İDRAR KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN ENTEROKOK SUŞLARININ TÜR DAĞILIMLARI VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARI

Year 2019, Volume: 20 Issue: 1, 177 - 182, 27.08.2019

Merih Şimşek

https://doi.org/10.18229/kocatepetip.529275

Cited By: 2

Abstract

AMAÇ: Üriner sistem enfeksiyonlarının ve nozokomiyal enfeksiyonların en önemli etkenlerinden biri olan enterokok cinsi bakterilerin mortalitesi yüksek enfeksiyonlara sebep olabildiği bilinmektedir. Çalışmada, Afyonkarahisar Sağlık Bilimleri Üniversite hastanesinin çeşitli poliklinik ve servislerden Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’na gönderilen idrar örneklerinden izole edilen enterokokların tür dağılımı ve kliniklere göre dağılımı ile antibiyotik duyarlılıklarının araştırılması amaçlanmıştır.

GEREÇ VE YÖNTEM: Ocak 2014 - Aralık 2018 tarihleri arasında laboratuvarımıza gelen idrar örneklerinden bakterilerin izolasyonu için standart mikrobiyolojik yöntemler kullanılmıştır. İdentifikasyon ve antibiyotik duyarlılık profili için VITEK 2 (bioMerieux, France) tam otomatize identifikasyon ve antibiyotik duyarlılık sistemi kullanılmıştır. Kültür sonuçları retrospektif olarak taranmıştır.

BULGULAR: Bu çalışmada en sık Enterococcus faecalis (%69.1) üremesi gözlenirken bunu Enterococcus faecium (%27.6) türü takip etmektedir. Enterokok türlerinin sırasıyla en sık Fizik Tedavi ve Rehabilitasyon (%23), Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları (%22.6) ve Üroloji (%11.9) birimlerinden gelen örneklerden izole edildiği gözlenmiştir. Vankomisin direnci Enterococcus faecalis için %1.9, Enterococcus faecium için %6.3 olarak belirlenmiştir. Enterococcus faecium için ampisillin (%83.9) en yüksek direnç oranına sahipken Enterococcus faecalis için bu oran %10.6 olarak belirlenmiştir. Yüksek düzey gentamisin ve streptomisin direnç oranları sırasıyla, Enterococcus faecalis için %14.8-%6.2 ve Enterococcus faecium için %36.4-%10.5 olarak belirlenmiştir. Penisilin direnci ise Enterococcus faecalis için %4.8, Enterococcus faecium için %20.3 olarak belirlenmiştir.

SONUÇ: Bu çalışmada, Enterococcus faecium ve Enterococcus faecalis’ in bazı antibiyotiklere karşı direnç göstermesi, bu bakterilere bağlı olarak ortaya çıkan üriner sistem enfeksiyonlarında yaşanan tedavi zorluklarını açıklamaktadır. Diğer çalışmalara ve çalışmamıza ait veriler incelendiğinde enterokoklar da antibiyotik direnç oranları ülkemizde yöresel ve dünyada bölgesel olarak farklılık göstermektedir. Enterokok enfeksiyonların da yöresel olarak direnç profillerinin belirlenmesi tedavi başarısı açısından ayrıca bu enfeksiyonların yayılmasını önlemek açısından büyük bir öneme sahiptir.

Keywords

Enterokok, İdrar kültürü, Antibiyotik duyarlılık.

SPECIES DISTRIBUTION AND ANTIBIOTIC SUSCEPTIBILITIES OF ENTEROCOCCI STRAINS ISOLATED FROM URINE CULTURES

Abstract

OBJECTIVE: Enterococcal bacterial infections, which are the main cause of urinary tract infections and nosocomial infections, are known to cause serious and high mortality infections. The aim of this study was to investigate the antibiotic susceptibility and distribution of enterococci isolated from urine samples sent to the Medical Microbiology Laboratory from various outpatient clinics and services of Afyonkarahisar University of Health Sciences Hospital.

MATERIAL AND METHODS: Between January 2014 and December 2018, microbiological methods were used for the isolation of bacteria from urine samples. VITEK 2 (bioMerieux, France) fully automated identification and antibiotic susceptibility system were used for identification and antibiotic susceptibility profile. Culture results were evaluated retrospectively.

RESULTS: In our study, Enterococcus faecalis (69.1%) was the most common in this study. Enterococcus faecium (27.6%) was the second. Enterococci were most frequently observed in urine specimens sent from Physical Therapy and Rehabilitation (23%), Child Health and Disease (22.6%) and Urology Units (11.9%). Vancomycin resistance was 1.9% for Enterococcus faecalis and 6.3% for Enterococcus faecium. Ampisillin resistance was 83.9% for Enterococcus faecium, whereas this rate was determined to be 10.6% for Enterococcus faecalis. The rates of high-level gentamicin and streptomycin resistance were found to be 14.8%-6.2% for Enterococcus faecalis and 36.4%-10.5% for Enterococcus faecium, respectively. Penicillin resistance was found to be 4.8% for Enterococcus faecalis and 20.3% for Enterococcus faecium.

CONCLUSIONS: In our study, antibiotics resistance of Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis explains the treatment difficulties experienced in urinary tract infections. When the data from other studies and our study are examined, the rates of antibiotic resistance of enterococci differ according to the local in our country and regional in the world. Determination of local resistance profiles in enterococcal infections has a great importance in terms of treatment success and also to prevent the spread of these infections.

