Araştırma Makalesi
BibTex RIS Kaynak Göster

Dermatofitlerin İzolasyonu, Moleküler Tanımlanması ve Bununla İlişkili Bazı Çevresel Faktörlerin İncelenmesi

Yıl 2023, Cilt: 1 Sayı: 1, 1 - 9, 30.06.2023

Öz

Bu çalışmanın amacı, dermatofitlerin laboratuvarda fungal test yöntemleriyle izole edilmesi
ve teşhis edilmesi, ortaya çıkan türlerin tanımlanması ve mevcut yerel izolatların Ulusal
Biyoteknoloji Bilgi Merkezi (NCBI) tarafından sağlananlarla karşılaştırılmasıdır.
Dermatofit izolatları, kolonilerinin makroskopik ve mikroskopik özellikleri incelenerek
tanımlanmıştır. Teşhislerinin doğruluğundan emin olmak için, PCR tekniği kullanılarak
elde edilen sonuçlar, primerlerin (ITS1, ITS4) incelenen mantarların genomlarını
çoğalttığını ve çoğaltılan bantların (600 baz çifti) arasında değiştiğini göstermiştir. Bu
çalışmadaki 1.2.3.4 numaralı izolatlar, izolatlarla benzerlik göstermektedir. Genbank'ta
OP752127 numarasıyla kayıtlı Candida albicans. 5.6.7.8.9 numaralı izolatlar da OP752433
numaralı GenBank'ta kayıtlı Candida glabrata izolatları ile benzerlik göstermektedir.
10.11.12 numaralı türler OP712459 numaralı GenBank'ta kayıtlı Candida tropicalis
izolatları ile benzerlik göstermektedir. 13.14.15 ve 16 numaralı izolatlar GenBank
OP712621'de kayıtlı Trichophyton mentagrophytes izolatları ile benzerlik göstermektedir.
17 ve 18 numaralı izolatlar da Scopulariopsis brevicaulis ile benzerlik göstermektedir ve
Genbank OP752128'de kayıtlıdır.

