DETERMINATION OF RAPDS MOLECULAR MARKERS FOR CITRUS SPECIES

Year 2003, Volume: 20 Issue: 1, 43 - 47, 20.03.2016

Münevver Göçmen Cahit Çakır İlknur Polat

Abstract

ABSTRACT
In this study, RAPD molecular technique was used in order to determine genetic similarity and obtain molecular markers for some citrus species (mandarin, orange, grapefruit and Flying Dragon (a kind of Poncirus spp.). For this aim, 20 RAPD primers (OP-F), each of which consisted of 10 nucleotid bases, were used. While a total of 125 polymorphic DNA bands were obtained by 16 primers, 40 monomorphic bands were found by 16 primers and no DNA synthesis was materialized by 4 of that. Each of four species was established as different at the DNA level. The rate of the less genetic similarity was found as 21% between Flying Dragon and ‘Pixie’ species while the rate of the most genetic similarity was determined as 56% between ‘Pixie’ (mandarin) and ‘Navelina’ (orange).

Keywords

-

BAZI TURUNÇGİL TÜRLERİNE UYGUN RAPD MARKÖRLERİN BELİRLENMESİ

Abstract

Citrus cinsine ait farklı türler ile poncirus cinsi arasındaki filogenetik ilişkiyi belirlemek ve bu cins ve türlere ait moleküler markörler oluşturmak amacı ile yapılan bu çalışmada RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) moleküler tekniği kullanılmıştır. Çalışmada, ‘Pixie’ mandarini (Citrus reticulata Blanco), ‘Navelina’ portakalı (Citrus sinensis Osb.), ‘Star Ruby’ altıntopu (Citrus paradisi Maef) ile Flying Dragon (Poncirus trifoliata (L.) Raf) materyal olarak kullanılmıştır. Yirmi farklı tesadüfi nükleotid diziliminden oluşan 10 mer’lik (bazlık) RAPD primerlerinin (Operon F) kullanıldığı çalışmada, primerlerin 4 tanesinde (OF-17, OF-18, OF-19 ve OF-20) hiç DNA amplifikasyonu gerçekleşmemiş, diğer 16 primerde ise monomorfik ve polimorfik bant sayısı sırasıyla 40 ve 125 olarak bulunmuştur. Özellikle anaç olarak kullanılan Flying Dragon farklı olarak oluşturduğu çok sayıdaki polimorfik DNA bantları ile diğer turunçgil türlerinden kolaylıkla ayrılmıştır. Araştırma bulguları, elde edilen polimorfik DNA bantlarının tekrarlanabilir olduğunu, Citrus cinsine ait türlerde ve Ponsirus cinsinde RAPD tekniğinin kolaylıkla uygulanabileceğini göstermiştir. Benzerlik oranı indeksine göre birbirine en uzak (%21) ‘Pixie’ mandarin çeşidi ile Flying Dragon bulunurken, en yakın (%56) ‘Pixie’ mandarin çeşidi ile ‘Navelina’ portakal çeşidi bulunmuştur.

Keywords

-