Distribution Of Microorganisms In Blood Culture And Antimicrobial Susceptiblity

Abstract

Purpose: In this study, the distribution of hospitalized patients and antimicrobial susceptibilityof microorganisms isolated from blood culture were investigated.Methods: Blood samples sent to our laboratory by taking Bactec 9050 automated blood culturemedia bottles (Becton Dickinson, USA) were incubated at 35 ° C and under normal atmosphericconditions. İdentification of microorganisms was used conventional methods and / or the APIidentification systems (bioMérieux, Etoile, Fransa). Kirby-Bauer Disk diffusion method and / orwas ATB STREP 5, ATB ENTEROC 5 (bioMérieux, Etoile, Fransa) performed for antibioticsusceptibility testing according the criteria of Clinical and Laboratory Standards Institute.Extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) production was investigated with disk diffusionscreening test in Gram-negative bacteria.Results: A total of 2,807 blood samples sent to our laboratory between July 2009 – 2010. 2,121(75%) patients of didn’t reproductive, 583 (21%) of the cases were positive, 103 (4%) of thecontamination was evaluated as an example. The most isolated pathogens, respectively, coagulasenegative staphylococci (CNS) (42.1%), Staphylococcus aureus (22%) and Escherichia coli (13%)were found. 54% KNS strains, 44 % S. aureus strains were resistant to methicillin. E. coli strainsof extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) prevalence of 14% and 21% of Klebsiella spp.strains were determined. İmipenem resistance in Pseudomonas aeruginosa strains were identifiedby 39%. The sensitivity of E. coli strains, 93% of amikacin, piperacillin-tazobactam 95%, thesensitivity of Klebsiella spp. strains, 100% of amikacin, piperacillin-tazobactam 93% weredetermined. The results of the study were examined by comparing with similar studies.Conclusion: As a result, the distribution of bacteria isolated from blood cultures and antimicrobialsusceptibility patterns vary among centers, each center, therefore, thought to be useful in theirassessment of the results at regular intervals

Keywords

• Blood culture,CNS,S. aureus,E.coli,ESBL

Kan Kültürlerinden İzole Edilen Mikroorganizmaların Dağılımı ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları

Abstract

Amaç: Bu çalışmada, yatan hastaların kan kültürü örneklerinden izole edilen mikroorganizmalarındağılımının ve antimikrobiyal duyarlılıklarının araştırılması amaçlanmıştır.Yöntem: Laboratuarımıza Bactec 9050 otomatik kan kültür (Becton Dickinson, USA) besiyerişişelerine alınarak gönderilen kan örnekleri, normal atmosfer koşullarında, 35°C’de inkübeedilmiştir. Üreyen mikroorganizmaların identifikasyonunda, konvansiyonel yöntemler ve/veyaAPİ identifikasyon sistemleri(bioMérieux, Etoile, Fransa) kullanılmıştır. Tiplendirme sonrasındamikroorganizmaların antibiyotik duyarlılık testleri, Clinical Laboratory Standards Institute(CLSI)'nin önerilerine göre Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi ve/veya ATB STREP 5, ATBENTEROC 5 (bioMérieux, Etoile, Fransa) sistemleri ile yapılmıştır. Gram negatif bakterilerdeGSBL varlığının saptanmasında, disk difüzyon tarama testi kullanılmıştır.Bulgular: Temmuz 2009-2010 tarihleri arasında, laboratuarımıza toplam 2807 kan örneğigönderilmiştir. Örneklerin 2121 (%75)’inde üreme olmamışken, 583 (%21)’ünde üremesaptanmış, 103 (%4) örnek ise kontaminasyon olarak değerlendirilmiştir. En fazla izole edilenetkenler, sırasıyla koagülaz negatif stafilokok (KNS) (%42,1), Staphylococcus aureus (%22) veEscherichia coli ( %13) olarak tespit edilmiştir. Kültürlerde izole edilen KNS’lerin % 54’ü, S.aureus’ların ise %44’ü metisiline dirençli olarak bulunmuştur. Escherichia coli suşlarındagenişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) sıklığı %14, Klebsiella spp. suşlarında %21 olaraksaptanmışken, Pseudomonas aeruginosa suşlarında %39 oranında imipenem direnci tespitedilmiştir.Sonuç: Kan kültürlerinden izole edilen bakterilerin dağılımı ve antimikrobiyal duyarlılıklarınınmerkezler arasında değişebildiği, bu nedenle de her merkezin kendi sonuçlarını belli aralıklarladeğerlendirmesinin faydalı olacağı düşünülmüştür

