İşlenme Aşamalarındaki Çay Yapraklarından izole Edilen Koliform Grubu Bakterilerde Antibiyotik Direnç Profilinin Araştırılması

Year 2016, Volume: 28 Issue: 4, 150 - 157, 30.01.2017

Elif Sevim , Ali Sevim Ahu Kanburoğlu Zuhal Kalyoncu

https://doi.org/10.7240/marufbd.290786

Abstract

Çay bitkisi (Camellia cinensis) dünyada sudan sonra en çok kullanılan içecektir. Bu çalışmada, fabrikaya getirilen yaş çayın kuru çay ola-
rak imal edilinceye kadar olan her bir işlenme aşamasındaki süreçte üzerinde doğal olarak bulunan, Gram negatif koliformbakterilerin an-
tibiyotik direnç profillerinin belirlenmesi hedeflenmiştir. İzole edilen koliform bakterilerin identifikasyonu koloni morfolojisi, Gram bo-
yanma özelliği geleneksel yöntemler kullanılarak yapılmıştır. Agar disk difüzyon metodu ile antibiyotik direnç profilleri belirlenmiş ve
TEM tipi beta-laktamaz ve tetrasiklindirenç genlerinin varlığı PCR ile araştırılmıştır. Yaş çayın işleme aşamalarında toplam 312 enterik
bakteri izole edilirken işlenmiş çayda herhangi bir mikroorganizma gözlemlenmemiştir. İzolatların %35,8’i Klebsiella, %17,6’sı Citrobac-
ter, %15,1’i Enterobacter, %8,3’ü Edwarsiella, %7,1’i Escherichia cinslerine ait oldukları belirlenirken %16,1’i tanımlanamamıştır. İzole
edilen suşlarda en yüksek direnç %81,73 ile ampisiline karşı gözlenirken, nalidiksik asit, netilmisin ve imipeneme dirençli suş bulunma-
mıştır. Ampisilin dirençli suşların ikisinde TEM tipi β-laktamaz geni (blaTEM) tespit edilmiştir. İzole edilen suşlarda tet(A), (B) ve (C) gen-
lerinin varlığı araştırılmış ve tetrasiklin dirençli suşlarda tet(B) geninin yaygın olarak bulunduğu tespit edilmiştir. Yapılan transformasyon
çalışmaları sonucunda tetrasiklin, ampisilin, streptomisin, seftazidim ve trimethoprim/sülfametaksazol dirençlerinin transfer edilebilir ol-
duğu tespit edilmiştir. 

Keywords

Çay yaprakları, koliform bakteriler, antibiyotik direnci, blaTEM geni, tet(A)-(B)-(C) geni

