Research Article
BibTex RIS Cite

Klinik örneklerden izole edilien karbapeneme dirençli Acineobacter baumannii suşlarında metallo-beta-laktamaz enzimi varlığının iki farklı fenotipik yöntemle araştırılması

Year 2018, Volume: 1 Issue: 1, 9 - 12, 05.04.2018
https://doi.org/10.32322/jhsm.410890

Abstract

Amaç:
Acineobacter
baumannii
(A.
baumannii
) suşları pekçok antibiyotik grubuna karşı direnç geliştirebilen
nozokomiyal infeksiyon etkenleridir. A. baumannii
suşlarında karbapenem grubu anibiyotiklere karşı direnç mekanizmalarından
birisi de meallo-beta-laktamaz enzimi üretimidir.  Metallo-beta-laktamaz enzimleri (VIM, IMP
vb.) aztreonam dışındaki tüm beta-laktamazları inhibe eden, çinko iyonuna
gereksinim  duyan enzimlerdir. Bu
çalışmanın amacı, karbapeneme dirençli A.
baumannni
suşlarında metallo-beta-laktamaz  varlığının iki farklı fenoipik yöntemle araştırılmasıdır.

Gereç
ve Yöntem:
Çalışmaya çeşitli klinik örnekleden
izole edilen karbapeneme dirençli 82 A. baumannii
suşu dahil edildi. Bakteri identifikasyonu konvansiyonel yönemler ve BD Phoenix
(Becton Dickinson, USA) otomatize sistemi ile gerçekleştirildi. Antibiyotik
duyarlılık testleri EUCAST önerileri doğrulusunda disk difüzyon yöntemiyle
belirlendi. MBL varlığı kombine disk yöntemi ve modifiye Hodge testi ile araştırıldı.

Bulgular:
Karbepeneme dirençli 82 A. baumannii
suşunun 3’ünde (% 3.7), kombine disk yöntemiyle MBL enzimi saptanırken,
Modifiye Hodge testi çalışılan 70 A. baumannii
suşunun 27 (%39)’sinde MBL üretimi saptandı. 







Sonuç: Hastanemizde karbapeneme dirençli A.baumannii suşlarında kombine disk
yöntemiyle MBL enzimi pozitifliği düşük oranda saptanırken, modifiye Hodge
testi ile yüksek oranda saptanmıştır. İki yöntem arasında korelasyon
saptanmamıştır. Sonuç olarak, MBL enzim varlığının referans
yöntem olan moleküler yöntemlerle belirlenerek iki fenotipik yöntemden
hangisinin daha uygun olduğunun belirlenmesi uygun bir yaklaşım olacaktır.  

