The Identification of Turkish Honey Bee Populations Inferred From Mitochondrial DNA Cytochrome C Oxidase I and Cytochrome C Oxidase II Intergenic Region (COI-COII Intergenic Region)

Year 2008, Volume: 22 Issue: 45, 46 - 51, 25.08.2008

Fulya Özdil Mehmet Ali Yıldız

Abstract

In this study, the identification of Turkish honey bee populations was carried out using cytochrome C oxidase I and II intergenic region of mitochondrial genome. A total of 244 worker bees from 20 different locations in Turkey were used. Restriction fragment length polymorphism (RFLP) and DNA sequence data were utilized to identify the honeybee populations. DraI digestion of the COI-COII intergenic region generated four fragments. In this study, DraI digestion of the COI-COII intergenic region gave rise to a total of five DraI haplotypes which have been accurately identified from DNA sequence results. Three of the DraI haplotypes (47/41/64/420 bp-C1; 47/40/64/420 bp-C2 and 47/39/64/420 bp) have been reported in other papers but two of them (47/41/64/419 bp and 47/39/64/418 bp) were first seen in this study. DraI digestion of the COI-COII intergenic region generated four fragments in Turkish honeybees which previously have been found to be characteristic of the C lineage an these results confirmed that Turkish honey bee populations belong to East European and Mediterranean (C) lineage.

Keywords

Apis mellifera L., mtDNA, COI-COII intergenic region, PCR-RFLP, DNA sequence analysis

Mitokondriyel DNA Sitokrom C Oksidaz I İle II Arasındaki İntergenik Bölge (COI-COII İntergenik Bölge) Bakımından Türkiye Bal Arısı Populasyonlarının Tanımlanması

Abstract

Bu araştırmada, Türkiye bal arısı populasyonları mitokondriyel genomda sitokrom C oksidaz I ile II arasındaki in-tergenik bölge bakımından tanımlanmıştır. Türkiye’nin 20 farklı yöresinden toplam 244 adet işçi arı örneği materyal olarak kullanılmış ve bal arısı populasyonlarının tanımlanmasında restriksiyon parça uzunluk polimorfizmi (RFLP) ve DNA dizi analizi yöntemlerinden yararlanılmıştır. COI-COII intergenik bölgenin DraI restriksiyon enzimi ile kesimi sonucu 4 banttan oluşan kesim modeli elde edilmiş ve Türkiye bal arılarında 5 haplotip belirlenmiştir. Bu haplotipler DNA dizi analizi sonuçları ile kesin bir şekilde belirlenmiştir. Bunlardan üçü (47/41/64/420 bç-C1; 47/40/64/420 bç-C2 ve 47/39/64/420 bç) daha önceki çalışmalarda bildirilmiş, diğer ikisi ise (47/41/64/419 bç ve 47/39/64/418 bç) ilk kez bu çalışma ile ortaya konmuştur. Çalışılan tüm örneklerde Dra restriksiyon enzimi ile kesim sonucu literatürde C genetik soyu için bildirilen ve 4 banttan oluşan kesim model elde edilmiş ve bu sonuçla Türkiye bal arısı populasyonlarının Doğu Avrupa ve Akdeniz (C) genetik soyu içerisinde yer aldığı belirlenmiştir.

Keywords

Apis mellifera L., mtDNA, COI-COII intergenik bölge, PCR-RFLP, DNA dizi analizi