BibTex RIS Cite

Akut Lösemi Hücre Serilerinde Beta-Katenin siRNA Uygulamaları

Year 2012, Volume: 2 Issue: 3, 16 - 22, 08.02.2012

Yücel Erbilgin Esin Aktaş Günnur Deniz Uğur Özbek Müge Sayitoğlu Özden Hatırnaz Ng

Abstract

Ribonukleik asid (RNA) interferans evrimsel olarak korunmuş ve çift iplikli kısa RNA dizilerinin hedef mRNA'lara bağlanarak gen anlatımını baskılayan bir biyolojik süreçtir. Keşfini takiben deneysel kullanımı son derece yaygınlaşmış ve farklı alanlarda çok sayıda çalışma yapılmıştır. Bu çalışmada Akut Lenfoblastik Lösemi (ALL) hücre serilerinde, WNT sinyal ileti yolağının kilit molekülü olan BETA KATENİN genini siRNA ile baskılayarak apoptotik etkilerini inceledik. Sonuçta siRNA yöntemi ile beta-catenin genini %60 başarı ile kapatarak anlatımını baskılanmıştır. Ayrıca baskılanma sonrası MOLT4 hücre serilerinde apoptozun baskılanmamış hücrelere göre iki kat arttığı belirlenmiştir. Buna göre ALL hücre serilerinde var olan aktif WNT sinyalleri, siRNA kullanımı ile kapatılarak apoptozdan kaçan lösemi hücrelerinin yeniden apoptoza yönelmesi sağlanmıştır. siRNA uygulamaları, özellikle in vitro çalışmalarda hızlı, etkin ve ucuz bir yöntemdir. Ancak in vivo çalışmalardaki etkinliğini ve klinik uygulamaları için daha geniş kapsamlı çalışmalara ihtiyaç duyulmaktadır.

References

  • Napoli C, Lemieux CJorgensen R, Introduction of a Chimeric Chalcone Synthase Gene into Petunia Results in Reversible Co-Suppression of Homologous Genes in trans. Plant Cell, 1990. 2(4): p. 279-289.
  • Fire A, Xu S, Montgomery MK, Kostas SA, Driver SEMello CC, Potent and specific genetic interference by double-stranded RNAin Caenorhabditis elegans. Nature, 1998. 391(6669): p. 806-811.
  • Cogoni C, Irelan JT, Schumacher M , Schmidhauser TJ, Selker EUMacino G, Transgene silencing of the al-1 gene in vegetative cells of Neurospora is mediated by a cytoplasmic effector and does not depend on DNA-DNA interactions or DNA methylation. EMBO J, 1996. 15(12): p. 3153-3163.
  • Lindbo JADougherty WG, Untranslatable transcripts of the tobacco etch virus coat protein gene sequence can interfere with tobacco etch virus replication in transgenic plants and protoplasts. Virology, 1992. 189(2): p. 725-733.
  • van der Krol AR, Mur LA, Beld M , Mol JNStuitje AR, Flavonoid genes in petunia: addition of a limited number of gene copies may lead to a suppression of gene expression. Plant Cell, 1990. 2(4): p. 291-299.
  • Hammond SM, Bernstein E, Beach DHannon GJ, An RNA-directed nuclease mediates post-transcriptional gene silencing in Drosophila cells. Nature, 2000.404(6775): p. 293ı 296.
  • Aigner A, Gene silencing through RNA interference (RNAi) in vivo: strategies based on the direct application of siRNAs. J Biotechnol, 2006. 124(1): p. 12-25.
  • Elbashir SM, Martinez J, Patkaniowska A, Lendeckel WTuschl T, Functional anatomy of siRNAs for mediating efficient RNAi in Drosophila melanogaster embryo lysate. EMBO J, 2001. 20(23): p. 6877-6888.
  • Reynolds A, Leake D, Boese Q, Scaringe S, Marshall WSKhvorova A, Rational siRNA design for RNA interference. Nat Biotechnol, 2004. 22(3): p. 326-330.
  • Huesken D, Lange J, Mickanin C, Weiler J, Asselbergs F, Warner J, Meloon B, Engel S, Rosenberg A, Cohen D, Labow M, Reinhardt M , Natt FHall J, Design of a genome- wide siRNA library using an artificial neural network. Nat Biotechnol, 2005. 23(8): p. 995-1001.
  • Austin TW, Solar GP, Ziegler FC, Liem LMatthews W, A role for the Wnt gene family in hematopoiesis: expansion of multilineage progenitor cells. Blood, 1997. 89(10): p. 3624ı 3635.
  • Chung EJ, Hwang SG, Nguyen P, Lee S, Kim JS, Kim JW, Henkart PA, Bottaro DP, Soon L, Bonvini P, Lee SJ, Karp JE, Oh HJ, Rubin JSTrepel JB, Regulation of leukemic cell adhesion, proliferation, and survival by beta-catenin. Blood, 2002. 100(3): p. 982-990.
  • Livak KJSchmittgen TD, Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2(- Delta Delta C(T)) Method. Methods, 2001. 25(4): p. 402-408.
  • Steg AD, Katre AA, Goodman B, Han HD, Nick AM, Stone RL, Coleman RL, Alvarez RD, Lopez-Berestein G, Sood AKLanden CN, Targeting the notch ligand JAGGED 1 in both tumor cells and stroma in ovarian cancer. Clin Cancer Res. 17(17): p. 5674-5685.