Kaynakça

  • Ahmadi, B., Mirhendi, H., Shidfar, M. R., Nouripour-Sisakht, S., Jalalizand, N., Geramishoar, M., & Shokoohi, G. R. (2015). A comparative study on morphological versus molecular identification of dermatophyte isolates. J Mycol Med, 25(1), 29-35.
  • Al-Aboudi, Khansa Abdul-Hussein Abadi, Zikra Muhammad Kazem Al-Mutairi, Ban Taha Muhammad, (2016). Morphological and molecular isolation and diagnosis of the mouth and diaphragm regions of children from Karbala Children’s Teaching Hospital in the holy city of Karbala. Karbala University Scientific Journal, Karbala University, College of Education for Pure Sciences, Department of Life Sciences, Volume Fourteen, Issue Four, pp. 116-122.
  • Al-Khafajii, K. (2014). Myco-epidemiologic and genetic study of rermatophytosis and non dermatophytes in middle euphrates Iraq. African Journal of Microbiology Research, 8(24), 2381-2386.
  • Didehdar, M., Shokohi, T., Khansarinejad, B., Sefidgar, S. A. A., Abastabar, M., Haghani, I., & Mondanizadeh, M. (2016). Characterization of clinically important dermatophytes in North of Iran using PCR-RFLP on ITS region. Journal de Mycologie Medicale, 26(4), 345-350.
  • Dilek, N., Yücel, A. Y., Dilek, A. R., Saral, Y., & Toraman, Z. A. (2009). Dermatophytosis agents in patients who attending to dermatology clinic of Firat University Hospital/Firat Universitesi Hastanesi dermatoloji klinigi'ne basvuran hastalardaki dermatofitoz etkenleri. Turkish Journal of Dermatology, 3, 27-32
  • Dwaish, A. S., Yousif, D. Y., Alwan, A. H., & Lefta, S. N. (2018). Anti-dermatophytes activity of macroalgal extracts (Chara vulgaris) isolated from Baghdad City-Iraq. Journal of global pharma Technology, 10(03), 759-766.
  • Elavarashi, E., Kindo, A. J., & Rangarajan, S. (2017). Enzymatic and non enzymatic virulence activities of dermatophytes on solid media. Journal of Clinical and Diagnostic Research: J Clin Diagn Res, 11, 23-25.
  • El-Diasty, E. M., Ahmed, M. A., Okasha, N. A. G. W. A., Mansour, S. F., El-Dek, S. I., El-Khalek, H. M. A., & Youssif, M. H. (2013). Antifungal activity of zinc oxide nanoparticles against dermatophytic lesions of cattle. Romanian J. Biophys, 23, 191-202.
  • Mohammed, S. J., Noaimi, A. A., Sharquie, K. E., Karhoot, J. M., Jebur, M. S., Abood, J. R., & AlHamadani, A. (2015). A Survey Of Dermatophytes Isolated From Iraqi Patients In Baghdad City. AL-Qadisiyah medicalI journal, 11(19), 10-15.
  • Ellis, D. H. (1994). Clinical mycology: The human opportunistic mycoses. Pfizer Incorporated. p 166. Emmons, C. W., Binford, C. H., & Vtzx, J. P. (1974). Medical mycology. 2nd ed. Lea and Febiger. Philadeliphia.pp: 508-509.
  • Ergin, Ç. (2007). Dermatofitlerin doğadan soyutlanması. İnfeksiyon dergisi, 21, 113-116 Faergemann, J., & Baran, R. (2003). Epidemiology, clinical presentation and diagnosis of onychomycosis. British Journal of Dermatology, 149, 1-4.
  • Ghojoghi, A., Falahati, M., Paghehm A. S., Abastabar, M., Ghasemi, Z., Ansari, S., Farahyar, S., & Roudbary, M. (2015). Molecular identification of epidemiological aspect of Dermatophytosis in Tehran, Iran. J. Research in Molecular Medicine, 3, 11-16.
  • Goa, K. L., & Barradell, L. B. (1995). Fluconazole. Drugs, 50(4), 658-690.
  • Godoy, J. S., de Souza Bonfim‐Mendonça, P., Nakamura, S. S., Yamada, S. S., Shinobu‐Mesquita, C., Pieralisi, N., Fiorini, A., & Svidzinski, T. I. (2013). Colonization of the oral cavity by yeasts in patients with chronic renal. failure undergoing hemodialysis. Journal of Oral Pathology & Medicine, 42(3), 229-234.
  • Gürcan, Ş. (2007). Tek konidiyum oluşturan hyalen küfler ve infeksiyonları (Scedosporium, Chrysosporium, Sepedoniumve Beauveria). İnfeksiyon dergisi, 21, 159-164.
  • Jha, B. K., Murthy, S. M., & Devi, N. L. (2012). Molecular identification of dermatophytosis by polymerase chain reaction (PCR) and detection of source of infection by restricted fragment length polymorphism (RFLP). Journal of College of Medical Sciences-Nepal, 8(4), 7-15.
  • Kardjeva, V., Summerbell, R., Kantardjiev, T., Devliotou-Panagiotidou, D., Sotiriou, E., & Graser, Y. (2006). Forty-eight-hour diagnosis of onychomycosis with subtyping of Trichophyton rubrum strains. Journal of clinical microbiology, 44(4), 1419-1427.
