Bacterial community composition of five freshwater resources poured ınto the Northeast Mediterranean Region, Turkey

Year 2022, Volume: 2 Issue: 2, 62 - 71, 30.09.2022

Meltem Eken Esra Bıçkıcı

Abstract

Turkey's Mediterranean coast which hosts the Iskenderun Bay, around the present residential areas, industrial organizations and is one of the areas under intense threat of pollution due to the resulting sea traffic. Although many studies have been carried out on the pollution of the Gulf of Iskenderun, there are very few studies on the resources poured into the Gulf. In this study, bacteria that cause microbiological contamination and the antibiotic resistance of these bacteria have been investigated. In the water samples included in the study, the types of bacteria identified by regions are as follows. Acinetobacter baumannii Escherichia coli Pseudomonas aeruginosa Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae species in Akçay and Deliçay; A. baumannii E. coli P. aeruginosa S. aureus species in Arsuz stream; A. baumannii E. coli P. aeruginosa, Staphylococcus epidermidis, Enterococcus faecalis, K. pneumoniae species in Demirtaş stream and A. baumanni E. coli P. aeruginosa, S. aureus, S. epidermidis, E. faecalis, Proteus vulgaris, K. pneumoniae species in Feyezan Channel. As a result of the identification of 296 isolates isolated from fresh water sources poured into the Gulf of Iskenderun, 8 different bacteria species were identified. When the identification results are examined, 70.7% of the 296 isolates are E.coli troughs. When the antibiotic resistance levels of the bacteria isolated from the water sources poured into the Iskenderun Gulf are examined, the situation which is considerably higher than the reference values is observed.

Keywords

Bacterial Pollution, Northeast Mediterranean, Iskenderun Bay, Freshwater, Antibiotic Resistance

Supporting Institution

Mustafa Kemal University BAP

Project Number

BAP 2013/8981

Thanks

The authors gratefully acknowledge the financial support of Mustafa Kemal University (BAP 2013/8981).

İskenderun Körfezi'ne Dökülen Beş Tatlı Su Kaynağının Bakteriyel Topluluk Kompozisyonu, Kuzeydoğu Akdeniz, Türkiye

Abstract

İskenderun Körfezi'ne ev sahipliği yapan Türkiye'nin Akdeniz kıyısı, mevcut yerleşim alanları, sanayi kuruluşları ve bunun sonucunda oluşan deniz trafiği nedeniyle yoğun kirlilik tehdidi altındaki alanlardan biridir. İskenderun Körfezi kirliliği konusunda birçok çalışma yapılmışsa da, Körfez'e dökülen su kaynakları ile ilgili çok az çalışma bulunmaktadır. Bu çalışmada mikrobiyolojik kontaminasyona neden olan bakteriler ve bu bakterilerin antibiyotik direnci araştırılmıştır. Çalışmaya dahil edilen su örneklerinde bölgelere göre belirlenen bakteri türleri; Deliçay ve Akçay'da Acinetobacter baumannii Escherichia coli Pseudomonas aeruginosa Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae türleri; Arsuz deresinde A. baumannii E. coli P. aeruginosa S. aureus türleri; Demirtaş deresinde A. baumannii E. coli P. aeruginosa, Staphylococcus epidermidis, Enterococcus faecalis, K. pneumoniae türleri ve Feyezan kanalında A. baumanni E. coli P. aeruginosa, S. aureus, S. epidermidis, E. faecalis, Proteus vulgaris, K. pneumoniae olarak tespit edilmiştir. İskenderun Körfezi'ne dökülen tatlı su kaynaklarından izole edilen 296 izolattan 8 farklı bakteri türü tespit edilmiştir. Tanımlama sonuçları incelendiğinde 296 izolatın% 70,7'si E. coli olduğu görülmüştür. İskenderun Körfezi'ne dökülen su kaynaklarından izole edilen bakterilerin antibiyotik direnç seviyeleri incelendiğinde referans değerlerin oldukça üzerinde bir durum gözlenmektedir.

