Araştırma Makalesi
BibTex RIS Kaynak Göster

Cloning and Protein Production of the Antigenic FliC Gene of Salmonella enterica serovar typhimurium ATCC 14028 Strain

Yıl 2026, Cilt: 42 Sayı: 1 , - , 13.03.2026

Selda Kılıç , Betül Arı , Orhan Erdoğan

https://doi.org/10.65520/erciyesfen.1757982
https://izlik.org/JA39SP58XC

Öz

Proteins are large and complex biomolecules that perform a wide variety of biological functions in living organisms. These biomolecules play a critical role in many fields, including medicine, industry, food, the environment, and scientific research. Producing these proteins in their natural environment is both inefficient and extremely difficult. Using a molecular technique called recombinant DNA technology, proteins can be easily produced in appropriate quantities in an organism other than their natural source. The primary objective of this study was to clone the FliC gene from Salmonella enterica serovar typhimurium ATCC 14028 into the pET-SUMO vector for the first time and produce recombinant protein. For this purpose, the FliC gene obtained from S. typhimurium ATCC 14028 was inserted into the pET-SUMO vector, and recombinant protein production was carried out in Escherichia coli (E. coli) BL21(DE3) cells. The results showed that the culture induced with 1 mM IPTG provided the highest protein yield. The produced protein, approximately 70 kDa in size, was confirmed and purified using SDS-PAGE and nickel (Ni+2) affinity chromatography. In this study, the S. typhimurium FliC gene was successfully transferred to the pET-SUMO vector using the A-T cloning method for the first time, enabling the production of the targeted recombinant FliC protein.

Anahtar Kelimeler

Cloning FliC Purification Recombinant protein production Salmonella typhimurium

Destekleyen Kurum

This study is supported by Atatürk University Scientific Research Projects (BAP) Unit

