2011-2014 yılları arasında kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antimikrobiyal direnç durumları

Year 2017, Volume: 74 Issue: 1, 55 - 70, 01.03.2017

Fatma Köksal Çakırlar Yavuz Uyar Sinem Özdemir Ayşe Barış Ezgi Gözün Şaylan Zafer Habip Hrisi Bahar Tokman Nevriye Gönüllü Murat Günaydın Nuri Kiraz

Abstract

Amaç: Kan akım enfeksiyonları en yaygın nozokomiyal enfeksiyonlardan olup önemli mortalite ve morbidite nedenlerindendir. Erken tanı ve tedavi hasta prognozu açısından büyük önem taşımaktadır. Bakteriyemi ve sepsis tanısı için en güvenilir yöntem kan kültürüdür. Bu çalışmada, tıbbi mikrobiyoloji laboratuvarına Ocak 2011 - Aralık 2014 tarihleri arasında çeşitli kliniklerden gönderilen kan kültürlerinden, izole edilen mikroorganizmaların tanımlanması ve antibiyotiklere direnç profillerinin belirlenmesi amaçlanmıştır.Yöntem: Kan kültürleri, BACTEC 9120 BectonDickinson Diagnostic Instrument Systems, USA otomasyon sistemi ile çalışılmıştır. Mikroorganizmaların tanımlanması konvansiyonel yöntemler ve BD Phoenix Otomatize Mirobiyoloji Tanımlama Sistemi Becton Dickinson and Company, Sparks, USA kullanılarak yapılmıştır. Bakterilerin antibiyotik duyarlılıkları Kirby-Bauer disk difüzyon metodu ile çalışılmış ve Klinik ve Laboratuvar Standartları Enstitüsü Clinical Laboratory Standards Institute-CLSI kriterlerine göre değerlendirilmiştir.Bulgular: Çalışmamızda, 22.366 hastadan alınan toplam 50.850 kan kültürü incelenmiş ve kültürlerin 7510 %14,7 ’unda üreme saptanmıştır. Üreyen cultures. 4.894 67.5% of the reproduced microorganisms were Gram positive cocci 71% plasma coagulase negative staphylococci, 9% Staphylococcus aureus, %9 Enterococcus sp., and %6 Streptococcus sp. , 181 2.4% were Gram positive bacillus, 2105 28% were Gram negative Bacillus 32.9% E. coli, 23.9% Klebsiella sp., 16% Pseudomonas aeruginosa, 13% Acinetobacter sp., and 5.8% Enterobacter sp. , 21 0.27% were anaerobe bacteria and 305 4% were fungus type 96.7% Candida sp. . Methicillin resistance was detected as 34% in plasma coagulase negative staphylococci and 20.9% in S. aureus. Vancomycin resistance in enterococcus was determined as 13%. Broad spectrum beta lactamase formation was found as 34% in E. coli and 50% in Klebsiella sp. Carbapenemase production was detected as 8% in E.coli and 17% in Klebsiella sp. Resistance rates of E.coli and Klebsiella sp. to ampicillin was respectively as 44.7% and 100%, to gentamicin 26% and 27%, to amicasin 15% and 17%, to amoxicillin+clavulanate acid 30% and 35%, cefuroxime 41% and 51%, to cefepime 35% and 50%, to ceftazidime and cefotaxime 36% and 50%, and to ciprofloxacin 39.5% and 31.8%. Resistance rates of Acinetobacter sp. and P. aeruginosa to ceftazidime was respectively 78% and 22%, to ciprofloxacin 64% and 12.6%, to imipenem 63.6% and 26.5%, to gentamicin 56% and 11.8%, to amicasin 53% and 7%, to piperacillin + tazobactam 58% and 12%, to cefepime 61% and 16.6%, to cefotaxime 74.7% and 22%, and to cefoperazone + sulbactam 56.7% and 11%.Conclusion: It is understood that staphylococci resistant to methicillin, which is a significant problem in our hospital, bacteria like E. coli and Klebsiella sp., and bacteria like Pseudomonas and Acinetobacter genus are multiple-drug resistant and that this resistance has undergone a change over time

Keywords

kan akım enfeksiyonları, kan kültürü, antibiyotik, antimikrobiyal direnç

Microorganisms isolated from blood cultures between 2011 and 2014 and their state of antimicrobial resistance

