Determination of the Connection Between the Asthma Patients and Mycobiota in the Environment They Live in

Year 2023, Volume: 14 Issue: 2, 103 - 110, 30.10.2023

Aras Fahrettin Korkmaz , Günay Tülay Çolakoğlu , İskender Karaltı

https://doi.org/10.30708/mantar.1322258

Abstract

In the 12-month period between February 2014 and January 2015, this study was carried out in the homes of 55 asthma patients living in 14 different regions of Istanbul (Ataşehir, Bulgurlu, Fikirtepe, Hasanpaşa, İçerenköy, Moda, Göztepe, Çekmeköy, Ümraniye, Altayçeşme Neighborhood, Esenkent Neighborhood, Feyzullah Neighborhood, Gülsuyu Neighborhood, Yalı Neighborhood). Air ideal (Biomerieux, France) air vacuuming device was used to determine the fungal flora in the domestic ambient air of the relevant patients. In this context, in order to prevent bacterial growth, Streptomycin antibiotic was added and Rose Bengali potato dextrose agar was placed in the slot of the device and the air filter of the device was installed. The device, which was placed at a height of 75-85 cm from the ground, was operated for 3-5 minutes and 200 liters of domestic ambient air was vacuumed. A total of 1071 microfungi colonies isolated in the study were found to belong to a total of 10 genuses and 23 species. The obtained genera are Alternaria (Arıküfü), Aspergillus (Asper), Aureobasidium (Karamaya), Chaetomium (Günoku), Cladosporium (Havaküfü), Fusarium (Solduran), Mucor (Ekmekküfü), Paecilomyces (Günküfü), Penicillium (Penisilyum) and Rhizopus (Karaküf). Among them, the most isolated genera were Aspergillus, Penicillium, Cladosporium, Alternaria and Fusarium. The most isolated species in this study were Aspergillus niger (Kara asper), Fusarium poae (Buğday solduran), Alternaria alternata (Astımküfü), Cladosporium cladosporioides (Karakökküfü), Penicillium brevicompactum (Sağlam penisilyum), Cladosporium macrocarpum (İrikurutan), Cladosporium sphaerospermum (Güllekurutan) and Penicillium glabrum (Bol penisilyum). In the 12-month period, the lowest microfungi concentration was observed in January and the highest microfungi concentration was observed in May. During the study, the temperature of the sample areas were measured with a thermometer and the humidity rates were measured with a hygrometer. In this study, the types of allergen microfungus that cause the onset of asthma disease or the progression of the degree of disease are stated. These were determined as Alternaria alternariae (Fıstık küfü), Alternaria alternata, Aspergillus fumigatus (Kıran asper), Aspergillus niger, Aureobasidium pullulans (Karamaya), Chaetomium globosum (Top günoku), Cladosporium cladosporioides, Cladosporium herbarum (Yaygınkurutan), Cladosporium sphaerospermum, Penicillium chrysogenum (Penisilyum), Penicillium glabrum.

Keywords

İstanbul, Asthma, Indoor air, Microfungi

Thanks

I would like to thank and pay my respects to Asst. Prof. Dr. İskender KARALTI for providing laboratory support in the conduct of the study and providing all kinds of materials and equipment support.

Astım Hastalarının Yaşadıkları Ortamlardaki Mikobiyotanın Astım Hastalığıyla İlişkisinin Belirlenmesi

