Distribution Of Microorganisms In Blood Culture And Antimicrobial Susceptiblity

Year 2013, Volume: 15 Issue: 2, 11 - 14, 01.07.2013

İdris Şahin Elif Öztürk M Tevfik Yavuz Hilal Türkmen Albayrak Gülkan Karadağ Asiye Altinöz Aytar Emel Çalışkan

Abstract

Purpose: In this study, the distribution of hospitalized patients and antimicrobial susceptibilityof microorganisms isolated from blood culture were investigated.Methods: Blood samples sent to our laboratory by taking Bactec 9050 automated blood culturemedia bottles (Becton Dickinson, USA) were incubated at 35 ° C and under normal atmosphericconditions. İdentification of microorganisms was used conventional methods and / or the APIidentification systems (bioMérieux, Etoile, Fransa). Kirby-Bauer Disk diffusion method and / orwas ATB STREP 5, ATB ENTEROC 5 (bioMérieux, Etoile, Fransa) performed for antibioticsusceptibility testing according the criteria of Clinical and Laboratory Standards Institute.Extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) production was investigated with disk diffusionscreening test in Gram-negative bacteria.Results: A total of 2,807 blood samples sent to our laboratory between July 2009 – 2010. 2,121(75%) patients of didn’t reproductive, 583 (21%) of the cases were positive, 103 (4%) of thecontamination was evaluated as an example. The most isolated pathogens, respectively, coagulasenegative staphylococci (CNS) (42.1%), Staphylococcus aureus (22%) and Escherichia coli (13%)were found. 54% KNS strains, 44 % S. aureus strains were resistant to methicillin. E. coli strainsof extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) prevalence of 14% and 21% of Klebsiella spp.strains were determined. İmipenem resistance in Pseudomonas aeruginosa strains were identifiedby 39%. The sensitivity of E. coli strains, 93% of amikacin, piperacillin-tazobactam 95%, thesensitivity of Klebsiella spp. strains, 100% of amikacin, piperacillin-tazobactam 93% weredetermined. The results of the study were examined by comparing with similar studies.Conclusion: As a result, the distribution of bacteria isolated from blood cultures and antimicrobialsusceptibility patterns vary among centers, each center, therefore, thought to be useful in theirassessment of the results at regular intervals

Keywords

Blood culture, CNS, S. aureus, E.coli, ESBL

Kan Kültürlerinden İzole Edilen Mikroorganizmaların Dağılımı ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları

Abstract

Amaç: Bu çalışmada, yatan hastaların kan kültürü örneklerinden izole edilen mikroorganizmalarındağılımının ve antimikrobiyal duyarlılıklarının araştırılması amaçlanmıştır.Yöntem: Laboratuarımıza Bactec 9050 otomatik kan kültür (Becton Dickinson, USA) besiyerişişelerine alınarak gönderilen kan örnekleri, normal atmosfer koşullarında, 35°C’de inkübeedilmiştir. Üreyen mikroorganizmaların identifikasyonunda, konvansiyonel yöntemler ve/veyaAPİ identifikasyon sistemleri(bioMérieux, Etoile, Fransa) kullanılmıştır. Tiplendirme sonrasındamikroorganizmaların antibiyotik duyarlılık testleri, Clinical Laboratory Standards Institute(CLSI)'nin önerilerine göre Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi ve/veya ATB STREP 5, ATBENTEROC 5 (bioMérieux, Etoile, Fransa) sistemleri ile yapılmıştır. Gram negatif bakterilerdeGSBL varlığının saptanmasında, disk difüzyon tarama testi kullanılmıştır.Bulgular: Temmuz 2009-2010 tarihleri arasında, laboratuarımıza toplam 2807 kan örneğigönderilmiştir. Örneklerin 2121 (%75)’inde üreme olmamışken, 583 (%21)’ünde üremesaptanmış, 103 (%4) örnek ise kontaminasyon olarak değerlendirilmiştir. En fazla izole edilenetkenler, sırasıyla koagülaz negatif stafilokok (KNS) (%42,1), Staphylococcus aureus (%22) veEscherichia coli ( %13) olarak tespit edilmiştir. Kültürlerde izole edilen KNS’lerin % 54’ü, S.aureus’ların ise %44’ü metisiline dirençli olarak bulunmuştur. Escherichia coli suşlarındagenişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) sıklığı %14, Klebsiella spp. suşlarında %21 olaraksaptanmışken, Pseudomonas aeruginosa suşlarında %39 oranında imipenem direnci tespitedilmiştir.Sonuç: Kan kültürlerinden izole edilen bakterilerin dağılımı ve antimikrobiyal duyarlılıklarınınmerkezler arasında değişebildiği, bu nedenle de her merkezin kendi sonuçlarını belli aralıklarladeğerlendirmesinin faydalı olacağı düşünülmüştür

