İdiyopatik boy kısalığı olan olgularda SHOX geni mutasyonlarının araştırılması

Abstract

AMAÇ: Kısa boy %2 oranla çocukluk çağında oldukça sık karşılaşılan bir durum olup tıbbi ve sosyal öneme sahiptir. İdiyopatik boy kısalığıherhangi bir dismorfik, sistemik, endokrinolojik, nutrisyonel ve kromozomal anomali olmaksızın normal seviyede büyüme hormonuna sahip bir bireyin boyunun belli bir populasyonda aynıyaşve cinsiyete göre hesaplanmışortalama boy değerinden -2 SD daha aşağıda olması şeklinde tanımlanmaktadır. İBK olan bazıolgularda belirli genlerde çeşitli mutasyonlar saptanmıştır. Bu genlerden biri X ve Y kromozomlarının p kolundaki pseudootozomal bölgenin (PAR1) 700 kb distalinde yer alan SHOXgenidir. Bu gende meydana gelen mutasyonların İBK olgularının bir bölümünden sorumlu olduğu gösterilmiştir. Bu nedenle, bu çalışmada, İBK olgularının etiyolojisini açıklayabilmek amacıyla söz konusu hasta grubunda SHOX genindeki mutasyon varlığıaraştırılmıştır.YÖNTEMLER: Pamukkale Üniversitesi Hastaneleri Pediatrik Endokrinoloji Bilim Dalı’na başvuran ve tüm tetkikleri yapılarak İBK tanısıalmışolan 25 adet olgu çalışmaya dâhil edilmiştir. Periferik kan örneklerinden DNA izolasyonu sonrasında SHOXgeni 2-6. ekzonları, özgül primerler kullanılarak polimeraz zincir reaksiyonu ile çoğaltılmıştır. Bu ekzonlardaki mutasyon varlığıDNA dizi analizi ile araştırılmıştır.BULGULAR: Çalışmaya katılan olgularda mutasyon saptanmamıştır. Çalışılan gen bölgesinde heterozigot SNP Single Nucleotide Polymorphism bulunmamasınedeniyle ise SHOX geninde delesyon varlığı değerlendirilememiştir.SONUÇ: İBK tanılıolgularda mutasyonun yanısıra SHOXgen delesyonlarının FISH ya da MLPA yöntemleri ile değerlendirilmesi uygun olacaktır. Ayrıca SHOXgeninde herhangi bir defekt saptanmayan bireylerde ise boy kısalığından sorumlu olabilecek diğer genlerin araştırılmasının, hem büyümede etkili genetik faktörlerin aydınlatılmasına hem de genotip-fenotip korelasyonu ile tedaviye yanıt arasındaki ilişki ile ilgili diğer çalışmalara katkısağlayabileceği düşünülmektedir.

Keywords

• İdiyopatik boy kısalığı, SHOX geni, mutasyon

A research on SHOX gene mutations in idiopathic short stature

Abstract

OBJECTIVE: Short stature, which can be seen in childhood very commonly with a rate of 2%, has a medical and social importance. Idiopathic short stature is defined as the body height of an individual - without dysmorphic, systemic, endocrinological, nutritional and chromosomal abnormalities, but with normal levels of growth hormone- to be 2 SD lower than the mean height calculated in a particular population of the same age and sex. Various mutations in specific genes have been identified in some patients with ISS. One of these genes is SHOX gene, located in the X and Y chromosome’s p arm, 700 kb distal of the pseudoautosomal region (PAR1). Mutations in this gene have been shown to be responsible for ISS cases for some part.Therefore, in this study the presence of these mutations in SHOX gene was investigated in order to explain the etiology of ISS patients.METHODS: Twenty-five patients who were admitted to Pamukkale University Hospital Division of Pediatric Endocrinology and diagnosed with ISS have been included in this study. Right after DNA isolation from peripheral blood samples, 2-6 exons of the SHOX gene were amplified by Polymerase Chain Reaction using specific primers. Presence of mutation in these exons was investigated by DNA sequence analysis.RESULTS: Mutation was not detected in patients included in this study. Because of the fact that heterozygous Single Nucleotide Polymorphisms was not found in the analyzed gene region, the presence of gene deletion in SHOX could not be evaluated.CONCLUSION: It would be appropriate to analyze SHOX gene deletions by FISH or MLPA methods together with mutation analysis in patients diagnosed with ISS. In addition, it has been thought that individuals having no SHOX gene defects should be investigated for the other genes that may be responsible for short stature, and this may enlighten the genetic factors effective in body growth, also will contribute to other studies about the relationship between the elucidation of genotype-phenotype correlation and response to treatment..

Keywords

• Idiopathic short stature, SHOX gene, mutation