The evaluation of antimicrobial resistances of Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium strains isolated from clinical specimens

Abstract

 Aim: Enterococci
are found in human flora and have quite low virulence. However, enterococci
cause nosocomial and community acquired infections, and in recent years there
has been an increase in antibiotic resistance rates in these infections. The
aim of this study was to evaluate the antibiotic susceptibility of Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium, the most
frequently isolated enterococcal species.

Material and Method: In our study, we evaluated 727 enterococcus strains obtained from various clinical specimens that was accepted in medical microbiology laboratory from 2012 to 2016. Species identification and antibiotic susceptibility tests were performed using conventional methods and VITEK^®-2 (BioMérieux, France) automated identification analyzer.

Results: In this study, 450 (61.9%) E. faecalis and 277 (38.1%) E. faecium were detected from 727 enterococci strains isolated. Gender distribution of patients with Enterococcus strains isolated; 387 (53.2%) women, 340 (46.8%) males. The distribution of the clinical specimens follows as 467 (64.2%) urine, 110 (15.1%) blood, 77 (10.6%) gaita, 43 (5.9%) wound and 30 (4.1%)  other specimens. Enterococci strains were most frequently isolated from urine specimens. All isolates of E. faecium and E. faecalis strains were susceptible to tigecycline.Vancomycin resistance rates were determined as 29.9% (80/268) in E.faecium isolates and 8.6% (37/432) in E. faecalis isolates.

Conclusion: Increasing resistance rates in enterococci limit the use of many antibiotics against these infections. We thought that each hospital's own surveillance programming, identification of enterococci at species level, doing antibiotic susceptibility testing, and application of treatment protocols according to these resistance patterns are effective in controlling enterococcal infections.

Keywords

• Enterococcus faecalis,Enterococcus faecium,vancomysin,tigecycline,antibiotic resistance

Klinik örneklerden izole edilen Enterococcus faecalis ve Enterococcus faecium suşlarında antibiyotik dirençlerinin değerlendirilmesi

Abstract

Amaç: Enterokoklar insan florasında bulunurlar ve oldukça düşük virulansa sahiptirler. Ancak, enterokoklar hastane ve toplum kaynaklı enfeksiyonlara neden olmakta ve son yıllarda bu enfeksiyonlarda antibiyotik direnç oranlarında artış gözlenmektedir. Bu çalışmada en sık izole edilen enterokok türleri olan Enterococcus faecalis ve Enterococ­cus faecium’un antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi amaçlanmıştır.

Gereç ve Yöntem: Çalışmamızda 2012 - 2016 yılları arasında Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarımıza gelen çeşitli klinik örneklerden izole edilen 727 enterokok suşu değerlendirmeye alınmıştır. Tür tanımlamaları ve antibiyotik duyarlılık testleri konvansiyonel metodlar ve VITEK^®-2 (BioMérieux, Fransa) otomatize identifikasyon cihazı ile yapılmıştır.

Bulgular: Bu çalışmada izole edilen 727 enterokok suşunun 450’si (%61,9) E. faecalis, 277’si (%38,1) E. faecium olarak tanımlanmıştır. Enterokok suşlarının izole edildiği hastaların cinsiyet dağılımı; 387 (%53,2) kadın, 340 (%46,8) erkektir. Klinik örneklerin dağılımı; 467 (%64.2) idrar, 110 (%15.1) kan, 77 (%10.6) gaita, 43 (%5.9) yara ve 30 %(4.1) diğer örneklerdir. Enterokok suşları en sık idrar örneklerinden izole edilmiştir. İzole edilen E. faecium ve E. faecalis suşlarının tamamı tigesikline duyarlı olarak saptanmıştır. Vankomisin direnç oranı E. faecium izolatlarında %29,9 (80/268), E. faecalis izolatlarında %8,6 (37/432) olarak belirlenmiştir.

Sonuç: Enterokoklarda son zamanlarda giderek artan direnç oranları bu enfeksiyonlara karşı birçok antibiyotiğin kullanımını sınırlandırmaktadır. Her hastanenin kendi sürveyans programını oluşturarak enterokokların tür düzeyinde tanımlanması, antibiyogram duyarlılık testlerini yapılması ve tedavi protokollerinin bu direnç paternlerine göre uygulanmasının enterokok enfeksiyonlarının kontrol altına alınmasında etkili olacağı kanaatindeyiz.

