Antibiotic resistance distributions of non-fermentative gram negative bacteria isolated from respiratory tract samples: six years analysis

Abstract

Solunum yolu örneklerinden izole edilen non-fermentatif gram negatif bakterilerin antibiyotik direnç dağılımları: altı yıllık analiz

Abstract

Amaç: Kültür pozitif pnömonili yatan hastalarda, non-fermentatif gram negatif bakterilerin (NFB) dağılımı, antimikrobiyal direnç oranları ile bunların yıllar içerisinde ki değişimi analiz edilerek, ampirik tedavide kullanılabilecek antimikrobiyallerin belirlenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: 2014–2019 tarihleri arasında çeşitli servislerde yatarak tedavi gören hastaların solunum yolu örneklerinden izole edilen NFB üremeleri retrospektif olarak değerlendirilmiştir. Bakterilerin identifikasyonu ve antimikrobiyal duyarlılık testi otomatize sistem (Phoenix,BD,USA) kullanılarak yapılmıştır. Bulgular: Çalışmaya 2865 örnek dahil edilmiştir. Örneklerin %72,3’ü yoğun bakım ünitelerinde (YBÜ) yatan hastalardan alınmıştır. Acinetobacter baumannii %56(n:1604), Pseudomonas aeruginosa %39,4(n:1128) ve Stenotrophomonas maltophilia %4,6(n:133) oranında izole edilmiştir. Pseudomonas aeruginosa izolatlarında amikasin (n(%5,5) vs. n(%11,2), p:0.001), aztreonam (n(%73,6) vs. n(%93,4), p:0.000) ve kolistin (n(%2) vs. n(%14,5), p:0.000) dirençlerinin, A. baumannii izolatlarında ise gentamisin (n(%63,9) vs. n(%89,1), p:0.000), amikasin (n(%73,7) vs. n(%83,4), p:0.000) ve kolistin (n(%1,2) vs. n(%11,2), p:0.000) dirençlerinin geç peryotta anlamlı olarak arttığı saptanmıştır. Yoğun bakım ünitelerinde ise P. aeruginosa izolatlarında amikasin (n(%7,2) vs. n(%12,5), p:0.024), aztreonam (n(%79,9) vs. n(%93,8), p:0.000) ve kolistin (n(%1,7) vs. n(%14,3), p:0.000) dirençlerinin, A. baumannii izolatlarında ise amikasin (n(%78,3) vs. n(%87,1), p:0.000) ve kolistin (n(%0,8) vs. n(%11,2), p:0.000) dirençlerinin geç peryotta anlamlı olarak arttığı belirlenmiştir. Stenotrophomonas maltophilia izolatlarında trimetoprim-sulfametaksazol direnci saptanmamıştır. Sonuç: Antibiyotiklerin yoğun ve kontrolsüz kullanımı dirençli suşların sayısını ve dağılımını arttırmaktadır. Bu nedenle YBÜ başta olmak üzere hastanelerde NFB’lerin dağılım özellikleri ve ilaç direnç oranları hakkındaki bilgileri kavramak, antibiyotiklerin doğru ve etkin kullanımının yanı sıra ilaç direnç oranlarının da azaltılabilmesi için oldukça önemlidir.

Keywords

• Non-fermantatif gram negatif bakteri
• solunum yolu örnekleri
• antimikrobiyal direnç dağılımı
• Acinetobacter baumannii
• Pseudomonas aeruginosa

References

1. 1. Antunes LC, Visca P, Towner KJ. Acinetobacter baumannii: evolution of a global pathogen. Pathog Dis 2014; 71:292-301. https://doi.org/10.1111/2049-632X.12125
2. 2. Bassetti M, Vena A, Croxatto A, Righi E, Guery B. How to manage Pseudomonas aeruginosa infections. Drugs Context 2018; 7:212527. https://doi.org/10.7573/dic.212527
3. 3. Doi Y, Murray GL, Peleg AY. Acinetobacter baumannii: Evolution of antimicrobial resistance-treatment options. Semin Respir Crit Care Med 2015; 36:85-98. https://doi.org/10.1055/s-0034-1398388
4. 4. İnce N, Geyik MF, Özdemir D, Danış A. A comparison of the antibiotic susceptibility rates Pseudomonas aeruginosa strains causing hospital acquired infections according to years. ANKEM Derg 2014; 28:94-99.
5. 5. Agarwal S, Kakati B, Khanduri S, Gupta S. Emergence of carbapenem resistant non-fermenting gram-negative bacilli isolated in an ICU of a tertiary care hospital. J Clin Diagn Res 2017; 11:DC04-DC07. https://doi.org/10.7860/JCDR/2017/24023.9317
6. 6. Küme G, Demirci M. Yoğun bakım ünitelerindeki hastaların alt solunum yolu örneklerinden izole edilen non-fermantatif gram-negatif bakterilerin antimikrobiyal duyarlılıkları ve alt solunum yolu enfeksiyonu ile ilişkili risk faktörleri. DEÜ Tıp Fakültesi Dergisi. 2012; 26:37-44.
7. 7. Özünel l, Boyacıoğlu Zİ, Güreser AS, Taylan Özkan HA. Çorum eğitim ve araştırma hastanesinde derin trekeal aspirat örneklerinden izole edilen Pseudomonas aeruginosa ve Acinetobacter baumannii suşlarının antimikrobiyal duyarlılık paternlerinin değerlendirilmesi. Turk Hij Den Biyol Derg 2014; 71:81-88. https://doi.org/10.5505/TurkHijyen.2014.76093
8. 8. Ozdemir M, Erayman I, Gundem NS, Baykan M, Baysal B. Hastane infeksiyonu etkeni Acinetobacter suşlarının çeşitli antibiyotiklere duyarlılıklarının araştırılması. Ankem Derg 2009; 23:127-132.

