BibTex RIS Cite

Akut gastroenteritli hastalarda rotavirus ve enterik adenovirus sıklığının araştırılması

Year 2020, Volume: 77 Issue: 2, 185 - 194, 01.06.2020

Abstract

Amaç: Viral patojenler gelişmiş ve gelişmekte olan ülkelerde akut gastroenteritin en yaygın nedenidir. Bu çalışmada hastanemize başvuran akut gastroenteritli hastalarda rotavirus ve enterik adenovirus pozitifliğinin belirlenmesi ve etkenin yaş, cinsiyet ve mevsimlere göre dağılımının retrospektif olarak değerlendirilmesi amaçlanmıştır.Yöntem: Ocak 2012-Aralık 2017 tarihleri arasında hastanemize başvuran akut gastroenterit ön tanılı 2.885 hastanın dışkı örneği çalışmaya dahil edilmiştir. Dışkı örneklerinde rotavirus ve enterik adenovirus antijenleri kalitatif immünokromatografik ABON Biopharm Rota/Adeno, Çin yöntem ile çalışılmıştır.Bulgular: İncelenen 2885 hasta örneğinin 610 %21.1 ’unda rotavirus ve/veya adenovirus antijeni saptanmıştır. Rotavirus antijen pozitifliği %10.528.5 arasında, adenovirus antijen pozitifliği %6.1-29 arasında, rotavirus ve adenovirus antijeni birlikte pozitifliği %3.5-64.9 arasında tespit edilmiştir. Kadın hastaların %47.4’ünde, erkek hastaların %52.6’sında rotavirus ve/veya adenovirus antijeni saptanmış olup cinsiyetler arasında istatistiksel olarak anlamlı fark bulunmamıştır p=0.406 . Rotavirus ve adenovirus positivity and gender p=0.406 .Rotavirus and adenovirus positivity rates were found most commonly in the 1324 months age group p

