anajas Anadolu Tarım Bilimleri Dergisi 1308-8750 1308-8769 Ondokuz Mayıs Üniversitesi 10.7161/omuanajas.480586 Saf Gerze tavuğu ve Sinop ili köy tavuğu popülasyonlarının sekiz polimorfik mikrosatellit lokusu bakımından karşılaştırılması Comparison of Gerze and village chicken populations in Sinop by eight polymorphic microsatellite loci Mercan Levent ONDOKUZ MAYIS ÜNİVERSİTESİ, ZİRAAT FAKÜLTESİ Bilgi Fatih ONDOKUZ MAYIS ÜNİVERSİTESİ, ZİRAAT FAKÜLTESİ Budak Merve 06 25 2019 34 2 164 171 11 08 2018 02 14 2019 Copyright © 1986, Anadolu Tarım Bilimleri Dergisi 1986 Anadolu Tarım Bilimleri Dergisi

Araştırma, Sinop ili Gerze ilçesindebulunan koruma altındaki saf Gerze tavuğu popülasyonu ve aynı ildeyetiştiriciliği yapılan köy tavuğu popülasyonları arasındaki genetik ilişkininbelirlenmesi amacıyla yürütülmüştür. Çalışmada yüksek düzeyde polimorfizmgösteren 8 adet mikrosatellit lokusu kullanılmıştır. Çalışmanın hayvanmateryalini, Sinop ili Ayancık, Boyabat ve Gerze ilçelerinde bulunan 3 köytavuğu popülasyonuna ait 60 örnek ve Gerze ilçesinde koruma altında tutulan 20adet saf Gerze tavuğu oluşturmuştur. Sinop Gerze Köy, Sinop Gerze (Hacıkadı),Sinop Ayancık Köy ve Sinop Boyabat Köy popülasyonlarında beklenenheterozigotluk (He) değerleri sırasıyla 0.820, 0.755, 0.795 ve 0.741olarak hesaplanmıştır. Popülasyon ayrımı yapılmaksızın hesaplanan akrabalıyetiştirme katsayısı (FIS) değerleri LEI0166, MCW0034 ve MCW0069lokuslarında -0.131, -0.195, -0.137 ve ADL0278, LEI0234, MCW0080, MCW0104,MCW0330 lokuslarında ise sırasıyla 0.178, 0.134, 0.766, 0.508 ve 0.433 olarakbulunmuştur. Temel koordinatlar ve Structure analizi sonuçları saf Gerze(Hacıkadı) popülasyonunun diğer köy popülasyonlarından genetik olarak farklıolduğunu ortaya koymuştur. Araştırmada, halk elinde yetiştiriciliği yapılanGerze tavuklarının saf olmadığı, bu ırkın korunması için bölgede saf olarakyetiştirilmesinin gerekli olduğu sonucuna varılmıştır.

In this study, we aimed to identify the geneticrelation between indigenous Gerze chicken population which is conserved inGerze district of Sinop province and village chicken populations which areraised in Sinop. We used 8 highly polymorphic microsatellite loci forexaminations. Animal materials of this study are total of 60 samples from 3village chicken populations raised in Ayancık, Boyabat and Gerze districts, and20 samples from Gerze chicken from the conserved population in Gerze districtof Sinop province. Expected heterozygosity (He) values in SinopGerze Village, Sinop Gerze (Hacıkadı), Sinop Ayancık Village and Sinop BoyabatVillage populations were calculated as 0.820, 0.755, 0.795 and 0.741,respectively. FIS values were predicted as -0.131, -0.195, -0.137 inLEI0166, MCW0034 ve MCW0069 loci and 0.178, 0.134, 0.766, 0.508, 0.433 inADL0278, LEI0234, MCW0080, MCW0104, MCW0330 loci respectively. Principalcoordinate and Structure analyses’ results showed that Gerze (Hacıkadın)population is genetically different from the other village populations. In thestudy, it was concluded that the chickens in the Gerze villages are not purebreed. Thus, pure breed raising is necessary to conserve this breed in theregion.

