Eskişehir Yöresi Türk Arap Atlarında Lavanta Renkli Tay Sendromunun Araştırılması
Year 2019,
Volume: 59 Issue: Ek Sayı, 97 - 101, 04.06.2020
Muhammet Kaya
,
Tuğba Yıldız
Elif Günvar
Metin Taş
Abstract
Lavanta Renkli Tay Sendromu (Lavender Foal Syndrome-LFS) otozomal resesif kalıtım modeli gösteren bir genetik kusur olup, Arap atlarında nörolojik anormalliklere ve ekonomik kayıplara neden olmaktadır. Yürütülen araştırmada, Eskişehir yöresindeki dokuz özel işletmeden alınan toplam 115 baş Arap atı materyalinde LFS mutant allellin varlığı araştırılmıştır. Genomik DNA kandan elde edilmiş ve LFS’den sorumlu mutasyonu içeren MYO5A gen bölgesi Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) yöntemi ile çoğaltılmıştır. PCR ürünleri Faul restriksiyon enzimi ile muamele edildikten sonra agaroz jel elektroforezde analiz edilmiştir. Heterozigot genotipte olanlar dizi analizi yöntemiyle teyit edilmiştir. Araştırmada, incelenen 115 baş Türk Arap atının LFS genetik kusuru bakımından mutant allele sahip olmadığı tespit edilmiştir.
References
- 01. Alkalamawy NM, Amin DM, Alkalamawy IM, Abd Elaty IA
(2018): Lavender foal syndrome in Egyptian Arabian horses:
molecular and pathological studies. SVU-International
Journal of Veterinary Sciences, 1 (1): 55-65.
- 02. Animal Genetics (2019): Erişim: http://www.animalgenetics.us/
equine/genetic_disease/Index.asp. (Erişim tarihi: 18.02.2019)
- 03. Animal Genetics (2019): Erişim: http://www.animalgenetics.
us/equine/genetic_disease/LFS.asp. (Erişim tarihi: 18.02.2019)
- 04. Bierman A, Guthrie AJ, Harper CK (2010): Lavender foal syndrome
in Arabian horses is caused by a single-base deletion in
the MYO5A gene. Animal Genetics, 41: 199-201.
- 05. Bilgen N, Çınar Kul B, Ertuğrul O, Erzurum F (2017): Türkiye
Arap Atı Popülasyonunda LFS ve PSSM-I Hastalıklarının
Moleküler Taraması. Kafkas Universitesi Veteriner Fakultesi
Dergisi, 23 (2): 339-342.
- 06. Brooks SA, Gabreski N, Miller D, Brisbin A, Brown HE (2010):
Whole-genome SNP association in the horse: identification
of a deletion in myosin Va responsible for Lavender Foal
Syndrome. PLOS Genetics, 6 (4): e1000909.
- 07. Bursa İl Gıda, Tarım ve Hayvancılık Müdürlüğü Faaliyet Raporu
(2013): Erişim: https://www.tarimorman.gov.tr/SGB/Belgeler/
Bakanlık_Faaliyet_Raporları/2013%20YILI.pdf
- 08. Efendić M, Maćešić N, Samardžija M, Vojta A, Korabi N,
Capak H, Sušnić MA, Žaja IŽ, Pećin M, Babić NP (2018):
Determination of Sublethal Mutation Causing Lavender Foal
Syndrome in Arabian Horses From Croatia. Journal of Equine
Veterinary Science, 61: 72-75.
- 09 Eskişehir İl Gıda, Tarım ve Hayvancılık Müdürlüğü Faaliyet
Raporu (2015): Erişim: https://eskisehir.tarimorman.gov.tr/
Belgeler/2016_Faaliyet_Raporu/2016%20Yılı%20Faaliyet%20
Raporu.pdf. (Erişim tarihi: 18.02.2019)
- 10. Fanelli HH (2005): Coat color dilution lethal (Lavender Foal
Syndrome): A tetany syndrome of Arapian foals. Equine
Veterinary Education, 17: 260-263.
- 11. Gabreski NA, Haase B, Armstrong CD, Distl O, Brooks SA
(2012): Investigation of allele frequencies for Lavender foal
syndrome in the horse. Animal Genetics, 43: 646-652.
- 12. Khanshour AM, Juras R, Stelly L, Cothran EG (2013): Molecular
investigation and diagnosis of three genetic diseases in
Arabian horses from Middle East and North American populations.
Journal of Equine Veterinary Science, 33 (5): 364-365.
- 13. Kumar S, Stecher G, Li M, Knyaz C, Tamura K (2018): MEGA X:
Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing
platforms. Molecular Biology and Evolution, 35: 1547-1549.
