@article{article_633776, title={Ordu ilinde bulunan Rubus (Rosaceae) türlerinin trnL-F gen bölgeleri ile filogenetik ilişkilerinin belirlenmesi}, journal={Akademik Ziraat Dergisi}, volume={9}, pages={223–228}, year={2020}, DOI={10.29278/azd.633776}, author={Eker, Seçil and Kolören, Onur}, keywords={DNA,gen bölgesi,haplotip,Karadeniz Bölgesi,Rubus spp.}, abstract={<p class="MsoNormal" style="margin-top:6pt;margin-right:0cm;margin-bottom:6pt;margin-left:0cm;text-align:justify;line-height:200%;"> <span lang="en-us" style="font-size:10pt;line-height:200%;font-family:Arial, sans-serif;" xml:lang="en-us">Bu çalışmada; Karadeniz Bölgesi Ordu ilinde yaygın olan <i>Rubus </i>yabancı ot türlerinin filogenetik
farklılıkları <i>trn </i>L-F gen bölgeleri
kullanılarak belirlenmeye çalışılmıştır. Ordu’nun farklı noktalarından 24 adet <i>Rubus </i>spp. örneği survey yapılmıştır. Örneklerden
DNA izole etme aşamasında protokol Haymes (1996) uyarlanarak kullanılmıştır. Örneklerimizin <i>trn </i>L-F gen bölgesini belirlemek için,
GenBank’tan alınan referans diziler ile çalışmamızda elde ettiğimiz sekans
dizileri karşılaştırılmıştr. MEGA6 paket programı yardımıyla genetik uzaklıklar
hesaplanmış ve filogeni ağaçlarının çizimi yapılmıştır. Örneklerden 6 Haplotip
sonucu çıkmıştır. Bunlar; Haplotip 1 (F3, P1, P3, P4, U1, U2, O2, O3, O4, CM1),
Haplotip 2 (F5), Haplotip 3 (P2), Haplotip 4 (P5), Haplotip 5 (S1, CM2, CM3),
Haplotip 6 (O1, CT1, CT2, CT3) örnekleri sırasıyla <i>R. sanctus </i>(EF055343), <i>R.
silvaticus </i>(KM036881), <i>R. divaricatus </i>(KM036924), <i>R. conothyrsoides </i>(KM036856), <i>R. capricollensis </i>(KM036923) ve <i>Rubus </i>sp. (KT581217)  ile %100 nükleotid dizisi benzerliğiyle akraba
olarak görülmüştür.  </span> </p> <p> </p>}, number={2}, publisher={Ordu Üniversitesi}