Balıkçılık filosunda zaman içerisinde kaydedilen gelişmelerin tespit edilmesi balıkçılık yönetiminde gelecek stratejilerinin belirlenmesi için önem arz etmektedir. Bu çalışmada; Türkiye’nin en uzun kıyı şeridine sahip ve Türkiye filosunun % 10’unu oluşturan Muğla ili balıkçılık filosunun son 29 yıllık değişimi , filodaki artış ve azalışların sebepleri, mevcut durumda balıkçı gemisi özellikleri ve balıkçılık türleri Muğla İl Gıda, Tarım ve Hayvancılık Müdürlüğü kayıtları incelenerek tespit edilmiştir. “Balıkçı Gemisini Avcılıktan Çıkaranlara Yapılacak Destekleme Tebliği (2012/51)" kapsamında 2012 yılında Muğla ili balıkçılık filosundan çıkan gemilerin sayıları, türleri ve gemi özellikleri belirlenerek filoda kaydedilen küçülme oranı saptanmıştır. Muğla balıkçılık filosundaki gemi sayısı, 1985-2005 yılları arasında artış, 2005’den 2013 yılına kadar ki süreçte ise düşüş göstermiştir. 29 yıllık periyot içerisinde toplam 359 balıkçı gemisi filodan çıkmıştır. Filodan çıkış sebepleri, 233’ünde ruhsat yenilememe, 1’inde yasak yerde avcılık, 1’inde ruhsat birleştirilmesi ve 1’inde yolcu gemisine dönüştürülmesi olarak gösterilmiş ve ruhsat iptali ile 108’inin diğer illere satışı ve 15’inin hibe desteğinden yararlanması olarak belirlenmiştir. Buna karşılık filoya diğer illerden transfer edilen balıkçı gemisi sayısı 234’dür. 2013 yılı güncel verilerine göre 1.428 balıkçı gemisine sahip Muğla ili balıkçılık filosu; % 97,1’i ağ-paragat, % 1,7’si gırgır, % 0,9’u trol, % 0,3’ü yardımcı hizmet gemilerinden oluşmaktadır. 2012/51 numaralı tebliğ kapsamında filodan çıkan balıkçı gemilerinin; % 40’ı ağ-paragat, % 40’ı gırgır ve % 20’si trol balıkçılığı yapmaktadır. Hibe desteğiyle çıkan balıkçı gemileri, filoda sayı olarak % 1’lik ve gemi boyu olarak % 2'lik azalma göstermesine rağmen, motor gücü olarak % 7 ve groston olarak % 23 gibi önemli oranlarda düşüş sağlamışlardır. Hibe desteği uygulamasının Muğla ili balıkçılık filosu için sayı ve boy açısından etkin olmamasına rağmen, motor gücü ve groston olarak etkin olduğu düşünülmektedir. Filoda 2005 yılından sonraki değişimler, stoklar üzerinde avcılık baskısı oluşturulduğuna ve balıkçılığın ekonomik olmaktan çıktığına işaret etmektedir