- 14. Laboklin Laboratory (2019): Erişim: http://www.laboklin.co.uk/
laboklin/index.jsp. (Erişim tarihi: 18.02.2019)
- 15. Malatya İl Gıda, Tarım ve Hayvancılık Müdürlüğü Faaliyet
Raporu (2019): Erişim: https://malatya.tarimorman.gov.tr/
Menu/14/Hayvan-Varligi. (Erişim tarihi: 18.02.2019)
- 16. Meydan H (2007): Türkiye’de yetiştirilen siyah alaca sığır ırkında
lökosit adhezyon yetersizliği (BLAD; Bovine Leukocyte
Adhesion Deficiency)’nin PCR-RFLP yöntemi kullanılarak
belirlenmesi. Yüksek Lisans Tezi, Ankara Universitesi Fen
Bilimleri Enstitüsü, Ankara.
- 17. Nagahata H (2004): Bovine Leukocyte Adhesion Deficiency
(BLAD): A Review. The Journal of Veterinary Medical Science,
66 (12): 1475-1482.
- 18. Online Mendelian Inheritance in Animals (OMIA) (2019):
Erişim: https://omia.org/home/. (Erişim tarihi: 18.02.2019)
- 19. Page P, Parker R, Harper C, Guthrie A, Neser J (2006): Clinical,
clinicopathologic, postmortem examination findings and
familial history of 3 Arapians with lavender foal syndrome.
Journal of Veterinary Internal Medicine, 20: 1491-1494.
- 20. Takagishi Y, Murata Y (2006): Myosin Va mutation in rats is an
animal model for the human hereditary neurological disease,
Griscelli syndrome type 1. Annals of the New York Academy
of Sciences, 1086: 66-80.
- 21. Tarr CJ, Thompson PN, Guthrie AJ, Harper CK (2014): The carrier
prevalence of severe combined immunodeficiency, lavender
foal syndrome and cerebellar abiotrophy in Arabian
horses in South Africa. Equine Veterinary Journal, 46: 512-
514,
- 22. The UC Davis Veterinary Genetics Laboratory (2019): Erişim:
https://www.vgl.ucdavis.edu/services/horse.php. (Erişim tarihi:
18.02.2019)
- 23. TIGEM Hayvancilik Sektor Raporu (2013): Erişim: https://
www.tigem.gov.tr/DosyaGaleriData/View/a374cc25-acc1-
44e8-a546-63b4c8bce146.
- 24. TOB Hayvancılık Genel Müdürlüğü (2019): Erişim: https://www.
tarimorman.gov.tr/HAYGEM/Duyuru/124/%E2%80%8Bsafkan-
Arap-Ati-Ve-Spor-Ati-Spermasi-Ithalat-Teknik-Kriterleri-
Yayinlanmistir. (Erişim tarihi: 18.02.2019)
- 25. Türkiye İstatistik Kurumu (2019): Hayvancılık İstatistikleri,
Erişim: http://www.tuik.gov.tr/PreTablo.do?alt_id=1002.
(Erişim tarihi: 18.02.2019)
Year 2019,
Volume: 59 Issue: Ek Sayı, 97 - 101, 04.06.2020
Muhammet Kaya
,
Tuğba Yıldız
Elif Günvar
Metin Taş
References
- 01. Alkalamawy NM, Amin DM, Alkalamawy IM, Abd Elaty IA
(2018): Lavender foal syndrome in Egyptian Arabian horses:
molecular and pathological studies. SVU-International
Journal of Veterinary Sciences, 1 (1): 55-65.
- 02. Animal Genetics (2019): Erişim: http://www.animalgenetics.us/
equine/genetic_disease/Index.asp. (Erişim tarihi: 18.02.2019)
- 03. Animal Genetics (2019): Erişim: http://www.animalgenetics.
us/equine/genetic_disease/LFS.asp. (Erişim tarihi: 18.02.2019)
- 04. Bierman A, Guthrie AJ, Harper CK (2010): Lavender foal syndrome
in Arabian horses is caused by a single-base deletion in
the MYO5A gene. Animal Genetics, 41: 199-201.
- 05. Bilgen N, Çınar Kul B, Ertuğrul O, Erzurum F (2017): Türkiye
Arap Atı Popülasyonunda LFS ve PSSM-I Hastalıklarının
Moleküler Taraması. Kafkas Universitesi Veteriner Fakultesi
Dergisi, 23 (2): 339-342.
- 06. Brooks SA, Gabreski N, Miller D, Brisbin A, Brown HE (2010):
Whole-genome SNP association in the horse: identification
of a deletion in myosin Va responsible for Lavender Foal
Syndrome. PLOS Genetics, 6 (4): e1000909.