 Genetik çeşitlilik Köy tavuğu Mikrosatellitler Sinop Genetic diversity Village chicken Microsatellites Sinop Abebe, A.S., Mikko, S., Johansson, A.M., 2015. Genetic diversity of five local swedish chicken breeds detected by microsatellite markers. Plos One, 10, 4: e0120580. Anderson, M., Willis, T.J., 2003. Canonical analysis of principal coordinates: a useful method of constrained ordination for ecology. Ecology, 84, 2: 511-525. Anmarkrud, J.A., Kleven, O., Bachmann, L., Lifjeld, J.T., 2008. Microsatellite evolution: Mutations, sequence variation and homoplasy in the hypervariable avian microsatellite locus HrU10. BMC Evolutionary Biology, 8: 138-147. Bruford, M.W., Wayne, R.K., 1993. Microsatellites and their application to population genetic studies. Current Opinion in Genetics and Development, 3: 939-943. Chatterjee, R.N., Bhattacharya, T.K., Dange, M., Dushyanth, K., Niranjan, M., Reddy, B.L.N., Rajkumar, U., 2014. Genetic heterogeneity among various indigenous and other chicken populations with microsatellite markers. Journal of Applied Animal Research, 43, 3: 266-271. Chen, G., Bao, W., Shu, J., Ji, C., Wang, M., Eding, H., Muchadeyi, F., Weigend, S., 2008. Assessment of Population Structure and Genetic Diversity of 15 Chinese Indigenous Chicken Breeds Using Microsatellite Markers. Asian-Australasian Journal of Animal Sciences, 21, 3: 331 - 339. Elmaci, N., Berry, R.S., 1999. Principal Coordinate Analysis on a Protein Model. Journal of Chemical Physics. 110, 21: 10606-10622. Fadhıl, M., Mercan, L., 2017. Molecular Characterization of Mx Gene Polymorphism in Gerze Chicken Breed and Pure Line Chicken Breed. Animal Research International, 13, 3: 2540-2543. FAO, 2007. The State of the World’s Animal Genetic Resources for Food and Agriculture. FAO, 2017. FAOSTAT, http://www.fao.org/faostat/en/#data/QL. Granevitze, Z., Hillel, J., Chen, G.H., Cuc, N.T.K., Feldman, M., Eding, H., Weigend, S., 2007. Genetic diversity within chicken populations from different continents and management histories. Animal Genetics, 38: 576-83. Hillel, J., Granevitze, Z., Twito, T., Ben-Avraham, D., Blum, S., Lavi, U., David, L., Feldman, M.W., Cheng, H., Weigend, S., 2007. Molecular markers for assessment of chicken biodiversity. World Poultry Science Journal, 63: 33-45. Mercan, L., Okumuş, A., 2015. Genetic diversity of village chickens in central black sea region and commercial chickens in Turkey by using microsatellite markers. Turkish Journal of Veterinary and Animal Sciences, 39: 134-140. Notter, D. R., 1999. The importance of genetic diversity in livestock populations of the future. Journal of Animal Science, 77: 61-69. Peakall, R., Smouse, P.E., 2012. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update. Bioinformatics 28, 2537-2539. Pritchard, J. K., Stephens, M., Donnelly, P., 2000. Inference of population structure using multilocus genotype data. Genetics, 155: 945-959. Rohlf, F.J., 2000. Numeric Taxonomy System Version 2.11. NTSYSpc, East Setauket, New York, USA. Romanov, M.N., Wezyk, S., Cywa-Benko, K., Sakhatsky, N.I., 1996. Poultry genetic resources in the countries of Eastern Europe history and current state. Poultry Avian Biology, 7: 1-29. Romanov, M.N., Weigend, S., 2001. Analysis of genetic relationships between various populations of domestic and jungle fowl using microsatellite markers. Poultry Science, 80: 1057-1063. Sarıca, M., Yamak, U.S., Boz, M.A., Uçar, A., 2014. Geriye Melezlemeyle Üretilen Etçi Genotiplerin Bir Ticari Etlik Piliç Genotipiyle Büyüme, Kesim ve Karkas Özellikleri Bakımından Karşılaştırılması. Tavukçuluk Araştırma Dergisi, 11, 1: 5-9. Suh, S., Sharma, A., Lee, S., Cho, C.Y., Kim, J.H., Choi, S.B., Kim, H., Seong, H.H., Yeon, S.H., Kim, D.H., Ko, G.Y., 2014. Genetic diversity and relationships of Korean chicken breeds based on 30 microsatellite markers. Asian-Australasian Journal of Animal Sciences, 27, 10: 1399-1405. Tadano, R., Nishibori, M., Imamura, Y., Matsuzaki, M., Kinoshita, K., Mizutani, M., Namikawa, T., Tsudzuki, M., 2007. High genetic divergence in miniature breeds of japanese native chickens compared to red junglefowl, as revealed by microsatellite analysis. Animal Genetics, 39: 71-78. Wilkinson, S., Wiener, P., Teverson, D., Haleyand, C.S., Hocking, P.M., 2011. Characterization of the genetic diversity, structure and admixture of British chicken breeds. Animal Genetics, 43: 552-563. Wright, S., 1951, The Genetical Structure of Populations. Annals of Eugenics, 15: 323-354. Wright, S., 1969. Evolution and Genetics of Populations: The Theory of Gene Frequencies. Univ. Chicago Press, Chicago.