Keywords

• Kan kültürü,KNS,S. aureus,E.coli,GSBL

References

1. Çiçek A, Kuzucu Ç, Durmaz B: Kan kültür sonuçlarının değerlendirilmesinde etkili olan faktörler, İnönü Üniversitesi Tıp Fakültesi Derg 2005;12: 277–80.
2. Bilgehan H: Klinik Mikrobiyolojik Tanı. 4. basım, İzmir: Fakülteler Kitabevi, 2004: 317–28.
3. Kinney KK: Treatment of infections caused by antimicrobial- resistant Gram-positive bacteria, Am J Med Sci 2010; 340: 209–17.
4. Queenan AM, Foleno B, Gownley C, Wira E, Bush K: Effects of inoculum and β-lactamase activity in AmpC- and extended- spectrum β-lactamase (ESBL)- producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae clinical isolates tested by using NCCLS ESBL methodology, J Clin Microbiol 2004; 42: 269– 75.
5. Susan E, Daniel J, Gary V: Determining the clinical significance of coagulase-negative staphylococci isolated from blood cultures, infection control and hospital epidemiology 2005 ;26: 559–66.
6. Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) (Çeviri editörü D Gür). Antimikrobik Duyarlılık Testleri İçin Uygulama Standartları. Onsekizinci Bilgi Eki, Bilimsel Tıp Yayınevi, Ankara, 2008.
7. Dündar V, Öztürk Dündar D: Stafilokok Enfeksiyonları, “Wilke Topçu A, Söyletir G, Doğanay M(ed): Enfeksiyon Hastalıkları ve Mikrobiyolojisi Etkenlere Göre Enfeksiyonlar 2” İstanbul: Nobel tıp kitabevi, 2008: 2065–77.
8. Winn W, Allen S, Janda W “et al”: Koneman’s Color Atlas and Textbook of Diagnostic Microbiology. 6th ed. Philadelphia: JB Lippincott Co, 2006,98–9.

9. Demir M, Kaleli İ, Cevahir N, Mete E, Şengül M: İki yıllık kan kültür sonuçlarının değerlendirilmesi, İnfeksiyon Derg 2003; 17: 297–300.
10. Kaya S, Cicioğlu-Arıdoğan B, Çetin H, Demirci M: Çocuk hastalardan mikroorganizmalar ve antibiyotik dirençleri, Fırat Tıp Derg 2007;12::34–6. kültürlerinde üreyen
11. Baysallar M, Üsküdar-Güçlü A, Şenses Z, Kaptan K, Ataergin S, Başustaoğlu AC: Febril nötropenik hastaların kan kültürlerinde bakteriyel spektrum ve antimikrobiyal duyarlılık profili, Gülhane Tıp Derg 2007;49.168–172.
12. Adeyemi AI, Sulaiman AA, Solomon BB, Chinedu OA, Victor IA: Bacterial bloodstream infections in HIV-infected adults attending a Lagos Teaching Hospital, J Health Popul Nutr 2010; 28: 318–26.
13. Sevim S, Öztürk Ş, Coşkuner A, Özgenç O, Avcı M: Bactec kan kültür sistemi İle izole edilen mikroorganizmaların değerlendirilmesi, İnfeksiyon Derg 2007; 21: 135–40.
14. Yüce P, Demirdağ K, Kalkan A, Özden M, Denk A, Kılıç Ss: Kan kültürlerinde izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkları, ANKEM Derg 2005; 19: 17–21.
15. Khan FY, Elshafie SS, Almaslamani M, Abu-Khattab M, El Hiday AH, Errayes M, Almaslamani E: Epidemiology of Bacteraemia in Hamad General Hospital, Qatar: A One Year Hospital-Based Study: Travel Med Infect Dis 2010 Nov 10.
16. Pien BC, Sundaram P, Raoof N, Costa SF, Mirrett S, Woods CW, Reller LB, Weinstein MP: The clinical and prognostic importance of positive blood cultures in adults, Am J Med 2010; 123: 819–28.
17. Doğan Ö, Yalınay-Çırak M, Engin D, Türet S: Klinik örneklerden izole edilen stafilokoklarda metisilin direnci ve çeşitli antibiyotiklere in-vitro duyarlılıkları, ANKEM Derg 2005;19: 39–42.
18. Gürsoy Nc, Ersoy Y, Günal S, Kuzucu Ç: Kan kültürlerinden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarının antibiyotiklere direnç durumlarının değerlendirilmesi ANKEM Derg 2009;23: 26–29.
19. Yiğit N, Aktaş AE, Doğruman-Al F, Ayyıldız A: Kan kültürlerinden izole edilen koagülaz negatif stafilokokların tiplendirilmesi ve metisilin direnci, Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi 2008; 65: 61–6.
20. Kizirgil A, Yakupoğulları Y, Şenol Ff, Aşçı Toraman Z: Kan kültürü örneklerinde genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üreten enterik basillerin prevalansı ve antibiyotik duyarlılıklarının araştırılması, İnfeksiyon Derg 2005; 19 : 111– 4.
21. Uyanık Mh, Hancı H, Yazgı H, Karameşe M: Kan kültürlerinden soyutlanan Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarında GSBL sıklığı ve ertapenem dahil çeşitli antibiyotiklere in-vitro duyarlılıkları, ANKEM Derg 2010; 24: 86–91.
22. Coşar M, Tuncer İ, Arslan U: Kan kültürlerinde üreyen Pseudomonas aerugınosa suşlarının antibiyotik direnç profili, İnfeksiyon Derg 2009; 23: 47–50.
23. Küçükbasmacı Ö, Çalışkan Algıngil R, Hamança Ö, Çelik Ş, Köksal F, Gönüllü N, Saması M: Kan örneklerinden üretilen Gram negatif çomakların antibiyotiklere duyarlılıkları, Türk Mikrobiyol Cem Derg 2007; 37: 201–3.