BibTex RIS Cite

Yatan hastaların idrar kültürlerinden izole edilen Candida türleri ve antifungal duyarlılıkları

Year 2013, Volume: 70 Issue: 4, 185 - 190, 01.12.2013

Mustafa Altay Atalay Ayşe Nedret Koç Hafize Sav Gonca Demir

Abstract

Amaç: Candida türlerinin oluşturduğu üriner sistem enfeksiyonları en sık görülen hastane enfeksiyonlarındandır. Hastalardaki diabetes mellitus, üriner sistem defektleri, kronik böbrek yetmezliği, nötropeni, immunsupresif tedavi, antimikrobiyal kullanımı bu enfeksiyonların görülme oranını artırmaktadır. Etkin tedavi için tür tanımıyla birlikte antifungal testleri yapılmalıdır. Bu çalışmada idrar kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin tanımlanması ve suşların amfoterisin B, flukonazol, vorikonazol ve kaspofungine duyarlılıklarının E-test Yöntemi ile araştırılması amaçlanmıştır.Yöntem: Haziran-Aralık 2011 tarihleri arasında yatan hastaların idrar kültürlerinden izole edilen 61 Candida suşu çalışmaya alınmıştır. Candida türlerinin tanımlanmasında germ tüp testi, Cornmeal-Tween 80 agarda üreme ve klamidospor oluşumu, pseudohif bulunuşu, karbonhidrat fermantasyon ve asimilasyon testleri, üreaz testi, nitrat testi kullanılmıştır. Tanımlanan Candida suşlarının antifungal amfoterisin B, flukonazol, vorikonazol ve kaspofungine duyarlılıkları E-test AB Biodisk, İsveç Yöntemi ile araştırılmıştır. Bu yöntemde %2 glikoz ve %1,5 agar içeren RPMI 1640 Sigma, USA besiyeri kullanılmıştır. Sonuçlar üretici firmanın önerisi doğrultusunda gerçekleştirilmiştir.Bulgular: Toplam 61 suşun 18 %30 ’i C. albicans, 18 %30 ’i C. glabrata, 14 %23 ’ü C. tropicalis, 7 %11 ’si C. parapsilosis, 2 %3 ’si C. krusei ve 2 %3 ’si de

