BibTex RIS Cite

Klinik Örneklerden İzole Edilen Pseudomonas aeruginosa Suşlarının Yıllara Göre Antibiyotik Direnci

Year 2017, Volume: 74 Issue: 3, 229 - 236, 01.09.2017

Abstract

Amaç: Hastanemiz mikrobiyoloji laboratuvarına gönderilen örneklerden izole edilen P. aeruginosa suşlarının 2011-2015 yıllarındaki antibiyotik direnç yüzdelerinin dağılımının saptanması amaçlanmıştır. Yöntem: P. aeruginosa izolasyonu için laboratuvarımıza farklı kliniklerden gönderilen çeşitli örnekler kanlı agar ve EMB agara ekim yapılarak 37°C’de 18-24 saat inkübe edilmiştir. Üreyen bakteriler konvansiyonel yöntemlerle ve MALDI Biotyper Bruker, Almanya sistemi ile tanımlanmıştır. Tüm izolatların antimikrobiyal duyarlılıkları 2011-2014 yılları için Clinical Laboratory Standards Institute CLSI ve 2015 yılı için ise The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing EUCAST önerilerine uygun olarak çalışılmıştır. Antimikrobiyal duyarlılıkları; poliklinik hastalarında Mueller-Hinton besiyerinde disk difüzyon yöntemiyle, servis ve yoğun bakım hastalarında Phoenix otomatize sistemi BD, Sparks, MD, USA ile değerlendirilmiştir. Bulgular: 2011-2015 yılları arasında 1026 poliklinik ve 408 yatan hasta olarak toplam 1434 hastanın çeşitli örneklerinden P. aeruginosa izole edilmiştir. En fazla idrar kültürlerinden izole edilmiş olup poliklinik hastalarında %78, yatan hastalarda ise %40 oranlarında bulunmuştur. 2011-2015 yılları arasında poliklinik hastalarının antimikrobiyal duyarlılıklarına bakıldığında; abse ve yara örneklerinin siprofloksasin CIP direncinde yıllara göre bir değişim bulunmazken idrar kültürlerinin CIP direncinde belirgin bir artış gözlenmiştir %14-20,3 . Bu hastaların idrar, abse ve yara kültürlerinin Amikasin ve Gentamisin direncinde yıllara göre belirgin bir değişim göstermezken, Seftazidim direnci idrar, abse ve yara örneklerinde sırasıyla; %6,6-9,3, %18-20 ve % 8,3-11 olarak bulunmuş olup, yıllara göre azalma eğiliminde olduğu gözlenmiştir. 2015 yılı yatan hastalarda imipenem IPM %31 ve meropenem MEM %29 ’in EUCAST kriterleri ile saptanan direncinin, CLSI kriterleri ile saptanan dirençten anlamlı olarak daha düşük olduğu gözlenmiştir p