References

  • 1. Huang H, Chen B, Liu G, et al. A multi-center study on the risk factors of infection caused by multi-drug resistant Acinetobacter baumannii. BMC Infect Dis. 2018;18(1):11.
  • 2. Lee CR, Lee JH, Park M, et al. Biology of Acinetobacter baumannii: pathogenesis, antibiotic resistance mechanisms, and prospective treatment options. Front Cell Infect Microbiol 2017 Mar 13;7:55. doi: 10.3389/fcimb.2017.00055.
  • 3. Öztürk CE, Çalışkan E, Şahin İ. Pseudomonas aeruginosa suşlarında antibiyotik direnci ve metallo-beta-laktamaz sıklığı. ANKEM Derg 2011;25(1):42-7.
  • 4. Nordmann P, Poirel L. Emerging carbapenemases in Gram-negative aerobes, Clin Microbiol Infect 2002;8(6):321-31.
  • 5. Aktaş AE, Yiğit N, Kayserili F, Ayyıldız A. Pseudomonas ve Acinetobacter suşlarının antibi-yotik duyarlılıkları ve metallo-beta-laktamaz üre¬timinin araştırılması, İnfeksiyon Derg 2009;23(2)2:57-62.
  • 6. Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) (Çeviri editörü D Gür). Antimikrobik Duyarlılık Testleri İçin Uygulama Standartları, Ondokuzuncu Bilgi Eki, Bilimsel Tıp Yayınevi, Ankara (2009).
  • 7. Fidan I, Gürelik FÇ, Yüksel S, Sultan N. Pseudomonas aeruginosa suşlarında antibiyotik direnci ve metallo-beta-laktamaz sıklığı. ANKEM Derg 2005;19(2):68-70.
  • 8. Pragasam AK, Sahni RD, Anandan S, et al. Study on Carbapenemase Detection: Do We See the Same Level of Agreement as with the CLSI Observations.J Clin Diagn Res 2016;10(7):DC09-13.
  • 9. Lee K, Lim YS, Yong D, Yum JH, Chong Y. Evaluation of the Hodge test and the Imipenem-EDTA double disk synergy test for differentiating metallo-β-lactamase producing isolates of Pseudomonas spp. and Acinetobacter spp. J Clin Microbiol 2003;41:4623-9.
  • 10. Yan JJ, Wu JJ, Tsai SH, Chuang CL. Comparison of the double-disk, combined disk, and Etest methods for detecting metallo-b-lactamases in Gramnegative bacilli. Diagn Microbiol Infect Dis. 2004;49(1):5-11.
  • 11. Türkdağı H, Kuş H, Keyik Ş, Arslan U, Tuncer İ, Fındık D. Karbapenemlere dirençli Acinetobacter baumannii suşlarında metallo-beta-laktamaz varlığının araştırılması. ANKEM Derg 2012;26(4):187-92 doi:10.5222/ankem.2012.187.
  • 12. Anwar M, Ejaz H, Zafar A, Hamid H. Phenotypic detection of metallo-beta-lactamases in carbapenem resistant Acinetobacter baumannii isolated from pediatric patients in Pakistan. J Pathog 2016;2016:8603964.
  • 13. Eser ÖK, Ergin A, Hasçelik G. Erişkin hastalardan izole edilen Acinetobacter türlerinde antimikrobi¬yal direnç ve metallo-beta-laktamaz varlığı. Mikrobiyol Bul 2009;43:383-90.
  • 14. Aksoy MD, Çavuşlu Ş, Tuğrul HM. Investigation of metallo beta lactamases and oxacilinases in carbapenem resistant Acinetobacter baumannii strains isolated from inpatients. Balkan Med J 2015;32(1):79-83.

Investigation of the presence of metallo-beta-lactamase enzyme in two different phenotypic methods in carbapenem resistant Acineobacter baumannii strains isolated from clinical specimens

Year 2018, Volume: 1 Issue: 1, 9 - 12, 05.04.2018
https://doi.org/10.32322/jhsm.410890

Abstract

Aim:
Acinobacter baumannii strains are nosocomial infections that can develop
resistance to many antibiotic strains. One of the mechanisms of resistance of
the carbapenem group to anobiotics in A.baumannii strains is the production of
meallo-beta-lactamase enzyme. Metallo-beta-lactamase enzymes (VIM, IMP, etc.)
are enzymes that inhibit all beta- lactamases outside of aztreonam and require
zinc ions. The aim of this study is to investigate the presence of
metallo-beta-lactamase in carbapenem resistant A. baumannii strains by two
different phenotypic methods.

Material
and Method:
The study included 82 A. baumannii
strains isolated in various clinical specimens resistant to carbapenem.
Bacteria identification was performed using conventional manners and an
automated system from BD Phoenix (Becton Dickinson, USA). Antibiotic
susceptibility tests were determined by disc diffusion method in accordance
with the EUCAST recommendation. MBL presence was investigated by the combined
disc method and the modified Hodge test.

Results:
MBL enzyme was detected by combined disc method in 3 of carbobehim resistant 82
A.baumannii strains (3.7%), whereas unde MBL production was detected in 27 of
70 A. baumannii strains tested
(Modifiye Hodge test)







Conclusion:
In our hospital, MBL enzyme positivity was detected at low rate by combination
disc method in carbapenem resistant A. baumannii
strains, but it was detected high with the modified Hodge test. No correlation
was found between the two methods. In conclusion, it would be appropriate to
identify the presence of MBL enzyme by molecular methods which are the
reference methods and to determine which of the two phenotypic methods is mor
e appropriate.

