Antimicrobial Resistance Ratios of Pseudomonas aeruginosa Strains Isolated from Various Clinical Samples-A Three- Year Evaluation

Abstract

Pseudomonas aeruginosa is one of the most common opportunistic pathogens in nosocomial infections and has quite high morbidity and mortality rates. In this study, it was aimed to determine the antimicrobial resistance rates to contribute to the antibiotic use policies. A total of 380 P.aeruginosa strains isolated from various clinical specimens in 2015-2017 were investigated retrospectively. The samples were inoculated to 5 % sheep blood agar, Eosin Methylene Blue (EMB) agar and chocolate agar media and blood-sterile body fluids were inoculated to BACTEC 9120 blood culture system. Bacterial identification and antimicrobial susceptibility tests were performed using conventional methods and Phoenix fully automated bacterial identification system. Antimicrobial susceptibilities were interpreted according to the European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) standards. Distribution of P.aeruginosa strains according to clinical samples and antimicrobial resistance rates were investigated. P.aeruginosa strains were most frequently isolated from intensive care units with a rate of 47.1 %. ‘’The strains were obtained from the respiratory tract (52.4 %), urine (21.8 %), wound (21.3%), and the other samples (4.4 %).’’ The least resistance was found aganist colistin (6.7%) and amikacin (11.6 %). There has been no change in the resistance rates for colistin, gentamicin, ceftazidime, piperacillin / tazobactam, levofloxacin, ciprofloxacin, imipenem and meropenem in the last three years. Increased resistance to cefepime and aztreonam has been observed in the last two years. It was thought that the results obtained in the study would contribute to empirical treatment of hospital infections and rational antibiotic use policies

Keywords

• antibiotic resistance
• clinical specimens
• Pseudomonas aeruginosa

Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Pseudomonas aeruginosa Suşlarının Antimikrobiyal Direnç Oranları: Üç Yıllık Değerlendirme*

Abstract

Pseudomonas aeruginosa, hastane enfeksiyonlarında en sık görülen fırsatçı patojenlerden biri olup morbidite ve mortalitesi oldukça yüksektir. Bu çalışmada P.aeruginosa suşlarının antimikrobiyal direnç oranlarını belirleyerek antibiyotik kullanım politikalarına katkıda bulunulması amaçlanmıştır. 2015-2017 yıllarında çeşitli klinik örneklerden izole edilen toplam 380 P.aeruginosa suşu retrospektif olarak incelenmiştir. Gönderilen örnekler % 5 koyun kanlı agar, Eosin Methylene Blue (EMB) agar ve çikolatamsı agar besiyerlerine, kan ve steril vücut sıvıları ise BACTEC 9120 kan kültürü sistemine ait sişelere ekilmiştir. Bakteri tanımlaması ve antimikrobiyal duyarlılık testleri için konvansiyonel yöntemler ve Phoenix tam otomatik bakteri tanımlama sistemi kullanılmıştır. Antimikrobiyal duyarlılıkları European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) standartlarına göre yorumlanmıştır. P.aeruginosa suşlarının klinik örneklere göre dağılımı ve antimikrobiyal direnç oranları araştırılmıştır. P.aeruginosa suşları en sık % 47.1 oranında yoğun bakımlardan izole edilmiştir. Suşların % 52.4’ü solunum yolu, % 21.8’i idrar, % 21.3’ü yara ve % 4.4’ü de diğer örneklerden elde edilmiştir. En az direnç kolistin (% 6.7) ve amikasine (% 11.6) karşı bulunmuştur. Kolistin, gentamisin, seftazidim, piperasilin / tazobaktam, levofloksasin, siprofloksasin, imipenem ve meropenem için son üç yılda direnç oranlarında değişiklik olmamıştır. Sefepim ve aztreonama karşı son iki yılda direnç artışı saptanmıştır. Çalışmada saptanan sonuçların hastane enfeksiyonlarının ampirik tedavisinde ve akılcı antibiyotik kullanım politikalarında katkı sağlayacağı düşünülmüştür

Keywords

• antibiyotik direnci
• klinik örnek
• Pseudomonas aeruginosa

References

1. Ahmed OB. Incidence and antibiotic susceptibility pattern of Pseudomonas aeruginosa Isolated from Inpatients in two tertiary hospitals. Clin Microbiol. 2016;5(2):2-4.
2. Akduman Alaşehir E, Karadeniz A, Balıkçı A, Topkaya E. Klinik örneklerinden izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarının antibiyotik duyarlılıkları. Maltepe Medical Journal. 2013:5(3):12-6.
3. Aktaş E, Terzi HA, Külah C, Cömert F. Pseudomonas aeruginosa izolatlarının antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirmesi: çeşitli antibiyotiklere azalan duyarlılık. ANKEM Derg. 2010;24(4):188-92.
4. Berktaş M, Çıkman A, Parlak M, Yaman G, Güdücüoğlu H. Nozokomiyal kökenli Pseudomonas aeruginosa izolatlarında antibiyotiklere direnç. Van Tıp Derg. 2011;18(4):192-6.
5. Brusselaers N, Vogelaers D, Blot S. The rising problem of antimicrobial resistance in the intensive care unit. Ann Intensive Care. 2011;1(1):47-53. https://doi.org/10.1186/2110-5820-1-47
6. Calgin MK, Cetinkol Y. Assessment of antibiotic resistance rates of Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii strains isolated in intensive care units between 2014 and 2017. Annals of Medical Research. 2019;26(2):213-6. https://doi.org/10.5455/annalsmedres.2018.09.186
7. Coşkun USŞ, Coşkun G. Klinik örneklerden izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarının antibiyotik direnç durumunun belirlenmesi. FLORA. 2013;18(4):175-80.
8. Duman Y, Kuzucu Ç, Kaysadu H, Tekerekoğlu MS. Bir yıllık sürede izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarının antibiyotik duyarlılığının araştırılması: kesitsel bir çalışma. İnönü Üniversitesi Sağlık Bilimleri Derg. 2012;1(1):41-5.

