Kan kültürlerinde izole edilen mikroorganizmalar ve antimikrobiyal duyarlılık paternlerinin son beş yıldaki değişimi

Year 2019, Volume: 76 Issue: 3, 231 - 242, 01.09.2019

Tuba Müderris Süreyya Gül Yurtsever Nurten Baran Rahim Özdemir Hakan Er Serdar Güngör Ayşegül Aksoy Gökmen Selçuk Kaya

Abstract

Amaç: Kan kültürlerinde üreyen bakterilerin neden olduğu enfeksiyonlar, yüksek morbidite ve mortaliteye neden olan önemli tıbbi problemlerdir. Bu çalışmanın amacı, beş yıllık süreçte çeşitli kliniklerden gelen kan örneklerinden izole edilen bakteriler ve antibiyotik duyarlılıklarının irdelenmesi ve hastanemizde dolaşım sistemi enfeksiyonlarında ampirik tedavide seçilebilecek antimikrobiyallerin belirlenmesidir. Escherichia coli %18,6 olarak saptanmıştır. S. aureus ve koagülaz negatif stafilokoklarda KNS glikopeptid ve linezolid direncine rastlanmamıştır. Enterokoklarda vankomisin ve teikoplanin direnci %9,7 olarak saptanırken linezolid direnci %2 olarak belirlenmiştir. Genişlemiş spektrumlu beta laktamaz üretimi E. coli izolatlarında %46,7 ve Klebsiella pneumoniae izolatlarında %63,4 olup E. coli izolatlarında ise son üç yılda artmıştır. Yıllar içerisinde S. aureus ve KNS izolatlarında trimetoprim-sulfametoksazol direncinde azalma saptanmasına rağmen E. coli ve K. pneumoniae izolatlarında netilmisin; Pseudomonas aeruginosa izolatlarında ise aztreonam, imipenem ve meropenem direnç oranlarının arttığı belirlenmiştir. Çalışmamızda en etkili antimikrobiyallerin; stafilokok ve enterokoklarda linezolid ve glikopeptidler, E. coli izolatlarında karbapenemler ve amikasin, K. pneumoniae, Acinetobacter baumannii ve P. aeruginosa izolatlarında ise kolistin olduğu saptanmıştır.Sonuç: Kan kültürlerinden izole edilen bakterilerin çeşitliliği ve antibiyotiklere olan duyarlılıkları, coğrafik bölgelere, hastane florasına ve hastanede kullanılan antimikrobiyallere göre değişiklik göstermektedir. Bu nedenle her hastanenin belli aralıklarla kendi bakteriyel dağılımını ve antibiyotik duyarlılıklarını saptayarak akılcı ilaç kullanım politikalarını belirlemesinin dirençli mikroorganizmalarla mücadelede fayda sağlayacağı kanaatine varılmıştır

Keywords

Kan kültürü, antimikrobiyal duyarlılık, ampirik tedavi

Microorganisms isolated from blood cultures and the change of their antimicrobial susceptibility patterns in the last five years

Abstract

Objective: Infections caused by bacteria growing in blood cultures are important medical problems that cause high morbidity and mortality. The aim of this study is to examine the changes in antibiotic susceptibility and the bacteria isolated from blood samples from various clinics in the five-year period and to determine the antimicrobials that can be chosen in empirical treatment in blood stream infection in our hospital.Methods: Blood samples from our laboratories were evaluated retrospectively between during 20132017. Samples were incubated in an automated system of BACTEC-FX BD,USA . Conventional methods and automated systems Phoenix,BD,USA have been used to identify bacteria. Antibiotic susceptibilities of isolated bacteria were evaluated using the automated systems Phoenix,BD,USA .Results: A total of 4597 bacterial reproductions that isolated from the blood samples including 1972 42.9% gram positive and 2625 57.1% gram negative were included in the study. The most frequently isolated gram positive bacteria were Staphylococcus aureus 15.3% and the gram negative bacteria were