Keywords

Antifungal duyarlılık E-test idrar kandidüri

References

  • Achkar JM, Fries BC. Candida infections of the genitourinary tract. Clin Microbiol Rev, 2010; (2): 253-73.
  • Nayman Alpat S, Özgüneş I, Ertem OT, Erben N, Doyuk Kartal E, Tözün M, ark. Kandidürisi olan hastalarda risk faktörlerinin değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul, 2011; 45(2): 318-24.
  • Ener B. İn vitro antifungal duyarlılık testleri: Standardizasyon ve klinik önemi. Mikrobiyol Bul, ; 30: 419-25. Ells R, Kock JL, Pohl CH. Candida albicans or Candida dubliniensis? Mycoses, 2011; 54(1): 1-6.
  • Koc AN, Gokahmetoglu S, Oguzkaya M. Comparison of E-test with microdilution method in susceptibility testing of yeast isolates against four antifungals. Mycoses, 2000; 43: 293-7.
  • Emori TG, Gaynes RP. An overview of nosocomial infections, including the role of the microbiology laboratory. Clin Microbiol Rev,1993;6(4): 428-42.
  • Lundstrom T, Sobel J. Nosocomial candiduria: A review. Clin Infect Dis, 2001; 32: 1602-7.
  • Kauffman CA, Vazquez JA, Sobel JD, Gallis HA, McKinsey DS, Karchmer AW, et al. Prospective multicenter surveillance study of funguria in hospitalized patients. The National Institute for Allergy and Infectious Diseases (NIAID) Mycoses Study Group. Clin Infect Dis, 2000; 30(1): 8.
  • Alverez-Lerma F, Nolla-Salas J, León C, Palomar M, Jordá R, Carrasco N. Candiduria in critically ill patients admitted to intensive care medical units. Intensive Care Med, 2003; 29(7): 1069-76.
  • Passos XS, Sales WS, Maciel PJ, Costa CR, Miranda KC, Lemos Jde A. Candida colonization in intensive care unit patients' urine. Mem Inst Oswaldo Cruz, ; 100(8): 925-8. Güler S, Ural O, Fındık D, Aslan U. Risk factors for nosocomial candiduria. Saudi Med J, 2006; 27(11): 10.
  • Pfaller MA, Diekema DJ. Progress in antifungal susceptibility testing of Candida spp. by use of Clinical and Laboratory Standards Institute broth microdilution methods, 2010 to 2012. J Clin Microbiol, 2012; 50(9): 2846-56.
  • Da Silva EH, Ruiz Lda S, Matsumoto FE, Auler ME, Giudice MC, Moreira D, et al. Candiduria in a public hospital of São Paulo (1999-2004): characteristics of the yeast isolates. Rev Inst Med Trop Sao Paulo, ; 49(6): 349-53
  • Jain N, Kohli R, Cook E, Gialanella P, Chang T, Fries BC. Biofilm formation by and antifungal susceptibility of Candida isolates from urine. Appl Environ Microbiol, 2007; 73(6): 1697-703.
  • Yüksekkaya Ş, Fındık D, Aslan U. Yoğun bakım ünitesinde yatan hastaların idrarlarından izole edilen Candida türlerinin moleküler epidemiyolojisi ve antifungal duyarlılıkları. Mikrobiyol Bul, 2011; (1): 137-149.
  • Warren JW. Catheter-associated urinary tract infections.Int J Antimicrob Agents, 2001; 17(4): 303.
  • Kobayashi CCBA, Fernandes OFL, Miranda KC, Souza ED, Silva MMR. Candiduria in hospital patients: A study prospective. Mycopathologia, 2004; 158: 52.
  • Kim J, Kim DS, Lee YS, Choi NG. Fungal urinary tract infection in burn patients with long-term foley catheterization. Korean J Urol, 2011;52(9); 31.
  • CLSI 2008. Reference method for broth dilution antifungal susceptibility testing of yeasts, 3rd Ed
  • M27–A3 Clinical and Laboratory Standards Institute, Wayne, PA. Ozhak- Baysan B, Ogunc D, Çolak D, Ongut G, Dönmez L, Vural T, et al. Distribution and antifungal susceptibility of Candida species causing nosocomial candiduria. Med Mycol, 2012; (5); 529-32.
  • Keçeli S, Budak F, Sönmez Tamer G, Willke A. Candida türlerinin bazı antifungallere duyarlılıklarının ve fosfolipaz aktivitelerinin araştırılması. İnfeksiyon Dergisi, 2003; 17 (3): 321-4.

Candida species isolated from urine specimens and antifungal susceptibility in hospitalized patients

Year 2013, Volume: 70 Issue: 4, 185 - 190, 01.12.2013

Mustafa Altay Atalay Ayşe Nedret Koç Hafize Sav Gonca Demir

Abstract

Objective:Urinary system infections caused by Candida species are the most common nosocomial infections. Diabetes mellitus, urinary system defects, chronic renal failure, neutopenia, immunsuppressive treatment, and use of antimicrobials of patients increase the incidence of these infections. Antifungal tests should be applied with identification of species for effective treatment. In this study, identification of Candida species isolated from urine and investigation of susceptibility of these strains to amphotericin B, fluconazole, voriconazole and caspofungin by E-test method are aimed to be investigated.Method:61 Candida strains isolated from urine cultures of hospitalized patients between JuneDecember 2011 are included in the study. Germ tube test, growth on Cornmeal-Tween 80 agar and chylamidospore formation, presence of psudohyphae, carbohydrate fermentation and assimilation tests, urease test and nitrate tests were used to identificate Candida species. The antifungal amphotericin B, fluconazole, voriconazole, and caspofungin susceptibility of the identified Candida strains was investigated by E-test ABBiodisk, Sweden method. For this method, RPMI 1640 medium with 2% glucose and 1.5% agar Sigma, USA was used. The results were evaluated according to manufacturer recommendation.Results:Total of 61 strains were identified as follows; 18 30% were C. albicans, 18 30% were C. glabrata, 14 C. keyfr olarak tanımlanmıştır. Tüm suşlar amfoterisin B, kaspofungin ve vorikonazole duyarlı bulunurken, flukonazole dirençli iki C. krusei suşu ve doza bağlı duyarlı bir C. glabrata suşu dışında tüm suşların duyarlı olduğu saptanmıştır.Sonuç: Hastanemizde idrar kültürlerinden izole edilen Candida türlerinden C. albicans ilk sırayı almakla beraber, C. glabrata ikinci en sık izole edilen tür olmuştur. Sonuç olarak, Candida enfeksiyonları için risk teşkil eden hasta popülasyonunun artmasına paralel olarak, türlerin tanımlanması için epidemiyolojik çalışmaların ve yeni antifungal ajanları da içeren antifungal duyarlılık testlerinin yapılması gerekliliği kanaatine varılmıştır. 23% were C. tropicalis, 7 11% were C. parapsilosis, 2 3% were C. krusei and 2 3% were C. kefyr. All of the strains were found as susceptible to amphotericin B, caspofungin, voriconazole and fluconazole except two C. krusei strains resistant to fluconazole and one C. glabrata strain dose-dependant susceptible to fluconazole.Conclusion: In our hospital, C. albicans was the most frequently isolated Candida species from urine cultures, however, C. glabrata was found as the second most frequent species. As a result, in parallel to the increase of patient population who are at risk for Candida infections, the necessity of doing epidemiological studies for identification of species and susceptibility tests including new antifungal agents was concluded