References

  • 1. Wilhelmi I, Roman E, Sanchez-Fauquier A.Viruses causing gastroenteritis. Clin Microbiol Infect, 2003;9(4):247-62.
  • 2. King CK, Glass R, Bresee JS, Duggan C. Centers for Disease Control and Prevention. Managing acute gastroenteritis among children: oral rehydration, maintenance, and nutritional therapy. MMWR Recomm Rep, 2003;52(RR16): 1-16.
  • 3. GBD Diarrhoeal Diseases Collaborators. Estimates of global, regional, and national morbidity, mortality, and aetiologies of diarrhoeal diseases: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2015. Lancet Infect Dis, 2017;17(9):909-48.
  • 4. Chow CM, Leung AK, Hon KL. Acute gastroenteritis: from guidelines to real life. Clin Exp Gastroenterol, 2010;3:97-112.
  • 5. Bányai K, Estes MK, Martella V, Parashar UD. Viral gastroenteritis. Lancet, 2018;392(10142):175-186.
  • 6. Stuempfig ND, Seroy J. Gastroenteritis, Viral. In StatPearls [Internet]. StatPearls Publishing, 2018. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/ NBK518995/.
  • 7. Cal I W, Mohedano del Pozo RB, Sánchez-Fauquier A. Rotavirus and other viruses causing acute childhood gastroenteritis. Enferm Infec Microbiol Clin, 2008;(26)13:61-5.
  • 8. Walls T, Shankar AG, Shingadia D. Adenovirus: an increasingly important pathogen in paediatric bone marrow transplant patients. Lancet Infect Dis, 2003;3(2):79–86.
  • 9. Bisseux M, Colombet J ,Mirand A, et al. Monitoring human enteric viruses in wastewater and relevance to infections encountered in the clinical setting: a one-year experiment in central France, 2014 to 2015. Euro Surveill, 2018 ;23(7).
  • 10. Agbla JMM, Capo-Chichi A, Agbankpé, A, et al. Epidemiological survey of rotaviruses responsible for ınfantile diarrhea by the immunomolecular technique in Cotonou (Benin, West Africa). Int J Microbiol, 2018; 2018:3602967.
  • 11. Chansaenroj J, Tuanthap S, Thanusuwannasak T, et al. Human enteroviruses associated with and without diarrhea in Thailand between 2010 and 2016. PLoS One, 2017;12(7):e0182078.
  • 12. Tran A, Talmud D, Lejeune B, Jovenin N, et al. Prevalence of rotavirus, adenovirus, norovirus, and Astrovirus infections and coinfections among hospitalized children in Northern France. J Clin Microbiol, 2010;48(5):1943-6.
  • 13. Parashar UD, Gibson CJ, Bresee JS, Glass RI. Rotavirus and severe childhood diarrhea. Emerg Infect Dis, 2006;12(2):304-6.
  • 14. Centers for Disease Control and Prevention (CDC). “Rotavirus surveillance-worldwide, 2009.” MMWR, 2011;60(16): 514.
  • 15. World Health Organization (WHO). Global Rotavirus Information and Surveillance Bulletin. Geneva: WHO Press, 2012.
  • 16. Biçer S, Şahin GT, Koncay B, ve ark. Çocuk acil servisinde saptanan rotavirüs gastroenteriti olgularının sıklığı. Çocuk Enf Derg, 2008;3:96-9.
  • 17. Tekin A. Mardin’deki akut gastroenteritli çocuklarda rotavirüs ve enterik adenovirüs sıklığı. Klin Den Ar Derg, 2010;1:41-5.
  • 18. Balkan ÇE, Çelebi D, Çelebi Ö, Altoparlak Ü. Erzurum’da 0-5 yaş arası çocuklarda rotavirüs ve ade¬novirüs sıklığının araştırılması. Turk Mikrobiyol Cem Derg, 2012;42:51-4.
  • 19. Kizirgil A, Karakoç S. Çocukluk yaş grubu akut gastroenteritlerinde etyolojik ajanların belirlenmesi. Nobel Med, 2012; 8(3): 60-65.
  • 20. Topkaya AE, Aksungar B, Özakkaş F, Çapan N. Examination of rotavirus and enteric adenovirus in children with acute gastroenteritis. Türk Mikrobiyol Cem Derg, 2006;4:210-213.
  • 21. Otağ F, Direkel Ş,Özgür D, Delialioğlu N, Aslan G, Emekdaş G. Akut gastroenteritli çocuklarda rotavirüs ve enterik adenovirüs antijenlerinin hızlı immunokromatografik yöntemle araştırılması. Mersin Üniv Sağlık Bilim Derg, 2012;(5):3.
  • 22. Doğan Y, Ekşi F, Karslıgil T, Bayram A. Akut Gastroenteritli hastalarda rotavirüs ve adenovirüs varlığının araştırılması. Türk Mikrobiyol Cem Derg, 2014;44:18-22.
  • 23. Gülen D, Aydın M, Uzun A, Kaya AD. Tekirdağ Devlet Hastanesi’ne başvuran gastroenteritli çocuklarda rotavirus ve adenovirus antijen varlığının araştırılması. J Pediatr Inf, 2013;7:131-5.
  • 24. Türk Dağı H, Fındık D. Akut gastroenteritli hastalarda rotavirüs ve adenovirüs antijenlerinin araştırılması. J Clin Exp Invest, 2014;5(2):256-60.
  • 25. Özer B, Jenedi K, Pehlivanoğlu C, Göçmen M. Akut gastroenteritli hastaların dışkı örneklerinde rotavirüs ve adenovirüs sıklığı. Mustafa Kemal Üniv Tıp Derg, 2014;5:1-10.
  • 26. Karagün BŞ, Gürsu HA, Korkmaz Ö, Bozdağ İ, Hasbek M. Beş yaşın altında akut gastroenteritli çocuklarda rotavirüs ve enterik adenovirüs sıklığının araştırılması. Türk Mikrobiyol Cem Derg, 2014;44(2):70-4.
  • 27. Demiray T, Topcu M, Aydemir O, et al. Prevalence of rotavirus and adenovirus in children with acute gastroenteritis. J Immunol Clin Microbiol, 2016;1(2).
  • 28. Çaycı YT, Yılmaz G, Birinci A. Akut gastroenterit vakalarında rotavirüs ve adenovirüs sıklığının araştırılması. Pam Tıp Derg, 2017;(1):61-5.
  • 29. Özdemir S, Delialioğlu N, Emekdaş G. Akut Gastroenteritli çocuklarda rotavirus, adenovirus ve astrovirus sıklığının araştırılması ve epidemiyolojik özelliklerinin değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul. 2010;44:571-8.
  • 30. de Hoog MLA,Vesikari T, Giaquinto C, et al.Report of the 5th European expert meeting on rotavirus vaccination (EEROVAC). Hum Vaccin Immunother, 2018;14(4):1027-34.
  • 31. Roman E, Wilhelmi I, Colomina J, et al. Acute viral gastroenteritis: proportion and clinical relevance of multiple infections in Spanish children. J Med Microbiol, 2003;52(Pt 5):435-40.
  • 32. Motamedifar M, Amini E, Shirazi PT. Frequency of rotavirus and adenovirus gastroenteritis among children in Shiraz, Iran. Iran Red Crescent Med J, 2013;15(8):729-33.
  • 33. Carraturo A, Catalani V,Tega L. Microbiological and epidemiological aspects of rotavirus and enteric adenovirus infections in hospitalized children in Italy. New Microbiol, 2008;31(3):329-36.
  • 34. Parashar UD, Gibson CJ, Bresee JS, Glass RI. Rotavirus and severe childhood diarrhea. Emerg Infect Dis, 2006;12(2):304-6.
  • 35. Raini SK, Nyangao J, Kombich J, et al. Humanrotavirus group a serotypes causing gastroenteritis in children less than 5 years and hiv-infected adults in viwandani slum, Nairobi. Ethiop J Health Sci, 2015;25:1.
  • 36. Boni-cisse C, Meite S, Mlan AB, et al. Genotypic characterization of rotavirus in children under 5 years circulating in Côte D’Ivoire from 2010 to 2013. Virol J, 2018;15:78.
  • 37. Inouye S, Yamashita K, Yamadera S, Yoshikawa M, Kato N, Okabe N. Surveillance of viral gastroenteritis in Japan: Pediatric cases and outbreaks incidents. J Infect Dis, 2000;181:270-4.
  • 38. World Health Organization. Diarrhea: Why Children Are Still Dying and What Can Be Done. Geneva, Switzerland: World Health Organization. 2009.
  • 39. Bernstein DI. Rotavirus overview. Pediatr Infect Dis J, 2009;28(3):50-3.
  • 40. Khoury H, Ogilvie I, El Khoury AC, Duan Y, Goetghebeur MM. Burden of rotavirus gastroenteritis in the Middle Eastern and North African pediatric population. BMC Infect Dis, 2011;(7)11:9.

