Kavunda Fusarium Solgunluğu Hastalığına (Fom-1 ve Fom-2) Dayanım Düzeyinin Belirlenmesi

Abstract

Melon Fusarium Wilt (MFW) olarak adı geçen Fusarium oxysporum f.sp. melonis (FOM) toprak kökenli bir patojenin sebep olduğu yüksek verim kayıplarına sebep olan bir hastalıktır. Hastalık etmeni fungusun kavun tarlalarında dört farklı ırkı (0, 1, 2 ve 1-2) tanımlanmıştır. Kavunda solgunluk hastalığına dayanıklılık FOM-1, FOM-2 genleri tarafından kontrol edilmektedir. F.oxysporum f.sp. melonis (FOM)’in 0 ve 2 numaralı ırklarına karşı FOM-1 geninin dayanıklı olduğu bildirilmiştir. FOM’ın 0 ve 1 numaralı ırklarına karşı FOM-2 geninin dirençli olduğu ortaya konmuştur. Toprak kökenli bu patojen ile mücadelede en etkili ve çevreci yol, dayanıklı çeşit kullanmaktır. Çalışmamızda daha önceki çalışmalarımız sonucunda elde edilen 5 baba hat ve 39 ana hattın melezlenmesi ile elde edilen 195 birey izolasyonu gerçekleştirilmiş ve bunların FOM-1 ve FOM-2’ye dayanımlarına bakılmıştır. Moleküler çalışmalarda ırk 1 için SB17645 ve SV01574 markörleri, ırk 2 için NBS1-CAPS ve CAPS2 markörleri kullanılmıştır. Sonuç olarak FOM-1’de; 184 adet homozigot dayanım (RR), 5 adet homozigot duyarlı (rr), FOM-2’de 129 adet homozigot dayanım (RR), 60 adet homozigot duyarlı (rr) olarak bulunmuştur.

Keywords

• Fusarium oxysporum f.sp. melonis
• kavun
• moleküler markör
• ırk

Determination of Resistance Level to Fusarium Wilt Disease (Fom-1 and Fom-2) in Melons

Abstract

Fusarium oxysporum f.spp. melonis (FOM) is a disease that causes high yield losses caused by a soil-based pathogen. Four different strains (0, 1, 2 and 1-2) of the disease-causing fungus were identified in melon fields. Resistance to wilt disease in melon is controlled by FOM-1, and FOM-2 genes. F.oxysporum f.spp. melonis (FOM) has been reported to be resistant to the FOM-1 against races 0 and 2. It has been found that FOM-2 gene is resistant to the races 0 and 1 of FOM. The most effective and environmentally friendly way to combat this soil-based pathogen is to use a resistant variety. In our study, the 195 individual isolation of 5 father lines and 39 main lines were performed as a result of our previous work and were based on FOM-1 and FOM-2. In molecular studies, SB17645 and SV01574 marker for race 1, NBS1-caps and CAPS2 marker for race 2 are used. As a result, the FOM-1 was found as 184 homozygotes resistant (RR), 5 homozygotes sensitive (rr), and FOM-2 was found as 129 homozygotes resistant (RR), 60 homozygygote sensitive (rr).

Keywords

• Fusarium oxysporum f.sp. melonis
• melon
• molecular marker
• race

References

1. Baran, B., 2000. Güneydoğu Anadolu Bölgesi kavun ekim alanlarında solgunluk hastalığı etmeni (Fusarium oxysporum f.sp. melonis) (Leach and Currence)’nin yaygınlığı ve bu etmene karşı bazı kavun çeşitlerinin tepkileri (Yüksek Lisans Tezi). Yüzüncü Yıl Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Bitki Koruma Anabilim Dalı, Van.
2. Oumouloud, A., Otmani M. El., Alvarez J., 2015. Molecular characterization of Fom-1 gene and development of functional markers for molecular breeding of resistance to Fusarium race-2 in melon. Euphytica, 205:491-501.
3. Schmidt, S.M., J. Lukasiewicz, R. Farrer, P.V. Dam, C. Bertoldo, M. Rep, 2016. Comparative genomics of Fusarium oxysporum f.sp. melonis reveals the secreted protein recognized by the Fom-2 resistance gene in melon. Europe PMC Funders Group, 209:307-318.
4. Blancard, D., H. Lecoq, M. Pitrat, 1994. A colour atlas of cucurbit diseases: observation, identification and control. ISBN:978-1-874-54515-6.
5. Risser, G., Z. Banihashimi, D. Davis, 1976. A proposed nomenclature of Fusarium oxysporum f.sp. melonis races and resistance genes in Cucumis melo. Phytopathology, 66:1105-1106.
6. Şensoy, S., 2005. Türkiye kavunlarındaki genetik varyasyonun ve fusarium solgunluğuna dayanıklılığın fenotipik ve moleküler yöntemlerle araştırılması (Doktora Tezi). Yüzüncü Yıl Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Bahçe Bitkileri Bölümü, Van.
7. Frary, A., T.M. Fulton, D. Zamir, S.D. Tanksley, 2004. Advanced backcross QTL analysis of a Lycopersicon esculentum XL. pennellii cross and identification of possible orthologs in the Solanaceae. Theor Appl. Genet. 108:485-496.
8. Oumouloud, A., M.S. Arnedo-Andres, R. Gonzalez-Torres, J.M. Alvarez, 2008. Development of molecular markers linked to the Fom-1 locus for resistance to Fusarium race 2 in melon. Euphytica, 164:347-356.

9. Demirelli, M.B., 2020. Farklı tipteki kavun genotiplerinin Fusarium oxysporum f.sp. melonis’e dayanıklılık durumlarının klasik ve moleküler yöntemlerle belirlenmesi (Yüksek Lisans). Akdeniz Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Bitki Koruma Anabilim Dalı, Antalya, 36s.
10. Kahraman, A., H. İlbi, 2012. Determination of resistant local varieties to Fusarium wilt (Fusarium oxysporum f.sp melonis) with molecular markers. Cucurbitaceae 2012:Proceedings of the 10. Eucarpia Meeting on Genetics and Breeding of Cucurbitaceae, Adana.