Keywords

Enterococcus, Urine culture, Antibiotic susceptibility.

References

• 1. Ekşi F, Gayyurhan ED. Klinik örneklerden izole edilen streptokok ve enterokok suşlarının antibiyotiklere duyarlılıkları. Ankem Dergisi 2008; 22(2): 53-8.
• 2. Yıldırım M. Enterokoklar ve enterokoklarla gelisen enfeksiyonlar. Düzce Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi 2007; 2: 46-52.
• 3. Etiz P, Kibar F, Ekenoğlu Y, Yaman A. İdrar kültüründen izole edilen enterokok türlerinin antibiyotik direnç profillerinin değerlendirilmesi. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 2014; 44(3): 107-13.
• 4. Işıkgöz MT. Vankomisine dirençli enterokok olguları. Ankem Dergisi 2010; 24: 82-4.5. Chomarat M. Resistance of bacteria in urinary tract infections. Int J Antimicrob Agents 2000; 16: 483-7.
• 6. Hayes JS, Soule BM, La Rocc MT. Nosocomial infections: an overview. In: Howard BJ. editors. Clinical and Pathogenic Microbiology. 9th ed. Vol 1. St Louis, Missouri: Mosby, 1987; p. 67-81.
• 7. Aral M, Paköz NİE, Aral İ, Doğan S. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen E.faecalis ve E.faecium suşlarının antibiyotik direnci. Türk Hijyen Deneysel Biyoloji Dergisi 2011; 68(2): 85-92.
• 8. Güneş H, Donma MM, Nalbantoğlu B, Aydın M, Kaya AD, Topçu B. Namık Kemal üniversitesi araştırma ve uygulama hastanesi’ne başvuran çocuklarda idrar örneklerinden izole edilen etkenler ve antibiyotik direnç durumları. Cumhuriyet Tıp Dergisi 2013; 35: 1-8.
• 9. Saraçoğlu KT, Fidan V, Pekel Ö, Saraçoğlu A, Kalkandelen S, Arpalı E. İdrar kültürlerinde izole edilen bakterilerin antibiyotik duyarlılıkları. Journal of Clinical and Experimental Investigations 2013; 4 (3): 356-9.
• 10. Yiş R, Aslan S, Çıtak Ç, Değirmenci S. Gaziantep çocuk hastanesinde vankomisine dirençli enterokok kolonizasyonunun değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul 2011; 45(4): 646-54.
• 11. Yüksel Ergin Ö, Bayram DB, Uzun B, Güngör S, Demirdal T. İdrar kültürlerinden izole edilen enterococcus türleri ve antibiyotik dirençleri. Ankem Dergisi 2013; 27(4): 173-8.
• 12. Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing. Twentieth Informational upplement. CLSI Document M100-S20. Wayne, PA: CLSI, 2012.
• 13. European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. (2018). EUCAST Version 8.1.
• 14. Özseven AG, Çetin Sesli E, Arıdoğan Cicioğlu B, Çiftçi E, Özseven L. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıkları. Ankem Dergisi 2011; 25: 256-62.
• 15. Türk Dağı H, Arslan U, Tuncer Eİ. Kan kültürlerin¬den izole edilen enterokoklarda antibiyotik direnci. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 2011; 4: 103-6.
• 16. Aktepe OC, Aşık G, Çiftçi İH, Çetinkaya Z. Klinik örneklerden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik direnç oranları. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 2011; 41: 86-90.
• 17. Cömert F, Külah C, Eroğlu Ö, Aktaş E. Zonguldak Karaelmas Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi’nde izole edilen enterokok izolatlarının üç yıllık değerlen¬dirmesi Flora Dergisi 2007; 12: 98-102.
• 18. Miskeen PA, Deodhar L. Antimicrobial susceptibility pattern of Enterococcus species from urinary tract infections. J Assoc Physicians India 2002; 50: 378-81.
• 19. Maradia MR, Mehta K, Prajapati K, Vadsmiya M, Shah P, Vegad M. Prevalence of multidrugresistant Enterococcus species isolated from urine samples in a tertiary care hospital, Western India. Int J Med Sci Public Health 2017; 6(4): 715-9.
• 20. Terek GE, Tunçel Başoğlu M. Bir üniversite hastanesine gönderilen idrar kültürlerinde üreyen izolatların dağılımı ve antimikrobiyal duyarlılık profilinin incelenmesi. Ege Tıp Dergisi 2013; 52(3): 136-40.
• 21. Akhter J., Ahmed S., Anwar S. Antimicrobial Susceptibility Patterns of Enterococcus species Isolated from urinary tract infections. Bangladesh J Med Microbiol 2014; 08(01): 16-20.
• 22. Rudy M, Nowakowska M, Wiechuła B, Zientara M, Radosz-Komoniewska H. Antibiotic susceptibility analysis of Enterococcus spp. isolated from urine. Przegl Lek 2004; 61(5): 473-6.
• 23. Meena S, Mohapatra S, Sood S, Dhawan B, Das B.K, Kapil A. Revisiting Nitrofurantoin for Vancomycin Resistant Enterococci. Journal of Clinical and Diagnostic Research 2017; 11(6): 19-22.