Research Article

Applications of Different Comet Assay (the Single Cell Gel Eelectrophoresis) Methods for Detecting DNA Damage in Cryopreserved Fish Sperm

Volume: 1 Number: 1 December 11, 2016
TR EN

Kriyoprezervasyon Uygulanmış Balık Sperm Hücrelerinde DNA Hasarının Tespitinde Farklı Comet Analizi (Tek Hücre Jel Elektroforezi) Metotlarının Uygulanmaları

Abstract

Kriyoprezervasyon, hem insan hem de hayvan gametlerinin, hatta embriyolarının, başarılı bir şekilde uzun süreli saklanması için yaygın olarak kullanılan yardımcı üreme tekniklerindendir. Ayrıca, sperm kriyoprezervasyonun birçok avantajı vardır. Örneğin, balıklarda suni döllemenin geliştirilmesinde, genetik manipülasyonların kolaylaştırılmasında, erkek anaç stokunun azaltılmasında kullanılır. Ancak kriyoprezervasyon sonrası, sperm hücrelerinde sonrasında dölleme ve yumurtadan çıkış oranlarının azalmasına sebep olacak motilite kaybı ve DNA hasarı gibi problemler ile oluşabilir. Comet analizi, DNA sarmalındaki kırıkları tek bir sperm hücresi seviyesinde tespit edebilen basit ve hassas bir araçtır. 

Bu çalışmada, farklı kimyasal maddeler ve uygulama zamanlarına sahip üç farklı Comet analiz metodu balık sperm hücrelerine uygulanmıştır. Olgun sazan balığı (Cyprinus carpio)  bireylerinden alınan sperm örnekleri bu çalışmada kullanılmıştır. Öncelikle, taze sperm örnekleri kullanılarak, her metot için liziz solüsyonuna 12, 25 ve 50 µM H2O2 eklenerek DNA hasarı sınıflandırılmıştır. Böylece, DNA hasarı, her hücre DNA’sının oluşturduğu kuyruk uzunluğuna göre floresan mikroskop altında incelenerek görsel olarak, 1. 2. ve 3. dereceden hasarlı ve H2O2 eklenmemiş örnekler 0 (hasarsız) olarak ölçeklendirilebilir. Sonrasında,  kriyoprezervasyon uygulanmış sperm örnekleri çözündürülerek, üç farklı Comet analiz metodu uygulanmıştır. Üç metoda ait yüzde hasarsız DNA sonuçları (%67,7±2,0; % 69,3±1,8 ve %68,2±2,8)  arasında ve toplam hasarlı DNA sonuçları (%32,3±2,0; % 30,7±1,8 ve %31,8±2,8) arasında istatistiki olarak önemli derece fark saptanamamıştır. Buna karşın, DNA hasar sınıflandırmaları arasında bazı istatistiksel farklılıklar bulunmaktadır. Sonuç olarak, her üç metot hasarsız ve toplam hasarlı DNA tespitinde benzer başarıyı göstermekte iken DNA hasar sınıflarının tanımlanmasında farklılıklar olabilmektedir.


Keywords

References

  1. Barbas JP, Mascarenhas RD ( 2009): Cryopreservation of domestic animal sperm cells. Cell Tissue Bank 10(1): 49-62.
  2. Baumber JB, Barry A, Jennifer J, Stuart A (2003): Reactive Oxygen Species and Cryopreservation Promote DNA Fragmentation in Equine Spermatozoa. J Androl 24(4): 621-28.
  3. Cabrita E, Alvarez R, Anel L, Rana KJ, Herráez MP (1998): Sublethal damage during cryopreservation of rainbow trout sperm, Cryobiology 37: 245-53.
  4. Cabrita E, Robles V, Rebordinos L, Sarasquete C, Herráez MP (2005): Evaluation of DNA damage in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) and gilthead sea bream (Sparus aurata) cryopreserved sperm. Cryobiology 50: 144-53.
  5. Chao N, Liao IC (2001): Cryopreservation of finfish and shellfish gametes and embryos. Aquaculture 197: 161-189.
  6. Chao NH, Chao WC, Liu KC, Liao IC (1987): The properties of tilapiasperm and its cryopreservation, J Fish Biol 30: 107-18.
  7. Diwan AD, Ayyappan S, Lal KK, Lakra WS (2010): Cryopreservation of fish gametes and embryos. Indian Journal of Animal Sciences 80(4): 109-24.
  8. Fraser L, Strzeżek J (2005): Effects of Freezing–Thawing on DNA Integrity of Boar Spermatozoa Assessed by the Neutral Comet Assay. Reprod Domest Anim 40: 530-36.