Keywords

Bakteriyal Kirlilik, Kuzeydoğu Akdeniz, İskenderun Körfezi, Antibiyotik Direnci

Project Number

BAP 2013/8981

References

• Akbaş E 1998. Hastane İnfeksiyon Kaynağı Olarak Su.Hastane İnfeksiyonları Dergisi 1, 23-35.
• Alkan U, Çalışkan S, Mescioğlu Ü 1999. UluabatGölü' nün Mikrobiyolojik Kirlilik Seviyesinin Belirlenmesi, Ekoloji dergisi 9 (33), 3-5.
• Avşar D 1999. Yeni Bir Skifomedüz (Rhopilema nomadica)’ün Dağılımı ile İlgili Olarak Doğu Akdeniz’in Fiziko-Kimyasal Özellikleri. Turkish Journal of Zoology, 23(2), 605-616.
• Balcı RS, Dinçer S 2008. Seyhan Baraj Gölü’nün Bakteriyolojik Kirlilik Düzeyinin Belirlenmesi ve Enterobacterıaceae Üyelerinde Antibiyotik Dirençliliği. Ç.Ü Fen Bilimleri Enstitüsü 17(2),122-131.
• Çolakoğlu AF, Çakır F 2004. Sarıçay Akarsuyunun Mikrobiyolojik Kalitesi. Türk Sucul Yaşam Dergisi 3, 320-327.
• Demirhan, S. A., Alkan, A., & Şimşek, E. 2020. Artificial reef application from the Iskenderun Bay, Northeastern Mediterranean, Turkey; an experimental study. Sakarya University Journal of Science, 24(1), 49-54.
• Erkan ME, Vural A 2006. Dicle Nehri’nin Hijyenik Kalitesi Üzerine Bir Araştırma. Dicle Tıp Dergisi. 33(4), 205-209.
• Gholami H, Dinçer S 2012. Ağyatan Lagününün (Karataş) Mikrobiyal Kalitesinin Belirlenmesi, Antibiyotik Dirençlilik Frekansının Tespiti ve Plasmid İzolasyonu. Ç.Ü Fen ve Mühendislik Bilimleri Dergisi.27(1), 148-156.
• Gidirişlioğlu AR, Çakır HH, Tok H, Ekinci. O Yüksel 1998. Ergene Nehri ve Kollarının Evsel ve Endüstriyel Atıklarla Kirlenmesi ve Toprak Üzerine Etkileri. Köy Hizmetleri Genel Müdürlüğü, Atatürk Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü, 102, 70, Kırklareli.
• Go-ni-Urriza M, Captepuy M, Aprın C, Raymond. N, Caumette P, Qentın C 2000. Impact of an Urban Effluent on Antibiotic Resistance of Riverine Enterobacteriaceae C and Aeromonas spp. Applied Enviromental Microbiology 66(1), 125-132. doi: 10.1128/aem.66.1.125-132.2000.
• Karayakar F, Ay Ö, Cicik B 2004. Mersin Kıyı Şeridinden Alınan Su Örneklerinden İzole Edilen Escherichia coli Suşlarının Bazı Antibiyotiklere Karşı Plasmid Kökenli Dirençliliğin Saptanması. Ekoloji Dergisi. 13 (52), 28–32.
• Kryalıkovya K, Krycmyery V, Krycmyery V.Jr 1984. Transferable Resistanece To Gentamicin And Other Antibiotics in Enterobacteriaceae Isolates from Municipal Wastewater. Jour. Hyg. Epidemiol. Microbiol Immunol. 28 (2), 161-166.
• Lıma-Bıttencourt CI, Cursına L, Gonçalves-Dornelas H, Pontes D.S, Nardı RMD, Callısto M, Chartone-Souza E, Nascımento AMA 2007. Multiple antimicrobial resistance in Enterobacteriaceae isolates from pristine freshwater. Genetics and Molecular Research. 6 (3), 510-521.
• Martin MT, Myaki DM, Pellizari V.H, Adams C, Bosselan NRS 1991. Comparison of the Presence-Absence (P-A) test and conventional methods for detection of bacteriological water quality indicators, Water Research. 25 (10), 1279-1283. https://doi.org/10.1016/0043-1354(91)90068-2
