TY  - JOUR
TT  - Biber genotiplerinin genetik çeşitliliklerinin srap markörleri kullanılarak belirlenmesi
AU  - Bozkalfa, M.Kadri
AU  - Kaygısız Aşcıoğlu, Tansel
AU  - Eşiyok, Dursun
PY  - 2017
DA  - October
Y2  - 2017
DO  - 10.7161/omuanajas.284511
JF  - Anadolu Tarım Bilimleri Dergisi
JO  - ANAJAS
PB  - Ondokuz Mayıs Üniversitesi
WT  - DergiPark
SN  - 1308-8750
SP  - 321
EP  - 329
VL  - 32
IS  - 3
KW  - Breeding
KW  - Molecular characterization
KW  - Pepper
KW  - SRAP markers
KW  - Variability
N2  - Türkiyenin coğrafik konumu itibariyle ticaretyolları üzerinde yer alması biberin diğer ülkelere yayılmasında etkili olmuştur.Ülkemizde çok sayıda yerel populasyonlara ve ticari çeşitler biberyetiştiriciliğinde kullanılmaktadır. Biber ıslahının başarısı yüksek genetikçeşitliliğe sahip kaynakların varlığına, genetik materyalin özelliklerine veistenen özelliğe sahip kombinasyonların oluşturulmasına dayanmaktadır. Bitkiselmateryalin karekterizasyonu bu işlemin ilk adımını oluşturmaktadır. Buçalışmada kullanılan bitkisel materyalin kaynağını; 2004-2007 yılları arasındayürütülen, yerel biber genotiplerinin morfolojik ve agronomik özellikleryönünden karakterizasyonu amacıyla yürütülen çalışmadan sağlanan gen kaynağınıoluşturmaktadır. Morfolojik özellikleri tanımlanan bu gen havuzunun moleküleryöntemler ile karakterizasyonu amacıyla yürütülen bu projede ise toplam 94yerel biber genotipinin birbirlerine olan genetik uzaklıkları SRAP (Sequence related amplified polymorphism)markör sistemi kullanılarak belirlenmiştir. Elde edilen veriler istatistikiolarak değerlendirildiğinde incelenen genotiplerin yüksek düzeyde varyabilitiyesahip, büyük bir bölümünün genetik yönden uzak akraba olduğu ve dendogramdafarklı gruplarda yer aldığı görülmüştür. 33 SRAP markör kombinasyonukullanılarak yapılan moleküler analizler sonucunda varyasyonun %85’i 9 faktörgrubunda yer almış ve genotiplerin genetik uzaklıkları %62 ile %94 arasındadeğişmiştir. Bu sonuçlar ileride yürütülecek ıslah programlarında genotiplerindaha etkin kullanımına imkan sağlarken ıslah süresini büyük ölçüdekısaltacaktır.
CR  - Andrews, J. 1999. The pepper trail: history and recipes from around the world. Univ. North Texas Press, Denton, Tex.
CR  - Aktaş, H., Abak, K., Şensoy, S. 2009: Genetic diversity in some Turkish pepper (Capsicum annum L.) genotypes revealed by AFLP analysis. Afr. J. Biotechnol. 8(18):.4378-7386.
CR  - Apuya, N.R., Frazier, B.L., Keim, P., Jillroth, E., Lark, K.G. 1988. Restriction fragment length polymorphisms as genetic markers in soybean, Glycine max (L.) Merill. Theor. Appl. Genet. 75: 889–901.
CR  - Bozokalfa, M.K., Eşiyok, D. 2011. Evaluation of morphological and agronomical characterization of Turkish pepper accessions. Int. J. Veg. Sci. 17: 115-135.
CR  - Bozokalfa, M.K., Eşiyok, D., Turhan, K. 2009. Patterns of phenotypic variation in a germplasm collection of pepper (Capsicum annuum L.) from Turkey. Span. J. Agric. Res. 7: 83-95.
CR  - Budak, H., Shearman, R.C., Parmaksiz I., Gaussoin, R.E., Riordan T.P., Dweikat I. 2004. Molecular characterization of buffalograss germplasm using sequence-related amplified polymorphism markers. Theor. Appl. Genet. 108: 328-334.
CR  - Dias, J.S., Lima, M.B., Song, K.M., Monterio, A.A., Williams, P.H., Osborn, T.C. 1992. Molecular taxonomy of portuguese tronchuda cabbage and kale landraces using nuclear RFLPs. Euphytica 58: 221–229.
CR  - Dias, J.S., Monterio, A.A., Lima, M.B. 1993. Numerical taxonomy of portuguese tronchuda cabbage and galega kale landraces using morphological characters. Euphytica 69: 51–68.
CR  - Doyle, J.J., Doyle, J.L. 1990. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus 12: 13-15.
CR  - Ender, M., Terpstra K., Kelly, J.D. 2008. Marker-assisted selection for white mold resistance in common bean. Mol. Breed. 21: 149-157.
CR  - Eşiyok, D. 2012. Kışlık ve yazlık sebze yetiştiriciliği. Meta Basım, 404 s. Bornova/İzmir.
CR  - Ferriol, M., Pico, B., Nuez, F. 2003. Genetic diversity of a germplasm collection of Cucurbita pepo Using SRAP and AFLP Markers. Theor. Appl. Genet. 107: 271–282.
