Retrospective Evaluation of Candida Species Isolated From Urine in a University Hospital

Abstract

Urinary system infections are mostly caused by bacteria. Gram negatives, especially Escherichia coli species, are isolated among the bacteria. Fungal infections following bacterial infections are also frequently infections caused by the genus belonging to the genus Candida. In our study, the distribution of Candida genus were determined which were isolated from urine specimens in the Yeditepe University Hospital Microbiology Laboratory for a period of ten years (2006-2016). Germ tube test was done for the identification of C. albicans, and for species of Non-albicans Candida species were determined using API ID32C and Vitec 2.0 (Biomerieux, France) devices. 249 Candida species were observed in total. The most isolated species was C. albicans (54.2%). This was followed by C. tropicalis (14.1%), C. glabrata (12.4%) and C. parapsilosis (4.4%). Candida species are not common, but an increase is observed in recent years. Considering the contamination of some samples during the intake, treatment should be started by evaluating the culture result with the patient's clinic.

Keywords

• Urinary System,Urine,Candida,Candidiasis

Bir Üniversite Hastanesinde İdrardan İzole Edilen Candida Türlerinin Retrospektif Olarak Değerlendirilmesi

Abstract

Üriner sistem enfeksiyonları çoğunlukla bakteriler tarafından oluşturulmaktadır. Bakteriler içinde de daha çok Gram negatifler, özellikle de Escherichia coli türleri izole edilmektedir. Bakterilerden sonra gelen mantar enfeksiyonları içinde de sıklıkla Candida cinsine ait türlerin neden olduğu enfeksiyonlara rastlanmaktadır. Çalışmamızda on yıllık periyotta (2006-2016 yılları arasında) Yeditepe Üniversitesi Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarında idrar örneklerinden izole edilen Candida kökenlerinin dağılımı belirlenmiştir. Tanımlamada C. albicans ayrımı için germ tüp testi yapılmış olup, Non-albicans Candida türleri için ise API ID32C ve Vitec 2.0 (Biomerieux, Fransa) cihazları kullanılarak tür tayinleri yapılmıştır. Toplamda 249 adet Candida üremesi gözlenmiştir. En fazla izole edilen tür C. albicans (%54.2) olmuştur. Bunu C. tropicalis (%14.1), C. glabrata (%12.4), C. parapsilosis (%4.4) izlemiştir. İdrarda Candida türleri sık görülmemekle birlikte son yıllarda bir artış gözlenmektedir. Bazı örneklerin alımı sırasında meydana gelen kontaminasyon da göz önünde bulundurularak hastanın kliniği ile kültür sonucu birlikte değerlendirilerek tedaviye başlanmalıdır.

Keywords

• : Üriner Sistem,idrar,Kandida,Candidiasis

References

1. Achkar J.M., Fries B.C., Candida Infections of the Genitourinary Tract., Clin Microbiol Rev., 23(2)253–273(2010).
2. Arısoy A., Simpozyum: Maya infeksiyonlarından seçkiler. Infeksiyon Dergisi, 21(0)123-125(2007).
3. Behzadi P. Ranjbar R., Urinary tract infections and Candida albicans, Cent European J Urol., 68(1)96-101(2015).
4. Erdem F., Tuncer Ertem G., Oral B., Karakoç E., Demiröz A.P., Tülek N., Candida Türlerine Bağlı Nozokomiyal Enfeksiyonların Epidemiyolojik ve Mikrobiyolojik Açıdan Değerlendirilmesi Mikrobiyol Bul, 46(4)637-648(2012).
5. İnci M., Atalay, M.A., Koç A. N., Özer B., Kılınç Ç., Durmaz S., Candida albicans dışı mayaların tanımlanmasında VITEK 2 YST kart ile API 20C AUX sisteminin karşılaştırılması, Dicle Tıp Dergisi,39(1)80-82(2012).
6. Kauffman C.A., Candiduria, Clin Infect Dis., 2005; 41:S371–6.
7. Kauffman C.A., Diagnosis and Management of Fungal Urinary Tract Infection, Infect Dis Clin N Amr., 28:61–74 (2014).
8. Keten D., Aktas F., Guzel Tunccan O., Dizbay M., Kalkanci A., Biter G., Keten H.S., Catheter-associated urinary tract infections in intensive care units at a university hospital in Turkey, Bosn J Basic Med Sci., 14;14(4)227-33(2014).

9. Leblebicioglu H, Esen S., Hospital-acquired urinary tract infections in Turkey: a nationwide multicenter point prevalence study., J Hosp Infect., 53(3)207-10(2003).
10. Nayman Alpat S., Özgüneş İ., Ertem O.T., Erben N., Doyuk Kartal E., Tözün M., Usluer G., Kandidürisi Olan Hastalarda Risk Faktörlerinin Değerlendirilmesi, Mikrobiyol Bul., 45(2)318-324(2011).
11. Sobel, J.D., Fisher J.F., Kaufman C.A., Newman C.A., Candida urinary tract infections-epidemiology, Clinical Infectious Diseases, 52(6)433–436(2011).
12. Klimud Derneği (Kaynak No7). Tıbbi Mikrobiyoloji Uzmanları İçin Klinik Örnekten Sonuç Raporuna Uygulama Rehberi: Üriner Sistem Örnekleri, Çağhan Ofset Matbaacılık Ltd. Şti, Ankara(2015).
13. Toka Özer T., Durmaz S., Yula E., Antifungal susceptibilities of Candida species isolated from urine culture. J Infect Chemother., 22(9)629-32(2016).