Year 2020, Volume 15 , Issue 1, Pages 9 - 22 2020-05-31

Experimental and Theoretical Analysis of Structural and Electronic Properties of Bis [2- (methylamino) troponato]copper (II) Molecule
Bis[2-(metilamino)troponato]bakır(II) Molekülünün Yapısal ve Elektronik Özelliklerinin Deneysel ve Kuramsal Analizleri

Serap UZUN [1] , Zeynep DEMİRCİOĞLU [2]


The molecular, electronic and chemical structure of the Bis[2-(methylamino)troponato]copper(II) molecule was clarified. It is aimed to determine the local and global chemical activity parameters and electrophilic and nucleophilic nature by computational chemistry method of density functional theory of the molecule which can not be obtained experimentally. In addition, the tendency of the studied molecule to be an optical material has been investigated. Stabilization energy of the structure, conjugate interactions, stabilization of orbital orbitals, hybridization percentages and transition states were examined by natutal bond orbital analysis.

Bis[2-(metilamino)troponato]bakır(II) molekülünün moleküler, elektronik ve kimyasal yapısı incelendi. Hesaplamalı kimya yöntemlerinden yoğunluk fonksiyonel kuramı kullanılarak molekülün deneysel olarak elde edilemeyen lokal ve global kimyasal aktivite parametreleri ve elektrofilik ve nükleofilik doğasının belirlenmesi amaçlandı. Bunun yanı sıra çalışılan molelükün optik bir materyal olma eğilimi incelenmiştir. Yapının kararlılık enerjisi, konjüge etkileşimler, yörünge orbitallerinin stabilizasyonu, hibritleşme yüzdeleri ve geçiş durumları incelendi.