Year 2012, Volume: 2 Issue: 3, 16 - 22, 08.02.2012

Yücel Erbilgin Esin Aktaş Günnur Deniz Uğur Özbek Müge Sayitoğlu Özden Hatırnaz Ng

Abstract

References

  • Napoli C, Lemieux CJorgensen R, Introduction of a Chimeric Chalcone Synthase Gene into Petunia Results in Reversible Co-Suppression of Homologous Genes in trans. Plant Cell, 1990. 2(4): p. 279-289.
  • Fire A, Xu S, Montgomery MK, Kostas SA, Driver SEMello CC, Potent and specific genetic interference by double-stranded RNAin Caenorhabditis elegans. Nature, 1998. 391(6669): p. 806-811.
  • Cogoni C, Irelan JT, Schumacher M , Schmidhauser TJ, Selker EUMacino G, Transgene silencing of the al-1 gene in vegetative cells of Neurospora is mediated by a cytoplasmic effector and does not depend on DNA-DNA interactions or DNA methylation. EMBO J, 1996. 15(12): p. 3153-3163.
  • Lindbo JADougherty WG, Untranslatable transcripts of the tobacco etch virus coat protein gene sequence can interfere with tobacco etch virus replication in transgenic plants and protoplasts. Virology, 1992. 189(2): p. 725-733.
  • van der Krol AR, Mur LA, Beld M , Mol JNStuitje AR, Flavonoid genes in petunia: addition of a limited number of gene copies may lead to a suppression of gene expression. Plant Cell, 1990. 2(4): p. 291-299.
  • Hammond SM, Bernstein E, Beach DHannon GJ, An RNA-directed nuclease mediates post-transcriptional gene silencing in Drosophila cells. Nature, 2000.404(6775): p. 293ı 296.
  • Aigner A, Gene silencing through RNA interference (RNAi) in vivo: strategies based on the direct application of siRNAs. J Biotechnol, 2006. 124(1): p. 12-25.
  • Elbashir SM, Martinez J, Patkaniowska A, Lendeckel WTuschl T, Functional anatomy of siRNAs for mediating efficient RNAi in Drosophila melanogaster embryo lysate. EMBO J, 2001. 20(23): p. 6877-6888.
  • Reynolds A, Leake D, Boese Q, Scaringe S, Marshall WSKhvorova A, Rational siRNA design for RNA interference. Nat Biotechnol, 2004. 22(3): p. 326-330.
  • Huesken D, Lange J, Mickanin C, Weiler J, Asselbergs F, Warner J, Meloon B, Engel S, Rosenberg A, Cohen D, Labow M, Reinhardt M , Natt FHall J, Design of a genome- wide siRNA library using an artificial neural network. Nat Biotechnol, 2005. 23(8): p. 995-1001.
  • Austin TW, Solar GP, Ziegler FC, Liem LMatthews W, A role for the Wnt gene family in hematopoiesis: expansion of multilineage progenitor cells. Blood, 1997. 89(10): p. 3624ı 3635.
  • Chung EJ, Hwang SG, Nguyen P, Lee S, Kim JS, Kim JW, Henkart PA, Bottaro DP, Soon L, Bonvini P, Lee SJ, Karp JE, Oh HJ, Rubin JSTrepel JB, Regulation of leukemic cell adhesion, proliferation, and survival by beta-catenin. Blood, 2002. 100(3): p. 982-990.
  • Livak KJSchmittgen TD, Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2(- Delta Delta C(T)) Method. Methods, 2001. 25(4): p. 402-408.
  • Steg AD, Katre AA, Goodman B, Han HD, Nick AM, Stone RL, Coleman RL, Alvarez RD, Lopez-Berestein G, Sood AKLanden CN, Targeting the notch ligand JAGGED 1 in both tumor cells and stroma in ovarian cancer. Clin Cancer Res. 17(17): p. 5674-5685.
There are 14 citations in total.