Proje Numarası

2022-10628

Kaynakça

  • Mattick, J. S. (2003). Challenging the dogma: The hidden layer of non-protein-coding RNAs in complex organisms. BioEssays, 25(10), 930-939. https://doi.org/10.1002/bies.10332
  • Khan, S., Ullah, M. W., Siddique, R., Nabi, G., Manan, S., Yousaf, M., & Hou, H. (2016). Role of Recombinant DNA Technology to Improve Life. International Journal of Genomics, 2016, 1-14. https://doi.org/10.1155/2016/2405954
  • Unver, Y., Ari, B., Acar, M. et al. A self-inducible heterologous protein expression system in Komagataella phaffii (Pichia pastoris). 3 Biotech 14, 193 (2024). https://doi.org/10.1007/s13205-024-04039-x
  • Eastwood, T. A., Baker, K., Streather, B. R., Allen, N., Wang, L., Botchway, S. W., Brown, I. R., Hiscock, J. R., Lennon, C., & Mulvihill, D. P. (2023). High-yield vesicle-packaged recombinant protein production from E. coli. Cell Reports Methods, 3(2), 100396. https://doi.org/10.1016/j.crmeth.2023.100396
  • McElwain, L., Phair, K., Kealey, C., & Brady, D. (2022). Current trends in biopharmaceuticals production in Escherichia coli. Biotechnology Letters, 44(8), 917-931. https://doi.org/10.1007/s10529-022-03276-5
  • Waugh, D. S. (2005). Making the most of affinity tags. Trends in Biotechnology, 23(6), 316-320. https://doi.org/10.1016/j.tibtech.2005.03.012
  • Li, M., Su, Z.-G., & Janson, J.-C. (2004). In vitro protein refolding by chromatographic procedures. Protein Expression and Purification, 33(1), 1-10. https://doi.org/10.1016/j.pep.2003.08.023
  • Chiu, T.-W., Peng, C.-J., Chen, M.-C., Hsu, M.-H., Liang, Y.-H., Chiu, C.-H., Fang, J.-M., & Lee, Y. C. (2020). Constructing conjugate vaccine against Salmonella Typhimurium using lipid-A free lipopolysaccharide. Journal of Biomedical Science, 27(1), 89. https://doi.org/10.1186/s12929-020-00681-8
  • Reeves, M. W., Evins, G. M., Heiba, A. A., Plikaytis, B. D., & Farmer, J. J. (1989). Clonal nature of Salmonella typhi and its genetic relatedness to other salmonellae as shown by multilocus enzyme electrophoresis, and proposal of Salmonella bongori comb. Nov. Journal of Clinical Microbiology, 27(2), 313-320. https://doi.org/10.1128/jcm.27.2.313-320.1989
  • Takaya, A., Yamamoto, T., & Tokoyoda, K. (2020). Humoral Immunity vs. Salmonella. Frontiers in Immunology, 10, 3155. https://doi.org/10.3389/fimmu.2019.03155
  • Simpson, K. M. J., Hill-Cawthorne, G. A., Ward, M. P., & Mor, S. M. (2018). Diversity of Salmonella serotypes from humans, food, domestic animals and wildlife in New South Wales, Australia. BMC Infectious Diseases, 18(1), 623. https://doi.org/10.1186/s12879-018-3563-1
  • Hohmann, E. L. (2001). Nontyphoidal Salmonellosis. Clinical Infectious Diseases, 32, 263-269
  • Jajere, S. M. (2019). A review of Salmonella enterica with particular focus on the pathogenicity and virulence factors, host specificity and antimicrobial resistance including multidrug resistance. Veterinary World, 12(4), 504-521. https://doi.org/10.14202/vetworld.2019.504-521
  • Ikeda, J. S., Schmitt, C. K., Darnell, S. C., Watson, P. R., Bispham, J., Wallis, T. S., Weinstein, D. L., Metcalf, E. S., Adams, P., O’Connor, C. D., & O’Brien, A. D. (2001). Flagellar Phase Variation of Salmonella enterica Serovar Typhimurium Contributes to Virulence in the Murine Typhoid Infection Model but Does Not Influence Salmonella -Induced Enteropathogenesis. Infection and Immunity, 69(5), 3021-3030. https://doi.org/10.1128/IAI.69.5.3021-3030.2001
  • Zarkani, A. A., López-Pagán, N., Grimm, M., Sánchez-Romero, M. A., Ruiz-Albert, J., Beuzón, C. R., & Schikora, A. (2020). Salmonella Heterogeneously Expresses Flagellin during Colonization of Plants. Microorganisms, 8(6), 815. https://doi.org/10.3390/microorganisms8060815
  • Honko, A. N., Sriranganathan, N., Lees, C. J., & Mizel, S. B. (2006). Flagellin Is an Effective Adjuvant for Immunization against Lethal Respiratory Challenge with Yersinia pestis. Infection and Immunity, 74(2), 1113-1120. https://doi.org/10.1128/IAI.74.2.1113-1120.2006
  • Butt, T. R., Edavettal, S. C., Hall, J. P., & Mattern, M. R. (2005). SUMO fusion technology for difficult-to-express proteins. Protein Expression and Purification, 43(1), 1-9. https://doi.org/10.1016/j.pep.2005.03.016
  • Ceylan, H. (2016). İnsan beyin asetilkolinesteraz enziminin klonlanması, e. coli’de ekspresyonu ve enzimin karakterizasyonu.
  • Lai, J. Y., Klatt, S., & Lim, T. S. (2019). Potential application of Leishmania tarentolae as an alternative platform for antibody expression. Critical Reviews in Biotechnology, 39(3), 380-394. https://doi.org/10.1080/07388551.2019.1566206
  • García-Ortega, X., Cámara, E., Ferrer, P., Albiol, J., Montesinos-Seguí, J. L., & Valero, F. (2019). Rational development of bioprocess engineering strategies for recombinant protein production in Pichia pastoris (Komagataella phaffii) using the methanol-free GAP promoter. Where do we stand? New Biotechnology, 53, 24-34. https://doi.org/10.1016/j.nbt.2019.06.002
  • Huang, C.-J., Lin, H., & Yang, X. (2012). Industrial production of recombinant therapeutics in Escherichia coli and its recent advancements. Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology, 39(3), 383-399. https://doi.org/10.1007/s10295-011-1082-9
  • Chen, R. (2012). Bacterial expression systems for recombinant protein production: E. coli and beyond. Biotechnology Advances, 30(5), 1102-1107. https://doi.org/10.1016/j.biotechadv.2011.09.013
  • Achinas, S., Charalampogiannis, N., & Euverink, G. J. W. (2019). A Brief Recap of Microbial Adhesion and Biofilms. Applied Sciences, 9(14), 2801. https://doi.org/10.3390/app9142801
  • Wang, F., Deng, L., Huang, F., Wang, Z., Lu, Q., & Xu, C. (2020). Flagellar Motility Is Critical for Salmonella enterica Serovar Typhimurium Biofilm Development. Frontiers in Microbiology, 11, 1695. https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.01695
  • Chilcott, G. S., & Hughes, K. T. (2000). Coupling of Flagellar Gene Expression to Flagellar Assembly in Salmonella enterica Serovar Typhimurium and Escherichia coli. Microbiology and Molecular Biology Reviews, 64(4), 694-708. https://doi.org/10.1128/MMBR.64.4.694-708.2000
  • Munir, A., Ahmed, N., Akram, M., Fujimura, N. A., Tahir, S., & Malik, K. (2023). Enhanced soluble expression of active recombinant human interleukin-29 using champion pET SUMO system. Biotechnology Letters, 45(8), 1001-1011. https://doi.org/10.1007/s10529-023-03402-x
  • Taherkhani, R., Farshadpour, F., Makvandi, M., & Samarbafzadeh, A. R. (2014). Cloning of fliC Gene From Salmonella typhimurium in the Expression Vector pVAX1 and Evaluation of its Expression in Eukaryotic Cells. Jundishapur journal of microbiology, 7(11), e12351. https://doi.org/10.5812/jjm.12351
  • Zhao, T., Huang, H., Tan, P., Li, Y., Xuan, X., Li, F., … Yang, D. (2021). Enhancement of Solubility, Purification, and Inclusion Body Refolding of Active Human Mitochondrial Aldehyde Dehydrogenase 2. ACS Omega, 6(18), 12004–12013. https://doi.org/10.1021/acsomega.1c00577
  • Qu, J., Zhang, J., Zellmer, L., He, Y., Liu, S., Wang, C., Yuan, C., xu, N., Huang, H., & Liao, D. J. (2020). About three‐fourths of mouse proteins unexpectedly appear at a low position of SDS‐PAGE, often as additional isoforms, questioning whether all protein isoforms have been eliminated in gene‐knockout cells or organisms. Protein Science, 29(4), 964-976. https://doi.org/10.1002/pro.3823
  • Chen, J., Ng, S. M., Chang, C., Zhang, Z., Bourdon, J.-C., Lane, D. P., & Peng, J. (2009). P53 isoform Δ113p53 is a p53 target gene that antagonizes p53 apoptotic activity via BclxL activation in zebrafish. Genes & Development, 23(3), 278-290. https://doi.org/10.1101/gad.1761609
  • Komoriya, K., Shibano, N., Higano, T., Azuma, N., Yamaguchi, S., & Aizawa, S. (1999). Flagellar proteins and type III‐exported virulence factors are the predominant proteins secreted into the culture media of Salmonella typhimurium. Molecular Microbiology, 34(4), 767–779. https://doi.org/10.1046/j.1365-2958.1999.01639.x
  • Mani, T., Joshi, J. B., Priyadharshini, R., Sharmila, J. S., & Uthandi, S. (2023). Flagellin, a plant-defense-activating protein identified from Xanthomonas axonopodis pv. Dieffenbachiae invokes defense response in tobacco. BMC Microbiology, 23(1), 284. https://doi.org/10.1186/s12866-023-03028-z
  • Roumagnac, P., Weill, F.-X., Dolecek, C., Baker, S., Brisse, S., Chinh, N. T., … Achtman, M. (2006). Evolutionary History of Salmonella Typhi. Science, 314(5803), 1301–1304. https://doi.org/10.1126/science.1134933
  • Holt, K. E., Parkhill, J., Mazzoni, C. J., Roumagnac, P., Weill, F.-X., Goodhead, I., … Dougan, G. (2008). High-throughput sequencing provides insights into genome variation and evolution in Salmonella Typhi. Nature Genetics, 40(8), 987–993. https://doi.org/10.1038/ng.195

