Klinik örneklerden izole edilen Candida türlerinin değerlendirilmesi

Abstract

Amaç: Candida türleri kritik hastalarda en önemli patojendir ve epidemiyolojisi sürekli değişmektedir. Candida albicans enfeksiyona neden olan türler arasında halen en sık görülen patojen olmakla beraber diğer Candida türlerinin de oranı artmaktadır. Son yıllarda albicans dışındaki diğer Candida’larla oluşan enfeksiyonlardaki artış ve antifugallare direnç gelişmesi Candida türlerinin oluşturduğu enfeksiyonlardan izole edilen etkenlerin tür düzeyinde tanımlanmasında önem kazanmıştır. Bu çalışmada çeşitli klinik örneklerden izole edilen Candida türlerinin tanımlanması amaçlanmıştırYöntem: Ocak 2011 - Haziran 2012 tarihleri arasında 3905 klinik örnekten Candida türleri izole edilmiştir. Candida türlerinin tanımlanmasında germ tüp testi, Cornmeal-Tween 80 agarda üreme ve klamidospor oluşumu, pseudohif bulunuşu, karbonhidrat fermantasyon ve asimilasyon testleri, üreaz testi, nitrat testi çalışılmıştır.Bulgular: Sonuç olarak 3905 klinik örnekten 1122 Candida türü izole edildi. Klinik örneklerin dağılımı şöyledir; 556 %49,6 bronkoalveolar lavaj BAL , 271 %24,2 balgam, 114 %10,2 kan kültürü, 51 %4,6 vaginal sürüntü, 50 %4,4 idrar, 30 %2,6 doku, 22 %1,9 endotrakeal trakeal aspirat ETA , dokuz %0,80 plevral mai, altı %0,53 periton sıvısı, dört %0,35 mide açlık sıvısı MAS , üç %0,28 gaita, iki %0,18 apse, üç %0,26

Keywords

• Mayalar, Candida, tür ayrımı

Evaluation of Candida strains isolated from clinical specimens

Abstract

Objective: Candida spp. are the most important pathogens in critically ill patients and the epidemiology is changing. While Candida albicans remains the predominant pathogen, the proportion of infection caused by other species of Candida continues to increase. In recent years, due to the increase in incidence of infections with non-albicans strains and the development of resistance to antifungals, identification of Candida strains to species level gained significant importance.The aim of this study was to identify Candida strain isolated from various clinical specimens.Method: January 2011 to June 2012, Candida strains were isolated from 3905 clinical specimen. In identification of Candida species that were isolated, germ tube test, growth in Cornmeal-Tween 80 agar and formation of clamydospore, presence of pseudohyphae, carbonhytrate fermentation and assimilation tests, and the test of nitrate were studiedResults: Finally 1122 Candida strains were isolated from 3905 various clinical specimens. The distribution of clinical specimens were as fallows: 556 from bronchoalveolar lavage 49.6% , 271 from sputum 24.2% , 114 from blood 10.2% , 51 vaginal swabs 4.6% , 50 from urine 4.4% , 30 from tissue 2.6% , 22 from endotracheal tracheal aspirate ETA 1.9% , nine from pleural mai 0.80% , six from peritoneal fluid 0.53% , four tırnak ve bir %0,10 de beyin omurilik sıvısı BOS .Bu klinik örneklerden 848 %75,6 C. albicans, 143 %12,8 C. glabrata, 40 %3,57 C. parapsilosis, 33 %2,94 C. krusei, 33 %2,94 C. kefyr, 19 %1,7 C. tropicalis suşları izole edilmiştir. Diğer suşlarda C. lusitania, C. lipolytica, C. norvegensis, C. pelliculosa ve C. zeylanoides olarak tanımlanmıştır.Sonuç: Hastanemizde tanımlanan Candida izolatları arasında C. albicans’ın halen en sık izole edilen tür olduğu, bununla birlikte albicans dışı türlerde de zamanla artış olduğu kanısına varılmıştır.from gastric fluid 0.35% ,three from stool 0.28% ,two from abscess 0.18% ,three from nail 0.26% , one from cerebrospinal fluid 0.10% . From these clinical samples 848 C. albicans 75.6% , 143 C. glabrata 12.8% , 40 C. parapsilosis, 3.57% , 33 C. krusei 2.94% , 33 C. kefyr 2.94% , 19 C. tropicalis 1.7% were isolated. Other strains were identified as C. lusitania, C. lipolytica, C. norvegensis, C. pelliculosa ve C. zeylanoidesConclusion: It was concluded that C.albicans has still been the most frequent species among Candida isolates of in our hospital; however, the incidence of non-albicans species have increased

Keywords

• Yeasts, Candida, species identification

References

1. 1. Warnock DW. Trends in the epidemiology of invasive fungal infections. Nihon Ishinkin Gakkai Zasshi, 2007; 48(1): 1-12.
2. 2. Wenzel RP. Nosocomial candidemia: risk factors and attributable mortality. Clin Infect Dis, 1995; 20(6): 1531-4.
3. 3. Fridkin SK, Jarvis WR. Epidemiology of nosocomial fungal infections. Clin Microbiol Rev, 1996; 9(4): 499-511.
4. 4. Krcmery V,Barnes AJ. Non-albicans Candida spp. causing fungaemia: pathogenicity and antifungal resistance. J Hosp Infect, 2002; 50(4): 243-60.
5. 5. St-Germain G, Laverdière M, Pelletier R, Bourgault AM, Libman M, Lemieux C, et al. Prevalence and antifungal susceptibility of 442 Candida isolates from blood and other normally sterile sites: results of a 2-year (1996 to 1998) multicenter surveillance study in Quebec, Canada. J Clin Microbiol, 2001; 39(3): 949-53.
6. 6. Pemán J, Cantón E, Quindós G, Eraso E, Alcoba J, Guinea J et al. Epidemiology, species distribution and in vitro antifungal susceptibility of fungaemia in a Spanish multicentre prospective survey. J Antimicrob Chemother, 2012; 67(5): 1181-7.
7. 7. Phaller MA, Boyken LB, Hollis RJ, Kroeger J,Messer SA, Tendolkar S et al. Validation of 24-hour posaconazole and voriconazole MIC readings versus the CLSI 48-hour broth microdilution reference method: application of epidemiological cut off values to results from a global Candida antifungal surveillance program. J Clin Microbiol, 2011; 49(4): 1274-9.
8. 8. Al FD, Aktaş AE, Tuncel E, Ayyıldız A, Uslu H, Aktaş O. Atatürk Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastaneleri Mikrobiyoloji Laboratuvarlarında Klinik Örneklerden İzole Edilen Maya Türleri. İnfeksiyon Derg, 2002: 16(2): 205-10.

9. 9. Erdem F, Tuncer Erdem G, Oral B, Karakoç E, Demiröz AP, Tülek N. Candida Türlerine Bağlı Nozokomiyal Enfeksiyonların Epidemiyolojik ve Mikrobiyolojik Açıdan Değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul, 2012; 46(4): 637-48.
10. 10. Bayram Y, Gültepe B, Güdücüoğlu H. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Candida kökenlerinin identifikasyonu ve antifungal duyarlılıklarının araştırılması. Van Tıp Derg, 2012; 19 (4): 177-81.
11. 11. Satılmış ÖK, Akkaya Y, Ergin Ç, Kaleli İ. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Candida sp kökenlerinde slime faktör üretimi. Pam Tıp Derg, 2011; 4(1): 25-9.
12. 12. Viudes A, Pemán J, Cantón E, Ubeda P, LpóezRibot JL, Gobernado M. Candidemia at a tertiarycare hospital: epidemiology, treatment, clinical outcome and risk factors for death. Eur J Clin Microbiol Infect Dis, 2002; 21(11): 767-74.
13. 13. Horn DL, Neofytos D, Anaissie EJ, Fishman JA, Steinbach WJ, Olyaei AJ et al. Epidemiology and outcomes of candidemia in 2019 patients: data from the prospective antifungal therapy alliance registry. Clin Infect Dis, 2009; 48(12): 1695-703.
14. 14. Ural O. Fungal hastane infeksiyonları: Fungal infeksiyonların epidemiyolojisi ve korunma. Hastane İnfeksiyonları Dergisi, 2004; 8: 159-67.
15. 15. Yenigün Koçak B, Kuloğlu F, Doğan Çelik A, Akata F. Bir üçüncü basamak hastanesinde erişkin kandidemi olgularının epidemiyolojik özellikleri ve risk faktörlerinin değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul, 2011; 45(3): 489-503.
16. 16. Aslan U, Uysal EB, Işık F, Tuncer İ, Fındık D. 2002- 2005 Yılları arasında kan örneklerinden soyutlanan Candida türleri. İnfeksiyon Derg, 2006; 20 (3): 177-81.
17. 17. Gültekin B, Eyigör M, Telli M, Aksoy M, Aydın N. Yedi yıllık dönemde kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin retrospektif olarak incelenmesi. ANKEM Derg, 2010; 24(4): 202-8.
18. 18. Berk E, Kayman T, Sarıgüzel FM, Koç AN, Sav H, Çelik İ. Yoğun bakım ünitesinde yatan hastaların kan kültürlerinden izole edilen Candida türleri ve antifungal duyarlılıkları. 35. Türk Mikrobiyoloji Kongresi Özet Kitabı, (3-7 Kasım 2012, Aydın) P027:227.
19. 19. Koç AN, Erdem F, Çetin N. Kan kültürlerinde üreyen mayaların retrospektif olarak değerlendirilmesi ve antifungal duyarlılıkları. Türk Mikrobiyol Cem Derg, 1999; 29: 177-82.
20. 20. Delisle MS, Williamson DR, Perreault MM, Albert M, Jiang X, Heyland DK. The clinical significance of Candida colonization of respiratory tract secretions in critically ill patients. J Crit Care, 2008; 23(1): 11-7.
21. 21. Taşbakan MS, Çeviker Y, Başoğlu ÖK, Metin D, Çitim Ş, Taşkıranlar P. Solunum örneklerinden Candida türlerinin izole edilmesinin prognoza etkisi. Tur Toraks Derg, 2011; 12: 153-7.
22. 22. Passos XS, Sales WS, Maciel PJ, Costa CR, Miranda KC, Lemosjde A, et al. Candida colonization in intensive care unit patients' urine. Mem Inst Oswaldo Cruz, 2005; 100(8): 925-8.
23. 23. Alvarez-Lerma F, Nolla-Salas J, Leon C, Palomar M, Jordá R, Carrasco N et al. Candiduria in critically ill patients admitted to intensive care medical units. Intensive Care Med 2003; 29(7): 1069-76.
24. 24. Gültekin B, Yazıcı V, Aydın N. Vajinal örneklerden izole edilen Candida suşlarının dağılımı ve chromagar Candida besiyerinin değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul, 2005; 39: 319-24.
25. 25. Altanlar N. Vulvovajinal candidiasis olgularından izole edilen Candidaların türlere göre dağılımı. Ankara Ecz Fak Derg, 1999; 28(1): 61-70.
26. 26. Miranda LN, Van der Heijden IM, Costa SF, Sousa AP, Sienra RA, Gobara S et al. Candida colonisation as a source for Candidaemia. J Hosp Infect, 2009: 72(1):9-16.