The Investigation of Rotavirus and Adenovirus Frequency Among Patients with Acute Gastroenteritis

Year 2020, Volume: 77 Issue: 2, 185 - 194, 01.06.2020

Abstract

Objective: Viral pathogens are the most common cause of acute gastroenteritis in developed and developing countries. The objective of this study was to determine the prevalence of rotavirus and enteric adenovirus, and to investigate age, sex, and seasonal-related distribution in patients with acute gastroenteritis, retrospectively.Methods: A total of 2885 stool specimens obtained from patients with acute gastroenteritis, admitted to our hospital between January 2012 and December 2017 were included in the study. The presence of rotavirus and enteric adenovirus antigen in the stool samples were investigated by qualitative immunochromatographic method ABON Biopharm Rota/Adeno, China .Results: In this study, rotavirus and/or adenovirus antigens were detected in 610 21.1% out of 2885 patient specimens. Rotavirus antigen positivity was found between 10.5-28.5%, adenovirus antigen positivity was 6.1-29%, and both rotavirus and adenovirus antigen positivity was detected between 3.5-64.9%. Viral antigens positivity was detected as 47.4% in female patients and 52.6% in male patients.There was no statistically significant difference between viral antigen çocuklarda önemli bir morbidite ve mortalite Akut gastroenteritler dünya genelinde özellikle