Salmonella enterica serovar typhimurium ATCC 14028 Suşuna ait Antijenik FliC Geninin Klonlanması ve Protein Üretimi

Yıl 2026, Cilt: 42 Sayı: 1 , - , 13.03.2026

Selda Kılıç , Betül Arı , Orhan Erdoğan

https://doi.org/10.65520/erciyesfen.1757982
https://izlik.org/JA39SP58XC

Öz

Proteinler, canlı organizmalarda çok çeşitli biyolojik işlevleri yerine getiren büyük ve karmaşık biyomoleküllerdir. Bu biyomoleküller tıp, endüstri, gıda, çevre ve bilimsel araştırma gibi birçok alanda kritik bir rol oynar. Bu proteinleri doğal ortamlarında üretmek hem verimsiz hem de son derece zordur. Rekombinant DNA teknolojisi adı verilen bir moleküler teknik kullanılarak, proteinler doğal kaynakları dışındaki bir organizmada uygun miktarlarda kolayca üretilebilir. Bu çalışmanın temel amacı, Salmonella enterica serovar typhimurium ATCC 14028'in FliC genini ilk kez pET-SUMO vektörüne aktarıldı ve rekombinant protein üretmektir. Bu amaçla, S. typhimurium ATCC 14028'den alınan FliC geni pET-SUMO vektörüne klonlandı ve rekombinant protein üretimi Escherichia coli (E. coli) BL21(DE3) hücrelerinde gerçekleştirildi. Sonuçlar, 1 mM IPTG ile indüklenen kültürün en yüksek protein verimini sağladığını gösterdi. Üretilen protein yaklaşık 70 kDa olup, SDS PAGE ve nikel (Ni+2) afinite kromatografisi ile doğrulanmış ve saflaştırılmıştır. Bu araştırmada, S. typhimurium FliC geninin A-T klonlama yöntemi ile ilk kez pET-SUMO vektörüne aktarılarak hedeflenen rekombinant FliC proteinin üretimi başarıyla gerçekleştirilmiştir.

Anahtar Kelimeler

FliC Klonlama Rekombinant protein üretimi Saflaştırma Salmonella typhimurium

Destekleyen Kurum

Bu çalışma Atatürk Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri (BAP) Birimi tarafından desteklenmektedir.