Keywords

Antifungal susceptibility E-test urine candiduria

References

  • Achkar JM, Fries BC. Candida infections of the genitourinary tract. Clin Microbiol Rev, 2010; (2): 253-73.
  • Nayman Alpat S, Özgüneş I, Ertem OT, Erben N, Doyuk Kartal E, Tözün M, ark. Kandidürisi olan hastalarda risk faktörlerinin değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul, 2011; 45(2): 318-24.
  • Ener B. İn vitro antifungal duyarlılık testleri: Standardizasyon ve klinik önemi. Mikrobiyol Bul, ; 30: 419-25. Ells R, Kock JL, Pohl CH. Candida albicans or Candida dubliniensis? Mycoses, 2011; 54(1): 1-6.
  • Koc AN, Gokahmetoglu S, Oguzkaya M. Comparison of E-test with microdilution method in susceptibility testing of yeast isolates against four antifungals. Mycoses, 2000; 43: 293-7.
  • Emori TG, Gaynes RP. An overview of nosocomial infections, including the role of the microbiology laboratory. Clin Microbiol Rev,1993;6(4): 428-42.
  • Lundstrom T, Sobel J. Nosocomial candiduria: A review. Clin Infect Dis, 2001; 32: 1602-7.
  • Kauffman CA, Vazquez JA, Sobel JD, Gallis HA, McKinsey DS, Karchmer AW, et al. Prospective multicenter surveillance study of funguria in hospitalized patients. The National Institute for Allergy and Infectious Diseases (NIAID) Mycoses Study Group. Clin Infect Dis, 2000; 30(1): 8.
  • Alverez-Lerma F, Nolla-Salas J, León C, Palomar M, Jordá R, Carrasco N. Candiduria in critically ill patients admitted to intensive care medical units. Intensive Care Med, 2003; 29(7): 1069-76.
  • Passos XS, Sales WS, Maciel PJ, Costa CR, Miranda KC, Lemos Jde A. Candida colonization in intensive care unit patients' urine. Mem Inst Oswaldo Cruz, ; 100(8): 925-8. Güler S, Ural O, Fındık D, Aslan U. Risk factors for nosocomial candiduria. Saudi Med J, 2006; 27(11): 10.
  • Pfaller MA, Diekema DJ. Progress in antifungal susceptibility testing of Candida spp. by use of Clinical and Laboratory Standards Institute broth microdilution methods, 2010 to 2012. J Clin Microbiol, 2012; 50(9): 2846-56.
  • Da Silva EH, Ruiz Lda S, Matsumoto FE, Auler ME, Giudice MC, Moreira D, et al. Candiduria in a public hospital of São Paulo (1999-2004): characteristics of the yeast isolates. Rev Inst Med Trop Sao Paulo, ; 49(6): 349-53
  • Jain N, Kohli R, Cook E, Gialanella P, Chang T, Fries BC. Biofilm formation by and antifungal susceptibility of Candida isolates from urine. Appl Environ Microbiol, 2007; 73(6): 1697-703.
  • Yüksekkaya Ş, Fındık D, Aslan U. Yoğun bakım ünitesinde yatan hastaların idrarlarından izole edilen Candida türlerinin moleküler epidemiyolojisi ve antifungal duyarlılıkları. Mikrobiyol Bul, 2011; (1): 137-149.
  • Warren JW. Catheter-associated urinary tract infections.Int J Antimicrob Agents, 2001; 17(4): 303.
  • Kobayashi CCBA, Fernandes OFL, Miranda KC, Souza ED, Silva MMR. Candiduria in hospital patients: A study prospective. Mycopathologia, 2004; 158: 52.
  • Kim J, Kim DS, Lee YS, Choi NG. Fungal urinary tract infection in burn patients with long-term foley catheterization. Korean J Urol, 2011;52(9); 31.
  • CLSI 2008. Reference method for broth dilution antifungal susceptibility testing of yeasts, 3rd Ed
  • M27–A3 Clinical and Laboratory Standards Institute, Wayne, PA. Ozhak- Baysan B, Ogunc D, Çolak D, Ongut G, Dönmez L, Vural T, et al. Distribution and antifungal susceptibility of Candida species causing nosocomial candiduria. Med Mycol, 2012; (5); 529-32.
  • Keçeli S, Budak F, Sönmez Tamer G, Willke A. Candida türlerinin bazı antifungallere duyarlılıklarının ve fosfolipaz aktivitelerinin araştırılması. İnfeksiyon Dergisi, 2003; 17 (3): 321-4.
There are 19 citations in total.