• Matyar F, Akkan T, Uçak Y, Eraslan B 2009. Aeromonas and Pseudomonas: antibiotic and heavy metal resistance species from Iskenderun Bay, Turkey (northeast Mediterranean Sea), Environmental Monittoring and Assessment. 167(1-4),309-20. DOI 10.1007/s10661-009-1051-1.
• Matyar F, Dinçer S 2010. Doğu Akdeniz’den İzole Edilen Enterococcus faecalis Bakterilerinin Antibiyotik ve Ağır Metal Dirençliliği. SDU Journal of Science (E- Journal) 5 (2): 172-178.
• Mazlum, Y., Can, M. F., Yılmaz, A. B., Demirci, A., Gürlek, M., Şimşek, E., Şereflişan, M. and Uygur, N. 2019. Removal of abandoned and lost fishing equipment from various seabeds and habitats. (Paper presented at II. Ulusal Denizlerde İzleme ve Değerlendirme Sempozyumu), 173-174.
• Parveen S, Murhpree RL, Edmiston L, Kapsar CW, Portier K.M, Tamplin M.L 1997. Association of Multiple-Antibiotic-Resistance Profiles with Point and Nonpoint Sources of Escherichia coliin Apalachicola Bay. Applied and Environmental Microbiology 63(7), 2607-2612. doi: 10.1128/AEM.63.7.2607-2612.1997.
• Polat S, Olgunoğlu M, Aka Akiz A, Koray T 2006. Kuzeydoğu Akdeniz Kıyısal Sularında (İskenderun Körfezi) Dağılım Gösteren Potansiyel Zararlı Fitoplankton Türleri, E.U. Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. 23(1-2), 169–172.
• Samastı M, Ulusoy M, Akıncı T, Akdemi R, Özdemir H 1989. Terkos Gölü ve dereleriyle Büyükçekmece Gölü’nün halk sağlığı açısından değerlendirilmesi. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 19: 199-205.
• Sevim A 2005. Trabzon’daki derelerin fekal koliform kirliliği ve koliform bakterilerin antibiyotik direnç profillerinin araştırılması, Yüksek Lisans Tezi, KTÜ, Fen Bilimleri Enstitüsü, Trabzon, 94 s.
• Taşpınar B 2015. Rize İli Kıyı Sularının Bakteriyolojik Kirlilik Seviyesinin Belirlenmesi. Yunus Araştırma Bülteni. 15 (2), 17- 27.
• Thımm T, Hoffman A, Frıtz I, Tebbe CC 2001. Contribution of the Earthworm Lumbricus rubellus (Annelida, Oligachaeta) to the Establishment of Plasmids in Soil Bacterial Communities. Microbial Ecology. 41, 341-351 DOI: 10.1007/s002480000115
• Unat E.K 1997. Temel Mikrobiyoloji. Değiştirilmiş ve yenilenmiş 3. baskı. İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fak. Yayınları . 701 s.
• Verep B, Serdar O, Turan D, Şahin C 2005. İyidere (Trabzon)‘nin Fiziko-Kimyasal Açıdan Su Kalitesinin Belirlenmesi. Ekoloji 14(57), 26-35.
• Yılmaz, A. B., Demirci, A., Akar, Ö., Kılıç, E., Uygur, N., Şimşek, E., Yanar, A. & Ayan, O. A. 2022. An Assessment of Sea Surface and Seabed Macro Plastic Density in Northeastern Mediterranean Sea. Pollution, 8(2), 543-552.
• Yılmaz, A. B., Demirci. A., Uygur N., Şimşek, E., Yanar, A., Akar, Ö., Kılıç, E. and Alptekin, O. A. 2019. Evaluation of plastic waste from Iskenderun Bay. (Paper presented at II. Ulusal Denizlerde İzleme ve Değerlendirme Sempozyumu), 175-178.