Details

Primary Language Turkish
Journal Section Genetik
Authors

Yücel Erbilgin This is me

Esin Aktaş This is me

Günnur Deniz This is me

Uğur Özbek This is me

Müge Sayitoğlu This is me

Özden Hatırnaz Ng

Publication Date February 8, 2012
Published in Issue Year 2012 Volume: 2 Issue: 3

Cite

APA Erbilgin, Y., Aktaş, E., Deniz, G., Özbek, U., et al. (2012). Akut Lösemi Hücre Serilerinde Beta-Katenin siRNA Uygulamaları. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi, 2(3), 16-22.
AMA Erbilgin Y, Aktaş E, Deniz G, Özbek U, Sayitoğlu M, Hatırnaz Ng Ö. Akut Lösemi Hücre Serilerinde Beta-Katenin siRNA Uygulamaları. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi. July 2012;2(3):16-22.
Chicago Erbilgin, Yücel, Esin Aktaş, Günnur Deniz, Uğur Özbek, Müge Sayitoğlu, and Özden Hatırnaz Ng. “Akut Lösemi Hücre Serilerinde Beta-Katenin SiRNA Uygulamaları”. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi 2, no. 3 (July 2012): 16-22.
EndNote Erbilgin Y, Aktaş E, Deniz G, Özbek U, Sayitoğlu M, Hatırnaz Ng Ö (July 1, 2012) Akut Lösemi Hücre Serilerinde Beta-Katenin siRNA Uygulamaları. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi 2 3 16–22.
IEEE Y. Erbilgin, E. Aktaş, G. Deniz, U. Özbek, M. Sayitoğlu, and Ö. Hatırnaz Ng, “Akut Lösemi Hücre Serilerinde Beta-Katenin siRNA Uygulamaları”, Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi, vol. 2, no. 3, pp. 16–22, 2012.
ISNAD Erbilgin, Yücel et al. “Akut Lösemi Hücre Serilerinde Beta-Katenin SiRNA Uygulamaları”. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi 2/3 (July 2012), 16-22.
JAMA Erbilgin Y, Aktaş E, Deniz G, Özbek U, Sayitoğlu M, Hatırnaz Ng Ö. Akut Lösemi Hücre Serilerinde Beta-Katenin siRNA Uygulamaları. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi. 2012;2:16–22.
MLA Erbilgin, Yücel et al. “Akut Lösemi Hücre Serilerinde Beta-Katenin SiRNA Uygulamaları”. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi, vol. 2, no. 3, 2012, pp. 16-22.
Vancouver Erbilgin Y, Aktaş E, Deniz G, Özbek U, Sayitoğlu M, Hatırnaz Ng Ö. Akut Lösemi Hücre Serilerinde Beta-Katenin siRNA Uygulamaları. Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Dergisi. 2012;2(3):16-22.
 Download Cover Image