  • [1] G. Steyl, T.J. Muller and A. Roodt, “Bis[2-(methylamino)troponato]copper(II),” Acta Cryst., E66, m1508, 2010.
  • [2] Y.-C. Liang, M.-C.,Hong, R. Cao, and Q. Shi, “Bis(pyridine-2,4-dicarboxylato)copper(II) dihydrate,” Acta Cryst. E57, m380–m381, 2001.
  • [3] Z. A. Starikova and E. A. Shugam, “Crystal chemical data for inner complexes of β-diketones,” Zh. Strukt. Khim., 10, 290–293, 1969.
  • [4] M. P. Byrn, C. J. Curtis, Y.Hsiou, S.I. Khan, P.A. Sawin, S.K. Tendick, A. Terzis, C.E. Strouse, J. Am. Chem. Soc., “Porphyrin sponges: Conservation of host structure in over 200 porphyrin-based lattice clathrates,” 115, 9480–9497, 1993.
  • [5] K. H. Park and W.J. Marshall, “Routes to N,N′-unsymmetrically substituted 1,3-diketimines,” J. Am. Chem. Soc., 127, 9330–9331, 2005.
  • [6] I. A. Baidina, P. A. Stabnikov, A. D. Vasil’ev, S. A. Gromilov, and I. K. Igumenov, “Crystal and molecular structure of copper(II)trans-bis-(2-(methylimino)-4-pentanonate),” Zh. Strukt. Khim., 45, 671-677, 2004.
  • [7] GaussView, Version 5, R. Dennington, T. Keith and J. Millam, Semichem Inc., Shawnee Mission KS, 2009.
  • [8] M.J. Frisch, G.W. Trucks, H.B. Schlegel, G.E. Scuseria, M.A. Robb, J.R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci, G.A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Caricato, X. Li, H.P. Hratchian, A.F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J.L. Sonnenberg, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, J.A. MontgomeryJr., J.E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J.J. Heyd, E. Brothers, K.N. Kudin, V.N. Staroverov, R. Kobayashi, J. Normand, K. Raghavachari, A. Rendell, J.C. Burant, S.S. Iyengar, J. Tomasi, M. Cossi, N. Rega, J.M. Millam, M. Klene, J.E. Knox, J.B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R.E. Stratmann, O. Yazyev, A.J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J.W. Ochterski, R.L. Martin, K. Morokuma, V.G. Zakrzewski, G.A. Voth, P. Salvador, J.J. Dannenberg, S. Dapprich, A.D. Daniels, O. Farkas, J.B. Foresman, J.V. Ortiz, J. Cioslowski, and D.J. Fox, Gaussian 09W, Revision E.01, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2009.
  • [9] D. J. G. S. K. Wolff, J. J. McKinnon, M. J. Turner, D. Jayatilaka, and M. A. Spackman, CrystalExplorer, 2012, Version3.1.
  • [10] B.-Y. Zhang, Q. Yang, and J.-J. Nie, “ Bis(pyrimidine-2-carboxyl¬ato-Ќ2N,O)copper(II),” Acta Cryst. E64, m7, 2008.
  • [11] T. N. Hill and G. Steyl, “ Dicarbon¬yl[2-hydr¬¬oxy-3,5,7-tris¬¬(mor¬pho¬lino¬methyl)cyclo¬hepta-2,4,6-trien¬onato(1–)-κ2O1,O2]rhodium(I),” Acta Cryst., E64, m1580–m1581, 2008.
  • [12] O. Kristiansson, “Bis¬(pyrazine-2-carbox¬amide)¬bis¬¬(tri¬fluoro¬methane¬sulfonato)copper(II) monohydrate,” Acta Cryst., E58, m130–m132, 2002.
  • [13] K. Bahgat and S. Fraihat, “Normal coordinateanalysis, molecularstructure, vibrational, electronicspectraand NMR investigation of 4-amino-3-phenyl-1H-1,2,4-triazole-5(4H)-thionebyab initio HF and DFT method,” Spectrochim. Acta A, 135, 1145-1155, 2015.
  • [14] Ş. Toprak, H. Tanak, M. Macit, N. Dege, and M. Orbay, “Experimental and theoretical studies of bis[(E)-1-((3-chloro-4-methylphenylimino)methyl)naphthalen-2-olate-N,O]copper(II),” J. Mol. Struct., 1174, 184-191, 2018.
  • [15] Ch. Himasekar1, S. Mustafa, and M. S. Babu, “Synthesis, characterization of mixed Cu(II) Pyridyl Tetrazoles and 1,10-Phenanthroline complexes - DFT and biological activity,” Open Chemistry Journal, 6, 1-7, 2019.
  • [16] R. S. Mulliken, “Electronic population analysis on LCAO-MO molecular wave functions. I.’’,J.Chem.Phys., 23(10), 1833-1840, 1955.
  • [17] R.S.J Mulliken, “Electronic Population Analysis on LCAO–MO MolecularWaveFunctions”, Chem. Phys.. 23, 1833-1840, 1955.
  • [18] W. Yang and R. G. Parr, “Hardness, softness, and the fukui function in the electronic theory of metals and catalysis,” Proc. Natl. Acad. Sci., 82, 6723-6726, 1985.
  • [19] H. S. Nalwa and S. Miyata, Non-linear Optics of Organic Molecules and Polymers. CRC Press, Boca Raton, FL, 611, 1997.
  • [20] A. Hinchliffe and M. H .J. Soscun, “ Ab initio studies of the dipole polarizabilities of conjugated molecules. Part 2. Monocyclic azines,” J. Mol. Struct., 110 (2), 109-120, 1994.
  • [21] S. Eskikanbur, K. Sayin, M. Kose, H. Zengin, V. McKee, and M. Kurtoglu, “Synthesis of two new azo-azomethines; spectral characterization, crystal structures, computational and fluorescence studies,” J. Mol. Struct. 1094, 183-194, 2015.
  • [22] Z. Demircioğlu, C. C. Ersanlı, G. Kaya Kantar, and S. Şaşmaz, “ Spectroscopic, Hirshfeld surface, X-ray diffraction methodologies and local & global chemical activity calculations of 5-(2-methoxy-4-(prop-1-en-1-yl)phenoxy)pyrazine-2,3-dicarbonitrile”, J. Mol. Struct.,1181, 25-37, 2019.
  • [23] A. E. Reed and F. Weinhold, “Natural bond orbital analysis of near‐Hartree-Fockwaterdimer,” J. Chem. Phys., 78, 4066-4073, 1983.
  • [24] A. E. Reed and F. Weinhold, “Natural localized molecular orbitals,” J. Chem. Phys,. 83, 1736-1740, 1985.
  • [25] T. Samanta, L. Dey, J. Dinda, S.K. Chattopadhyay, and S.K. Seth, “Structural characterization and Hirshfeld surface analysis of a CoIIcomplexwithimidazo[1,2-a]pyridine,” J. Mol. Struct., 1068, 58-70, 2014.
Primary Language tr
Subjects Physics, Applied
Journal Section Makaleler
Authors