9. 9. Klinik örnekten sonuç raporuna uygulama rehberi. Solunum sistemi örnekleri. Klinik Mikrobiyoloji Uzmanlık Derneği Yayınları No:10. 2015;44-55.
10. 10. Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance standards for antimicrobial susceptibility testing, Twenty- third informational supplement, M100-S23, CLSI, Wayne, PA 2013.
11. 11. The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST). Available at: http://www.eucast.org/clinical_breakpoints/ Accesed: April 04, 2020.
12. 12. Tripathi PC, Gajbhiye SR, Agrawal GN. Clinical and antimicrobial profile of Acinetobacter spp: An emerging nosocomial superbug. Adv Biomed Res 2014; 9:13. https://doi.org/10.4103/2277-9175.124642
13. 13. Wendel AF, Brodner AH, Wydra S, et al. Genetic charecterization and the emergence of metallo -beta-lactamase GIM 1 in Pseudomonas species and Enterobacteriaceae during a long- term outbreak. Antimicrobial Agent Chemother 2013; 57:5162-5165.
14. 14. Malini A, Deepa EK, Gokul BN, Prasad SR. Nonfermenting gram-negative bacilli infections in a tertiary care hospital in Kolar, Karnataka. J Lab Physicians. 2009; 1:62-66. https://doi.org/10.4103/0974-2727.59701
15. 15. Hao D, Hu Z, Liu X, et al. Analysis of the distribution characteristics and drug resistance of non-fermenting bacterial infection in intensive care unit from 2009 to 2015. Zhonghua Wei Zhong Bing Ji Jiu Yi Xue 2016; 28:439-444.
16. 16. Chawla K, Vishwanath S, Munim FC. Nonfermenting gram-negative bacilli other than Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter Spp. causing respiratory tract infections in a tertiary care center. J Glob Infect Dis 2013; 5:144-148. https://doi.org/10.4103/0974-777X.121996
17. 17. Öncül A, Koçulu S, Elevli K. Bir devlet hastanesinin yoğun bakım ünitelerinde kazanılan hastane enfeksiyonlarının epidemiyolojisi. Şişli Etfal Hastanesi Tıp Bülteni 2012; 46:60-66.
18. 18. Gazi H, Ecemis T, Kurutepe S, Gürsev N, Sürücüoğlu S. Hastanede yatan hastaların alt solunum yolu örneklerinden izole edilen gram-negatif bakterilerde antimikrobiyal direnç. Klimik Dergisi 2011; 24:112-115. https://doi.org/1 0.5152/kd.2011.27
19. 19. Malekzadegan Y, Abdi A, Heidari H, Moradi M , Rastegar E , Saraie HSE. In vitro activities of colistin, imipenem and ceftazidime against drug‑resistant Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii isolates in the south of Iran. BMC Res Notes 2019; 12:301. https://doi.org/10.1186/s13104-019-4344-7
20. 20. Baumgart AMK, Molinari MA, Silveira AC. Prevalence of carbapenem resistant Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii in high complexity hospital. Braz J Infect Dis 2010; 14:433-436. https://doi.org/10.1590/s1413-86702010000500002
21. 21. Gladstone P, Rajendran P, Brahmadathan KN. Incidence of carbapenem resistant nonfermenting gram negative bacilli from patients with respiratory infections in the intensive care units. Indian J Med Microbiol 2005; 23:189-191. https://doi.org/10.4103/0255-0857.16593
22. 22. Memish ZA, Shibl AT, Kambal AM, Ohaly YA, Ishaq A, Livermore DM. Antimicrobial resistance among non-fermenting gram-negative bacteria in Saudi Arabia. Journal of Antimicrobial Chemotherapy 2012; 67:1701-1705. https://doi.org/10.1093/jac/dks091
23. 23. Shah AA, Jamil B, Naseem S, et al. Susceptibility pattern of tracheal tube isolates from intensive care unit of Fauji Foundation Hospital Rawalpindi. J Pak Med Assoc 2019; 69:981-984.