Research Article

KOLİSTİN DUYARLILIK TESTİ İÇİN DIAGNOSTICS COLISTIN MIC-STRIP TESTİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ

Volume: 35 Number: 1 April 29, 2021
TR EN

KOLİSTİN DUYARLILIK TESTİ İÇİN DIAGNOSTICS COLISTIN MIC-STRIP TESTİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ

Abstract

Günümüzde çoklu ilaç direncine sahip Gram negatif mikroorganizmaların neden olduğu enfeksiyonların tedavisinde kullanılacak antimikrobiyallerin kısıtlı olması nedeniyle kolistin gibi eski antibiyotikler sıklıkla tercih edilmeye başlanmıştır. Ancak, kolistinin katyonik yapısı nedeniyle rutin laboratuvarda sıklıkla kullanılan antibiyotik duyarlılık testlerinde (disk difüzyon, gradient test, otomatize sistemler) birtakım sorunlar yaşanmaktadır. Bu nedenle European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) ve Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) tarafından kolistin duyarlılığını saptamak için sadece sıvı mikrodilüsyon testi önerilmektedir. Ancak sıvı mikrodilüsyon testlerinin zaman alıcı ve zahmetli olması nedeniyle rutin laboratuvarlarında hızlı ve güvenilir kolistin duyarlılığı sonucu sağlayabilen testlere ihtiyaç duyulmaktadır. Bu çalışmada, Klebsiella pneumoniae ve Acinetobacter baumannii kökenlerinde kolistin duyarlılığının saptanmasında ticari olarak hazır olarak üretilen Diagnostics MIC-COL (Diagnostics I.n.c., Galanta, Slovakya) testinin performansının değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Rutin laboratuvarımızda 2016-2019 yılları arasında çeşitli klinik örneklerden izole edilen K.pneumoniae (n=22) ve A.baumannii (n=28) kökenleri çalışmaya dahil edilmiştir. Kökenlerin kolistin minimum inhibitör konsantrasyonları (MİK) hem referans yöntem olan sıvı mikrodilüsyon yöntemi ile hem de ticari olarak üretilen Diagnostics MIC-COL testi ile çalışılmıştır. Elde edilen sonuçlar karşılaştırılarak testin temel uyum, kategorik uyum, büyük hata ve çok büyük hata oranları hesaplanmıştır. Sıvı mikrodilüsyon yöntemi ile karşılaştırıldığında Diagnostics MIC-COL testinin temel uyumu % 84, kategorik uyumu % 98, büyük hata oranı % 3,8 olarak tespit edilirken çok büyük hata tespit edilmemiştir. Rutin laboratuvarlarda hızlı ve güvenilir kolistin duyarlılığının tespit edilerek tedavinin yönlendirilmesi oldukça önemlidir. Çalışmamızda kullanılan ticari test kullanımı kolay ve zaman alıcı olmayan bir testtir. Ayrıca strip şeklinde olması sayesinde her izolat ayrı çalışılabilmektedir. Büyük hata oranının beklenilen değerlerin üzerinde olması nedeniyle daha fazla sayıda ve farklı direnç düzeylerine sahip kökenlerle yapılacak ileri çalışmalarla bu oranların yeniden değerlendirilmesi faydalı olacaktır.

Keywords

References

  1. Baron S, Hadjadj L, Rolain JM, Olaitan AO. Molecular mechanisms of polymyxin resistance: knowns and unknowns. Int J Antimicrob Ag. 2016;48(6):583-91. https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2016.06.023
  2. Caniaux I, van Belkum A, Zambardi G, Poirel L, Gros MF. MCR: modern colistin resistance. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2017;36(3):415-20. https://doi.org/10.1007/s10096-016-2846-y
  3. Chew KL, La MV, Lin RTP, Teo JWP. Colistin and polymyxin b susceptibility testing for carbapenemresistant and mcr-positive Enterobacteriaceae:comparison of Sensititre, MicroScan, Vitek 2, and Etest with broth microdilution. Journal of Clinical Microbiology. 2017;55(9):2609-16. https://doi.org/10.1128/JCM.00268-17
  4. Dafopoulou K, Zarkotou O, Dimitroulia E, et al. Comparative evaluation of colistin susceptibility testing methods among carbapenem-nonsusceptible Klebsiella pneumoniae and Acinetobacter baumannii clinical isolates. Antimicrob Agents Chemother 2015;59(8):4625-30. https://doi.org/10.1128/AAC.00868-15
  5. ECDC. Plasmid-mediated colistin resistance in Enterobacteriace ae. 2016. https://ecdc.europa.eu/ sites/portal/files/media/en/publications/Publications/enterobacteriaceae-risk-assessment-diseases-causedby-antimicrobial-resistant-microorganisms-europejune-2016.pdf.
  6. European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Recommendations for MIC determination of colistin (polymyxin E) as recommended by the joint CLSI-EUCAST Polymyxin Breakpoints Working Group. (2016).
  7. European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. 2019. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters, version 9.0.(2019).
  8. Ezadi F, Ardebili A, Mirnejad R. Antimicrobial susceptibility testing for polymyxins: challenges, issues, and recommendations. J Clin Microbiol. 2019;57(4). https://doi.org/10.1128/JCM.01390-18