- 07. Bursa İl Gıda, Tarım ve Hayvancılık Müdürlüğü Faaliyet Raporu
(2013): Erişim: https://www.tarimorman.gov.tr/SGB/Belgeler/
Bakanlık_Faaliyet_Raporları/2013%20YILI.pdf
- 08. Efendić M, Maćešić N, Samardžija M, Vojta A, Korabi N,
Capak H, Sušnić MA, Žaja IŽ, Pećin M, Babić NP (2018):
Determination of Sublethal Mutation Causing Lavender Foal
Syndrome in Arabian Horses From Croatia. Journal of Equine
Veterinary Science, 61: 72-75.
- 09 Eskişehir İl Gıda, Tarım ve Hayvancılık Müdürlüğü Faaliyet
Raporu (2015): Erişim: https://eskisehir.tarimorman.gov.tr/
Belgeler/2016_Faaliyet_Raporu/2016%20Yılı%20Faaliyet%20
Raporu.pdf. (Erişim tarihi: 18.02.2019)
- 10. Fanelli HH (2005): Coat color dilution lethal (Lavender Foal
Syndrome): A tetany syndrome of Arapian foals. Equine
Veterinary Education, 17: 260-263.
- 11. Gabreski NA, Haase B, Armstrong CD, Distl O, Brooks SA
(2012): Investigation of allele frequencies for Lavender foal
syndrome in the horse. Animal Genetics, 43: 646-652.
- 12. Khanshour AM, Juras R, Stelly L, Cothran EG (2013): Molecular
investigation and diagnosis of three genetic diseases in
Arabian horses from Middle East and North American populations.
Journal of Equine Veterinary Science, 33 (5): 364-365.
- 13. Kumar S, Stecher G, Li M, Knyaz C, Tamura K (2018): MEGA X:
Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing
platforms. Molecular Biology and Evolution, 35: 1547-1549.
- 14. Laboklin Laboratory (2019): Erişim: http://www.laboklin.co.uk/
laboklin/index.jsp. (Erişim tarihi: 18.02.2019)
- 15. Malatya İl Gıda, Tarım ve Hayvancılık Müdürlüğü Faaliyet
Raporu (2019): Erişim: https://malatya.tarimorman.gov.tr/
Menu/14/Hayvan-Varligi. (Erişim tarihi: 18.02.2019)
- 16. Meydan H (2007): Türkiye’de yetiştirilen siyah alaca sığır ırkında
lökosit adhezyon yetersizliği (BLAD; Bovine Leukocyte
Adhesion Deficiency)’nin PCR-RFLP yöntemi kullanılarak
belirlenmesi. Yüksek Lisans Tezi, Ankara Universitesi Fen
Bilimleri Enstitüsü, Ankara.
- 17. Nagahata H (2004): Bovine Leukocyte Adhesion Deficiency
(BLAD): A Review. The Journal of Veterinary Medical Science,
66 (12): 1475-1482.
- 18. Online Mendelian Inheritance in Animals (OMIA) (2019):
Erişim: https://omia.org/home/. (Erişim tarihi: 18.02.2019)
- 19. Page P, Parker R, Harper C, Guthrie A, Neser J (2006): Clinical,
clinicopathologic, postmortem examination findings and
familial history of 3 Arapians with lavender foal syndrome.
Journal of Veterinary Internal Medicine, 20: 1491-1494.
- 20. Takagishi Y, Murata Y (2006): Myosin Va mutation in rats is an
animal model for the human hereditary neurological disease,
Griscelli syndrome type 1. Annals of the New York Academy
of Sciences, 1086: 66-80.
- 21. Tarr CJ, Thompson PN, Guthrie AJ, Harper CK (2014): The carrier
prevalence of severe combined immunodeficiency, lavender
foal syndrome and cerebellar abiotrophy in Arabian
horses in South Africa. Equine Veterinary Journal, 46: 512-
514,
- 22. The UC Davis Veterinary Genetics Laboratory (2019): Erişim:
https://www.vgl.ucdavis.edu/services/horse.php. (Erişim tarihi:
18.02.2019)
- 23. TIGEM Hayvancilik Sektor Raporu (2013): Erişim: https://
www.tigem.gov.tr/DosyaGaleriData/View/a374cc25-acc1-
44e8-a546-63b4c8bce146.
- 24. TOB Hayvancılık Genel Müdürlüğü (2019): Erişim: https://www.
tarimorman.gov.tr/HAYGEM/Duyuru/124/%E2%80%8Bsafkan-
Arap-Ati-Ve-Spor-Ati-Spermasi-Ithalat-Teknik-Kriterleri-
Yayinlanmistir. (Erişim tarihi: 18.02.2019)
- 25. Türkiye İstatistik Kurumu (2019): Hayvancılık İstatistikleri,
Erişim: http://www.tuik.gov.tr/PreTablo.do?alt_id=1002.
(Erişim tarihi: 18.02.2019)