Erişkin hastalarda toplum kaynaklı üriner sistem enfeksiyonlarından izole edilen Escherichia coli suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının yıllara göre değişimi 2010-2014

Abstract

Amaç: Üriner sistem enfeksiyonları ÜSE , toplumda en sık görülen enfeksiyon hastalıklarından biridir. ÜSE’nin etkenleri arasında Gram negatif çomaklar ve özellikle de %70-80 görülme sıklığı ile Escherichia coli ilk sırada yer almaktadır. Üriner sistem enfeksiyonları için çoğu zaman kültür ve antimikrobiyal duyarlılık testleri beklenmeden ampirik tedaviye başlanmaktadır. Çalışmamızda, hastanemize üriner sistem enfeksiyonu şikayeti ile başvuran hastalara ait idrar örneklerinden izole edilen E. coli suşlarının ampirik tedavide sık kullanılan antibiyotiklere duyarlılıklarındaki değişim incelenmiştir. Yöntemler: Hastanemiz laboratuvarına 1 Ocak 2010 – 30 Aralık 2014 tarihleri arasında çeşitli polikliniklerden gönderilen idrar örneklerine ait sonuçlar retrospektif olarak incelenmiştir. ÜSE ön tanısı konulan hastalardan uygun şartlarda alınan orta akım idrar örnekleri 0,4 mm çaplı kalibre öze ile %5 koyun kanlı agar ve EMB agara ekilerek aerop koşullarda 37°C’de 24-48 saat inkübe edilmiştir. E. coli suşlarının identifikasyonu konvansiyonel yöntemlerle yapılmış ve antibiyotik duyarlılıkları ve fenotipik genişlemiş spektrumlu beta laktamaz GSBL doğrulaması disk difüzyon yöntemi spectrum beta –lactamase ESBL confirmation was evaluated by the disk diffusion method according to the current Clinical and Laboratory Standards Institute CLSI standards. Results: Reproduction has been detected in 17.857 17,8% from the total of 99.997 examples and 11.594 64,9% of them have been identified as E. coli. The 72.5% of patients having E. coli reproduction from urine culture samples 8401 were female and 27.5% 3193 were male. The antibiotics that the E. coli strains were mostly sensitive were detected as fosfomycin 99.6% . nitrofurantoin 96.7% and norfloxacin 80.6% . It was observed that there was a decrease in the resistance of amoxicillin/clavulanic acid, ampicillin/sulbactam, ampicillin and cefuroxime over the years. On the hand it was seen that there was an increase in the resistance of ciprofloxacin, levofloxacin, norfloxacin, nitrofurantain, cefazolin and ESBL rates within the years. Conclusion: As a result, for the E. coli strains isolated in our hospital from community-acquired urinary, nitrofurantoin 3.3% and the fosfomycin 0.4% with urinary pathogen low rate of resistance were Sonuç: Sonuç olarak hastanemizde izole edilen toplum kökenli üropatojen E. coli suşları için nitrofurantoin %3,3 ve fosfomisinin %0,4 düşük direnç oranları ile ÜSE tedavisinde en etkili antibiyotikler olduğu izlenmiştir

Keywords

• E. coli, fosfomisin, üriner sistem enfeksiyonları

The antibiotic susceptibility changes of the Escerichia coli strains isolated from community-acquired urinary tract infections in adults according to the years 2010-2014