References

  • 1. Huang H, Chen B, Liu G, et al. A multi-center study on the risk factors of infection caused by multi-drug resistant Acinetobacter baumannii. BMC Infect Dis. 2018;18(1):11.
  • 2. Lee CR, Lee JH, Park M, et al. Biology of Acinetobacter baumannii: pathogenesis, antibiotic resistance mechanisms, and prospective treatment options. Front Cell Infect Microbiol 2017 Mar 13;7:55. doi: 10.3389/fcimb.2017.00055.
  • 3. Öztürk CE, Çalışkan E, Şahin İ. Pseudomonas aeruginosa suşlarında antibiyotik direnci ve metallo-beta-laktamaz sıklığı. ANKEM Derg 2011;25(1):42-7.
  • 4. Nordmann P, Poirel L. Emerging carbapenemases in Gram-negative aerobes, Clin Microbiol Infect 2002;8(6):321-31.
  • 5. Aktaş AE, Yiğit N, Kayserili F, Ayyıldız A. Pseudomonas ve Acinetobacter suşlarının antibi-yotik duyarlılıkları ve metallo-beta-laktamaz üre¬timinin araştırılması, İnfeksiyon Derg 2009;23(2)2:57-62.
  • 6. Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) (Çeviri editörü D Gür). Antimikrobik Duyarlılık Testleri İçin Uygulama Standartları, Ondokuzuncu Bilgi Eki, Bilimsel Tıp Yayınevi, Ankara (2009).
  • 7. Fidan I, Gürelik FÇ, Yüksel S, Sultan N. Pseudomonas aeruginosa suşlarında antibiyotik direnci ve metallo-beta-laktamaz sıklığı. ANKEM Derg 2005;19(2):68-70.
  • 8. Pragasam AK, Sahni RD, Anandan S, et al. Study on Carbapenemase Detection: Do We See the Same Level of Agreement as with the CLSI Observations.J Clin Diagn Res 2016;10(7):DC09-13.
  • 9. Lee K, Lim YS, Yong D, Yum JH, Chong Y. Evaluation of the Hodge test and the Imipenem-EDTA double disk synergy test for differentiating metallo-β-lactamase producing isolates of Pseudomonas spp. and Acinetobacter spp. J Clin Microbiol 2003;41:4623-9.
  • 10. Yan JJ, Wu JJ, Tsai SH, Chuang CL. Comparison of the double-disk, combined disk, and Etest methods for detecting metallo-b-lactamases in Gramnegative bacilli. Diagn Microbiol Infect Dis. 2004;49(1):5-11.
  • 11. Türkdağı H, Kuş H, Keyik Ş, Arslan U, Tuncer İ, Fındık D. Karbapenemlere dirençli Acinetobacter baumannii suşlarında metallo-beta-laktamaz varlığının araştırılması. ANKEM Derg 2012;26(4):187-92 doi:10.5222/ankem.2012.187.
  • 12. Anwar M, Ejaz H, Zafar A, Hamid H. Phenotypic detection of metallo-beta-lactamases in carbapenem resistant Acinetobacter baumannii isolated from pediatric patients in Pakistan. J Pathog 2016;2016:8603964.
  • 13. Eser ÖK, Ergin A, Hasçelik G. Erişkin hastalardan izole edilen Acinetobacter türlerinde antimikrobi¬yal direnç ve metallo-beta-laktamaz varlığı. Mikrobiyol Bul 2009;43:383-90.
  • 14. Aksoy MD, Çavuşlu Ş, Tuğrul HM. Investigation of metallo beta lactamases and oxacilinases in carbapenem resistant Acinetobacter baumannii strains isolated from inpatients. Balkan Med J 2015;32(1):79-83.
There are 14 citations in total.

Details

Primary Language Turkish
Subjects Health Care Administration
Journal Section Original Article
Authors

Salih Cesur

Sami Kınıklı This is me

Kader Doğan This is me

Ayşe Büyükdemirci This is me

Serap Yağcı This is me

Çiğdem Ataman Hatipoğlu This is me

Esra Kaya Kılıç This is me

Bedia Dinç This is me

Publication Date April 5, 2018
Published in Issue Year 2018 Volume: 1 Issue: 1

Cite

AMA Cesur S, Kınıklı S, Doğan K, Büyükdemirci A, Yağcı S, Ataman Hatipoğlu Ç, Kılıç EK, Dinç B. Klinik örneklerden izole edilien karbapeneme dirençli Acineobacter baumannii suşlarında metallo-beta-laktamaz enzimi varlığının iki farklı fenotipik yöntemle araştırılması. J Health Sci Med / JHSM. April 2018;1(1):9-12. doi:10.32322/jhsm.410890

Interuniversity Board (UAK) Equivalency: Article published in Ulakbim TR Index journal [10 POINTS], and Article published in other (excuding 1a, b, c) international indexed journal (1d) [5 POINTS].