CR  - Figdore, S.S., Kennard, W.C., Song, K.M., Slocum, M.K., Osborn, T.C. 1988. Assessment of the degree of restriction length polymorphism in Brassica. Theor. Appl. Genet. 75:833–940.
CR  - Frary, A, Kegeli, M.A, Okmen B, Sigva H.O, Yemenicioglu, A., Doganlar, S. 2008. Water-soluble antioxidant potential of Turkish pepper cultivars. J. Am. Soc. Hortic. Sci. 43: 631-636
CR  - Geleta, L.F., Labuschagne, M.T., Viljoen, C.D. 2005. Genetic variability in pepper (Capsicum annuum L.) estimated by morphological data and amplified fragment lenth polymorphism markers. Biodivers. Conserv 14: 2361-2375.
CR  - Gepts, P., 1995. Genetic markers and core collections. ın core collections of plant genetic resources (Eds T. Hodgkin, A. H. D. Brown, Th. J. L. van Hintum & E. A. V. Morales), pp. 127–146. Chichester, UK: John Wiley & Sons.
CR  - Grisi, M.C., Blair, M.W., Gepts, P., Brondani, C., Pereira, P.A., Brondani, R.P. 2007. Genetic mapping of a new set of microsatellite markers in a reference common bean (Phaseolus vulgaris) population BAT93 x Jalo EEP558. Gen. Mol. Res. 30: 691-706.
CR  - Gulsen, O., Shearman, R.C., Heng-Moss, T.M., Mutlu, N., Lee, D.J., Sarath, G. 2007. Peroxidase gene polymorphism in buffalograss and other grasses. Crop Sci. 47: 767-772.
CR  - Haussmann, B.I.G, Parzies, H.K. Presterl T, Susic, Z., Miedaner, T. 2004 Plant genetic resources in crop improvement. Plant Genet Resour-C 2: 3–21.
CR  - Keleş, D., Özgen, Ş., Saraçoğlu, O., Ata, A., Özgen, M. 2016. Antioksidant potential of turkish pepper (Capsium annuum L.) genotypes at two different maturity stage. Turk. J. Agric. For. 40: 542-551.
CR  - Koutita, O., Tertivanidis, K., Koutsos, T.V., Koutsika-Sotiriou, M., Skaracisi, G.N..2005. Genetic diversity in four cabbage populations based on random amplified polymorphic DNA markers. J. Agric. Sci. 143: 377–384.
CR  - Lefebvre, V., Palloix, A., Rives, M. 1993. Nuclear RFLP between pepper cultivars (Capsicum annuum L.). Euphytica 71: 189–199.
CR  - Li, G., Quiros, C.F. 2001. Sequence-related amplified polymorphism (SRAP), a new marker system based on a simple PCR reaction: its application to mapping and gene tagging in brassica. Theor. Appl. Genet. 103: 455–461.
CR  - Long, Y., Shi, J., Qiu, D., Li, R., Zhang, C., Wang, J., Hou, J., Zhao, J., Shi, L., Beom-Seok, P., Choi, S.R., Lim, Y.P., Meng, J. 2007. Flowering time quantitative trait loci analysis of oilseed brassica in multiple environments and genomewide alignment with arabidopsis. Genetics 17(4): 2433-2444.
CR  - Miller, J.C., Tanksley, S.D. 1989. RFLP analysis of polygenetic relationships and genetic variation in the genus lycopersicon. Theor. Appl. Genet. 80: 437–448.
CR  - Mohammadi, S.A. Prassanna, B.M. 2003. Analysis of genetic diversity in crop plants-salient statistical tools and considerations, Crop Sci. 43: 1235–1248.
CR  - Nsabiyera, V., Logose, M., Ochwo-Ssemakula, M., Sseruwagi, P., Gibson, P., Ojiewo, C. 2013. Morphological characterization of local and exotic hot pepper (Capsicum annuum L.) collections in Uganda. Biorem. Biodiv Bioavail 7(1): 22-32.
CR  - Papa, R., Gepts, P. 2003. Asymmetry of gene flow and differential geographical structure of molecular diversity in wild and domesticated common bean (Phaseolus vulgaris L.) from mesoamerica. Theor. Appl. Genet. 106(2): 239-250.
CR  - Smith, J.S.C., Smith, O.S. 1989. The description and assessment of distances between ınbred lines of maize: the utility of morphological, biochemical and genetic descriptors and a scheme for the testing of distinctiveness between ınbred lines. Maydica 34: 151-161.
CR  - Souza, E., Sorrells, M.E. 1991. Genetic relationships among 70 north american oat cultivars, ı: cluster analysis using quantitative morphological characters. Crop Sci. 31: 599-605.
CR  - Toquica S. P., Rodriguez, F., Martinez, E., Duque, M.C., Tohme, J. 2003. Molecular characterization by aflps of capsicum germplasm from the amazon department in colombia, characterization by AFLPs of Capsicum. Genet. Resour. Crop Evol. 50: 639–647.
UR  - https://doi.org/10.7161/omuanajas.284511
L1  - https://dergipark.org.tr/tr/download/article-file/349809
ER  -