Abstract

Objective: Urinary tract infections UTI are one of the most common infectious diseases in the community. Gram- negative bacilli and especially with the prevalence of %70-80, Escherichia coli are in the first place among the effects of UTI. Most of the time for urinary tract infections empirical treatment is started without waiting the culture and antimicrobial susceptibility tests. In our study the susceptibility changes of the E. coli strains isolated from urine samples of the patients who applied to our hospital with the complaints of urinary tract infections to the antibiotics which are frequently used in empirical treatment were examined for the last five years period.Methods: The results of urine samples sent to the laboratory of our hospital from various clinics between 1 January 2010 - 30 December 2014 were analyzed retrospectively. Medium current urine samples which were taken from UTI prediagnosed patients at appropriate conditions, were inoculated on 5% sheep blood agar and EMB agar with 0.4 mm diameter calibrated loop and were incubated in aerobic conditions at 37°C for 24-48 hours.The identification of E. coli strains were made by conventional methods and their antibiotic sensitivity and phenotypic extended spectrum beta –lactamase ESBL confirmation was evaluated by the disk diffusion method according to the current Clinical and Laboratory Standards Institute CLSI standards. Results: Reproduction has been detected in 17.857 17,8% from the total of 99.997 examples and 11.594 64,9% of them have been identified as E. coli. The 72.5% of patients having E. coli reproduction from urine culture samples 8401 were female and 27.5% 3193 were male. The antibiotics that the E. coli strains were mostly sensitive were detected as fosfomycin 99.6% . nitrofurantoin 96.7% and norfloxacin 80.6% . It was observed that there was a decrease in the resistance of amoxicillin/clavulanic acid, ampicillin/sulbactam, ampicillin and cefuroxime over the years. On the hand it was seen that there was an increase in the resistance of ciprofloxacin, levofloxacin, norfloxacin, nitrofurantain, cefazolin and ESBL rates within the years. Conclusion: As a result, for the E. coli strains isolated in our hospital from community-acquired urinary, nitrofurantoin 3.3% and the fosfomycin 0.4% with urinary pathogen low rate of resistance were observed to be the most effective antibiotics in the treatment of UTI

Keywords

• E. coli, fosfomycin, urinary tract infections

References

1. 1. Auer S, Wojna A, Hell M. Oral treatment optionsfor ambulatory patients with urinary tract infections caused by extended-spectrum-ß-lactamaseproducing Escherichia coli. Antimicrob Agent Chemother, 2010; 54(9): 4006-8.
2. 2. Coşkun Ö, Erdem H, Avcı A. Management of community- acquired acute bacterial cystitis in Turkey. Turk J Med Sci, 2011; 41(1): 149-57.
3. 3. Pullukcu H, Aydemir S, Tasbakan MI, Çilli F, Tünger A, Ulusoy S. Susceptibility of extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli urine isolates to fosfomycin, ciprofloxacin, amikacin and trimethoprim-sulfamethoxazole. Turk J Med Sci, 2008; 38(2): 175-80.
4. 4. Guidelines on urological infections. European Association of Urology 2014. İnternet adresi: http://www.uroweb.org/gls/pdf/19%20 Urological% 20 infections_LR.pdf. Erişim tarihi: 29.05.2014
5. 5. Şener B. Antibiotic resistance in communıty – acquired infections: Epidemiology. Türkiye Klinikleri J Inf Dis-Special Topics, 2011; 4(1): 50-5.
6. 6. Oteo J, Pérez-Vázquez M, Campos J. Extendedspectrum [beta]-lactamas producing Escherichia coli: changing epidemiology and clinical impact. Curr Opin Infect Dis, 2010; 23(4): 320-6.
7. 7. Arman D, Ağalar C, Dizbay M, Güzel Tunçcan Ö, Tozlu Keten D, Aygün G. Community acquired lower urinary tract infections in primary care: causative agents and antimicrobial susceptibility. Mediterr J Infect Microb Antimicrob, 2012; 1(10): 1-8.
8. 8. Hooton TM, Besser R, Foxman B, Fritsche TR, Nicolle LE. Acute uncomplicated cystitis in an era of increasing antibiotic resistance: A proposed approach to empirical therapy. Clin Infect Dis, 2004; 39(1): 75-80.