Proje Numarası

2022-10628

Kaynakça

  • Mattick, J. S. (2003). Challenging the dogma: The hidden layer of non-protein-coding RNAs in complex organisms. BioEssays, 25(10), 930-939. https://doi.org/10.1002/bies.10332
  • Khan, S., Ullah, M. W., Siddique, R., Nabi, G., Manan, S., Yousaf, M., & Hou, H. (2016). Role of Recombinant DNA Technology to Improve Life. International Journal of Genomics, 2016, 1-14. https://doi.org/10.1155/2016/2405954
  • Unver, Y., Ari, B., Acar, M. et al. A self-inducible heterologous protein expression system in Komagataella phaffii (Pichia pastoris). 3 Biotech 14, 193 (2024). https://doi.org/10.1007/s13205-024-04039-x
  • Eastwood, T. A., Baker, K., Streather, B. R., Allen, N., Wang, L., Botchway, S. W., Brown, I. R., Hiscock, J. R., Lennon, C., & Mulvihill, D. P. (2023). High-yield vesicle-packaged recombinant protein production from E. coli. Cell Reports Methods, 3(2), 100396. https://doi.org/10.1016/j.crmeth.2023.100396
  • McElwain, L., Phair, K., Kealey, C., & Brady, D. (2022). Current trends in biopharmaceuticals production in Escherichia coli. Biotechnology Letters, 44(8), 917-931. https://doi.org/10.1007/s10529-022-03276-5
  • Waugh, D. S. (2005). Making the most of affinity tags. Trends in Biotechnology, 23(6), 316-320. https://doi.org/10.1016/j.tibtech.2005.03.012
  • Li, M., Su, Z.-G., & Janson, J.-C. (2004). In vitro protein refolding by chromatographic procedures. Protein Expression and Purification, 33(1), 1-10. https://doi.org/10.1016/j.pep.2003.08.023
  • Chiu, T.-W., Peng, C.-J., Chen, M.-C., Hsu, M.-H., Liang, Y.-H., Chiu, C.-H., Fang, J.-M., & Lee, Y. C. (2020). Constructing conjugate vaccine against Salmonella Typhimurium using lipid-A free lipopolysaccharide. Journal of Biomedical Science, 27(1), 89. https://doi.org/10.1186/s12929-020-00681-8
  • Reeves, M. W., Evins, G. M., Heiba, A. A., Plikaytis, B. D., & Farmer, J. J. (1989). Clonal nature of Salmonella typhi and its genetic relatedness to other salmonellae as shown by multilocus enzyme electrophoresis, and proposal of Salmonella bongori comb. Nov. Journal of Clinical Microbiology, 27(2), 313-320. https://doi.org/10.1128/jcm.27.2.313-320.1989
  • Takaya, A., Yamamoto, T., & Tokoyoda, K. (2020). Humoral Immunity vs. Salmonella. Frontiers in Immunology, 10, 3155. https://doi.org/10.3389/fimmu.2019.03155
  • Simpson, K. M. J., Hill-Cawthorne, G. A., Ward, M. P., & Mor, S. M. (2018). Diversity of Salmonella serotypes from humans, food, domestic animals and wildlife in New South Wales, Australia. BMC Infectious Diseases, 18(1), 623. https://doi.org/10.1186/s12879-018-3563-1
  • Hohmann, E. L. (2001). Nontyphoidal Salmonellosis. Clinical Infectious Diseases, 32, 263-269
  • Jajere, S. M. (2019). A review of Salmonella enterica with particular focus on the pathogenicity and virulence factors, host specificity and antimicrobial resistance including multidrug resistance. Veterinary World, 12(4), 504-521. https://doi.org/10.14202/vetworld.2019.504-521
  • Ikeda, J. S., Schmitt, C. K., Darnell, S. C., Watson, P. R., Bispham, J., Wallis, T. S., Weinstein, D. L., Metcalf, E. S., Adams, P., O’Connor, C. D., & O’Brien, A. D. (2001). Flagellar Phase Variation of Salmonella enterica Serovar Typhimurium Contributes to Virulence in the Murine Typhoid Infection Model but Does Not Influence Salmonella -Induced Enteropathogenesis. Infection and Immunity, 69(5), 3021-3030. https://doi.org/10.1128/IAI.69.5.3021-3030.2001
  • Zarkani, A. A., López-Pagán, N., Grimm, M., Sánchez-Romero, M. A., Ruiz-Albert, J., Beuzón, C. R., & Schikora, A. (2020). Salmonella Heterogeneously Expresses Flagellin during Colonization of Plants. Microorganisms, 8(6), 815. https://doi.org/10.3390/microorganisms8060815
  • Honko, A. N., Sriranganathan, N., Lees, C. J., & Mizel, S. B. (2006). Flagellin Is an Effective Adjuvant for Immunization against Lethal Respiratory Challenge with Yersinia pestis. Infection and Immunity, 74(2), 1113-1120. https://doi.org/10.1128/IAI.74.2.1113-1120.2006
  • Butt, T. R., Edavettal, S. C., Hall, J. P., & Mattern, M. R. (2005). SUMO fusion technology for difficult-to-express proteins. Protein Expression and Purification, 43(1), 1-9. https://doi.org/10.1016/j.pep.2005.03.016
  • Ceylan, H. (2016). İnsan beyin asetilkolinesteraz enziminin klonlanması, e. coli’de ekspresyonu ve enzimin karakterizasyonu.
  • Lai, J. Y., Klatt, S., & Lim, T. S. (2019). Potential application of Leishmania tarentolae as an alternative platform for antibody expression. Critical Reviews in Biotechnology, 39(3), 380-394. https://doi.org/10.1080/07388551.2019.1566206
  • García-Ortega, X., Cámara, E., Ferrer, P., Albiol, J., Montesinos-Seguí, J. L., & Valero, F. (2019). Rational development of bioprocess engineering strategies for recombinant protein production in Pichia pastoris (Komagataella phaffii) using the methanol-free GAP promoter. Where do we stand? New Biotechnology, 53, 24-34. https://doi.org/10.1016/j.nbt.2019.06.002
  • Huang, C.-J., Lin, H., & Yang, X. (2012). Industrial production of recombinant therapeutics in Escherichia coli and its recent advancements. Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology, 39(3), 383-399. https://doi.org/10.1007/s10295-011-1082-9
  • Chen, R. (2012). Bacterial expression systems for recombinant protein production: E. coli and beyond. Biotechnology Advances, 30(5), 1102-1107. https://doi.org/10.1016/j.biotechadv.2011.09.013
  • Achinas, S., Charalampogiannis, N., & Euverink, G. J. W. (2019). A Brief Recap of Microbial Adhesion and Biofilms. Applied Sciences, 9(14), 2801. https://doi.org/10.3390/app9142801
  • Wang, F., Deng, L., Huang, F., Wang, Z., Lu, Q., & Xu, C. (2020). Flagellar Motility Is Critical for Salmonella enterica Serovar Typhimurium Biofilm Development. Frontiers in Microbiology, 11, 1695. https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.01695
  • Chilcott, G. S., & Hughes, K. T. (2000). Coupling of Flagellar Gene Expression to Flagellar Assembly in Salmonella enterica Serovar Typhimurium and Escherichia coli. Microbiology and Molecular Biology Reviews, 64(4), 694-708. https://doi.org/10.1128/MMBR.64.4.694-708.2000
  • Munir, A., Ahmed, N., Akram, M., Fujimura, N. A., Tahir, S., & Malik, K. (2023). Enhanced soluble expression of active recombinant human interleukin-29 using champion pET SUMO system. Biotechnology Letters, 45(8), 1001-1011. https://doi.org/10.1007/s10529-023-03402-x
  • Taherkhani, R., Farshadpour, F., Makvandi, M., & Samarbafzadeh, A. R. (2014). Cloning of fliC Gene From Salmonella typhimurium in the Expression Vector pVAX1 and Evaluation of its Expression in Eukaryotic Cells. Jundishapur journal of microbiology, 7(11), e12351. https://doi.org/10.5812/jjm.12351
  • Zhao, T., Huang, H., Tan, P., Li, Y., Xuan, X., Li, F., … Yang, D. (2021). Enhancement of Solubility, Purification, and Inclusion Body Refolding of Active Human Mitochondrial Aldehyde Dehydrogenase 2. ACS Omega, 6(18), 12004–12013. https://doi.org/10.1021/acsomega.1c00577
  • Qu, J., Zhang, J., Zellmer, L., He, Y., Liu, S., Wang, C., Yuan, C., xu, N., Huang, H., & Liao, D. J. (2020). About three‐fourths of mouse proteins unexpectedly appear at a low position of SDS‐PAGE, often as additional isoforms, questioning whether all protein isoforms have been eliminated in gene‐knockout cells or organisms. Protein Science, 29(4), 964-976. https://doi.org/10.1002/pro.3823
  • Chen, J., Ng, S. M., Chang, C., Zhang, Z., Bourdon, J.-C., Lane, D. P., & Peng, J. (2009). P53 isoform Δ113p53 is a p53 target gene that antagonizes p53 apoptotic activity via BclxL activation in zebrafish. Genes & Development, 23(3), 278-290. https://doi.org/10.1101/gad.1761609
  • Komoriya, K., Shibano, N., Higano, T., Azuma, N., Yamaguchi, S., & Aizawa, S. (1999). Flagellar proteins and type III‐exported virulence factors are the predominant proteins secreted into the culture media of Salmonella typhimurium. Molecular Microbiology, 34(4), 767–779. https://doi.org/10.1046/j.1365-2958.1999.01639.x
  • Mani, T., Joshi, J. B., Priyadharshini, R., Sharmila, J. S., & Uthandi, S. (2023). Flagellin, a plant-defense-activating protein identified from Xanthomonas axonopodis pv. Dieffenbachiae invokes defense response in tobacco. BMC Microbiology, 23(1), 284. https://doi.org/10.1186/s12866-023-03028-z
  • Roumagnac, P., Weill, F.-X., Dolecek, C., Baker, S., Brisse, S., Chinh, N. T., … Achtman, M. (2006). Evolutionary History of Salmonella Typhi. Science, 314(5803), 1301–1304. https://doi.org/10.1126/science.1134933
  • Holt, K. E., Parkhill, J., Mazzoni, C. J., Roumagnac, P., Weill, F.-X., Goodhead, I., … Dougan, G. (2008). High-throughput sequencing provides insights into genome variation and evolution in Salmonella Typhi. Nature Genetics, 40(8), 987–993. https://doi.org/10.1038/ng.195
Toplam 34 adet kaynakça vardır.