Details

Primary Language Turkish
Journal Section Research Article
Authors

Mustafa Altay Atalay This is me

Ayşe Nedret Koç This is me

Hafize Sav This is me

Gonca Demir This is me

Publication Date December 1, 2013
Published in Issue Year 2013 Volume: 70 Issue: 4

Cite

APA Atalay, M. A., Koç, A. N., Sav, H., Demir, G. (2013). Yatan hastaların idrar kültürlerinden izole edilen Candida türleri ve antifungal duyarlılıkları. Türk Hijyen Ve Deneysel Biyoloji Dergisi, 70(4), 185-190.
AMA Atalay MA, Koç AN, Sav H, Demir G. Yatan hastaların idrar kültürlerinden izole edilen Candida türleri ve antifungal duyarlılıkları. Turk Hij Den Biyol Derg. December 2013;70(4):185-190.
Chicago Atalay, Mustafa Altay, Ayşe Nedret Koç, Hafize Sav, and Gonca Demir. “Yatan hastaların Idrar kültürlerinden Izole Edilen Candida türleri Ve Antifungal duyarlılıkları”. Türk Hijyen Ve Deneysel Biyoloji Dergisi 70, no. 4 (December 2013): 185-90.
EndNote Atalay MA, Koç AN, Sav H, Demir G (December 1, 2013) Yatan hastaların idrar kültürlerinden izole edilen Candida türleri ve antifungal duyarlılıkları. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi 70 4 185–190.
IEEE M. A. Atalay, A. N. Koç, H. Sav, and G. Demir, “Yatan hastaların idrar kültürlerinden izole edilen Candida türleri ve antifungal duyarlılıkları”, Turk Hij Den Biyol Derg, vol. 70, no. 4, pp. 185–190, 2013.
ISNAD Atalay, Mustafa Altay et al. “Yatan hastaların Idrar kültürlerinden Izole Edilen Candida türleri Ve Antifungal duyarlılıkları”. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi 70/4 (December 2013), 185-190.
JAMA Atalay MA, Koç AN, Sav H, Demir G. Yatan hastaların idrar kültürlerinden izole edilen Candida türleri ve antifungal duyarlılıkları. Turk Hij Den Biyol Derg. 2013;70:185–190.
MLA Atalay, Mustafa Altay et al. “Yatan hastaların Idrar kültürlerinden Izole Edilen Candida türleri Ve Antifungal duyarlılıkları”. Türk Hijyen Ve Deneysel Biyoloji Dergisi, vol. 70, no. 4, 2013, pp. 185-90.
Vancouver Atalay MA, Koç AN, Sav H, Demir G. Yatan hastaların idrar kültürlerinden izole edilen Candida türleri ve antifungal duyarlılıkları. Turk Hij Den Biyol Derg. 2013;70(4):185-90.