Gökkuşağı Alabalığında Karşılaşılan Bazı Bakteriyel Hastalık Etkenlerinin Hızlı Teşhisi
Öz
Bu çalışmada, PCR yöntemi ile gökkuşağı alabalığında (Oncorhynchus mykiss) hastalığa neden olan beş farklı patojenin (Aeromonas salmonicida, Aeromonas hydophila, Yersinia ruckeri, Flavobacterium psychrophila ve Renibacterium salmoninarum) hızlı teşhis edilebilmesi için beşyüz elli balık doku (solungaç, böbrek, ağız, deri ve yüzgeç) örneğinden direk olarak saflaştırılan DNA’lar kullanılmıştır. Çalışmamızdaki balık hastalık etkenlerini tespit edebilmek için beş farklı hedef gen bölgesi (gryA, gyrB, ompTS, n-DNA ve YER) kullanılmıştır ve bunların PCR reaksiyonları gerçekleştirilmiştir. Çalışmamızda sonuç olarak, hastalıklara neden olan etken bakteriler, dokulardan izole edilen DNA’lardaki hedef genlerin PCR methodu kullanılarak tespit edilmesiyle 3-4 saat içerisinde tanımlanmıştır.
Anahtar Kelimeler
References
- Austin, B., Austin, D.A. (2007). Bacterial Fish Pathogens Diseases of Farmed and Wild Fish. Springer, Praxis Publishing Chichester, UK.
- Balcazar, J.L., Vendrell, D., de Blas, I., Ruiz-Zarzuela, I., Gironés, O., Múzquiz, J.L. (2007). Quantitative detection of A.salmonicida in fish tissue by real-time PCR using self-quenched, fluorogenic primers. J. Med. Mic., 56(3), 323-8.
- Cerro, A., Marquez, I., Guıjarro, J.A. (2002). Cerro, A., Marquez, I., Guıjarro, J.A. (2002). Simultaneous detection of A.salmonicida. Appl. Envir. Mic., 68(10), 5177-5180.
- Chu, W.H., Lu, C.P. (2005). Multiplex PCR assay for the detection of pathogenic A.hydrophila. J. Fish Dis. 28(7), 437-441.
- Diler, Ö. Altun, S., Çalıkuşu, F., Diler, A. (2000). Gökkuşağı alabalığı (O. mykiss)’nin yaşadığı ortam ile ilişkili kalitatif ve kantitatif bakteriyel florası üzerine bir araştırma, Turkish J. Vet. Anim. Sci., 24, 251-259.
- Gibello, A., Blanco, M.M., Moreno, M.A., Cutuli, M.T., Domenech, A., Domínguez, L., Fernández-Garayzábal, J.F. (1999). Development of a PCR assay for detection of Y. ruckeri in tissues of inoculated and naturally infected trout. Appl. Envir. Mic., 65(1), 346-350.
- Gustafson, C.E., Thomas, C.J., Trust, T.J. (1992). Detection of A.salmonicida from fish by using PCR amplification of the virulence surface array protein gene. App. Envir.Mic., 58(12), 3816-25.
- Hidalgo, R., Magi, G.E., Balboa, S., Barja, J.L., Romalde, J.L. (2008).Development of a PCR protocol for the detection of A.salmonicida in fishby ampli. of the fstA gene. Vet. Mic., 128(3), 386-394.
Details
Primary Language
Turkish
Subjects
Hydrobiology
Journal Section
Research Article
Publication Date
December 31, 2018
Submission Date
May 18, 2018
Acceptance Date
November 29, 2018
Published in Issue
Year 2018 Volume: 3 Number: 3