9. Durmaz S, Toka Özer T. Klinik örneklerden izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarında antibiyotik direnci. Abant Tıp Derg. 2015;4(3):239-42. https://doi.org/10.5505/abantmedj.2015.38981
10. Dursun A, Özsoylu S, Kılıç H, Kılıç AU, Akyıldız BN. Çocuk yoğun bakım ünitesinde yatan hastalardan izole edilen Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae ve Acinetobacter baumannii suşlarının antibiyotik duyarlılıkları. Turk J Intensive Care. 2018;16(3):109-14.
11. Ekincioğlu P, Perçin D. Klinik Pseudomonas aeruginosa izolatlarının antibiyotiklere duyarlılık durumu. Sağlık Bilimleri Derg. 2013;22(2):141-9.
12. Gültepe B, Iraz M, Ceylan A, Doymaz MZ. Çeşitli Klinik örneklerden izole edilen Pseudomonas suşlarının antibiyotiklere direnci. ANKEM Derg. 2014;28(1):32-6. https://doi.org/10.5222/ankem.2014.032
13. Juayang A, Lim J, Bonifacio A, Lambot A, Millan S, Sevilla V, Sy J, et al. Five-year antimicrobial susceptibility of Pseudomonas aeruginosa from a local tertiary hospital in Bacolod City, Philippines. Trop Med Infect Dis. 2017;2(3):28-35. https://doi.org/10.3390/tropicalmed2030028
14. Karakeçe E, Terzi HA. Çiftci İH. Pseudomonas aeruginosa izolatlarının antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirmesi. Medeniyet Medical Journal. 2014;29(1):20-3.
15. Köse Ş, Atalay S, Ödemiş İ, Adar P. Çeşitli Klinik örneklerden izole edilen Pseudomonas suşlarının antibiyotik duyarlılıkları. ANKEM Derg. 2014;28(3):100-4. https://doi.org/10.5222/ankem.2014.100
16. Micek ST, Wunderink RG, Kollef MH, et al. An international multicenter retrospective study of Pseudomonas aeruginosa nosocomial pneumonia: impact of multidrug resistance. Crit Care. 2015;19(1):219-26. https://doi.org/10.1186/s13054-015-0926-5
17. Nathwani D, Raman G, Sulham K, Gavaghan M, Menon V. Clinical and economic consequences of hospital-acquired resistant and multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa infections: a systematic review and meta-analysis. Antimicrob Resist Infect Control. 2014;3(1):32-48. https://doi.org/10.1186/2047-2994-3-32
18. Öztürk CE, Çalışkan E, Şahin İ. Pseudomonas eruginosa suşlarında antibiyotik direnci ve metallo beta-laktamaz sıklığı. ANKEM Derg. 2011;25(1):42-7. https://doi.org/10.5222/ankem.2011.42
19. Öztürk CE, Türkmen Albayrak H, Altınöz A, Ankaralı H. Pseudomonas aeruginosa suşlarında antibiyotiklere direnç ve beta-laktamaz oranları. ANKEM Derg. 2010;24(3):117-23.
20. Paköz NİE, Şeriban Doğan S, Aral M. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Pseudomonas suşlarının antibiyotiklere duyarlılıkları. ANKEM Derg. 2011;25(2):73-8. https://doi.org/10.5222/ankem.2011.073
21. Raakhee T, Rao US. Prevalence and resistance pattern of pseudomonas strains isolated from ICU patients. Int J Curr Microbiol App Sci. 2014;3:527-34.
22. Sader HS, Huband MD, Castanheira M, Flamm RK. Pseudomonas aeruginosa antimicrobial susceptibility results from four years (2012 to 2015) of the international network for optimal resistance monitoring program in the United States. Antimicrob Agents Chemother. 2017;61(3):e02252-16. https://doi.org/10.1128/AAC.02252-16
23. Taşbent FE, Doğan M, Feyzioğlu B, Baykan M. Çeşitli Klinik örneklerden izole edilen Pseudomonas türlerinin antibiyotiklere direnci. Türk Mikrobiyol Cem Derg. 2013;43(4):138-43.
24. The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 4.0, (2014).
25. Tümer S, Kirişci Ö, Özkaya E, Çalışkan A. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarının antibiyotik duyarlılıkları. ANKEM Derg. 2015;29(3):99-104.
26. Tüzemen NÜ, Efe K, Akalın H, Özakın C. Retrospective evaluation of colistin-resistant isolates in automated system by gradient diffusion method and broth microdilution method. Klimik Derg. 2019;32(1):57- 61. https://doi.org/10.5152/kd.2019.13
27. Vojtová V, Kolár M, Hricová K, Uvízl R, Neiser J, Blahut L, Urbánek K. Antibiotic utilization and Pseudomonas aeruginosa resistance in intensive care units. New Microbiologica. 2011;34(3):291-8.
28. Yadav VC, Kiran VR, Jaiswal MK, Singh K. A study of antibiotic sensitivity pattern of Pseudomonas aeruginosa isolated from a tertiary care hospital in South Chhattisgarh. International Journal of Medical Science and Public Health. 2017;6(3):600-6. https://doi.org/10.5455/ijmsph.2017.0956717102016
29. Yapıcı O, Akgüneş A, Akgül S, Ekinci B, Pekintürk NS. Pseudomonas aeruginosa suşlarının direnç durumunun yıllar içindeki değişimi. Muğla Sıtkı Koçman Üniversitesi Tıp Derg. 2018;5(1):1-4.