Abstract

Objective: Bloodstream infections are the most common nosocomial infections and significant reasons for mortality and morbidity. Early diagnosis and treatment are of vital importance in terms of patient prognosis. Blood culture is the most reliable method for the diagnosis of bacteremia and sepsis. The aim of this study was to identify the microorganisms isolated from the blood cultures sent to medical microbiology laboratory from various clinics between January 2011 and December 2014 and to determine antibiotic resistance profiles of these microorganisms.Methods: Blood cultures were studied by the BACTEC 9120 Becton-Dickinson Diagnostic Instrument Systems, USA automation system. The identification of the microorganisms was carried out by using both conventional methods and BD Phoenix Automized Microbiology Identification System Becton Dickinson and Company, Sparks, USA . Antibiotic susceptibility of the bacteria was studied with Kirby-Bauer disc diffusion method and evaluated as regards the criteria of Clinical Laboratory Standards Institute CLSI . Results: One A total of 50.850 blood cultures taken from 22.366 patients were examined in this study and reproduction was detected in 7.510 14.7% of the cultures. 4.894 67.5% of the reproduced microorganisms were Gram positive cocci 71% plasma coagulase negative staphylococci, 9% Staphylococcus aureus, %9 Enterococcus sp., and %6 Streptococcus sp. , 181 2.4% were Gram positive bacillus, 2105 28% were Gram negative Bacillus 32.9% E. coli, 23.9% Klebsiella sp., 16% Pseudomonas aeruginosa, 13% Acinetobacter sp., and 5.8% Enterobacter sp. , 21 0.27% were anaerobe bacteria and 305 4% were fungus type 96.7% Candida sp. . Methicillin resistance was detected as 34% in plasma coagulase negative staphylococci and 20.9% in S. aureus. Vancomycin resistance in enterococcus was determined as 13%. Broad spectrum beta lactamase formation was found as 34% in E. coli and 50% in Klebsiella sp. Carbapenemase production was detected as 8% in E.coli and 17% in Klebsiella sp. Resistance rates of E.coli and Klebsiella sp. to ampicillin was respectively as 44.7% and 100%, to gentamicin 26% and 27%, to amicasin 15% and 17%, to amoxicillin+clavulanate acid 30% and 35%, cefuroxime 41% and 51%, to cefepime 35% and 50%, to ceftazidime and cefotaxime 36% and 50%, and to ciprofloxacin 39.5% and 31.8%. Resistance rates of Acinetobacter sp. and P. aeruginosa to ceftazidime was respectively 78% and 22%, to ciprofloxacin 64% and 12.6%, to imipenem 63.6% and 26.5%, to gentamicin 56% and 11.8%, to amicasin 53% and 7%, to piperacillin + tazobactam 58% and 12%, to cefepime 61% and 16.6%, to cefotaxime 74.7% and 22%, and to cefoperazone + sulbactam 56.7% and 11%.Conclusion: It is understood that staphylococci resistant to methicillin, which is a significant problem in our hospital, bacteria like E. coli and Klebsiella sp., and bacteria like Pseudomonas and Acinetobacter genus are multiple-drug resistant and that this resistance has undergone a change over time