Abstract

Şubat 2014-Ocak 2015 tarihleri arasındaki 12 aylık zaman periyodunda, İstanbul’un 14 farklı bölgesinde (Ataşehir, Bulgurlu, Fikirtepe, Hasanpaşa, İçerenköy, Moda, Göztepe, Çekmeköy, Ümraniye, Altayçeşme Mahallesi, Esenkent Mahallesi, Feyzullah Mahallesi, Gülsuyu Mahallesi, Yalı Mahallesi) yaşayan 55 astım hastasının ev ortamlarında bu çalışma gerçekleştirilmiştir. İlgili hastaların ev içi hava ortamında bulunan fungal floranın belirlenmesi amacıyla Air Ideal (Biomerieux, France) hava vakumlama cihazı kullanılmıştır. Bu bağlamda bakteriyel üremeyi önlemek amacıyla Streptomisin antibiyotiği eklenmiş Rose Bengalli patates dekstroz agarlar cihazın yuvasına yerleştirilmiş ve cihazın hava filtresi takılmıştır. Yerden 75-85 cm yüksekliğe konulan cihaz 3-5 dakika çalıştırılarak 200 litre ev içi ortam havası vakumlanmıştır. Araştırmada izole edilen toplam 1071 mikrofungus kolonisinin toplam 10 genus ve 23 türe ait olduğu saptanmıştır. Elde edilen cinsler Alternaria, Aspergillus, Aureobasidium, Chaetomium, Cladosporium, Fusarium, Mucor, Paecilomyces, Penicillium ve Rhizopus’tur. Bunların içerisinde en fazla izole edilen cinsler; Aspergillus, Penicillium, Cladosporium, Alternaria ve Fusarium olmuştur. Bu çalışmada en fazla izole edilen türler; Aspergillus niger, Fusarium poae, Alternaria alternata, Cladosporium cladosporioides, Penicillium brevicompactum, Cladosporium macrocarpum, Cladosporium sphaerospermum ve Penicillium glabrum olmuştur. 12 aylık zaman periyodunda en az mikrofungus konsantrasyonu Ocak ayında, en fazla mikrofungus konsantrasyonu ise Mayıs ayında görülmüştür. Çalışma süresince örneklem alanlarının termometre ile sıcaklığı, higrometre ile nem oranlarının ölçümleri gerçekleştirilmiştir. Bu çalışmada astım hastalığının başlamasına ya da hastalık derecesinin ilerlemesine neden olan allerjen mikrofungus türleri belirtilmiştir. Bunlar; Alternaria alternariae, Alternaria alternata, Aspergillus fumigatus, Aspergillus niger, Aureobasidium pullulans, Chaetomium globosum, Cladosporium cladosporioides, Cladosporium herbarum, Cladosporium sphaerospermum, Penicillium chrysogenum, Penicillium glabrum olarak tespit edilmiştir.