  • Lackner, M., Judith O., Verena N., Raschbichler, L. M., Carmen, K., Johannes, P, Julia, M., Sibylle, F., Cornelia L.F. & Ulrike, B. (2019). Cryptic Species of Aspergillus Section Terrei Display Essential Physiological Features to Cause Infection and Are Similar in Their Virulence Potential in Galleria Mellonella. Virulence, 10(1),542–54.
  • Faergemann, J., & Baran, R. (2003). Epidemiology, Clinical Presentation and Diagnosis of Onychomycosis. In British Journal of Dermatology, Supplement, 149, 1–4.
  • Liu, D., Coloe, S., Baird, R., & Pedersen, J. (2000). Application of PCR to the Identification of Dermatophyte Fungi. Journal of Medical Microbiology, 49(6),493–97.
  • Malcolm, G. M., López‐Gutıérrez, J. C., Koide, R. T., & Eissenstat, D. M. (2008). Acclimation to temperature and temperature sensitivity of metabolism by ectomycorrhizal fungi. Global Change Biology, 14(5), 1169-1180.
  • McGinnis, M., Ajello, L., & Schell, W. A. (1985). A Proposed Nomenclature. International journal of dermatology, 24(1), 9-15.
  • Michel, G. W. (1977). Nystatin. In Analytical profiles of drug substances (Vol. 6, pp. 341-421). Academic Press.
  • Mohammed, S. J., Noaimi, A. A., Sharquie, K. E., Karhoot, J. M., Jebur, M. S., Abood, J. R., & AlHamadani, A. (2015). A survey of dermatophytes isolated from Iraqi patients in Baghdad City. Al-Qadisiyah Medical Journal, 11(19), 10-15.
  • Naik, P. S., Mangala, G. K., & Lava, R. (2019). Spectrum of dermatophytic fungal ınfection in Tertiary Care Hospital, Davanagere. Int.J.Curr.Microbiol.App.Sci 8(3), 165-171.
  • Pal, M. (2017). Dermatophytosis in an Adult Cattle due to Trichophyton verrucosum. Animal Husbandry, Dairy and Veterinary Science, 1(1), 1-3.
  • Pinjon, E., Sullivan, D., Salkin, I., Shanley, D., & Coleman, D. (1998). Simple, inexpensive, reliable method for differentiation of Candida dubliniensis from Candida albicans. J. Clin. Microbiol. 36, 2093-2095.
  • Prize, C., Pauli, M., & Bazerque, P. (1990). Anantibiotic assay by the agar-well diffusion Method. J. Actabiologiae, 15, 113-115.
  • Reddy, K. R. (2017). Fungal infections (Mycoses): Dermatophytoses (Tinea, Ringworm). Journal of Gandaki Medical College-Nepal, 10(1).
  • Rippon, J. W. (1982). Medical mycology; the pathogenic fungi and the pathogenic actinomycetes. Eastbourne, UK; WB Saunders Company.
  • Sahoo, A. K., & Mahajan, R. (2016). Management of tinea corporis, tinea cruris, and tinea pedis: A comprehensive review. Indian Dermatology Online Journal, 7(2), 77.
  • Saleh, T. H. (2008). A study on dermatophytes and keratinocytes isolated from some animals and people in contact with them in Maysan Governorate [PhD thesis, University of Basra, College of Science, Republic of Iraq].
  • Sibanda, T., & Okoh, A. I. (2007). The challenges of overcoming antibiotic resistance: Plant extracts as potential sources of antimicrobial and resistance modifying agents. Afr. J. Biotechnol. 6(25), 2886-2896.
  • Viani, F. C., Dos Santos, J. I., Paula, C. R., Larson, C. E., & Gambale, W. (2001). Production of extracellular enzymes by microsporum canis and their role in its virulence. Medical Mycology, 39(5), 463–68.
  • Weitzman, I., & Summerbell, R. C. (1995). The dermatophytes. Clinical microbiology reviews, 8(2), 240-259.
  • Whittam, L. R., & Hay, R. J. (1997). The impact of onychomycosis on quality of life. Clinical And Experimental Dermatology, 22(2), 87–89.
  • Zarrin, M., Salehi, Z., & Mahmoudabadi, A. Z. (2015). Identification of dermatophytes by arbitrarily primed PCR. Asian Biomedicine, 9(3), 291-298 .
  • Ziolkowska, G., Nowakiewicz, A., Gnat, S., Troscianczyk, A., Zieba, P., & Majer Dziedzic, B. (2015). Molecular identification and classification of Trichophyton mentagrophytes complex strains isolated from humans and selected animal species. Mycoses, 58(3), 119-126.
Toplam 38 adet kaynakça vardır.

Ayrıntılar

Birincil Dil Türkçe
Konular Bitki Hücresi ve Moleküler Biyoloji
Bölüm Araştırma Makalesi
Yazarlar

Murad Khamees Mushıb Bu kişi benim 0000-0001-9791-0112

Waleed Khalid Ahmed Bu kişi benim 0000-0002-7659-6336

Muhammet Gaffaroğlu Bu kişi benim 0000-0001-7436-5828

Yayımlanma Tarihi 30 Haziran 2023
Gönderilme Tarihi 14 Aralık 2022
Yayımlandığı Sayı Yıl 2023 Cilt: 1 Sayı: 1

Kaynak Göster

APA Mushıb, M. K., Ahmed, W. K., & Gaffaroğlu, M. (2023). Dermatofitlerin İzolasyonu, Moleküler Tanımlanması ve Bununla İlişkili Bazı Çevresel Faktörlerin İncelenmesi. Kırşehir Ahi Evran Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 1(1), 1-9.