USE OF dsRNA ANALYSIS METHOD FOR IDENTIFICATION OF PLANT VIRUSES

Year 2004, Volume: 21 Issue: 1, 69 - 76, 01.03.2004

Nejla Yardımcı Handan Eryiğit

Abstract

Several approaches for detection and diagnosis of plant viruses can be used. Despite to their usefulness, some of them have been time consuming and particularly serological tests have been depend upon providing antisera. In recent years obtaining easy, fast and accurate results in detection and determination of viruses has been possible by the development and improvements of molecular techniques. One of the most important methods is the isolation and analysis of replicative double- stranded RNA (dsRNA) from virus-infected plants. The presence number, size, and abundance dsRNAs in infected plant tissue are of potential value for diagnosis. Cellulose-column chramatography are used for purification of viral dsRNA and the presence of dsRNA are represented by agarose gel electrophoresis.

Keywords

dsRNA; Agarose Gel

BİTKİ VİRÜSLERİNİN TANILANMASINDA dsRNA ANALİZ YÖNTEMİNİN KULLANILMASI

Abstract

Bitki virüslerinin tanı ve teşhisi için çeşitli yöntemler kullanılmaktadır. Bu yöntemler virüs teşhisinde elverişli olmalarına rağmen, bir kısmı zaman alıcı olmakta ve özellikle serolojik testlerde antiserumun varlığına bağımlı kalınmaktadır. Son yıllarda moleküler tekniklerde meydana gelen gelişmelerle virüslerin tanısı daha da kolaylaştığı gibi, daha kesin ve güvenilir sonuçlara ulaşmakta mümkün olabilmektedir. Bu moleküler tekniklerin en önemlilerinden biri de; virüsle infekteli bitkilerden replikatif double-stranded RNA (dsRNA)’nın izolasyonu ve analizidir. Bu yönteme göre bir bitkideki dsRNA’nın varlığı, sayısı, büyüklüğü, bir virüsün tanısı için potansiyel tanılama değerleridir. Viral dsRNA, selüloz kolon kromatografi ile izole edilir ve dsRNA’nın varlığı agarose jel elektroforez ile gösterilir.

Keywords

dsRNA; Agarose Jel