Keywords

Blood culture, antimicrobial susceptibility, empirical treatment

References

• 1. Er H, Aşık G, Yoldaş Ö, Demir C, Keşli R. Kan Kültürlerinde İzole Edilerek Tanımlanan Mikroorganizmaların ve Antibiyotik Direnç Oranlarının Belirlenmesi. T Mikrob Cem Derg 2015; 45(1): 48-54.
• 2. Çopur-Çiçek A, Şentürk-Köksal Z, Ertürk A, Köksal E. Rize 82. Yıl Devlet Hastanesi’nde bir yıllık sürede kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotiklere duyarlılıkları. Turk Hij Den Biyol Derg 2011; 68(4): 175-84.
• 3. Loonen AJ, Wolffs PF, Bruggeman CA, van den Brule AJ. Developments for improved diagnosis of bacterial bloodstream infections. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2014; 33(10): 1687-702.
• 4. Mushtaq A, Chen DJ, Strand GJ, Dylla BL, Cole NC, Mandrekar J et al. Clinical significance of coryneform Gram-positive rods from blood identified by MALDITOF mass spectrometry and their susceptibility profiles - a retrospective chart review. Diagn Microbiol Infect Dis 2016; 85(3): 372-6.
• 5. Johnstone J, Chen C, Rosella L, Adomako K, Policarpio ME, Lam F et al. Patient- and hospital-level predictors of vancomycin-resistant Enterococcus (VRE) bacteremia in Ontario, Canada. Am J Infect Control 2018; pii: S0196-6553(18)30576-5.
• 6. Ulusan-Gündoğdu DZ, Çopur-Çiçek A, Mutlu MA, Koçyiğit S. Kan Kültürlerinden İzole Edilen Gram Negatif Çomaklar ve Antibiyotik Duyarlılıkları. Eur J Health Sci 2015; 1(2): 58-62.
• 7. Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance standards for antimicrobial susceptibility testing, Twenty- third informational supplement, M100-S23, CLSI, Wayne, PA 2013.
• 8. The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST). Son erişim tarihi: 28.09.2018. Available from: http://www.eucast. org/clinical_breakpoints/.
• 9. Rello J, Valenzuela-Sánchez F, Ruiz-Rodriguez M, Moyano S. Sepsis: A Review of Advances in Management. Adv Ther 2017; 34(11): 2393-411.
• 10. Altınöz Aytar A, Öksüz Ş, Şahin İ, Öztürk CE, Avcıoğlu F. Kan kültürlerinden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarında antibiyotiklere direnç. ANKEM Derg 2013; 27(2): 60-3.
• 11. Turhanoglu M, Koyuncu E, Bayındır Bilman F, Onur A, Tekay F. Evaluation of the Results Obtained from Microbiological Analysis of Blood Cultures over 5 Years. Journal of Family Medicine and Health Care 2016; 2(4): 43-50.
• 12. Duman Y, Kuzucu Ç, Çuğlan S. Kan kültürlerinden izole edilen bakteriler ve antimikrobiyal duyarlılıkları. Erciyes Tıp Derg 2011; 33(3): 189-96.
• 13. Çetin F, Mumcuoğlu İ, Aksoy A, Gürkan Y, Aksu N. Kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antimikrobiyal duyarlılıkları. Turk Hij Den Biyol Derg 2014; 71(2): 67-74.
• 14. Şahin İ, Çalışkan E, Öztürk E, Yavuz MT, Albayrak Türkmen H, Karadağ G ve ark. Kan Kültürlerinden İzole Edilen Mikroorganizmaların Dağılımı ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları. Düzce Tıp Derg 2013; 15(2): 11-4.
• 15. Ece G. The Evaluation of the Distribution and Antimicrobial Susceptibility Profile of the Strains Isolated from Blood Cultures. Med Bull Haseki 2013; 51: 151-6.
• 16. Willke A, Azak E. Reproductive microorganisms from blood cultures and antibiotic sensitivity: Three-Year Results. ANKEM Derg 2011; 25 (Ek 1).