References

  • 1. Raja NS, Singh NN. Antimicrobial susceptibility pattern of clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa in a tertiary care hospital. J Microbiol Immunol Infect, 2007; 40(1): 45-9.
  • 2. Akduman Alaşehir E, Karadeniz A, Balıkçı A, Eren Topkaya A. Klinik örneklerinden izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarının antibiyotik duyarlılıkları. Maltepe Tıp Derg, 2013;5(3):12-6.
  • 3. Vahaboğlu H, Akhan SÇ. Pseudomonas aeruginosa ve diğer Pseudomonas türleri. In. Topçu WA, Söyletir G, Doğanay M eds. İnfeksiyon Hastalıkları ve Mikrobiyolojisi. 2. Baskı İstanbul: Nobel Matbaacılık, 2002; 1608-8.
  • 4. Dağı HT, Arslan U, Fındık D ve ark. Kan kültürlerinden izole edilen P. aeruginosa suşlarının antibiyotiklere direnç oranları. ANKEM Derg, 2011;25(2):107-10.
  • 5. Akalın H. Pseudomonas aeruginosa infeksiyonları ve tedavisi. Klimik Derg, 2007; 20 (Suppl. 1): 208- 14.
  • 6. Pier GB, Ramphal R. Pseudomonas aeruginosa, “Mandell GL, Bennett JE, Dolin R (eds): Principles and Practice of Infectious Diseases, 6. baskı” kitabında s. 2587-615. Churchill Livingstone. New York 2005.
  • 7. Eyigör M, Telli M, Tiryaki Y, Okulu Y, Aydın N. Yatan Hastalardan İzole Edilen Pseudomonas aeruginosa Suşlarının Antibiyotik Duyarlılıkları. Ankem Derg, 2009; 23(3):101-5.
  • 8. Fidan I, Çetin Gürelik F, Yüksel S, Sultan N. Pseudomonas aeruginosa Suşlarında Antibiyotik Direnci Ve Metallo-Beta-Laktamaz Sıklığı. Ankem Derg, 2005; 19:68-70.
  • 9. Şener AG, Atay T, Gülay Z, Türker M. Çoklu dirençli Pseudomonas aeruginosa kökenlerinde siprofloksasinamikasin, siprofloksasin- sefepim, seftazidim amikasin, sefepim- amikasin kombinasyonlarının in vitro sinerjistik etkinliklerinin araştırılması. Ankem Derg, 2003; 17(4): 388-92.
  • 10. Keten DT, Tunçcan ÖG, Dizbay M, Arman D. Nozokomiyal Pseudomonas aeruginosa İzolatlarında Doripenemin Diğer Karbapenemlerle İn-Vitro Karşılaştırmalı Etkinliği. Ankem Derg, 2010;24(2):71-5.
  • 11. Ekincioğlu P, Perçin D. Klinik Pseudomonas aeruginosa İzolatlarının Antibiyotiklere Duyarlılık Durumu. Sağlık Bilimleri Derg, (journal of health Sciences) 2013;22 (2)141-9.
  • 12. Özgenç O, Urbarlı A, Erdenizmenli M, Fidan N, Arı A. Pseudomonas aeruginosa kökenlerinin çeşitli antimikrobiklere direnç oranlarının araştırılması. İnfeksiyon Derg, 2002;16(2):179-82.
  • 13. Kassim A, Omuse G, Premji Z, and Revath G. Comparison of Clinical Laboratory Standards Institute and European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing guidelines for the interpretation of antibiotic susceptibility at a University teaching hospital in Nairobi, Kenya. Ann Clin Microbiol Antimicrob, 2016;15:21 DOI 10.1186/ s12941-016-0135-3.
  • 14. Sader HS, Farrell DJ, Castanheira M, Flamm R.K, and Jones RN. Antimicrobial activity ofceftolozane/ tazobactam tested against Pseudomonas aeruginosa and Enterobacteriaceae with various resistance patterns isolated in European hospitals (2011–12). J Antimicrob Chemother, 2014; 69: 2713- 22. doi:10.1093/jac/dku184.
  • 15. Köseoğlu E Ö, Kocagöz S, Ergin A, Altun B, Hasçelik G. Yoğun bakım ünitelerinde infeksiyon etkeni olan Gram-negatif basillerin değerlendirilmesi. İnfeksiyon Derg, 2005; 19:75-80.
  • 16. Duman Y, Kuzucu Ç, Kaysadu H, Tekerekoğlu MS. Bir Yıllık Sürede İzole Edilen Pseudomonas aeruginosa Suşlarının Antibiyotik Duyarlılığının Araştırılması. İnönü Üniversitesi Sağlık Bilimleri Dergisi 2012; 1: 41-5.
  • 17. Durmaz S, Özer TT. Klinik örneklerden izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarında antibiyotik direnci. abantmedj.2015.38981. doi: 10.5505.
  • 18. Cesur S, Albayrak F, Birengel S, Kolcu Z, Tekeli E. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarının karbapenem ve diğer beta-laktam antibiyotiklere duyarlılıkları. Türk Mikrobiyol Cem Derg, 2002;33(3-4):203-6.
  • 19. Gayyurhan E, Zer Y, Mehli M, Akgün S. Yoğun bakım ünitesi hastalarından izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarının antibiyotik duyarlılıkları ve metallo-beta laktamaz oranlarının belirlenmesi. İnfeksiyon Derg, 2008; 22(1): 49-52.