9. 9. Warren JW, Abrutyn E, Hebel JR, Johnson JR, Schaeffer AJ, Stamm WE. Guidelines for antimicrobial treatment of uncomplicated acute bacterial cystitis and acute pyelonephritis in women. Clin Infect Dis, 1999; 29(4): 745-58.
10. 10. Rahn DD. Urinary tract infections: contemporary management. Urol Nurs, 2008; 28: 333-41.
11. 11. Alo´s JI, Serrano MG, Go´mez-Garce´s JL, Perianes J. Antibiotic resistance of Escherichia coli from community-acquired urinary tract infections in relation to demographic and clinical data. Clin Microbiol Infect, 2005; 11: 199-203.
12. 12. Duman Y, Bozkurt1 İ, Tekerekoğlu MS. Investigation of Antibiotic Resistance and ESBLPresence of Community-Acquired Escherichia coli Strains, Isolated from UTI in Afşin StateHospital. Med Sci, 2014; 3(3): 1408-18.
13. 13. Zengin K, Tanık S, Albayrak S, Kaba M, Pirinççi N. Van Bölgesi’ndeki üriner sistem enfeksiyon etkenleri ve antibiyotik duyarlılıkları. Bozok Tıp Derg, 2014; 4(1); 1-5.
14. 14. Sağlam H.S, Öğütlü A, Demiray V, Karabey O. Üriner enfeksiyonlarda toplum kökenli Escherichia coli’nin yeri ve gelişen antibiyotik direnci. Nobel Medicus, 2012; 8(1): 67-8.
15. 15. Aktaş S.Ç, Gençer S, Batırel A, Hacıseyitoğlu D, Özer S. CLSI ve EUCAST Önerilerine Göre Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz Üreten Escherichia coli İdrar İzolatlarında Fosfomisin Duyarlılığı. Mikrobiyol Bul, 2014; 48(4): 545-55.
16. 16. Aykan ŞB, Çiftci İH. Türkiye’de idrar kültürlerinden izole edilen Escherichia coli suşlarinin antibiyotiklere direnç durumu: bir meta-analiz. Mikrobiyol Bul, 2013; 47(4): 603-8.
17. 17. Savaş L, Güvel S, Turunç T, Savaş N, Arslan H. Toplum Kökenli ve Nozokomiyal Üriner Sistem Enfeksiyonu Etkenleri ve Antibiyotik Duyarlılıklarının Karşılaştırılması. Turk Urol Derg, 2003; 29: 95-100.
18. 18. Cetin M, Ucar E, Guven O, Ocak S. Communityacquired urinary tract infections in Southern Turkey: etiology and antimicrobial resistance. Clinic Nephrol, 2009; 71: 30-5.
19. 19. Eroğlu M, Koçoğlu E, Karabay O, Semerciöz A. Toplum kaynaklı erişkin üriner sistem enfeksiyonlarında izole edilen enterobaktericea türlerinin bazı antibiyotiklere duyarlılıkları: geriye dönük çalışma. Turk Urol Derg, 2007; 33(1): 100-3.
20. 20. Baykan M, Kaya M, Arslan U, Baysal B: İdrar örneklerinden izole edilen E. coli suşlarının antimikrobiklere duyarlılıklarının değerlendirilmesi. İnönü Univ Tıp Fak Derg, 2001; 8: 15.
21. 21. Ozenci VM, Kırdar S, Yüce A, Yuluğ N: Uriner sistem infeksiyonlar›nda izole edilen Escherichia coli suşlarının sulbaktam-ampisilin ile klavulanik asit-amoksisilin duyarlılıklarının karşılaştırılması. İnfeks Derg, 1999; 13: 71.
22. 22. Arslanturk A, Yousefi Rad A, Namlıkaya M: idrar kültürlerinden izole edilen E. coli suşlarının bazı antibiyotiklere direnc durumları. 9. Türk Klinik Mikrobiyoloji ve İnfeksiyon Hastalıkları Kongresi Kitabı, 1999; s: 213.
23. 23. Sahin İ, Sencan İ, Kaya D, Gülcan A, Öksüz S. Hastane infeksiyonu etkeni üropatojen Escherichia coli izolatlarının çeşitli antibiyotiklere direnç durumu. Ankem Derg 2004; 18: 193-195.