• 17. Papadimitriou-Olivgeri I, Giormezis N, Papadimitriou-Olivgeris M, Zotou A, Kolonitsiou F, Koutsileou K et al. Number of positive blood cultures, biofilm formation, and adhesin genes in differentiating true coagulase-negative staphylococci bacteremia from contamination. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2016; 35(1): 57-66.
• 18. Rahkonen M, Luttinen S, Koskela M, Hautala T. True bacteremias caused by coagulase negative Staphylococcus are difficult to distinguish from blood culture contaminants. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2012; 31(10): 2639–44.
• 19. Wasihun AG, Wlekidan LN, Gebremariam SA, Dejene TA, Welderufael AL, Haile TD et al. Bacteriological profile and antimicrobial susceptibility patterns of blood culture isolates among febrile patients in Mekelle Hospital, Northern Ethiopia. Springerplus 2015; 4: 314-7.
• 20. Rhee Y, Aroutcheva A, Hota B, Weinstein RA, Popovich KJ. Evolving Epidemiology of Staphylococcus aureus Bacteremia. Infect Control Hosp Epidemiol 2015; 36: 1417-1422.
• 21. Güngör S, Karaayak Uzun B, Gül Yurtsever S, Baran N. Kan kültürlerinden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarında antibiyotiklere direnç. ANKEM Derg 2012; 26(4): 171-5.
• 22. Raza T, Ullah SR, Mehmood K, Andleeb S. Vancomycin resistant Enterococci: A brief review. J Pak Med Assoc 2018; 68(5): 768-72.
• 23. Abdallah HM, Reuland EA, Wintermans BB, Al Naiemi N, Koek A, Abdelwahab AM et al. ExtendedSpectrum β-Lactamase- and CarbapenemaseProducing Enterobacteriaceae Isolated from Egyptian Patients with Suspected Blood Stream Infection. PLoS One 2015; 10(5): e0128120.
• 24. Kirişci Ö, Özkaya E, Çalışkan A, Özden S, AlkışKoçtürk S. Klinik örneklerden izole edilen Acinetobacter türlerinde direnç profilinin incelenmesi. ANKEM Derg 2013; 27(3): 140-6.
• 25. Wang Y, Lei H, Zhang Y, Yang Q, Wang Y, Wang J et al. Epidemiology of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae bloodstream infections after renal transplantation from donation after cardiac death in a Chinese hospital: a case series analysis. Antimicrob Resist Infect Control 2018; 7: 66.
• 26. Mitgang EA, Hartley DM, Malchione MD, Koch M, Goodman JL. Review and Mapping of Carbapenemresistant Enterobacteriaceae in Africa: Using Diverse Data to Inform Surveillance Gaps. Int J Antimicrob Agents 2018; pii: S0924-8579(18)30157-2.
• 27. Corbella M, Mariani B, Ferrari C, Comandatore F, Scaltriti E, Marone P et al. Three cases of mcr1-positive colistin-resistant Escherichia coli bloodstream infections in Italy, August 2016 to January 2017. Euro Surveill 2017; 22(16).
• 28. Tansarli GS, Papaparaskevas J, Balaska M, Samarkos M, Pantazatou A, Markogiannakis A et al. Colistin resistance in carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae bloodstream isolates: evolution over 15 years and temporal association with colistin use by time series analysis. Int J Antimicrob Agents 2018; pii: S0924-8579(18)30179-1.
• 29. Eiamphungporn W, Yainoy S, Jumderm C, TanArsuwongkul R, Tiengrim S, Thamlikitkul V. Prevalence of colistin resistance gene mcr1 in colistin-resistant Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolated from humans in Thailand. J Glob Antimicrob Resist 2018; pii:S2213-7165(18)30117-6.