Evaluation of SARS-CoV-2 PCR Test Results During Hospital Admission and Positivity Rates in Pre-Operative Screenings

Abstract

Objective: Following the emergence of the first cases in Wuhan, China, in late December 2019, the World Health Organization declared the Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) a pandemic which affected the entire world and continues to have an impact. This research aimed to contribute to the epidemiological and present guideline data of the pan-demic by evaluating the COVID-19 RT-PCR test results. Material and Methods: The results of the SARS-CoV-2 RT-qPCR test, which were studied in the Microbiology Laboratory of the Izmir Ka-tip Celebi University Ataturk Training and Research Hospital between 14.09.2020-30.06.2021, were retrospectively analyzed according to the months and reasons for admission(probable case, pre-operative screening). Results: The total of probable cases and pre-operative tests was 140.249. The ratio of females to males in test requests was 48.4%/51.6%. The test request rates by age groups were 2.1%, 64.2%, and 33.7% for 0-18 years, 19-50 years, and 51-99 years, respectively. November 2020, December 2020, and April 2021 were the months with the highest number of test requests. The rates of positive results from probable cases and pre-operative tests examined in these months were 26.8%, 25.7%, and 16.5%, respectively. The test positivity rate for probable case testing was 19.3% (21.300/110.381), and the positivity rate for female and male cases was 49.5/50.5% (10.546/10.754). The test positivity rate in asymptomatic cases, tested pre-operatively per screening rules in the pre-operative period, was 4% (1.200/29.868), and the test positivity rate of pre-operative positivity for females and males was 51.6/48.4% (619/584) respectively. As a result of analyzing the ten-month period in our region, COVID-19 infection is more common in males and the age range of 19-50 years, and it also spreads faster in November and April. Conclusion: An important point to be considered to prevent the spread of infection during the pandemic process is the follow-up of asymptomatic cases.

Keywords

• COVID-19
• pandemic
• pre-operative COVID-19 testing

Hastaneye Başvurularda SARS-CoV-2 PCR Test Sonuçlarının ve Preoperatif Dönem Taramalarda Pozitiflik Oranlarının Değerlendirilmesi

Abstract

Amaç: Aralık 2019 sonlarında Çin’in Wuhan kentinde ilk vakaların ortaya çıkmasının ardından Dünya Sağlık Örgütü tarafından Coronavirüs Hastalığı 2019 (COVID-19) olarak adlandırılan ve tüm dünyayı etkisi altına alan pandemi, etkisini sürdürmeye devam ediyor. İzmir Kâtip Çelebi Üniversitesi Atatürk Eğitim ve Araştırma Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarına gönderilen nazofaringeal sürüntülerde çalışılan COVID-19 RT-PCR test sonuçları değerlendirilerek pandemi çalışmasına katkı sağlayacak epidemiyolojik ve güncel kılavuz verilerine katkı sağlanması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntemler: İzmir Kâtip Çelebi Üniversitesi Atatürk Eğitim ve Araştırma Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarında 14.09.2020-30.06.2021 tarihleri arasında çalışı-lan SARS-CoV-2 RT-qPCR testi sonuçları aylara ve başvuru nedenlerine (olası vaka, ameliyat öncesi tarama) göre retrospektif olarak analiz edildi. Bulgular: Olası vaka+preoperatif test sayısı 140.249 idi. Test çalışılan kadın/erkek oranı %48,4/%51,6 olarak tespit edildi. Yaş gruplarına göre başvuru oranları 0-18 yaş, 19-50 yaş, 51-99 yaş için sırasıyla %2,1, %64,2 ve %33,7 oldu. En fazla test istemi olan aylar ise Kasım 2020, Aralık 2020 ve Nisan 2021 oldu. Bu aylarda incelenen olası vaka+preoperatif test/pozitif sonuç oranları sırasıyla %26,8, %25,7 ve %16,5 oldu. Olası vaka testlerinde pozitiflik oranı %19,3 (21.300/110.381) ve kadın ve erkek vakalar için pozitiflik oranı %49.5/50.5 (10.546/10.754) idi. Ameliyat öncesi dönemde tarama kuralları gereğince test istenen asemptomatik olgularda pozitiflik oranları ameliyat öncesi dönemde %4 (1.200/29.868), kadın ve erkeklerde ameliyat öncesi pozitiflik oranı %51.6/48.4 (619/584) idi. Bölgemizde 10 aylık dönem incelendiğinde COVID-19 enfeksiyonunun erkeklerde ve 19-50 yaş aralığında daha sık görüldüğü, ayrıca Kasım ve Nisan aylarında daha hızlı yayıldığı görülmektedir. Sonuç: Pandemi sürecinde enfeksiyonun yayılmasını önlemek için dikkat edilmesi gereken önemli bir nokta da asemptomatik vakaların takibidir.

Keywords

• COVID-19
• pandemi
• preoperatif COVID-19 testi