Orcid: 0000-0002-2982-8376
Author: Serap UZUN (Primary Author)
Institution: SAMSUN ÜNİVERSİTESİ
Country: Turkey


Orcid: 0000-0001-9538-9140
Author: Zeynep DEMİRCİOĞLU
Institution: SİNOP ÜNİVERSİTESİ
Country: Turkey


Dates

Publication Date : May 31, 2020

Bibtex @research article { sdufeffd622153, journal = {Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Fen Dergisi}, issn = {}, eissn = {1306-7575}, address = {}, publisher = {Süleyman Demirel University}, year = {2020}, volume = {15}, pages = {9 - 22}, doi = {10.29233/sdufeffd.622153}, title = {Bis[2-(metilamino)troponato]bakır(II) Molekülünün Yapısal ve Elektronik Özelliklerinin Deneysel ve Kuramsal Analizleri}, key = {cite}, author = {Uzun, Serap and Demi̇rci̇oğlu, Zeynep} }
APA Uzun, S , Demi̇rci̇oğlu, Z . (2020). Bis[2-(metilamino)troponato]bakır(II) Molekülünün Yapısal ve Elektronik Özelliklerinin Deneysel ve Kuramsal Analizleri . Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Fen Dergisi , 15 (1) , 9-22 . DOI: 10.29233/sdufeffd.622153
MLA Uzun, S , Demi̇rci̇oğlu, Z . "Bis[2-(metilamino)troponato]bakır(II) Molekülünün Yapısal ve Elektronik Özelliklerinin Deneysel ve Kuramsal Analizleri" . Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Fen Dergisi 15 (2020 ): 9-22 <https://dergipark.org.tr/en/pub/sdufeffd/issue/54573/622153>
Chicago Uzun, S , Demi̇rci̇oğlu, Z . "Bis[2-(metilamino)troponato]bakır(II) Molekülünün Yapısal ve Elektronik Özelliklerinin Deneysel ve Kuramsal Analizleri". Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Fen Dergisi 15 (2020 ): 9-22
RIS TY - JOUR T1 - Bis[2-(metilamino)troponato]bakır(II) Molekülünün Yapısal ve Elektronik Özelliklerinin Deneysel ve Kuramsal Analizleri AU - Serap Uzun , Zeynep Demi̇rci̇oğlu Y1 - 2020 PY - 2020 N1 - doi: 10.29233/sdufeffd.622153 DO - 10.29233/sdufeffd.622153 T2 - Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Fen Dergisi JF - Journal JO - JOR SP - 9 EP - 22 VL - 15 IS - 1 SN - -1306-7575 M3 - doi: 10.29233/sdufeffd.622153 UR - https://doi.org/10.29233/sdufeffd.622153 Y2 - 2020 ER -
EndNote %0 Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Fen Dergisi Bis[2-(metilamino)troponato]bakır(II) Molekülünün Yapısal ve Elektronik Özelliklerinin Deneysel ve Kuramsal Analizleri %A Serap Uzun , Zeynep Demi̇rci̇oğlu %T Bis[2-(metilamino)troponato]bakır(II) Molekülünün Yapısal ve Elektronik Özelliklerinin Deneysel ve Kuramsal Analizleri %D 2020 %J Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Fen Dergisi %P -1306-7575 %V 15 %N 1 %R doi: 10.29233/sdufeffd.622153 %U 10.29233/sdufeffd.622153
ISNAD Uzun, Serap , Demi̇rci̇oğlu, Zeynep . "Bis[2-(metilamino)troponato]bakır(II) Molekülünün Yapısal ve Elektronik Özelliklerinin Deneysel ve Kuramsal Analizleri". Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Fen Dergisi 15 / 1 (May 2020): 9-22 . https://doi.org/10.29233/sdufeffd.622153
AMA Uzun S , Demi̇rci̇oğlu Z . Bis[2-(metilamino)troponato]bakır(II) Molekülünün Yapısal ve Elektronik Özelliklerinin Deneysel ve Kuramsal Analizleri. SDÜFEFFD. 2020; 15(1): 9-22.
Vancouver Uzun S , Demi̇rci̇oğlu Z . Bis[2-(metilamino)troponato]bakır(II) Molekülünün Yapısal ve Elektronik Özelliklerinin Deneysel ve Kuramsal Analizleri. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Fen Dergisi. 2020; 15(1): 9-22.