Keywords

bloodstream infections, blood culture, antibiotic, antimicrobial resistance

References

• 1. Kaye KS, Marchaim D, Chen TY, Baures T, Anderson DJ, Choi Y, et al. Effect of nosocomial bloodstream infections on mortality, length of stay, and hospital costs in older adults. J Am Geriatr Soc, 2014; 62 (2): 306-11.
• 2. Lambert ML, Suetens C, Savey A, Palomar M, Hiesmayr M, Morales I, et al. Clinical outcomes of health-care-associated infections and antimicrobial resistance in patients admitted to European intensive-care units: a cohort study. Lancet Infect Dis, 2011; 1 (1): 30-8.
• 3. Jian-nong WU, Tie-er GAN, Yue-xian ZHU, Jun-min CAO, Cong-hua JI, Yi-hua WU, et al. Epidemiology and microbiology of nosocomial bloodstream infections: analysis of 482 cases from a retrospective surveillance study. Biomed & Biotechnol, 2015; 16 (1): 70-7.
• 4. Goto M, Al-Hasan MN. Overall burden of bloodstream infection and nosocomial bloodstream infection in North America and Europe. Clin Microbiol Infect, 2013; 19 (6): 501-9.
• 5. Roh KH, Kim JY, Kim HN, Lee HJ, Sohn JW, Kim MJ, et al. Evaluation of BACTEC Plus aerobic and anaerobic blood culture bottles and BacT/Alert FAN aerobic and anaerobic blood culture bottles for the detection of bacteremia in ICU patients. Diagn Microbiol Infect Dis, 2012; 73 (3): 239-42.
• 6. Anonymous. Clinical and Laboratory Standards Institute: Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing; Twenty First Informational Supplement, M100-S25. ISBN: 1-56238-989-0, Wayne, CLSI, 2015.
• 7. Sogaard M, Norgaard M, Dethlefsen C, Schonheyder HC. Temporal changes in the incidence and 30- day mortality associated with bacteremia in hospitalized patients from 1992 through 2006: a population-based cohort study. Clin Infect Dis, 2011; 52: 61–9.
• 8. Sharma DK, Tiwari YK, Vyas N, Maheshwari RK. An investigation of the incidence of nosocomial infections among the patients admitted in the intensive care unit of a tertiary care hospital in Rajasthan. Int J Curr Microbiol, 2013; 2 (10): 428- 35.
• 9. Fram D, Okuno MFP, Taminato M, Ponzio V, Manfredi SR, Grothe C, et al. Risk factors for bloodstream infection in patients at a Brazilian hemodialysis center: a case–control study. BMC Infect Dis. 2015; 15: 158.
• 10. Balıkcı A, Belas Z, Topkaya AE. Kan kültürü pozitifliği: etken ya da kontaminasyon mu? Mikrobiyol Bul, 2013; 47 (1): 135-40.
• 11. Yılmaz S, Gümral R, Güney M, Bedir O, Üsküdar Güçlü A, Duyan S, et al. İki yıllık dönemde kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkların değerlendirilmesi. Gülhane Tıp Derg, 2013; 55: 247-52.
• 12. Ulusan-Gündoğdu DZ, Çopur-Çiçek A, Mutlu MA, Koçyiğit S. Kan kültürlerinden izole edilen gram negatif çomaklar ve antibiyotik duyarlılıkları. Eur J Health Sci, 2015; 1 (2): 58-62.
• 13. Özkaya E, Tümer S, Kirişci Ö, Çalışkan A, Erdoğmuş P. Son iki yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesi’nde kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi. Turk Hij Den Biyol Derg, 2015; 72 (2): 115-22.
• 14. Çopur-Çiçek A, Şentürk-Köksal Z, Ertürk A, Köksal E. Rize 82. Yıl Devlet Hastanesi’nde bir yıllık sürede kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotiklere duyarlılıkları. Turk Hij Den Biyol Derg, 2011; 68: 175-84.
• 15. Çetin F, Mumcuoğlu İ, Aksoy A, Gürkan Y, Aksu N. Kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antimikrobiyal duyarlılıkları. Turk Hij Den Biyol Derg, 2014; 71 (2): 67-74.
• 16. Duman Y, Kuzucu Ç, Çuğlan SS. Kan Kültürlerinden izole edilen bakteriler ve antimikrobiyal duyarlılıkları. Erciyes Med J, 2011; 33: 189-96.
• 17. Ece G. Kan kültüründe üreyen izolatların dağılımı ve antibiyotik duyarlılık profilinin incelenmesi. Haseki Tıp Bülteni, 2013; DOI : 10.4274/Haseki.1044.
• 18. Uzun BK, Güngör S, Yurtsever SG, Afşar İ, Demirci M. Yoğun bakım hastalarının kan kültürlerinden izole edilen Pseudomonas aeruginosa ve Acinetobacter baumannii suşlarının ceşitli antibiyotiklere direnç durumları. ANKEM, 2012; 26 (2): 55-60.
• 19. Wisplinghoff H, Bischoff T, Tallent SM, Seifert H, Wenzel RP, Edmond MB. Nosocomial blood stream infections in US hospitals: analysis of 24,179 cases from a prospective nationwide surveillance study BSI in US Hospitals. Clin Infect Dis, 2004; 39; 309-17.