Ayrıntılar

Birincil Dil İngilizce
Konular Gen İfadesi, Genom Yapısı ve Düzenlemesi, Genetik (Diğer)
Bölüm Araştırma Makalesi
Yazarlar

Selda Kılıç 0000-0003-0924-5365

Betül Arı 0000-0002-9720-1292

Orhan Erdoğan 0000-0001-8908-7293

Proje Numarası 2022-10628
Gönderilme Tarihi 4 Ağustos 2025
Kabul Tarihi 9 Mart 2026
Yayımlanma Tarihi 13 Mart 2026
DOI https://doi.org/10.65520/erciyesfen.1757982
IZ https://izlik.org/JA39SP58XC
Yayımlandığı Sayı Yıl 2026 Cilt: 42 Sayı: 1

Kaynak Göster

APA Kılıç, S., Arı, B., & Erdoğan, O. (2026). Cloning and Protein Production of the Antigenic FliC Gene of Salmonella enterica serovar typhimurium ATCC 14028 Strain. Erciyes Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Fen Bilimleri Dergisi, 42(1). https://doi.org/10.65520/erciyesfen.1757982
AMA 1.Kılıç S, Arı B, Erdoğan O. Cloning and Protein Production of the Antigenic FliC Gene of Salmonella enterica serovar typhimurium ATCC 14028 Strain. Erciyes Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Fen Bilimleri Dergisi. 2026;42(1). doi:10.65520/erciyesfen.1757982
Chicago Kılıç, Selda, Betül Arı, ve Orhan Erdoğan. 2026. “Cloning and Protein Production of the Antigenic FliC Gene of Salmonella enterica serovar typhimurium ATCC 14028 Strain”. Erciyes Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Fen Bilimleri Dergisi 42 (1). https://doi.org/10.65520/erciyesfen.1757982.
EndNote Kılıç S, Arı B, Erdoğan O (01 Mart 2026) Cloning and Protein Production of the Antigenic FliC Gene of Salmonella enterica serovar typhimurium ATCC 14028 Strain. Erciyes Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Fen Bilimleri Dergisi 42 1
IEEE [1]S. Kılıç, B. Arı, ve O. Erdoğan, “Cloning and Protein Production of the Antigenic FliC Gene of Salmonella enterica serovar typhimurium ATCC 14028 Strain”, Erciyes Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Fen Bilimleri Dergisi, c. 42, sy 1, Mar. 2026, doi: 10.65520/erciyesfen.1757982.
ISNAD Kılıç, Selda - Arı, Betül - Erdoğan, Orhan. “Cloning and Protein Production of the Antigenic FliC Gene of Salmonella enterica serovar typhimurium ATCC 14028 Strain”. Erciyes Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Fen Bilimleri Dergisi 42/1 (01 Mart 2026). https://doi.org/10.65520/erciyesfen.1757982.
JAMA 1.Kılıç S, Arı B, Erdoğan O. Cloning and Protein Production of the Antigenic FliC Gene of Salmonella enterica serovar typhimurium ATCC 14028 Strain. Erciyes Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Fen Bilimleri Dergisi. 2026;42. doi:10.65520/erciyesfen.1757982.
MLA Kılıç, Selda, vd. “Cloning and Protein Production of the Antigenic FliC Gene of Salmonella enterica serovar typhimurium ATCC 14028 Strain”. Erciyes Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Fen Bilimleri Dergisi, c. 42, sy 1, Mart 2026, doi:10.65520/erciyesfen.1757982.
Vancouver 1.Selda Kılıç, Betül Arı, Orhan Erdoğan. Cloning and Protein Production of the Antigenic FliC Gene of Salmonella enterica serovar typhimurium ATCC 14028 Strain. Erciyes Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Fen Bilimleri Dergisi. 01 Mart 2026;42(1). doi:10.65520/erciyesfen.1757982

Amaç ve Kapsam

Erciyes Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi Ulusal ve Uluslararası araştırmacıların bilim ve teknolojiye sağlayacakları en son katkıları yayımlamayı ilke edinmiş bir bilimsel dergidir. Dünyanın her tarafından araştırmacıların bilim ve teknolojiye dair bilgi ve becerilerini geliştirmeyi, paylaşmayı ve tartışmayı amaç edinir. Makaleler İngilizce olarak sunulmalıdır.