References

• Silva, C.F., Schwan, R.F., Dias, E.S. ve Wheals, A.E. (2000). Microbial diversity during maturation and natural processing of coffee cherries of Coffeaarabica in Brazil.International Journal of Food Microbiology, 60, 251–260.
• Madigan, M., Martinko, J. ve Dunlap, P. (2009). Brock Bio- logy of Microorganisms, 12 th.Edition, New York.
• Bashan, Y. ve de-Bashan, L.E. (2005). Plant growth-promo- ting. In: Hillel, D. (Ed.), Encyclopedia of Soils in the Envi- ronment, vol. 1. Elsevier, Oxford, U.K., pp. 103–115.
• Claus, M. (1992). A standardized gram staining procedure. World Journal of Microbiology and Biotechnology, 8, 451– 452.
• Prescott, M. ve Harley, J.P. (2001). Laboratory Exercises in Microbiology, McGraw-Hill | Fifth edition, 449-451.
• Holt, J.,Krieg, N., Sneath,P., Staley, J. ve Williams, S. (2000). Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology. 9th ed. Lip- pincott Williams & Wilkins, Philadelphia, Pennsylvania, USA.
• CLSI- Clinical and Laboratory Standards Institute. (2006). Approved standard M45-A. Methods for antimicrobial dilu- tion and disk susceptibility testing of infrequently isolated or fastidious bacteria.CLSI., Wayne, Pennsylvania, USA.
• Sambrook, J., Fritsch, E.F. veManiatis, T. (1990). Molecu- lar Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Lab. Press, Plainview, NY.
• Aarestrup, F.M., Lertworapreecha, M. ve Evans, M.C. (2003). Antimicrobial susceptibility and occurrence of resis- tance genes among Salmonella entericaserovarWeltevreden from different countries.Journal of Antimicrobial Chemothe- rapy, 52,715–8.
• Ausubel, F.M., Brient, R. ve Kingston, R.E. (1995). Short Protocols in Molecular Biology. 2nd ed. New York:John Wil- ley and Sons.
• Özdemir, F., Topuz, A. ve Erbağ, M. (1999). Ortodoksveçay- kuryöntemleriileüretilenfarklısınıfsiyahçayların mineral içe- rikleri.Turkish Journal of Agriculture and Forestry, 23, 809- 815.
• Bilgehan, H. (2000). KlinikMikrobiyoloji, ÖzelBakteriyolo- jiveBakteriEnfeksiyonları. 10. baskı, Barışyayınları, İzmir.
• Scott,E.,Bloomfield,S.F.VeBarlow,C.G.(1982).Aninves- tigation of microbial contamination in the home. Journal of Hygiene, 89, 279–93.
• Mo, H., Yang, Z. ve Zongmao, C. (2007). Microbial fermen- ted tea a potential source of natural food preservatives. Trends in Food Science and Technology, 19, 124-130.
• Chorianopoulos, N.G., Boziaris, I.S., Stamatiou, A. ve Ny- chas, G.J.E. (2005). Microbial association and acidity de- velopment of unheated and pasteurized green-table olives fermented using glucose or sucrose supplements at various levels. Food Microbiology, 22, 117–124.
• Nijjens,S.,Florjin,A.,Bonten,m.J.,Schmitz,F.J.,Verhoef,J. Ve Fluit, A.C. (2004). Beta lactam susceptibilities and preve- lance ESBL-producing isolates among more than 5000 Euro- pean Enterobacteriaceae isolates. International Journal of Antimicrobial Agents, 24, 585-591.
• Alpay-Karaoglu, S., Ozgumus, O.B., Sevim, E., Kolaylı, F., Sevim, A. ve Yesilgil, P. (2007). Investigation of antibiotic resistance profile and TEM-type β-lactamase gene carriage of ampicillin-resistant Escherichia coli strains isolated from drinking water. Annals of Microbiology, 57, 281-288.
• Ozgumus, O.B., Celik-Sevim, E., Alpay-Karaoglu, S., San- dalli, C. ve Sevim, A. (2007). Molecular Characterization of Antibiotic Resistant Escherichia coli Strains Isolated from Tap and Spring Waters in a Coastal Region in Turkey .The Journal of Microbiology, 45, 379-387.
• Ozgumus, O.B., Sandalli, C., Sevim, A., Celik-Sevim, E. ve Sivri, N. (2009). Class 1 and Class 2 Integrons and Plas- mid-Mediated Antibiotic Resistance in Coliforms Isolated from Ten Rivers in Northern Turkey. The Journal of Microbi- ology, 47, 1- 10.
• Çolakoğlu, F., Özgümüş, O.B., Sandalli, C., Çelik-Sevim, E. ve Alpay- Karaoğlu, Ş. (2010). Deniz suyu kökenliKoliform- lardaSınıf 1 veSınıf 2 Integron gen kasetlerive antibiyotik di- rencinin karakterizasyonu.TürkMikrobiyoloji Cemiyeti Der- gisi, 40, 97 – 108.
• Nwosu, V.C. (2001). Antibiotic resistance with particular re- ference to soil microorganisms.Research Microbiology, 152, 421-430.
• Livermore, D.M. (1995). β-Lactamases in laboratory and cli- nical resistance. Clinical Microbiology Review, 8, 557-84.
• Bush, K. ve Jacoby, G.A. (1997). Nomenclature of TEM β-la- ctamases.Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 39, 1-3.
• Roe, M.T., Vega, E. ve Pillai, S.D. (2003). Antimicrobial re- sistance markers of class 1 and class 2 integron bearing Es- cherichia coli from irrigation water and sediments.Emerging Infectious. Diseases, 9, 822-6.
• Chopra, I. ve Roberts, M. (2001). Tetracycline antibiotics: mode of action, applications, molecular biology, and epide- miology of bacterial resistance. Microbiology and Molecular Biology Review, 65, 232–60.