Antibiotic Resistance Rates of Pseudomonas aeruginosa Strains Isolated from Clinical Specimens by Years

Year 2017, Volume: 74 Issue: 3, 229 - 236, 01.09.2017

Abstract

Objective: We aimed to retrospectively determine the distribution of antibiotic resistance rates of P. aeruginosa strains which were isolated from samples sent to our hospital’s microbiology laboratory between the years 2011-2015. Methods: Various samples sent from different clinics to our laboratory for the isolation of P. aeruginosa were inoculated on blood agar and EMB agar plates and incubated at 37° C for 18-24 hours. Grown bacteria were identified by conventional techniques and MALDI Biotyper Bruker, Germany system. Antimicrobial susceptibility testing of isolates for the years 2011- 2014 were studied in accordance to recommendations of Clinical Laboratory Standards Institute CLSI and for the year of 2015 according to The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing EUCAST recommendations. Antimicrobial susceptibilities were evaluated by the disk diffusion method with Mueller-Hinton medium in outpatients and by Phoenix automated system BD, Sparks, MD, USA in service and intensive care patients. Results: P. aeruginosa strains isolated from 1026 outpatients and 408 inpatients between the years 2011-2014. P. aeruginosa were isolated mostly from urine culture 78% outpatients, 40% inpatients . When we look at the antimicrobial susceptibility rates between 2011 and 2015; we did not observe any changes in ciprofloxacin CIP resistance in abscess and wound culture 14-20.3% . The patient’s urine, abscesses and wound cultures showed no significant change in amikacin and gentamicin resistance according to the years. Resistance to ceftazidime urine in abscesses and wound specimens were found respectively; 6.6-9.3%, 18-20% and 8.3-11%. The patients hospitalized in 2015, imipenem IPM 31% and meropenem MEM 29% resistance were lower according to EUCAST criteria than according to CLSI criteria but cefepime FEP 49% , piperacillintazobactam TPZ 39% , ticarcillin clavulanic acid TIM 71% and ceftazidime CAZ %34 were higher according to CLSI criteria. Resistance to colistin CL was unchanged.Significant differences were found between FEP, TPZ, CAZ IPM, MEM and TIM p 0.05 . Conclusion: The combination of aminoglycosides,the beta-lactam and the quinolone can be used for empiric treatments of these infections. Also in the inpatient, P. aeruginosa strains was observed to show high resistance against most antimicrobial except for colistin CL . Antimicrobial resistance EUCAST criteria determined by CLSI criteria and causes no higher than the resistance detected is revealed EUCAST antimicrobial resistance.