Details

Primary Language

English

Subjects

Structural Biology, Hydrobiology

Journal Section

Research Article

Authors

Burak Evren İnanan
AKSARAY ÜNİVERSİTESİ
Türkiye

Nazlı Yıldırım This is me
MUGLA SITKI KOCMAN UNIV
Türkiye

Ekin Demirkaya This is me
MUGLA SITKI KOCMAN UNIV

Publication Date

December 11, 2016

Submission Date

September 2, 2016

Acceptance Date

January 28, 2017

Published in Issue

Year 2016 Volume: 1 Number: 1

APA
İnanan, B. E., Yıldırım, N., & Demirkaya, E. (2016). Applications of Different Comet Assay (the Single Cell Gel Eelectrophoresis) Methods for Detecting DNA Damage in Cryopreserved Fish Sperm. Journal of Advances in VetBio Science and Techniques, 1(1), 6-13. https://izlik.org/JA98FU64CY
AMA
1.İnanan BE, Yıldırım N, Demirkaya E. Applications of Different Comet Assay (the Single Cell Gel Eelectrophoresis) Methods for Detecting DNA Damage in Cryopreserved Fish Sperm. J Ad VetBio Sci Tech. 2016;1(1):6-13. https://izlik.org/JA98FU64CY
Chicago
İnanan, Burak Evren, Nazlı Yıldırım, and Ekin Demirkaya. 2016. “Applications of Different Comet Assay (the Single Cell Gel Eelectrophoresis) Methods for Detecting DNA Damage in Cryopreserved Fish Sperm”. Journal of Advances in VetBio Science and Techniques 1 (1): 6-13. https://izlik.org/JA98FU64CY.
EndNote
İnanan BE, Yıldırım N, Demirkaya E (December 1, 2016) Applications of Different Comet Assay (the Single Cell Gel Eelectrophoresis) Methods for Detecting DNA Damage in Cryopreserved Fish Sperm. Journal of Advances in VetBio Science and Techniques 1 1 6–13.
IEEE
[1]B. E. İnanan, N. Yıldırım, and E. Demirkaya, “Applications of Different Comet Assay (the Single Cell Gel Eelectrophoresis) Methods for Detecting DNA Damage in Cryopreserved Fish Sperm”, J Ad VetBio Sci Tech, vol. 1, no. 1, pp. 6–13, Dec. 2016, [Online]. Available: https://izlik.org/JA98FU64CY
ISNAD
İnanan, Burak Evren - Yıldırım, Nazlı - Demirkaya, Ekin. “Applications of Different Comet Assay (the Single Cell Gel Eelectrophoresis) Methods for Detecting DNA Damage in Cryopreserved Fish Sperm”. Journal of Advances in VetBio Science and Techniques 1/1 (December 1, 2016): 6-13. https://izlik.org/JA98FU64CY.
JAMA
1.İnanan BE, Yıldırım N, Demirkaya E. Applications of Different Comet Assay (the Single Cell Gel Eelectrophoresis) Methods for Detecting DNA Damage in Cryopreserved Fish Sperm. J Ad VetBio Sci Tech. 2016;1:6–13.
MLA
İnanan, Burak Evren, et al. “Applications of Different Comet Assay (the Single Cell Gel Eelectrophoresis) Methods for Detecting DNA Damage in Cryopreserved Fish Sperm”. Journal of Advances in VetBio Science and Techniques, vol. 1, no. 1, Dec. 2016, pp. 6-13, https://izlik.org/JA98FU64CY.
Vancouver
1.Burak Evren İnanan, Nazlı Yıldırım, Ekin Demirkaya. Applications of Different Comet Assay (the Single Cell Gel Eelectrophoresis) Methods for Detecting DNA Damage in Cryopreserved Fish Sperm. J Ad VetBio Sci Tech [Internet]. 2016 Dec. 1;1(1):6-13. Available from: https://izlik.org/JA98FU64CY

 

22563     logo_world_of_journals_no_margin.png     logo.png         download?token=eyJhdXRoX3JvbGVzIjpbXSwiZW5kcG9pbnQiOiJqb3VybmFsIiwib3JpZ2luYWxuYW1lIjoiZ29vZ2xlLXNjaG9sYXIyLmpwZyIsInBhdGgiOiI0YmNjL2M3YTEvZDJlZC82YTRkMjM4ZmIzNzNlOC42ODEzNzAwNi5qcGciLCJleHAiOjE3ODM0NDM4NzEsIm5vbmNlIjoiZTZiODBhZWQ3YTNjMzYzYmJhNjhiODFkYzZiODUwMTYifQ.2JojxvY-UGBIyhQ5h9ld027SWlgZMpsDO3IfZeyd2DE