Sığırlarda solunum sistemi hastalıkları kompleksinin major viral patojenlerden biri olan Bovine Parainfluenza Virus 3 (BPIV3) Kuzey Yarımküre’de genellikle sonbahar ve kış aylarında ortaya çıkan ve üst solunum yolu enfeksiyonlarına yol açan viral bir etkendir. Bu virusun izolatları yakın antijenik ilişki içerisinde olsalar da BPIV3GenotypeA, BPIV3GenotypeB ve BPIV3GenotypeC olarak üç farklı genotip de sınıflandırılmıştır. Bu araştırmada Batı Akdeniz bölgesinde sirkülasyon halinde olan BPIV3 suşunun Türkiye’nin farklı bölgelerinden izole edilmiş suşlar ve BPIV3’ün referenz suşu Shipping Fever (SF-4) ile aminoasit ve nükleotit pozisyonlarının karşılaştırılması amaçlanmıştır. Çalışmada daha önceki araştırmalarımızda tespit ettiğimiz ve M gen bölgesi parsiyel olarak analiz edilmiş BUR/BPIV3 izolatı kullanıldı. SF-4 ile Türkiye’de parsiyel olarak M gen bölgesi üzerine filogenetik araştırmaları ve Genbank’a kayıtları yapılmış farklı BPIV3 izolatları ve bizim tespit ettiğimiz BPIV3 suşunun aminoasit ve nükleotit pozisyonları karşılaştırıldı. BPIV3’ün Türkiye suşları ve referenz suşun nükleotit ve aminoasit pozisyonlarındaki değişimleri ortaya koyuldu. Sonuç olarak BPIV3 izolatları arasında noktasal mutasyonlarla meydana gelen baz ve kodon farklılaşmalarının buna bağlı olarak da ortaya çıkan aminoasit değişimlerinin belirlenmesinin aşı üretiminde kullanılacak suşun immunizasyon gücünün ortaya koyulması ve BPIV3’ün moleküler tespitinin standardizasyonunun sağlanması açısından önemli olduğu kanaatine varıldı.
0476-DR-17
One of the major viral pathogens of respiratory system disease complex in cattle, BPIV 3 is a viral agent generally appearing during autumn and winter months in Northern Hemisphere and causing upper respiratory tract infections. Even though the isolates of this virus are in close antigenic relations, it is classified within three different genotypes as BPIV3 Genotype A, BPIV3 Genotype B and BPIV3 Genotype C. In this research, we aimed to compare the strains of BPIV 3 strain circulating around Western Mediterranean region of Turkey and isolated from different regions of this country and the reference strain of BPIV 3, Shipping Fever (SF-4) with amino acid and nucleotide positions. In the study, previously detected BUR/BPIV 3 isolate with M gene region partially analyzed was used. Phylogenetic researches carried out partially on M gene region in Turkey, different BPIV 3 isolates recorded in gene bank and amino acid and nucleotide positions of BPIV 3 strain detected by ourselves were compared. The changes in Turkey strains of BPIV 3 and nucleotide and amino acid positions of the reference strain were revealed. As a result, detecting base and codon differentiations caused by point mutations among BPIV 3 isolates and correspondingly the appearing amino acid changes was considered crucial in terms of revealing the immunization power of the strain to be used in vaccine production and providing the standardization of BPIV 3 molecular detection.
Burdur Mehmet Akif Ersoy University Research Fund
0476-DR-17
This research was supported by Burdur Mehmet Akif Ersoy University Research Fund (Project No: 0476-DR-17) as a PhD thesis on “Investigation of Parainfluenza Virus Type 3 (BPIV3) in Cattle Using Direct Immunfluorescence (DIF) Test and Reverse Transcriptase - Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) Technique”.
Primary Language | English |
---|---|
Subjects | Health Care Administration |
Journal Section | Research Article |
Authors | |
Project Number | 0476-DR-17 |
Publication Date | August 26, 2022 |
Submission Date | March 28, 2022 |
Published in Issue | Year 2022 Volume: 10 Issue: 2 |
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.