The Directories (indexes) and Platforms we are included in are at the bottom of the page.

Note: Our journal is not WOS indexed and therefore is not classified as Q.

You can download Council of Higher Education (CoHG) [Yüksek Öğretim Kurumu (YÖK)] Criteria) decisions about predatory/questionable journals and the author's clarification text and journal charge policy from your browser. https://dergipark.org.tr/tr/journal/2316/file/4905/show







The indexes of the journal are ULAKBİM TR Dizin, Index Copernicus, ICI World of Journals, DOAJ, Directory of Research Journals Indexing (DRJI), General Impact Factor, ASOS Index, WorldCat (OCLC), MIAR, EuroPub, OpenAIRE, Türkiye Citation Index, Türk Medline Index, InfoBase Index, Scilit, etc.

       images?q=tbn:ANd9GcRB9r6zRLDl0Pz7om2DQkiTQXqDtuq64Eb1Qg&usqp=CAU

500px-WorldCat_logo.svg.png

atifdizini.png

logo_world_of_journals_no_margin.png

images?q=tbn%3AANd9GcTNpvUjQ4Ffc6uQBqMQrqYMR53c7bRqD9rohCINkko0Y1a_hPSn&usqp=CAU

doaj.png  

images?q=tbn:ANd9GcSpOQFsFv3RdX0lIQJC3SwkFIA-CceHin_ujli_JrqBy3A32A_Tx_oMoIZn96EcrpLwTQg&usqp=CAU

ici2.png

asos-index.png

drji.png





The platforms of the journal are Google Scholar, CrossRef (DOI), ResearchBib, Open Access, COPE, ICMJE, NCBI, ORCID, Creative Commons, etc.

COPE-logo-300x199.jpgimages?q=tbn:ANd9GcQR6_qdgvxMP9owgnYzJ1M6CS_XzR_d7orTjA&usqp=CAU

icmje_1_orig.png

cc.logo.large.png

ncbi.pngimages?q=tbn:ANd9GcRBcJw8ia8S9TI4Fun5vj3HPzEcEKIvF_jtnw&usqp=CAU

ORCID_logo.png

1*mvsP194Golg0Dmo2rjJ-oQ.jpeg


Our Journal using the DergiPark system indexed are;

Ulakbim TR Dizin,  Index Copernicus, ICI World of JournalsDirectory of Research Journals Indexing (DRJI), General Impact FactorASOS Index, OpenAIRE, MIAR,  EuroPub, WorldCat (OCLC)DOAJ,  Türkiye Citation Index, Türk Medline Index, InfoBase Index


Our Journal using the DergiPark system platforms are;

Google, Google Scholar, CrossRef (DOI), ResearchBib, ICJME, COPE, NCBI, ORCID, Creative Commons, Open Access, and etc.


Journal articles are evaluated as "Double-Blind Peer Review". 

Our journal has adopted the Open Access Policy and articles in JHSM are Open Access and fully comply with Open Access instructions. All articles in the system can be accessed and read without a journal user.  https//dergipark.org.tr/tr/pub/jhsm/page/9535

Journal charge policy   https://dergipark.org.tr/tr/pub/jhsm/page/10912


Editor List for 2022

Assoc. Prof. Alpaslan TANOĞLU (MD)  

Prof. Aydın ÇİFCİ (MD)

Prof. İbrahim Celalaettin HAZNEDAROĞLU (MD)

Prof. Murat KEKİLLİ (MD)

Prof. Yavuz BEYAZIT (MD) 

Prof. Ekrem ÜNAL (MD)

Prof. Ahmet EKEN (MD)

Assoc. Prof. Ercan YUVANÇ (MD)

Assoc. Prof. Bekir UÇAN (MD) 

Assoc. Prof. Mehmet Sinan DAL (MD)


Our journal has been indexed in DOAJ as of May 18, 2020.

Our journal has been indexed in TR-Dizin as of March 12, 2021.


17873

Articles published in the Journal of Health Sciences and Medicine have open access and are licensed under the Creative Commons CC BY-NC-ND 4.0 International License.