaziv örneklerin genotip dağılımları birbirleriyle karşılaştırıldıklarında istatistiksel olarak anlamlı bir fark görülmemiştir.

Keywords

Candida albicans, genotiplendirme

References

• Jabra-Rizk MA, Falkler WA, Merz WG, etal. Retrospective identification and characte- rization of Candida dubliniensis isolates among Candida albicans clinical labo- ratory isolates from Human Immunode- ficiency Virus (HIV)-infected and Non- HIV-infected individuals. J Clin Microbiol 2000; 38: 2423-2426.
• Swerdloff JN, Filler SG, Edwards JE Jr. Se- vere Candidal infections in neutropenic patients. Clin Infect Dis 1993; 17(suppl 2):457-467.
• Tamura M, Watanabe K, Mikami Y, etal. Molecular characterization of new cli- nical isolates of Candida albicans and C.dubliniensis in Japan: analysis reveals a new genotype of C.albicans with group I intron. J Clin Micribiol 2001; 39: 4309- 4315.
• Vrioni G, Bernard M. Molecular typing of Candida isolates from patients hospi- talized in an intensive care unit. J Infect 2001; 42: 50-56.
• Dalle F, Franco N, Lopez J et al. Compa- rative genotyping of Candida albicans bloodstream and non-bloodstream isola- tes at a polymorphic microsatellite locus. J Clin Microbiol 2000; 38: 4554-4559.
• McCullough MJ, Clemons KV, Stevens DA. Molecular and phenotypic Candida al- bicans subgroups and comparison with Candida dubliniensis and Candida ste- latoidea. J Clin Microbiol 1999; 37: 417- 421.
• Pfaller MA. Epidemiology of fungal infe- ctions: the promise of molecular typing. Clin Infect Dis 1995; 20: 1535-1580.
• Mannarelli BM, Kurtzman CP. Rapid iden- tification of Candida albicans and other human pathogenic yeasts by using short oligonucleotides in a PCR. J Clin Microbi- ol, 1998; 6:1634-1641.
• Sugita T, Kurosaka S, Yajitate M, etal. Extracellular proteinase and phospho- lipase activity of three genotypic strains of a human pathogenic yeast, Candida albicans. Microbiology and Immunology, 2002; 46:881-883.
• Scherer S, Stevens DA. Application of DNA typing methods to epidemiology and taxonomy of Candida species. J Clin Microbiol 1987; 25:675-679.
• Mercure S, Montplaisir S, Lemay G. Cor- relation between the presence of a self- splicing intron in the 25S rDNA of Candi- da albicans and strain susceptibility to 5’ fluorocytosine. Nucleic Acids Res. 1993; 21: 6020-6027.
• Stevens DA, Odds FC, Scherer S. Applica- tion of DNA typing methods to C.albicans epidemiology and correlation with phe- notype. Rev Infect Dis 1990; 12: 258-266.
• Clemons KV, Feroze F, Holmberg K, etal. Comparative analysis of genetic variability among Candida albicans isolates from different geographic locales by three ge- notypic methods. J Clin Microbiol 1997; 35: 1332-1336.
• McCullough MJ, Clemons KV, Del Palacio A, etal. Epidemiology of Candida albi- cans isolates from heroin addicts analy- sed by DNA typing. Med. Mycol. 1998; 36: 213-217.
• Millar BC, Moore JE, Xu J, etalR. Genot- ypic subgrouping of clinical isolates of Candida albicans and Candida dubli- niensis by 25S intron analysis. Lett Appl Microbiol 2002; 35: 102-106.
• Karahan ZC, Güriz H, Ağırbaşlı H, etal. Genotype distribution of Candida albi- cans isolates by 25S intron analysis with regard to invasiveness. Mycoses 2004; 47:465-469.