Keywords

İstanbul, Astım, İç ortam havası, Mikrofungus

References

• Arda, M. (1984). Temel Mikrobiyoloji. Medisan Yayın Serisi, sayfa: 1-548, Ankara.
• Asan, A., Tüney, E. ve Şen, B. (2018). Saf Kültür Olarak Stoklanmış Bazı Mikrogungusların ITS, β-Tubulin ve Aktin Gen Dizilerine Göre Moleküler Tanısı. Mantar Dergisi., 9 (1) 1-17.
• Barnett, H. ve Hunter, B. (1999). Illustrated Genera of Imperfect Fungi (4th ed.): St Paul: APS.
• Çolakoğlu, G.T. (1996). Mould Counts in the Atmosphere at the Europe Quarter of İstanbul Turkey. J. Basic Microbiol., 36 (6) 389-392.
• Çolakoğlu, G.T. ve Karaltı, İ. (2011). The Determination of Airborne Fungal Flora of Two Different Hospitals in İstanbul. Adv. Environ., 5 (11) 3645-3652.
• Ellis, M. (1965). Dematiaceous Hyphomycetes.: Commonwealth Mycological Institute, Kew.
• Huseynov, R., Javadov, S., Karaltı, İ. ve Taqıyev, B. (2020). Pulmonary Aspergillosis: A Case Report of Invasive Aspergillosis Caused by Aspergillus fumigatus. Mantar Dergisi., 11 (2) 101-104.
• Karaltı, İ. ve Çolakoğlu, G.T. (2012). The Seasonal Distribution of Airborne Fungi in Two Hospitals in İstanbul. Afr. J. Biotechnol., 11 (44) 10272-10279.
• Klich, M. (2002). Identification of Common Aspergillus Species. 122 pp. Centraalbureau voor Schimmelcultures, Utrecht, The Netherlands.
• Miller, J.D. (1992). Fungi as Contaminants in Indoor Air. Atmospheric Environment., 26 (12) 2163-2172.
• Pitt, J. (1979). The genus Penicillium and its Teleomorphic States Eupenicillium and Talaromyces. 634 pp.London etc.
• Pitt, J. ve Hocking, A. (2009). Fungi and Food Spoilage. Springer Verlag.
• Salo, P.M., Arbes, S.J., Crockett, P.W., Thorne, P.S., Cohn, R.D. ve Zeldin, D.C. (2008). Exposure Multiple Indoor Allergens in US Homes and its Relationship to Asthma. J. Allergy Clin. Immunol., 121 (3) 678-684.
• Samson, R.A., Hoekstra, E.S.ve Frisvad, J.C. (2004). Introduction to Food and Airborne Fungi: Centraalbureau voor Schimmelcultures (CBS).
• Sesli, E., Asan, A. ve Selçuk, F. (editors), Güner, A., Akata, I., Akgül, H., Demirel, K., Demirel, R., Kadaifçiler, D., Aktaş, S., Uzun, Yu., Uzun, Ya., Berikten, D., Şen, İ., Ökten, S., Ergül, C.C., Kalyoncu, F., Haliki Uztan, A., Şen, B., Akyüz, E., Alkayış, M.F., Allı, H., Asal, D., Abacı Günyar, Ö., Aydınkal, R.M., Aydoğdu, H., Can, M., Çıngay, B., Çimen, A.Ö., Doğan, H.H., Erdoğdu, M., Gemici, A., Genç, S.H., Giray, G., İkinci, N., İnci, Ş., Kabaktepe, Ş., Kadıoğlu, Z., Kanoğlu, S.S., Karaltı, İ., Kaşık, G., Kaya, A., Keskin, M., Eroğlu, G., Kırbağ, S., Körüklü, S.T., Kültür, Ş., Ocak, İ., Türkekul, İ., Özcan, A., Özkale, E., Özkan, A.M., Öztekin, M., Öztürk, C., Sarısoy, G., Kıvanç, M., Alkan, S., Keleş, A., Sevindik, M., Yoltaş, A., Sözen, K.B., Tekşen, M., Ulukapı, M., Yalçınkaya, R. and Yaşarkan, O. (2020). Türkiye Mantarları Listesi. Ali Nihat Gökyiğit Vakfı Yayını. İstanbul.
• Şen, B. ve Asan, A. (2001). Airborne Fungi in Vegatable Growing Areas of Edirne, Turkey. Aerobiologia., 17 (1) 69-75.
• Tümbay, E. (1983). Pratik Tıp Mikolojisi. Bilgehan Basımevi, sayfa: 119-146, İzmir.
• Ünlü, M., Ergin, Ç., Cirit, M., Şahin, Ü. ve Akkaya, A. (2003). Molds in the Homes of Asthmatic Patients in Isparta, Turkey. Asian Pac. J. Allergy Immunol., 21 (1) 21-24.
• Verhoeff, A.P. ve Burge, H.A. (1997). Health Risk Assessment of Fungi in Home Environments. Ann. Allergy Asthma Immunol., 78 (6) 544-556.
• Yoltaş, A., Utlu, S., Yücelmiş, U., Haliki Uztan, A., Çiftçi, H.M. ve Ekmekçi, S. (2010). Alerji Problemi Yaşanan Evlerde Hava Kökenli Potansiyel Alerjen Mikrofungus Florası ve Dağılımının İncelenmesi. Biyoloji Bilimleri Araştırma Dergisi., 3 (1) 7-17.
• Zock, J.P., Jarvis, D., Luczynska, C., Sunyer, J. ve Burney, P. (2002). Housing Characteristics, Reported Mold Exposure, and Asthma in the European Community Respiratory Health Survey. J. Allergy Clin. Immunol., 110 (2) 285-292.