Details

Primary Language

Turkish

Subjects

Clinical Microbiology

Journal Section

Research Article

Publication Date

April 29, 2021

Submission Date

November 4, 2020

Acceptance Date

March 11, 2021

Published in Issue

Year 2021 Volume: 35 Number: 1

APA
Altınkanat Gelmez, G., Sayin, E., Hasdemir, U., & Söyletir, G. (2021). KOLİSTİN DUYARLILIK TESTİ İÇİN DIAGNOSTICS COLISTIN MIC-STRIP TESTİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ. ANKEM Dergisi, 35(1), 9-13. https://doi.org/10.5222/ankem.2021.009
AMA
1.Altınkanat Gelmez G, Sayin E, Hasdemir U, Söyletir G. KOLİSTİN DUYARLILIK TESTİ İÇİN DIAGNOSTICS COLISTIN MIC-STRIP TESTİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ. ANKEM Derg. 2021;35(1):9-13. doi:10.5222/ankem.2021.009
Chicago
Altınkanat Gelmez, Gülşen, Elvan Sayin, Ufuk Hasdemir, and Güner Söyletir. 2021. “KOLİSTİN DUYARLILIK TESTİ İÇİN DIAGNOSTICS COLISTIN MIC-STRIP TESTİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ”. ANKEM Dergisi 35 (1): 9-13. https://doi.org/10.5222/ankem.2021.009.
EndNote
Altınkanat Gelmez G, Sayin E, Hasdemir U, Söyletir G (April 1, 2021) KOLİSTİN DUYARLILIK TESTİ İÇİN DIAGNOSTICS COLISTIN MIC-STRIP TESTİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ. ANKEM Dergisi 35 1 9–13.
IEEE
[1]G. Altınkanat Gelmez, E. Sayin, U. Hasdemir, and G. Söyletir, “KOLİSTİN DUYARLILIK TESTİ İÇİN DIAGNOSTICS COLISTIN MIC-STRIP TESTİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ”, ANKEM Derg, vol. 35, no. 1, pp. 9–13, Apr. 2021, doi: 10.5222/ankem.2021.009.
ISNAD
Altınkanat Gelmez, Gülşen - Sayin, Elvan - Hasdemir, Ufuk - Söyletir, Güner. “KOLİSTİN DUYARLILIK TESTİ İÇİN DIAGNOSTICS COLISTIN MIC-STRIP TESTİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ”. ANKEM Dergisi 35/1 (April 1, 2021): 9-13. https://doi.org/10.5222/ankem.2021.009.
JAMA
1.Altınkanat Gelmez G, Sayin E, Hasdemir U, Söyletir G. KOLİSTİN DUYARLILIK TESTİ İÇİN DIAGNOSTICS COLISTIN MIC-STRIP TESTİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ. ANKEM Derg. 2021;35:9–13.
MLA
Altınkanat Gelmez, Gülşen, et al. “KOLİSTİN DUYARLILIK TESTİ İÇİN DIAGNOSTICS COLISTIN MIC-STRIP TESTİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ”. ANKEM Dergisi, vol. 35, no. 1, Apr. 2021, pp. 9-13, doi:10.5222/ankem.2021.009.
Vancouver
1.Gülşen Altınkanat Gelmez, Elvan Sayin, Ufuk Hasdemir, Güner Söyletir. KOLİSTİN DUYARLILIK TESTİ İÇİN DIAGNOSTICS COLISTIN MIC-STRIP TESTİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ. ANKEM Derg. 2021 Apr. 1;35(1):9-13. doi:10.5222/ankem.2021.009

Cited By

88x31.png

This work is licensed under a https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ license.