24. 24. Temiz H, Akkoç H, Gül K. Laboratuvarımızda idrar kültürlerinden izole edilen gram negatif bakterilerde antibiyotiklere direnç. Dicle Tıp Dergisi, 2008; 35(4): 234-9.
25. 25. Tekin A, Deveci Ö, Dal T, Tekin R, Özekinci T, Dayan S: Üropatojen Escherichia coli izolatlarına fosfomisin ve bazı antibiyotiklerin in vitro etkinliği. ANKEM Derg, 2012; 26(2): 61-8.
26. 26. Çetin M, Ocak S, Görür S, Avunduk G. Semptomatik üriner sistem infeksiyonlarında üropatojenler ve izole edilen Escherichia coli suşlarının antibiyotik duyarlılığı. ANKEM Derg, 2006; 20(3): 169-72.
27. 27. Bauernfeind A, Horl G. Novel R-factorborne β-laktamase conferring resistance to cephalosporins. Infection, 1987; 15(4): 257-9.
28. 28. Ağca H. Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarının genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üretimleri ve antibiyotik duyarlılık oranları. DEÜ Tıp Fak Derg, 2011; 25(3): 169-73.
29. 29. Uğur A.R, Türk Dağı H, Tuncer İ, Fındık D, Arslan U. İdrar kültürlerinden izole edilen Escherichia coli suşlarının antibiyotik duyarlılığı ve genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz oranı. ANKEM Derg, 2013; 27(1): 13-8.
30. 30. Uyanık MH, Hancı H, Yazgı H. Üriner sistem infeksiyonlarından soyutlanan toplum kökenli Escherichia coli suşlarına fosfomisin trometamolün ve bazı antibiyotiklerin in-vitro etkinliği. ANKEM Derg, 2009; 23(4): 172-6.
31. 31. Göker G, Kaya I, Aydın D, Gürler N. Üriner sistemden izole edilen Escherichia coli, Klebsiella ve enterokok cinsi bakterilerde fosfomisin duyarlılığının araştırılması, ANKEM Derg, 2007; 21(4): 219-22.
32. 32. Baylan O. Fosfomisin: dünü, bugünü ve geleceği. Mikrobiyol Bult, 2010; 44(2): 311-21.
33. 33. Greenwood D. Fosfomycin and fosmidomycin. In: Finch RG, Greenwood D, Norrby SR, Whitley RJ, eds, Antibiotic and Chemotherapy. 8th ed. Toronto: Churchill Livingstone, 2003; 294-6.
34. 34. Arslan H, Azap OK, Ergonul O, Timurkaynak F. Urinary Tract Infection Study Group. Risk factors for ciprofloxacin resistance among Escherichia coli strains isolated from communityacquired urinary tract infections in Turkey. J Antimicrob Chemother, 2005; 56(5): 914-8.
35. 35. Hoşbul T, Ozyurt M, Baylan O, et al. Escherichia coli nedenli komplike olmamış uriner sistem enfeksiyonlarında fosfomisin trometamolun in vitro etkinliği. Mikrobiyol Bul, 2009; 43(4): 645-9.
36. 36. Eckentdorf HK, Castringius RG, Spingler HK. Comparative pharmacodynamics, urinary excretion, and half-life determinations of nitrofurantoin sodium, Antimicrob Agents Chemother, 1962; 2: 531-37.
37. 37. Reese RE, Betts RF. Urinary antiseptics. In: Reese RE, Betts RF. Gummustop B (eds) Handbook of Antibitotics 3rd ed. Philadelphi Lippincott Williams Wilkins, 2000: 564-73.
38. 38. Pullukçu H, Aydemir Ş, Taşbakan Işıkgöz M, Sipahi O.R, Çilli F, Ulusoy S. Nitrofurantoinin idrar kültürlerinden soyutlanan Escherichia coli suşlarına ın vitro etkinliği. İnfeksiyon Derg, 2007; 21(4): 197-200.
39. 39. Kurt Ö, Güneş H, Gümüş A, Mutlu R,Topkaya A.E. Toplumsal kaynaklı üriner sistem infeksiyonlarından izole edilen Escherichia coli suşlarında fosfomisin, nitrofurantoin ve siprofloksasinin in-vitro etkinliği. ANKEM Derg, 2014; 28(2): 58-62.