References

  • 1. Raja NS, Singh NN. Antimicrobial susceptibility pattern of clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa in a tertiary care hospital. J Microbiol Immunol Infect, 2007; 40(1): 45-9.
  • 2. Akduman Alaşehir E, Karadeniz A, Balıkçı A, Eren Topkaya A. Klinik örneklerinden izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarının antibiyotik duyarlılıkları. Maltepe Tıp Derg, 2013;5(3):12-6.
  • 3. Vahaboğlu H, Akhan SÇ. Pseudomonas aeruginosa ve diğer Pseudomonas türleri. In. Topçu WA, Söyletir G, Doğanay M eds. İnfeksiyon Hastalıkları ve Mikrobiyolojisi. 2. Baskı İstanbul: Nobel Matbaacılık, 2002; 1608-8.
  • 4. Dağı HT, Arslan U, Fındık D ve ark. Kan kültürlerinden izole edilen P. aeruginosa suşlarının antibiyotiklere direnç oranları. ANKEM Derg, 2011;25(2):107-10.
  • 5. Akalın H. Pseudomonas aeruginosa infeksiyonları ve tedavisi. Klimik Derg, 2007; 20 (Suppl. 1): 208- 14.
  • 6. Pier GB, Ramphal R. Pseudomonas aeruginosa, “Mandell GL, Bennett JE, Dolin R (eds): Principles and Practice of Infectious Diseases, 6. baskı” kitabında s. 2587-615. Churchill Livingstone. New York 2005.
  • 7. Eyigör M, Telli M, Tiryaki Y, Okulu Y, Aydın N. Yatan Hastalardan İzole Edilen Pseudomonas aeruginosa Suşlarının Antibiyotik Duyarlılıkları. Ankem Derg, 2009; 23(3):101-5.
  • 8. Fidan I, Çetin Gürelik F, Yüksel S, Sultan N. Pseudomonas aeruginosa Suşlarında Antibiyotik Direnci Ve Metallo-Beta-Laktamaz Sıklığı. Ankem Derg, 2005; 19:68-70.
  • 9. Şener AG, Atay T, Gülay Z, Türker M. Çoklu dirençli Pseudomonas aeruginosa kökenlerinde siprofloksasinamikasin, siprofloksasin- sefepim, seftazidim amikasin, sefepim- amikasin kombinasyonlarının in vitro sinerjistik etkinliklerinin araştırılması. Ankem Derg, 2003; 17(4): 388-92.
  • 10. Keten DT, Tunçcan ÖG, Dizbay M, Arman D. Nozokomiyal Pseudomonas aeruginosa İzolatlarında Doripenemin Diğer Karbapenemlerle İn-Vitro Karşılaştırmalı Etkinliği. Ankem Derg, 2010;24(2):71-5.
  • 11. Ekincioğlu P, Perçin D. Klinik Pseudomonas aeruginosa İzolatlarının Antibiyotiklere Duyarlılık Durumu. Sağlık Bilimleri Derg, (journal of health Sciences) 2013;22 (2)141-9.
  • 12. Özgenç O, Urbarlı A, Erdenizmenli M, Fidan N, Arı A. Pseudomonas aeruginosa kökenlerinin çeşitli antimikrobiklere direnç oranlarının araştırılması. İnfeksiyon Derg, 2002;16(2):179-82.
  • 13. Kassim A, Omuse G, Premji Z, and Revath G. Comparison of Clinical Laboratory Standards Institute and European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing guidelines for the interpretation of antibiotic susceptibility at a University teaching hospital in Nairobi, Kenya. Ann Clin Microbiol Antimicrob, 2016;15:21 DOI 10.1186/ s12941-016-0135-3.
  • 14. Sader HS, Farrell DJ, Castanheira M, Flamm R.K, and Jones RN. Antimicrobial activity ofceftolozane/ tazobactam tested against Pseudomonas aeruginosa and Enterobacteriaceae with various resistance patterns isolated in European hospitals (2011–12). J Antimicrob Chemother, 2014; 69: 2713- 22. doi:10.1093/jac/dku184.
  • 15. Köseoğlu E Ö, Kocagöz S, Ergin A, Altun B, Hasçelik G. Yoğun bakım ünitelerinde infeksiyon etkeni olan Gram-negatif basillerin değerlendirilmesi. İnfeksiyon Derg, 2005; 19:75-80.
  • 16. Duman Y, Kuzucu Ç, Kaysadu H, Tekerekoğlu MS. Bir Yıllık Sürede İzole Edilen Pseudomonas aeruginosa Suşlarının Antibiyotik Duyarlılığının Araştırılması. İnönü Üniversitesi Sağlık Bilimleri Dergisi 2012; 1: 41-5.
  • 17. Durmaz S, Özer TT. Klinik örneklerden izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarında antibiyotik direnci. abantmedj.2015.38981. doi: 10.5505.
  • 18. Cesur S, Albayrak F, Birengel S, Kolcu Z, Tekeli E. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarının karbapenem ve diğer beta-laktam antibiyotiklere duyarlılıkları. Türk Mikrobiyol Cem Derg, 2002;33(3-4):203-6.
  • 19. Gayyurhan E, Zer Y, Mehli M, Akgün S. Yoğun bakım ünitesi hastalarından izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarının antibiyotik duyarlılıkları ve metallo-beta laktamaz oranlarının belirlenmesi. İnfeksiyon Derg, 2008; 22(1): 49-52.
There are 19 citations in total.