 

Keywords

• Enterococcus faecalis,Enterococcus faecium,vankomisin,tigesiklin,antibiyotik direnci

References

1. 1. Etiz P, Kibar F, Ekenoğlu Y, Yaman A. İdrar Kültüründen İzole Edilen Enterokok Türlerinin Antibiyotik Direnç Profillerinin Değerlendirilmesi. Türk Mikrobiyol Cem Derg 44(3):107-113, 2014. doi:10.5222/TMCD.2014.1072. Güçkan R, Elmas A, Tilgel S, Yüksel G. Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Enterokok Suşlarının Antibiyotik Direnç Oranları. Int J Basic Clin Med 2013;1(2):74-77.3. Taşbakan Işıkgöz M. Vankomisine dirençli enterokok olguları. ANKEM Derg 2010; 24 (Ek 2):E82-4.4. Yüksel Ergin Ö, Deniz Bayram E, Uzun B, Güngör S, Demirdal T. İdrar kültüründen izole edilen Enterococcus türleri ve antibiyotik dirençleri. ANKEM Derg 2013; 27:173-8.5. Gaol W, Howden BP, Stinear TP. Evolution of virulence in Enterococcus faecium, a hospital adapted opportunistic pathogen. Current Opinion in Microbiology 2018; 41:76–82.6. Altun D, Erdem G, Çöplü N, Çağatay M. Klinik Örneklerden İzole Edilen Enterokok Suşlarının Tür Düzeyinde Tanımlanması ve Antibiyotik Duyarlılıklarının Çeşitli Yöntemlerle Araştırılması. ANKEM Derg 2013; 27(3):130-134. doi:10.5222/ankem.2013.130
2. 7. Ersoy Y, Bayraktar M, Fırat M, Yağmur M, Durmaz R. Klinik örneklerden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıkları. ANKEM Derg 2005; 19(2): 92-9.8. Mert-Dinç B, Aykut-Arca E, Yağcı S, Karabiber N. Çeşitli Klinik örneklerden izole edilen Enterococcus faecalis ve Enterococcus faecium suşlarında in-vitro antibiyotik duyarlılığı. Türk Hij Den Biyol Derg, 2009;66(3): 117-21.
3. 9. Meriç M, Rüzgar M, Gündeş S, Willke A. Hastanede yatan hastalardan izole edilen enterokok türleri ve antibiyotiklere direnç durumu. ANKEM Derg, 2004;18(3):141-4.
4. 10. Kaçmaz B, Akça G, Sultan N. Enterokokların antibiyotiklere direnç oranlarının araştırılması. İnfek Derg, 2004;18(3): 287-92.
5. 11. Sümerkan B. Streptococcus pneumoniae ve enterokoklarda antibiyotik direnci: 2003-2004 Türkiye haritası. ANKEM Derg. 2005; 19(Ek 2): E61-5.
6. 12. Çınar T, Leblebicioğlu H, Sümbül M, Eroğlu C, Esen Ş, Günaydın M. Enterokoklarda yüksek düzey gentamisin ve streptomisin direncinin araştırılması. Flora Dergisi. 1999; 4(2): 114-119.
7. 13. Kaçmaz B, Altan A. Antimicrobial resistance of enterococci in Turkey. Int J Antimicrob Agents. 2005; 12(6): 535-8.
8. 14. Aral M, Paköz NİE, Aral İ, Doğan S. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Enterococcus faecalis ve Enterococcus faecium suşlarının antibiyotik direnci. Turk Hij Den Biyol Derg: 2011; 68 (2): 85 – 92.15. Dilek AR, Yıldız F, Dilek N, Bülent Y, Toraman Z. Linezolidin MRSA ve Enterococcus spp suşlarına in-vitro etkinliği ANKEM Derg 2007; 21(4): 211-3.

9. 16. Zhanel GG, DeCorby M, Laing N, et al. Antimicrobial-resistant pathogens in intensive care units in Canada: results of the Canadian National Intensive Care Unit (CAN-ICU) study, 2005-2006. Antimicrob Agents Chemother. 2008; 52(4): 1430-7.
10. 17. Özseven AG, Sesli-Çetin E, Cicioğlu-Arıdoğan B, Çiftçi E, Özseven L. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıkları. ANKEM Derg. 2011; 25(4): 256-62.
11. 18. Aktaş G, Derbentli Ş. Vankomisine dirençli entero¬kokların önemi ve epidemiyolojik özellikleri. Infeks Derg 2009; 23:201-9.19. Aguş N, Sarıca A, Özkalay N, Cengiz A. Klinik örneklerden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik direnci. ANKEM Derg. 2006; 20(3): 145-7.
12. 20. Çetinkaya Y, Falle P, Mayhall CG. Vancomycin-resistant enterococci. Clin Microbiol Rev. 2000; 13(4): 686-707. 21. Vural T, Şekercioğlu AO, Öğünç D, Gültekin M, Çolak D, Yeşilipek A, Ünal S, Kocagöz S, Mutlu G. Vankomisine direncli Enterococcus faecium suşu. ANKEM Derg. 1999; 13(1): 1-4. 22. Kalaycı Ö, Yurtsever SG, Güngör S, Uzun B, Kurultay N. İdrar örneklerinden izole edilen entero¬kokların in vitro antibiyotik direnç oranlarının değerlendirilmesi. Klimik Derg 2011; 24:105-7. http://dx.doi.org/10.5152/kd.2011.25