• 20. Koksal F, Yasar H, Samasti M. Antibiotic resistance patterns of coagulase-negative staphylococcus strains isolated from blood cultures of septicemic patients in Turkey. Microbiol Res, 2009;164: 404-10.
• 21. Anonymous. Ulusal Antimikrobiyal Direnç Surveyans Sistemi 2011 Yıllık Raporu. T.C. Sağlık Bakanlığı Türkiye Halk Sağlığı Kurumu Başkanlığı, 2011, http:// uamdss.thsk.gov.tr., (Erişim Tarihi:01.04.2016)
• 22. Çetinkol Y, Çakır F, Enginyurt Ö. Kan kültürlerinden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarında metisiline direncin yıllara göre değişimi. ANKEM, 2013; 27 (1): 38-42.
• 23. Köksal F, Samasti M. Kan örneklerinden izole edilen mikroorganizmalar. Türk Mikrobiyol Cem Derg, 2001;32: 187-92.
• 24. Trecarichi EM, Cauda R, Tumbarello M. Detecting risk and predicting patient mortality in patients with extended-spectrum β-lactamase-producing Enterobacteriaceae bloodstream infections. Future Microbiol, 2012; 7 (10): 1173-89.
• 25. Beşirbellioğlu B. Dirençli gram-negatif bakteri sorunu. Yoğun Bakım Derg, 2010; (9) 4: 173-81.
• 26. Uyanık MH, Hancı H, Yazgı H, Karameşe M. Kan kültürlerinden soyutlanan Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarında GSBL sıklığı ve ertapenem dahil çeşitli antibiyotiklere in-vitro duyarlılıkları. ANKEM, 2010; 24 (2):86-91.
• 27. Karaayak Uzun B, Güngör S, Şerifhan İlgün M, Özdemir R, Baran N, Yüksel Ergin Ö. Kan kültürlerinden izole edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae izolatlarında genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz sıklığı ve in-vitro antibiyotiklere direnç paternleri. ANKEM, 2012; 26 (4):181-6.
• 28. Köksal F, Sirekbasan S, Ak K, Küçükbasmacı Ö, Samastı M. Kan kültürlerinden izole edilen genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz oluşturan Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae kökenlerinin prevalansı ve antimikrobiyal direnç patternleri. Türk Mikrobiyol Cem Derg, 2009; 39 (1-2): 31-35.
• 29. Şener A, Atay T, Gülay Z, Türker M. Çoklu dirençli Pseudomonas aeruginosa kökenlerinde siprofloksasinamikasin, siprofloksasin-sefepim, seftazidimamikasin, sefepim-amikasin kombinasyonlarının invitro sinerjistik etkinliklerinin araştırılması. ANKEM, 2003; 17 (4): 388-92.
• 30. Coşar M, Tuncer İ, Arslan U. Kan kültürlerinde üreyen Pseudomonas aeruginosa suşlarının antibiyotik direnç profili. İnfeksiyon Derg, 2009; 23 (2): 47-50.
• 31. Dündar D, Sönmez Tamer G. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarının antimikrobiyal direnci: üç yıllık değerlendirme. Ankem, 2009; 23 (1): 17-21.
• 32. Gültekin E, Uyanık MH, Hancı H, Erdil Z, Gelen FN, Çelebi S. Kan kültürlerinden izole edilen nonfermentatif Gram negatif bakterilerin çeşitli antibiyotiklere duyarlılıkları. ANKEM, 2014; 28 (3): 79-8.
• 33. Cesur S, Albayrak F, Birengel S, Kolcu Z, Tekeli E. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarının karbapenem ve diğer beta laktam antibiyotiklere duyarlılıkları. Türk Mikrobiyol Cem Derg, 2002; 32 (3-4): 203-6.
• 34. Ersöz G, Otağ F, Bayındır İ, Kandemir Ö, Aslan G, Kaya A. Nozokomiyal Pseudomonas aeruginosa izolatlarında antibiyotik direnci ve karbapenemlere dirençli suşlar için meropenemin MİK değerleri. ANKEM, 2004; 18 (1): 28-31.
• 35. Gazi H, Sürücüoğlu S, Kurutepe S, İnmez E, Dinç G, Özbakkaloğlu B. Yoğun bakım ünitesi ve diğer ünitelerde yatan hastalardan izole edilen Acinetobacter baumannii suşlarında in-vitro antibiyotik direnci. ANKEM, 2005; 19 (3):115-8.
• 36. Landman D, Bratu S, Kochar S, Panwar M, Trehan M, Doymaz M, et al. Evolution of antimicrobial resistance among Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii and Klebsiella pneumoniae in Brooklyn, Ny. J Antimicrob Chemother, 2007; 60 (1):78-82.
• 37. Türk Dağı H, Arslan U, Tuncer İ. Kan kültürlerinden izole edilen Acinetobacter baumannii suşlarında antibiyotik direnci. ANKEM, 2011; 25 (1): 22-6.
• 38. Gözütok F, Mutlu Sarıgüzel F, Çelik İ, Berk E, Aydın B, Güzel D. Hastane infeksiyonu etkeni Acinetobacter baumannii suşlarının antimikrobiyal direnç oranlarının araştırılması. ANKEM, 2013; 27 (1): 7-12.