Erciyes Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi özgün bilimsel araştırmalar ile uygulama çalışmalarına yer veren bir dergidir. Dergide fen ve mühendislik bilimlerinde yapılmış deneysel ve teorik ilerlemeleri konu alan analitik ve nümerik çözümleri içeren araştırma makalesi türündeki çalışmalara  yer verilir.

BENZERLİK ORANI DOSYASI : Makalenizin referanslar bölümü dahil Tam Metni "iThenticate" veya "Turnitin" programları ile taranmalıdır. İlgili programdan alacağınız benzerlik oranı sonucunun PDF formatında sistemimize yüklenilmesi gerekmektedir.

Dergi Makale Formatını İndirin

http://dergipark.org.tr/download/journal-file/14761

Link açılmazsa başka bir internet tarayıcısından deneyiniz. (Internet Explorer, Mozilla Firefox, Edge, Opera, Safari, Netscape vs.) veya linke sağ tıklayıp "Bağlantıyı farklı kaydet" deyiniz veya linki kopyalayıp arama çubuğuna yapıştırıp enter'layınız.

⛔ Makalenin yazar(lar)ının tahrif edilmiş ve uydurma veriler kullandığı tespit edildiği takdirde, bu durum yazarların çalıştığı kuruma bildirilerek makale reddedilir. İntihal oranı üst sınırı %20 (Kaynaklar hariç) olarak belirlenmiş ve intihal oranı %20'yi geçen makaleler, değerlendirmeye alınmaz.

⛔ Dergimize gönderilen makaleler için yazarların telif hakkı devir formunu doldurması gerekmektedir.

✯ Etik kurul izni gerektiren, tüm bilim dallarında yapılan araştırmalar için etik kurul onayı alınmış olmalı, bu onay makalede belirtilmeli ve belgelendirilmelidir.
✯ Etik kurul izni gerektiren araştırmalarda, izinle ilgili bilgilere (kurul adı, tarih ve sayı no) yöntem bölümünde, ayrıca makalenin ilk/son sayfalarından birinde; olgu sunumlarında, bilgilendirilmiş gönüllü olur/onam formunun imzalatıldığına dair bilgiye makalede yer verilmelidir.
✯ Dergi web sayfasında, makalelerde Araştırma ve Yayın Etiğine uyulduğuna dair ifadeye yer verilmelidir.
✯ Dergi web sayfasında, hakem, yazar ve editör için ayrı başlıklar altında etik kurallarla ilgili bilgi verilmelidir.
✯ Dergide ve/veya web sayfasında, ulusal ve uluslararası standartlara atıf yaparak, dergide ve/veya web sayfasında etik ilkeler ayrı başlık altında belirtilmelidir. Örneğin; dergilere gönderilen bilimsel yazılarda, ICMJE (International Committee of Medical Journal Editors) tavsiyeleri ile COPE (Committee on Publication Ethics)’un Editör ve Yazarlar için Uluslararası Standartları dikkate alınmalıdır.
✯ Kullanılan fikir ve sanat eserleri için telif hakları düzenlemelerine riayet edilmesi gerekmektedir.

Dergimiz ücretli değildir.

Atıf Dizinleri

TR Dizin

Diğer Dizinler

ResearchBib
WORLDCAT
Index Copernicus - ICI Journal Master List
Index Copernicus ICI World of Journals
Google Scholar
Paperity

Baş Editör

Munise Didem Demirbaş
Munise Didem DEMİRBAŞ
Mühendislik, Katı Mekanik, Makine Mühendisliği (Diğer), Kompozit ve Hibrit Malzemeler

Yardımcı Baş Editör

Umut Caliskan
Umut CALİSKAN
Makine Mühendisliği, Balistik Sistemleri, Katı Mekanik, Kompozit ve Hibrit Malzemeler
Mehmet Çağrı Soylu
Mehmet Çağrı SOYLU
Biyomedikal Bilimler ve Teknolojiler, Biyomedikal Tanı, Tıbbi Cihazlar

Editörler Kurulu

Default avatar
Nafiz KAHRAMAN
Mühendislik, Aerodinamik (Hipersonik Aerodinamik Hariç), Enerji, İçten Yanmalı Motorlar
Murat Muştu
Murat MUŞTU
Entomoloji, Bitki Koruma, Tarımda Entomoloji
Default avatar
Ahmet Alper ÖNER
Akışkan Mekaniği ve Termal Mühendislik, Hidromekanik, Su Kaynakları ve Su Yapıları
Default avatar
Hacı Abdullah TAŞDEMİR
Makine Mühendisliği, Katı Mekanik, Makine Tasarımı ve Makine Elemanları, Malzeme Tasarım ve Davranışları, Triboloji
Default avatar
Cem BOĞA
Sonlu Elemanlar Analizi, Kırılma Mekaniği, Katı Mekanik, Kaynak Teknolojileri, Kompozit ve Hibrit Malzemeler, Nanoteknoloji, Mekanik Titreşimler ve Gürültü
Default avatar
Demet BALKAN
Uzay Mühendisliği, Havacılık Malzemeleri, Havacılık Yapıları, Uydu, Uzay Aracı ve Füze Tasarımı ve Testleri, Uzay Mühendisliği (Diğer)
Default avatar
TAYYİP ÖZCAN