Keywords

Kan kültürü, KNS, S. aureus, E.coli, GSBL

References

• Çiçek A, Kuzucu Ç, Durmaz B: Kan kültür sonuçlarının değerlendirilmesinde etkili olan faktörler, İnönü Üniversitesi Tıp Fakültesi Derg 2005;12: 277–80.
• Bilgehan H: Klinik Mikrobiyolojik Tanı. 4. basım, İzmir: Fakülteler Kitabevi, 2004: 317–28.
• Kinney KK: Treatment of infections caused by antimicrobial- resistant Gram-positive bacteria, Am J Med Sci 2010; 340: 209–17.
• Queenan AM, Foleno B, Gownley C, Wira E, Bush K: Effects of inoculum and β-lactamase activity in AmpC- and extended- spectrum β-lactamase (ESBL)- producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae clinical isolates tested by using NCCLS ESBL methodology, J Clin Microbiol 2004; 42: 269– 75.
• Susan E, Daniel J, Gary V: Determining the clinical significance of coagulase-negative staphylococci isolated from blood cultures, infection control and hospital epidemiology 2005 ;26: 559–66.
• Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) (Çeviri editörü D Gür). Antimikrobik Duyarlılık Testleri İçin Uygulama Standartları. Onsekizinci Bilgi Eki, Bilimsel Tıp Yayınevi, Ankara, 2008.
• Dündar V, Öztürk Dündar D: Stafilokok Enfeksiyonları, “Wilke Topçu A, Söyletir G, Doğanay M(ed): Enfeksiyon Hastalıkları ve Mikrobiyolojisi Etkenlere Göre Enfeksiyonlar 2” İstanbul: Nobel tıp kitabevi, 2008: 2065–77.
• Winn W, Allen S, Janda W “et al”: Koneman’s Color Atlas and Textbook of Diagnostic Microbiology. 6th ed. Philadelphia: JB Lippincott Co, 2006,98–9.
• Demir M, Kaleli İ, Cevahir N, Mete E, Şengül M: İki yıllık kan kültür sonuçlarının değerlendirilmesi, İnfeksiyon Derg 2003; 17: 297–300.
• Kaya S, Cicioğlu-Arıdoğan B, Çetin H, Demirci M: Çocuk hastalardan mikroorganizmalar ve antibiyotik dirençleri, Fırat Tıp Derg 2007;12::34–6. kültürlerinde üreyen
• Baysallar M, Üsküdar-Güçlü A, Şenses Z, Kaptan K, Ataergin S, Başustaoğlu AC: Febril nötropenik hastaların kan kültürlerinde bakteriyel spektrum ve antimikrobiyal duyarlılık profili, Gülhane Tıp Derg 2007;49.168–172.
• Adeyemi AI, Sulaiman AA, Solomon BB, Chinedu OA, Victor IA: Bacterial bloodstream infections in HIV-infected adults attending a Lagos Teaching Hospital, J Health Popul Nutr 2010; 28: 318–26.
• Sevim S, Öztürk Ş, Coşkuner A, Özgenç O, Avcı M: Bactec kan kültür sistemi İle izole edilen mikroorganizmaların değerlendirilmesi, İnfeksiyon Derg 2007; 21: 135–40.
• Yüce P, Demirdağ K, Kalkan A, Özden M, Denk A, Kılıç Ss: Kan kültürlerinde izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkları, ANKEM Derg 2005; 19: 17–21.
• Khan FY, Elshafie SS, Almaslamani M, Abu-Khattab M, El Hiday AH, Errayes M, Almaslamani E: Epidemiology of Bacteraemia in Hamad General Hospital, Qatar: A One Year Hospital-Based Study: Travel Med Infect Dis 2010 Nov 10.
• Pien BC, Sundaram P, Raoof N, Costa SF, Mirrett S, Woods CW, Reller LB, Weinstein MP: The clinical and prognostic importance of positive blood cultures in adults, Am J Med 2010; 123: 819–28.
• Doğan Ö, Yalınay-Çırak M, Engin D, Türet S: Klinik örneklerden izole edilen stafilokoklarda metisilin direnci ve çeşitli antibiyotiklere in-vitro duyarlılıkları, ANKEM Derg 2005;19: 39–42.
• Gürsoy Nc, Ersoy Y, Günal S, Kuzucu Ç: Kan kültürlerinden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarının antibiyotiklere direnç durumlarının değerlendirilmesi ANKEM Derg 2009;23: 26–29.
• Yiğit N, Aktaş AE, Doğruman-Al F, Ayyıldız A: Kan kültürlerinden izole edilen koagülaz negatif stafilokokların tiplendirilmesi ve metisilin direnci, Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi 2008; 65: 61–6.
• Kizirgil A, Yakupoğulları Y, Şenol Ff, Aşçı Toraman Z: Kan kültürü örneklerinde genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üreten enterik basillerin prevalansı ve antibiyotik duyarlılıklarının araştırılması, İnfeksiyon Derg 2005; 19 : 111– 4.
• Uyanık Mh, Hancı H, Yazgı H, Karameşe M: Kan kültürlerinden soyutlanan Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarında GSBL sıklığı ve ertapenem dahil çeşitli antibiyotiklere in-vitro duyarlılıkları, ANKEM Derg 2010; 24: 86–91.
• Coşar M, Tuncer İ, Arslan U: Kan kültürlerinde üreyen Pseudomonas aerugınosa suşlarının antibiyotik direnç profili, İnfeksiyon Derg 2009; 23: 47–50.
• Küçükbasmacı Ö, Çalışkan Algıngil R, Hamança Ö, Çelik Ş, Köksal F, Gönüllü N, Saması M: Kan örneklerinden üretilen Gram negatif çomakların antibiyotiklere duyarlılıkları, Türk Mikrobiyol Cem Derg 2007; 37: 201–3.