Restriksiyon Parça Uzunluk Polimorfizmi (RFLP) tekniği kullanılarak tüm genomun analizinde Bovine Herpesviruses-1 (BoHV-1) suşlarını BoHV-1.1, 1.2a, 1.2b olmak üzere üç alt tipte sınıflandırılmaktadır. Bu alt tipler klinik bulgular göre de değerlendirilmektedir ancak bu yönde henüz net bir ilişkilendirme yapılmamıştır. Çoğunlukla BoHV-1.2b, genital hastalık bulgularıyla ilişkilendirilmektedir. Bu çalışmada solunum yolu hastalığından alınan nazal sürüntü örneğinde BoHV-1 izolatı elde edilmiştir. Bu çalışmada ayrıca, genomun UL44 (Glikoprotein C) bölgesini hedefleyen filogenetik analiz ve UL39 - US3 bölgelerini hedefleyen, yeni geliştirilen bir multipleks PCR analizini takiben Hind III enzimi kullanılarak uygulanan RFLP ile alt tiplendirme gerçekleştirilmiştir. Aynı zamanda izolasyon başarısı iki farklı devamlı hücre hattında karşılaştırılmıştır. SFT-R hücre hattı, BoHV-1 saha örneklerinin izolasyonunda MDBK hücre hattına nazaran daha duyarlı bulunmuştur. Elde edilen izolat (ID:8640), BoHV-1.2b olarak sınıflandırılırken, Cooper suşundan serolojik olarak ayırt edilemediği değerlendirildi. Mevcut çalışma, BoHV-1.2b'nin Türkiye'deki ilk izolasyonunu bildirmesinin yanı sıra klinik solunum yolu hastalığından nadir tespit edilen BoHV-1.2b izolasyonunu bildirmektedir. Sonuçlar ayrıca kolay ve hızlı alt tipleme için PCR tabanlı RFLP analizinin etkinliğini gösteren veriler içermektedir. Ancak BoHV-1 saha izolatlarının genetik çeşitliliğine bağlı olarak bu teknik üzerine daha fazla araştırma yapılmasına ihtiyaç duyulmaktadır.
BoHV-1 subtyping molecular characterization restriction endonuclease analysis virus isolation
Bursa Uludağ University Research Fund (BUU-BAP); Turkish Scientific and Technological Research Council (TUBİTAK)
OUAP(V)-2020/7; 119 O 571
OUAP(V)-2020/7; 119 O 571
Primary Language | English |
---|---|
Subjects | Veterinary Surgery |
Journal Section | Research Articles |
Authors | |
Project Number | OUAP(V)-2020/7; 119 O 571 |
Publication Date | December 31, 2022 |
Acceptance Date | July 25, 2022 |
Published in Issue | Year 2022 |