Antimicrobial Susceptibility of E.Coli Strains and Presence of Extended-Spectrum Beta Lactamase

Abstract

Objective: In this study we aimed to determine antimicrobial susceptibility profiles and ESBL ranges of E.coli strains which were isolated by department of Clinical Microbiology Laboratory in our hospital between March 2009- March 2010. Materials and Methods: Antimicrobial susceptibilities of E.coli strains which identified by conventional methods and automated systems in several different samples were determined with Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI) criteria between March 2009-March 2010. Results: 747 of isolated 2459 strains of E. coli belong to the outpatients and the rest belong to the inpatients. The highest resistance ratio was detected against to ampicillin according to inpatients 84.8% and outpatients 77.3% treatments. The lowest resistance rates were found against imipenem and amikacin. The strains that were isolated from 104 (13.9%) outpatients and 471(27.5%) hospitalized patients detected extended spectrum β-lactamase(ESBL). Conclusion: Detection of antimicrobial resistance ranges in our hospital and selection of antimicrobial therapies according to these results will prevent ESBL production and resistance to antimicrobials.

Keywords

• -

Escherichia coli Suşlarında Antimikrobiyal Duyarlılık ve Genişlemiş Spektrumlu-Βeta Laktamaz (GSBL) Varlığı

Öz

Amaç: Bu çalışma Mart 2009 - Mart 2010 tarihleri arasında hastanemiz Merkez Laboratuvarı Klinik Mikrobiyoloji bölümünde izole edilen E.coli suşlarının antimikrobiyal duyarlılık profili ve GSBL oranlarının belirlenmesi amacıyla yapılmıştır. Gereç ve Yöntemler: Mart 2009 - mart 2010 tarihleri arasında çeşitli örneklerden konvansiyonel yöntemler ve otomatize sistemle tanımlanan E.coli suşlarının antimikrobiyal duyarlılık durumu Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI) kriterleriyle belirlendi. Bulgular: İzole edilen edilen 2459 E.coli suşu'nun, 747'si ayaktan tedavi gören, 1712'si yatarak tedavi gören hastalara aitti. Yatan hastalarda %84.8, ayakta tedavi gören hastalarda ise %77.3 ile en yüksek direnç oranı ampisiline karşı görülmüştür. En düşük direnç oranı imipenem ve amikasine karşı saptanmıştır. Ayaktan tedavi gören hastalardan izole edilen suşların 104'ünde (%13.9), yatan hastalardan izole edilen suşlardan ise 471'inde (%27.5) genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) belirlenmiştir. Sonuç: Hastanemizdeki antimikrobiyal direnç oranlarının belirlenmesiyle, antimikrobiyal tedavilerin bu sonuçlara göre seçilmesi, GSBL üretimi ve direnç gelişimini önleyecektir.

Anahtar Kelimeler

• -

References

1. 1. Washinton W, Allen S, Janda J, Koneman E; Color Atlas and Textbook of Diagnostic Microbiology. 6th. Ed, Baltimore: Lippincott Williams & Wilkins, 2006.
2. 2. Yetkin G, Kuzucu Ç, Çalışkan A, Ay S. Kan kültürlerinde üreyen Escherichia coli’lerin antibiyotik duyarlılıkları, GSBL oranları ve hastane birimlerine göre dağılımı. İnönü Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi 2006; 13: 147-150.
3. 3. Bauernfeind A, Horl G. Novel R-factor-borne β-laktamase conferring resistance to cephalosporins. Infection 1987; 15: 257- 259.
4. 4. Medeiros AA: Evalution and dissemination of β-lactamases accelerated by generation of β-lactam antibiotics. Clin Infect Dis 1997; 24: 19-45.
5. 5. Mulvey MR, Bryce ED, Boyd M, et al. Ambler class a extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella spp. in Canadian hospitals. Antimicrob Agents Chemother 2004; 48: 1204-1214.
6. 6. Clinical Laboratory Standards Institute: Performance standarts for antimicrobial susceptibility testing, 19th edition. Supplement M100-S19: Clinical Laboratory Standards Institute, 2009.
7. 7. Yılmaz F F, Ermertcan Ş. İdrar yolu infeksiyonlarından izole edilen Escherichia coli kökenlerinde florokinolon direncinin araştırılması, İnfeksiyon Derg 2005; 19: 429-433.
8. 8. Küçükbayrak A, Behçet M, Güler S, Özdemir D. Üriner semptomu olan poliklinik hastalarının idrarında üreyen E.coli suşlarının antibiyotik duyarlılığı. Tıp Araştırma Derg 2006; 4: 18-21.

9. 9. Kalem F, Gündem N.S, Arslan U, Tuncer İ. İdrar örneklerinden izole edilen Escherichia coli suşlarında antimikrobiyal duyarlılı- ğı. Ankem Derg 2008; 22: 193-197.
10. 10. Çetin M, Ocak S, Görür S, Avunduk G. Semptomatik üriner sistem infeksiyonlarında üropatojenler ve izole edilen Escherichia coli suşlarının antibiyotik duyarlılığı. Ankem Derg 2006;20: 169-172.
11. 11. Yetkin G, Kuzucu Ç, Çalışkan A. İdrarda üreyen Escherichia coli’lerin geniş spektrumlu beta laktamazlar yönünden irdelenmesi. İnönü Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi 2006; 13: 249- 252. 12. Ay S, İşeri LA, Duman B. İdrar örneklerinden izole edilen gram olumsuz mikroorganizmaların antibiyotiklere duyarlılıkları. İnö- nü Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi 2003; 10: 59-62.
12. 13. Gündüz T, Mumcuoğlu İ. İdrar örneklerinden izole edilen Escherichia coli suşlarının antibiyotiklere duyarlılıkları. Turk Mikrobiyol Cem Derg 2004; 34: 157-161.
13. 14. Yuluğkural Z, Mutlu B. İdrar kültürlerinden izole edilen Escherichia Coli suşlarının sık kullanılan antibakteriyellere karşı duyarlılıkları. Trakya Univ Tıp Fak Derg 2007; 24: 6-11.
14. 15. Bozkurt H, Güdücüoğlu H, Gülmez S, Aygül K, İzci H, Berktaş M. Erişkin Yaş grubu idrar kültürlerinden izole edilen Escherichia coli suşlarının antimikrobiyallere duyarlılıkları. Van Tıp Dergisi 2005; 12: 232-235.
15. 16. Gill CJ, Jackson JJ, Gerckens LS, et al. In vivo activity and pharmacokinetic evaluation of a novel long-acting carbapenem antibiotic, MK-826 (L-749, 345). Antimicrob Agents Chemother 1998; 42: 1996-2001.
16. 17. Daoud Z, Moubareck C, Hakime N. Extended spectrum betalactamase producing Enterobacteriaceae in Lebanese ICU patients: Epidemiology and patterns of resistance. J Gen Appl Microbiol 2006; 52: 169-178.
17. 18. Perez F, Endimiani A, Hujer KM, Bonomo RA. The continiuing challenge of ESBLs. Curr Opin Pharmacol 2007; 7: 459-469.
18. 19. Pfaller MA, Jones RN and the MYSTIC Study Group (Americas). MYSTIC (Meropenem Yearly Susceptibility Test Information Collection) results from the Americas: resistance implications in the treatment of serious infections. J Antimicrob Chemother 2000; 46: 25-37.
19. 20. Le J, Nguyen T, Okamoto M, McKamy S, Lieberman JM. Impact of empiric antibiotic use on development of infections caused by extended spectrum beta-lactamase bacteria in a neonatal intensive care unit. Pediatr Infect Dis J 2008; 27: 314- 318