T. Özcan, 2010 yılında İstanbul Kültür Üniversitesi, İstanbul, Türkiye'den bilgisayar mühendisliği alanında lisans derecesini, 2016 ve 2020 yıllarında ise Erciyes Üniversitesi Bilgisayar Mühendisliği Bölümü'nden yüksek lisans ve doktora derecelerini almıştır. 2013 yılında Erciyes Üniversitesi Bilgisayar Mühendisliği Bölümü'ne Araştırma Görevlisi olarak katılmıştır. Araştırma ilgi alanları arasında akıllı optimizasyon algoritmaları, görüntü işleme, makine öğrenmesi, derin öğrenme ve Kalman filtreleme bulunmaktadır. Uygulama alanları insan eylemi tanıma, insan-bilgisayar etkileşimi ve sağlık ile tarımda yapay zekâ konularına odaklanmaktadır.
Bilgi ve Bilgi İşleme Bilimleri, Derin Öğrenme, Makine Öğrenme (Diğer)
Sedat Per
Sedat PER
Biyoloji, Hayvan Sistematiği ve Taksonomi, Akaroloji, Hayvan Fizyolojisi - Ekofizyoloji
Savaş Bayram
Savaş BAYRAM
Proje ve Yapım Yönetimi, Yapı İşletmesi
Selma Büyükkılıç Beyzi
Selma BÜYÜKKILIÇ BEYZİ
Hayvan Diyeti ve Beslenme, Hayvan Bilimi (Diğer), Süt Teknolojisi, Hayvan Besleme, Zootekni, Genetik ve Biyoistatistik
Ertan Kösedağ
Ertan KÖSEDAĞ
Sonlu Elemanlar Analizi, Makine Mühendisliği, Balistik Sistemleri, Katı Mekanik, Kompozit ve Hibrit Malzemeler, Malzeme Karekterizasyonu
Serkan Şahan
Serkan ŞAHAN
Akış Analizi, Analitik Spektrometri, Enstrümantal Yöntemler, Separasyon Bilimi
Default avatar
Derya HAROGLU
Tekstil Bilimleri ve Mühendisliği, Tekstil Teknolojisi, Tekstil Bilimleri ve Mühendisliği (Diğer)
Default avatar
Güher Pelin TOKER
Makine Mühendisliği (Diğer)
Emrah Tıraş
Emrah TIRAŞ

Erciyes Üniversitesi Fizik Bölümü'nde Doçent ve Araştırma Dekan Yardımcısı olarak çalışmaktayım. Fermi Ulusal Hızlandırıcı Laboratuvarı'nda (Fermilab) nötrino deneyleri, ANNIE, NOvA ve DUNE ve UC-Berkeley'deki EOS deneyi üzerinde çalışıyorum. Ayrıca ABD'deki Iowa Üniversitesi'nde araştırmacı bilim insanı ve yarı zamanlı öğretim üyesi olarak görev yapıyorum ve CERN'deki LHC'de CMS deneyinde de çalışmalarımı sürdürüyorum. 

Ocak 2017'den Ekim 2020'ye kadar, Iowa Eyalet Üniversitesi'nde doktora sonrası araştırmacı olarak Fermilab'daki nötrino deneyleri, ANNIE ve NOvA üzerinde çalıştım. ANNIE'de Deney Koordinatörü ve Faz II Yükseltme ve Kurulum Yöneticisi olarak görev yaptım. Ağustos 2012'de Yüksek Lisans derecemi, Aralık 2016'da ise CERN'deki LHC'de CMS deneyi üzerine Iowa Üniversitesi'nde doktora derecemi tamamladım. 
Makine Öğrenmesi Algoritmaları, Modelleme ve Simülasyon, Yüksek Enerji Astrofiziği ve Kozmik Işınlar, Genel Fizik, Kuantum Bilgisayarları, Kuantum Bilgisi, Hesaplama ve İletişim, Kuantum Teknolojileri, Nükleer Fizik, Radyofizik, Astroparçacık Fiziği ve Parçacık Kozmolojisi, Parçacık Fiziği, Hızlandırıcılar, Fotonik ve Elektro-Optik Cihazlar, Sensörler ve Sistemler (İletişim Hariç), Kuantum Mühendislik Sistemleri (Bilgisayar ve İletişim Dahil)
Default avatar
Hamdi MIHÇIOKUR
Su Kalitesi ve Su Kirliliği, Çevre Mühendisliği
Gülhan Güler
Gülhan GÜLER
Tekstil Bilimleri ve Mühendisliği, Tekstil Bilimi, Tekstil Teknolojisi
Default avatar
Handan GÜRSOY DEMİR
Makine Öğrenmesi Algoritmaları, Modelleme ve Simülasyon, Kontrol Teorisi ve Uygulamaları
Default avatar
Murat ŞAHİN
Enerji, Balistik Sistemleri, Enerji Üretimi, Dönüşüm ve Depolama (Kimyasal ve Elektiksel hariç), Makine Mühendisliği (Diğer)
Çağlar Sevim
Çağlar SEVİM
Makine Mühendisliği, Makine Teorisi ve Dinamiği
Default avatar
Kevser ŞAHİN TIRAŞ

Nanomalzemeler, kuantum teknolojileri ve yarıiletken fiziği alanında uzmanlaşmış bir fizikçi ve öğretim üyesiyim. Araştırmalarım, optoelektronik aygıtlar, fotodetektörler ve radyasyon algılama sistemlerinde kullanılmak üzere karbon kuantum noktaları, perovskit nanokristaller ve bu yapıların hibrit formlarının sentezi ve karakterizasyonuna odaklanmaktadır. Sintilatörler, ışık yoğunlaştırıcı (LSC) sistemler ve hibrit fotodetektörler için karbon temelli nanomalzemeleri konu alan TÜBİTAK destekli projeler de dahil olmak üzere birçok ulusal ve uluslararası araştırma projesinde yürütücü ve araştırmacı olarak görev aldım.

Deneysel nanoteknoloji çalışmalarımın yanı sıra, bilim iletişimi ve öğretim faaliyetlerine de büyük önem veriyorum. Kuantum hesaplama, nanoyapılar ve modern fizik konularında dersler veriyor; hakemli dergilerde yayımlanmış çok sayıda makalenin yazarı ve ortak yazarı olarak akademik üretime katkı sağlıyorum. Ayrıca, araştırmalarımı düzenli olarak uluslararası konferanslarda sunuyorum.

