@article{article_1265800, title={Eber Gölü Prokaryotik Çeşitliliğinin Metagenomik Çalışmasıyla Karakterizasyonu}, journal={Journal of the Institute of Science and Technology}, volume={14}, pages={437–446}, year={2024}, DOI={10.21597/jist.1265800}, author={Pat, Fahri and Fidan Pedük, Sultan and Akçay, Neşe and Kızıl Pat, Hatice Kübra and Arıcan, Ercan}, keywords={Prokaryotik çeşitlilik, metagenomik, ekoloji, 16s rRNA, İllumina dizileme}, abstract={Eber Gölü, Türkiye’de göçmen kuşların geçiş rotası üzerinde yer almakta ve sazlık alanları sayesinde birçok kuş türüne doğal üreme ve yaşam alanı sağlamaktadır. Ülkemizde bu kadar önemli bir göl olmasına rağmen prokaryotik çeşitlilik konusunda yeterli çalışma olmadığı görülmüştür. Metagenomik analiz DNA izolasyonu ile elde edilen mikroorganizmaların türlerini, genetik yapılarını, fonksiyonel rollerini ve insan ile ekolojik sağlık üzerindeki etkilerini belirlemeyi mümkün kılmaktadır. Yeni nesil dizileme (YND), birçok DNA veya RNA örneğinin eşzamanlı olarak yüksek hızda ve yüksek hassasiyetle dizilenmesini mümkün kılan, modern bir DNA/RNA dizileme teknolojisidir. Bu çalışmamızda Eber Gölü’ne ait 16S ribozomal DNA (rDNA) (V3-V4 bölgeleri) dizilerinin metagenomik analizi için yüksek verimli YND yöntemleri kullanılmıştır. Prokaryotik çeşitliliği incelemek amacıyla MOTHUR yazılımı kullanılarak Illumina NovaSeq teknolojisi ile elde edilen dizi verileri analiz edilmiştir. Analizler sonucu Proteobacteria, Verrucomicrobia, Bacteroidetes ve Actinobacteria Şubelerinin baskın olduğu ortaya çıkarılarak Eber Gölü’ndeki prokaryotik çeşitlilik detaylı bir şekilde karakterize edilmiştir.}, number={1}, publisher={Iğdır Üniversitesi}, organization={İstanbul Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi}