Yatan hastaların idrar örneklerinden izole edilen Gram-negatif bakterilerin tür dağılımı ve antibiyotik duyarlılıkları

Öz

Amaç: Bu retrospektif çalışmada; hastanemizde yatan hastalarda gelişen üriner sistem enfeksiyonlarının ampirik tedavi yaklaşımına katkıda bulunabilmek için üriner sistem enfeksiyonu gelişen yatan hastaların idrar kültürlerinden izole edilen Gram-negatif bakterilerin tür dağılımını ve antimikrobik duyarlılık paternlerini belirlemeyi amaçladık.Yöntemler: Ocak 2006 ve Eylül 2011 tarihleri arasında, üriner sistem enfeksiyonu gelişen yatan hastaların idrar kültürlerinden elde edilen toplam 3.548 Gramnegatif izolatın identifikasyonu geleneksel yöntemler ve BD PhoenixTM 100 Becton Dickinson, MD, ABD tam otomatik mikrobiyoloji sistemi tarafından yapılmıştır. İzolatların antimikrobiyal duyarlılık testi Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi ile Clinical and Laboratory Standarts Institute CLSI kriterlerine göre çalışılmıştır. Ayrıca, baskın üropatojen bakterilerin genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz GSBL üretimi çift-disk sinerji yöntemi ile araştırılmıştır.Bulgular: Bu çalışmada, erkeklere göre kadınlarda önemli ölçüde daha yüksek üriner sistem enfeksiyonu insidansı gözlenmiştir, sırasıyla; 1.303 %36,7 ve 2.245 %63,3 . Escherichia coli’nin baskın patojen bakteri olduğu belirlendi ve üriner sistem enfeksiyonu gelişen toplam 3.548 yatan hastanın 2.341 %65,8 ’inde sorumlu etken olduğu bulundu. Ayrıca, 679 %19,1 ’unda Klebsiella pneumoniae, 177 %5 ’sinde Acinetobacter spp., 176 %5 ’sında Enterobacter spp., 142 %4 ’sinde Pseudomonas aeruginosa ve 38 %1,1 ’inde diğer Gramnegatif bakterilerin sorumlu etken olduğu saptandı. İdrar kültürlerinden izole edilen Gram-negatif bakterilerin antimikrobik duyarlılık oranları seftazidim, trimetoprimsülfametoksazol, siprofloksasin, piperasilin-tazobaktam, sefoperazon-sülbaktam, meropenem için sırasıyla; %34,5, %38, %42, %50, %70, %87, %90 ve %92 olarak tespit edilmiştir. Ayrıca, GSBL üreten E. coli ve K. pneumoniae oranları da sırasıyla; %38 ve %36 olarak bulunmuştur.amikasin, imipenem ve Sonuç: Bu çalışma ve diğer çalışmaların sonuçları yakın gelecekte, sefalosporinler, karbapenemler ve florokinolonlar gibi geniş spektrumlu antibiyotiklere karşı yüksek düzeyde direnç gelişiminin mümkün olduğunu ve tedavi seçeneklerimizin her zamankinden daha sınırlı hale gelebileceğini göstermektedir. Seftazidim, siprofloksasin ve trimetoprim-sülfametoksazole karşı gelişen yüksek düzey direnç nedeniyle, üriner sistem enfeksiyonlarının ampirik tedavisi için bu antibiyotiklerin kullanılmamasını öneririz

Anahtar Kelimeler

• Üriner sistem enfeksiyonu, antimikrobik Escherichia coli, GSBLduyarlılık, Gram-negatif bakteriler

The distribution according to the species of Gram-negative bacteria isolated from hospitalized patients's urine specimens and their antimicrobial susceptibility

Abstract

Objective: In this retrospective study, we aimed to determine the distribution according to the species of Gram-negative bacteria in isolates obtained from urine cultures of hospitalized patients with urinary tract infections and to detect their antimicrobial susceptibility pattern for contribute to empirical treatment approach to urinary tract infections in our hospital.Methods: Between the dates of January 2006 and September 2011, a total of 3,548 Gram-negative isolates obtained from urine cultures of hospitalized patients with urinary tract infection were identified by conventional methods and the BD PhoenixTM 100 Becton Dickinson, MD, USA fully automated microbiology system. Antimicrobial susceptibility testing of isolates was performed by KirbyBauer’s disk diffusion method according to the Clinical and Laboratory Standarts Institute CLSI criteria. In addition, extended-spectrum beta-lactamase ESBL production of predominant urinary pathogenic bacteria was detected by the double-disk synergy method.Results: In this study, a significantly higher incidence of urinary tract infection was observed in females compared with males; 2,245 63.3% and 1,303 36.7% , respectively. Escherichia coli was the predominant pathogenic bacterium and accounted for toplam 3.548 yatan hastanın 2.341 %65,8 ’inde sorumlu etken olduğu bulundu. Ayrıca, 679 %19,1 ’unda Klebsiella pneumoniae, 177 %5 ’sinde Acinetobacter spp., 176 %5 ’sında Enterobacter spp., 142 %4 ’sinde Pseudomonas aeruginosa ve 38 %1,1 ’inde diğer Gramnegatif bakterilerin sorumlu etken olduğu saptandı. İdrar kültürlerinden izole edilen Gram-negatif bakterilerin antimikrobik duyarlılık oranları seftazidim, trimetoprimsülfametoksazol, siprofloksasin, piperasilin-tazobaktam, sefoperazon-sülbaktam, meropenem için sırasıyla; %34,5, %38, %42, %50, %70, %87, %90 ve %92 olarak tespit edilmiştir. Ayrıca, GSBL üreten E. coli ve K. pneumoniae oranları da sırasıyla; %38 ve %36 olarak bulunmuştur.amikasin, imipenem ve Sonuç: Bu çalışma ve diğer çalışmaların sonuçları yakın gelecekte, sefalosporinler, karbapenemler ve florokinolonlar gibi geniş spektrumlu antibiyotiklere karşı yüksek düzeyde direnç gelişiminin mümkün olduğunu ve tedavi seçeneklerimizin her zamankinden daha sınırlı hale gelebileceğini göstermektedir. Seftazidim, siprofloksasin ve trimetoprim-sülfametoksazole karşı gelişen yüksek düzey direnç nedeniyle, üriner sistem enfeksiyonlarının ampirik tedavisi için bu antibiyotiklerin kullanılmamasını öneririz

Keywords

• Urinary tract infection, antimicrobial susceptibility, Gram-negative bacteria, Escherichia coli, ESBL

References

1. 1. Devrajani BR, Shah SZ, Devrajani T, Qureshi GA. Nosocomial Infections in Medical Ward (Four Months Descriptive Study in a Tertiary Care Hospital). World J Med Sci, 2009; 4(1):13-7.
2. 2. Üstün C et al. Surveillance of Nosocomial Infections in General Surgery Unit: Data of Ten Years Period. Düzce Tıp Dergisi, 2010; 12(3):1-6.
3. 3. Gaynes R, Edwards JR. Overview of nosocomial infections caused by gram-negative bacilli. Clin Infect Dis, 2005; 41(6):848-54.
4. 4. Goldstein FW. Antibiotic susceptibility of bacterial strains isolated from patients with communityacquired urinary tract infections in France. European J Clin Microbiol&Infect Dis, 2000; 19(2):112-7.
5. 5. Schitoa GC, Naberb KG, Bottoc H, Paloud J, Mazzeie T, Gualcoa L, et al. The ARESC study: an international survey on the antimicrobial resistance of pathogens involved in uncomplicated urinary tract infections. Int J Antimicrob Agents, 2009; 34(5):407-13.
6. 6. Kayaş L, Yolbaş İ, Ece A, Kayaş Y, Balık H, Kocamaz H. Causative agents and antibiotic susceptibilities in children with urinary tract infection. J Microbiol Infect Dis 2011; 1(1):17-21.
7. 7. Al-Benwan K, Al-Sweih N, Rotimi VO. Etiology and antibiotic susceptibility patterns of communityand hospital-acquired urinary tract infections in a general hospital in Kuwait. Med Princ Pract, 2010; 19(6):440-6.
8. 8. Kang CI, Chung DR, Son JS, Ko KS, Peck KR, Song JH. Korean Network for Study of Infectious Diseases. Clinical significance of nosocomial acquisition in urinary tract-related bacteremia caused by gram-negative bacilli. Am J Infect Control, 2011; 39(2):135-40.

9. 9. Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance standards for antimicrobial susceptibility testing; Twenty-first Informational Supplement. Document M100-S21. Wayne, PA 2011.
10. 10. Jarlier V, Nicolas M, Fournier G, Philippon A. Extended spectrum β-lactamases conferring transferable resistance to newer β-lactam agents in Enterobacteriaceae: Hospital prevalence and susceptibility patterns. Rev Infect Dis, 1988; 10:867-78.
11. 11. (http://www.rshm.gov.tr/enfeksiyon/dosya/ analiz_2010.pdf).
12. 12. Mathai D, Jones RN, Pfaller MA, and the SENTRY Participant Group. North America. Epidemiology and frequency of resistance among pathogens causing urinary tract infections in 1510 hospitalized patients: a report from the SENTRY Antimicrobial Surveillance Program (North America). Diagn Microbiol Infect Dis, 2001; 40(3):129-36.
13. 13. Galesa AC, Sader HS, Jones RN and the SENTRY Participants Group (Latin America). Urinary tract infection trends in Latin American hospitals: report from the SENTRY antimicrobial surveillance program (1997-2000). Diagn Microbiol Infect Dis, 2002; 44(3):289-99.
14. 14. Ryu KH, Kim YB, Yang SO, Lee JK, Jung T. Results of urine culture and antimicrobial sensitivity tests according to the voiding method over 10 years in patients with spinal cord injury. Korean J Urol, 2011; 52(5):345-9.
15. 15. Kehinde A, Adedapo K, Aimakhu C, Odukogbe AT, Olayemi O, Salako B. Urinary pathogens and drug susceptibility patterns of urinary tract infections among antenatal clinic attendees in Ibadan, Nigeria. J Obstet Gynaecol Res, 2011; 37(5):1-5.
16. 16. Rifaioğlu MM, Yıldırım A, Başok EK, Keskin SK, Özgüneş N, Tokuç R. Changing pattern of antibiotic resistance of bacteria's isolated from urine cultures in the last four years. Turkish Journal of Urology, 2009; 35(3): 201-9.
17. 17. Temiz H, Akkoç H, Gül K. Laboratuarımızda idrar kültürlerinden izole edilen gram negatif bakterilerde antibiyotiklere direnç. Dicle Tıp Dergisi, 2008; 35(4): 234-9.
18. 18. Dielubanza EJ, Schaeffer AJ. Urinary tract infections in women. Med Clin North Am, 2011; 95(1): 27-41.
19. 19. Geyik MF, Hoşoğlu S, Ayaz C, Çelen MK, Üstün M. Surveillance of Nosocomial Infections in Dicle University Hospital: a Ten-Year Experience. Turk J Med Sci 2008; 38(6): 587-93.
20. 20. Lockhart SR, Abramson MA, Beekmann SE, Gallagher G, Riedel S, Diekema DJ, et al. Antimicrobial Resistance among Gram-Negative Bacilli Causing Infections in Intensive Care Unit Patients in the United States between 1993 and 2004. J Clin Microbiol, 2007; 45(10): 3352-9.
21. 21. Hoban DJ, Nicolle LE, Hawser S, Bouchillon S, Badal R. Antimicrobial susceptibility of global inpatient urinary tract isolates of Escherichia coli: Results from the Study for Monitoring Antimicrobial Resistance Trends (SMART) program: 2009-2010. Diagn Microbiol Infect Dis, 2011; 70(4): 507-11.
22. 22. Leblebicioglu H, Esen S and Turkish Nosocomial Urinary Tract Infection Study Group. Hospitalacquired urinary tract infections in Turkey: a nationwide multicenter point prevalence study. J Hosp Infect, 2003; 53(3): 207-10.
23. 23. Mera RM, Miller LA, Amrine-Madsen H, Sahm DF. Acinetobacter baumannii 2002-2008: increase of carbapenem-associated multiclass resistance in the United States. Microb Drug Resist, 2010; 16(3):209-15.
24. 24. Lee K, Lee MA, Lee CH, Lee J, Roh KH, Kim S, et al. Increase of ceftazidime- and fluoroquinoloneresistant Klebsiella pneumoniae and imipenemresistant Acinetobacter spp. in Korea: analysis of KONSAR study data from 2005 and 2007. Yonsei Med J, 2010; 51(6): 901-11.
25. 25. Lee K, Yong D, Jeong SH, Chong Y. MultidrugResistant Acinetobacter spp.: Increasingly Problematic Nosocomial Pathogens. Yonsei Med J, 2011; 52(6): 879-91.