Profesyonel ilgi alanlarım nanofotonik, sürdürülebilir enerji malzemeleri ve gelişmiş radyasyon algılama teknolojilerinin kesişiminde yer almakta olup, özellikle çevre dostu ve suda çözünür nanomalzemelere odaklanmaktayım.
Kuantum Optik ve Kuantum Optomekaniği, Yoğun Maddenin Elektronik ve Manyetik Özellikleri; Süperiletkenlik, Yarı İletkenler, Nanoteknoloji
Murat Aydın
Murat AYDIN

Murat Aydın, Erciyes Üniversitesi'nde doçent olarak görev yapmaktadır. Aydın, akademik kariyerine 2007 yılında Erciyes Üniversitesi Makine Mühendisliği bölümünden mezun olarak başlamıştır. Yüksek lisans ve doktora derecelerini de aynı üniversitede tamamlamıştır. Doktora tezi, "Fonksiyonel kademelendirilmiş sandviç plakaların balistik davranışı" üzerinedir.

Aydın, 2009-2010 yılları arasında Erciyes Üniversitesi Sivil Havacılık Yüksekokulu'nda araştırma görevlisi olarak çalışmıştır. 2010-2014 yılları arasında aynı kurumda öğretim görevlisi olarak görev yapmış ve 2014 yılında Erciyes Üniversitesi Havacılık ve Uzay Bilimleri Fakültesi'ne doktor öğretim üyesi olarak atanmıştır. 2022 yılında doçent unvanını almıştır.

Aydın'ın araştırma alanları arasında kompozit malzemeler, balistik, darbe mekaniği ve fonksiyonel kademelendirilmiş malzemeler bulunmaktadır. Uluslararası hakemli dergilerde yayınlanmış çok sayıda makalesi ve bildirimi bulunmaktadır. Ayrıca, TÜBİTAK ve Avrupa Birliği tarafından desteklenen çeşitli projelerde görev almıştır.

Aydın, akademik çalışmalarının yanı sıra, Erciyes Üniversitesi Havacılık Çalışmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürü ve Uçak Mühendisliği Bölüm Başkanı olarak idari görevler de üstlenmektedir.
Malzeme Bilimi ve Teknolojileri, Balistik Sistemleri, Kompozit ve Hibrit Malzemeler, Havacılık Malzemeleri
Default avatar
Ömer Yavuz BOZKURT
Sonlu Elemanlar Analizi, Katı Mekanik, Kompozit ve Hibrit Malzemeler
Mevlüt Hakan
Mevlüt HAKAN
Sonlu Elemanlar Analizi, Makine Mühendisliği, Katı Mekanik, Makine Mühendisliğinde Sayısal Yöntemler, Kompozit ve Hibrit Malzemeler
Orhan Keklikcioğlu
Orhan KEKLİKCİOĞLU
Makine Mühendisliği
Fatma Öztürk Küp
Fatma ÖZTÜRK KÜP
Hücre Gelişimi, Proliferasyon ve Ölümü, Hücre Metabolizması, Endüstriyel Biyoteknoloji, Nanobiyoteknoloji, Hayvan Hücresi ve Moleküler Biyoloji
Default avatar
Sümeyye ÜSTÜNTAĞ
İplik Teknolojisi, Kumaş Teknolojisi, Lif Teknolojisi, Tekstil Teknolojisi, Tekstil Bilimleri ve Mühendisliği (Diğer)
Default avatar
Şükrü Taner AZGIN
Doğal Kaynak Yönetimi, İklim Değişikliğinin Ekolojik Etkileri ve Ekolojik Adaptasyon, Temiz Üretim Teknolojileri, Yenilenebilir Enerji Sistemleri
Default avatar
Serhan İLKENTAPAR
Yapı Malzemeleri
Emel Kızılkaya Aydogan
Emel KIZILKAYA AYDOGAN
Derin Öğrenme, Denetimli Öğrenme, Makine Öğrenmesi Algoritmaları, Çevresel Olarak Sürdürülebilir Mühendislik, Çok Ölçütlü Karar Verme, Endüstri Mühendisliği, Ergonomi ve İnsan Faktörleri Yönetimi, Üretimde Optimizasyon, Yeni Ürün Geliştirme

✯ Etik kurul izni gerektiren, tüm bilim dallarında yapılan araştırmalar için etik kurul onayı alınmış olmalı, bu onay makalede belirtilmeli ve belgelendirilmelidir.
✯ Etik kurul izni gerektiren araştırmalarda, izinle ilgili bilgilere (kurul adı, tarih ve sayı no) yöntem bölümünde, ayrıca makalenin ilk/son sayfalarından birinde; olgu sunumlarında, bilgilendirilmiş gönüllü olur/onam formunun imzalatıldığına dair bilgiye makalede yer verilmelidir.
✯ Dergi web sayfasında, makalelerde Araştırma ve Yayın Etiğine uyulduğuna dair ifadeye yer verilmelidir.
✯ Dergi web sayfasında, hakem, yazar ve editör için ayrı başlıklar altında etik kurallarla ilgili bilgi verilmelidir.
✯ Dergide ve/veya web sayfasında, ulusal ve uluslararası standartlara atıf yaparak, dergide ve/veya web sayfasında etik ilkeler ayrı başlık altında belirtilmelidir. Örneğin; dergilere gönderilen bilimsel yazılarda, ICMJE (International Committee of Medical Journal Editors) tavsiyeleri ile COPE (Committee on Publication Ethics)’un Editör ve Yazarlar için Uluslararası Standartları dikkate alınmalıdır.
✯ Kullanılan fikir ve sanat eserleri için telif hakları düzenlemelerine riayet edilmesi gerekmektedir.