Details

Primary Language Turkish
Journal Section Research Article
Authors

Ayşe Nuriye Varışlı This is me

Altan Aksoy This is me

Irmak Baran This is me

Neriman Aksu This is me

Publication Date September 1, 2017
Published in Issue Year 2017 Volume: 74 Issue: 3

Cite

APA Varışlı, A. N., Aksoy, A., Baran, I., Aksu, N. (2017). Klinik Örneklerden İzole Edilen Pseudomonas aeruginosa Suşlarının Yıllara Göre Antibiyotik Direnci. Türk Hijyen Ve Deneysel Biyoloji Dergisi, 74(3), 229-236.
AMA Varışlı AN, Aksoy A, Baran I, Aksu N. Klinik Örneklerden İzole Edilen Pseudomonas aeruginosa Suşlarının Yıllara Göre Antibiyotik Direnci. Turk Hij Den Biyol Derg. September 2017;74(3):229-236.
Chicago Varışlı, Ayşe Nuriye, Altan Aksoy, Irmak Baran, and Neriman Aksu. “Klinik Örneklerden İzole Edilen Pseudomonas Aeruginosa Suşlarının Yıllara Göre Antibiyotik Direnci”. Türk Hijyen Ve Deneysel Biyoloji Dergisi 74, no. 3 (September 2017): 229-36.
EndNote Varışlı AN, Aksoy A, Baran I, Aksu N (September 1, 2017) Klinik Örneklerden İzole Edilen Pseudomonas aeruginosa Suşlarının Yıllara Göre Antibiyotik Direnci. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi 74 3 229–236.
IEEE A. N. Varışlı, A. Aksoy, I. Baran, and N. Aksu, “Klinik Örneklerden İzole Edilen Pseudomonas aeruginosa Suşlarının Yıllara Göre Antibiyotik Direnci”, Turk Hij Den Biyol Derg, vol. 74, no. 3, pp. 229–236, 2017.
ISNAD Varışlı, Ayşe Nuriye et al. “Klinik Örneklerden İzole Edilen Pseudomonas Aeruginosa Suşlarının Yıllara Göre Antibiyotik Direnci”. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi 74/3 (September 2017), 229-236.
JAMA Varışlı AN, Aksoy A, Baran I, Aksu N. Klinik Örneklerden İzole Edilen Pseudomonas aeruginosa Suşlarının Yıllara Göre Antibiyotik Direnci. Turk Hij Den Biyol Derg. 2017;74:229–236.
MLA Varışlı, Ayşe Nuriye et al. “Klinik Örneklerden İzole Edilen Pseudomonas Aeruginosa Suşlarının Yıllara Göre Antibiyotik Direnci”. Türk Hijyen Ve Deneysel Biyoloji Dergisi, vol. 74, no. 3, 2017, pp. 229-36.
Vancouver Varışlı AN, Aksoy A, Baran I, Aksu N. Klinik Örneklerden İzole Edilen Pseudomonas aeruginosa Suşlarının Yıllara Göre Antibiyotik Direnci. Turk Hij Den Biyol Derg. 2017;74(3):229-36.