BibTex RIS Cite

YENİ NESİL DİZİLEME TEKNOLOJİSİ İLE TRANSKRİPTOM ANALİZİ

Year 2015, Volume: 5 Issue: 10, 51 - 59, 18.11.2015

Abstract

 

ÖZET

Yeni Nesil Dizileme  platformları sayesinde, RNA materyali  paralel ve eş zamanlı olarak transkriptom dizileme yöntemiyle  transkripte olan tüm  genler ve izoformları, genlerin 5’ ve 3’ uçlarının belirlenmesi, tek nükleotid değişimleri, insersiyon, delesyon, füzyon genler, ve genlerin ifadesi incelenebilmektedir. Bu makalede transkriptom dizileme uygulamaları ile dizileme sonuçlarının analizinde kullanılan bioinformatik araçlar hakkında genel bir bakış  sunulmuştur.

 

Abstract

By means of the  next generation sequencing platforms, RNA material can be analyzed all genes and isoforms, annotation of 5’ and 3’ ends of genes, single nucleotide polymorphisms, insertion, deletion, fusion genes, and gene expression by using massively parallel and simultaneously transcriptome sequencing method. This article provides a general overview to the transcriptome sequencing, applications and the bioinformatics tools to the analysis of the sequencing data.


Year 2015, Volume: 5 Issue: 10, 51 - 59, 18.11.2015

Abstract

There are 0 citations in total.

Details

Primary Language Turkish
Journal Section Makale
Authors

Melda Sarıman

Sema Sırma Ekmekci

Neslihan Abacı

Aris Çakiris

Ferda Paçal

Zeliha Emrence

Duran Üstek

Şükrü Öztürk This is me

Publication Date November 18, 2015
Published in Issue Year 2015 Volume: 5 Issue: 10

Cite

APA Sarıman, M., Sırma Ekmekci, S., Abacı, N., Çakiris, A., et al. (2015). YENİ NESİL DİZİLEME TEKNOLOJİSİ İLE TRANSKRİPTOM ANALİZİ. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi, 5(10), 51-59.
AMA Sarıman M, Sırma Ekmekci S, Abacı N, Çakiris A, Paçal F, Emrence Z, Üstek D, Öztürk Ş. YENİ NESİL DİZİLEME TEKNOLOJİSİ İLE TRANSKRİPTOM ANALİZİ. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi. December 2015;5(10):51-59.
Chicago Sarıman, Melda, Sema Sırma Ekmekci, Neslihan Abacı, Aris Çakiris, Ferda Paçal, Zeliha Emrence, Duran Üstek, and Şükrü Öztürk. “YENİ NESİL DİZİLEME TEKNOLOJİSİ İLE TRANSKRİPTOM ANALİZİ”. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi 5, no. 10 (December 2015): 51-59.
EndNote Sarıman M, Sırma Ekmekci S, Abacı N, Çakiris A, Paçal F, Emrence Z, Üstek D, Öztürk Ş (December 1, 2015) YENİ NESİL DİZİLEME TEKNOLOJİSİ İLE TRANSKRİPTOM ANALİZİ. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi 5 10 51–59.
IEEE M. Sarıman, S. Sırma Ekmekci, N. Abacı, A. Çakiris, F. Paçal, Z. Emrence, D. Üstek, and Ş. Öztürk, “YENİ NESİL DİZİLEME TEKNOLOJİSİ İLE TRANSKRİPTOM ANALİZİ”, Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi, vol. 5, no. 10, pp. 51–59, 2015.
ISNAD Sarıman, Melda et al. “YENİ NESİL DİZİLEME TEKNOLOJİSİ İLE TRANSKRİPTOM ANALİZİ”. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi 5/10 (December 2015), 51-59.
JAMA Sarıman M, Sırma Ekmekci S, Abacı N, Çakiris A, Paçal F, Emrence Z, Üstek D, Öztürk Ş. YENİ NESİL DİZİLEME TEKNOLOJİSİ İLE TRANSKRİPTOM ANALİZİ. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi. 2015;5:51–59.
MLA Sarıman, Melda et al. “YENİ NESİL DİZİLEME TEKNOLOJİSİ İLE TRANSKRİPTOM ANALİZİ”. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi, vol. 5, no. 10, 2015, pp. 51-59.
Vancouver Sarıman M, Sırma Ekmekci S, Abacı N, Çakiris A, Paçal F, Emrence Z, Üstek D, Öztürk Ş. YENİ NESİL DİZİLEME TEKNOLOJİSİ İLE TRANSKRİPTOM ANALİZİ. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi. 2015;5(10):51-9.