References

  • 1. Wilhelmi I, Roman E, Sanchez-Fauquier A.Viruses causing gastroenteritis. Clin Microbiol Infect, 2003;9(4):247-62.
  • 2. King CK, Glass R, Bresee JS, Duggan C. Centers for Disease Control and Prevention. Managing acute gastroenteritis among children: oral rehydration, maintenance, and nutritional therapy. MMWR Recomm Rep, 2003;52(RR16): 1-16.
  • 3. GBD Diarrhoeal Diseases Collaborators. Estimates of global, regional, and national morbidity, mortality, and aetiologies of diarrhoeal diseases: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2015. Lancet Infect Dis, 2017;17(9):909-48.
  • 4. Chow CM, Leung AK, Hon KL. Acute gastroenteritis: from guidelines to real life. Clin Exp Gastroenterol, 2010;3:97-112.
  • 5. Bányai K, Estes MK, Martella V, Parashar UD. Viral gastroenteritis. Lancet, 2018;392(10142):175-186.
  • 6. Stuempfig ND, Seroy J. Gastroenteritis, Viral. In StatPearls [Internet]. StatPearls Publishing, 2018. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/ NBK518995/.
  • 7. Cal I W, Mohedano del Pozo RB, Sánchez-Fauquier A. Rotavirus and other viruses causing acute childhood gastroenteritis. Enferm Infec Microbiol Clin, 2008;(26)13:61-5.
  • 8. Walls T, Shankar AG, Shingadia D. Adenovirus: an increasingly important pathogen in paediatric bone marrow transplant patients. Lancet Infect Dis, 2003;3(2):79–86.
  • 9. Bisseux M, Colombet J ,Mirand A, et al. Monitoring human enteric viruses in wastewater and relevance to infections encountered in the clinical setting: a one-year experiment in central France, 2014 to 2015. Euro Surveill, 2018 ;23(7).
  • 10. Agbla JMM, Capo-Chichi A, Agbankpé, A, et al. Epidemiological survey of rotaviruses responsible for ınfantile diarrhea by the immunomolecular technique in Cotonou (Benin, West Africa). Int J Microbiol, 2018; 2018:3602967.
  • 11. Chansaenroj J, Tuanthap S, Thanusuwannasak T, et al. Human enteroviruses associated with and without diarrhea in Thailand between 2010 and 2016. PLoS One, 2017;12(7):e0182078.
  • 12. Tran A, Talmud D, Lejeune B, Jovenin N, et al. Prevalence of rotavirus, adenovirus, norovirus, and Astrovirus infections and coinfections among hospitalized children in Northern France. J Clin Microbiol, 2010;48(5):1943-6.
  • 13. Parashar UD, Gibson CJ, Bresee JS, Glass RI. Rotavirus and severe childhood diarrhea. Emerg Infect Dis, 2006;12(2):304-6.
  • 14. Centers for Disease Control and Prevention (CDC). “Rotavirus surveillance-worldwide, 2009.” MMWR, 2011;60(16): 514.
  • 15. World Health Organization (WHO). Global Rotavirus Information and Surveillance Bulletin. Geneva: WHO Press, 2012.
  • 16. Biçer S, Şahin GT, Koncay B, ve ark. Çocuk acil servisinde saptanan rotavirüs gastroenteriti olgularının sıklığı. Çocuk Enf Derg, 2008;3:96-9.
  • 17. Tekin A. Mardin’deki akut gastroenteritli çocuklarda rotavirüs ve enterik adenovirüs sıklığı. Klin Den Ar Derg, 2010;1:41-5.
  • 18. Balkan ÇE, Çelebi D, Çelebi Ö, Altoparlak Ü. Erzurum’da 0-5 yaş arası çocuklarda rotavirüs ve ade¬novirüs sıklığının araştırılması. Turk Mikrobiyol Cem Derg, 2012;42:51-4.
  • 19. Kizirgil A, Karakoç S. Çocukluk yaş grubu akut gastroenteritlerinde etyolojik ajanların belirlenmesi. Nobel Med, 2012; 8(3): 60-65.
  • 20. Topkaya AE, Aksungar B, Özakkaş F, Çapan N. Examination of rotavirus and enteric adenovirus in children with acute gastroenteritis. Türk Mikrobiyol Cem Derg, 2006;4:210-213.
  • 21. Otağ F, Direkel Ş,Özgür D, Delialioğlu N, Aslan G, Emekdaş G. Akut gastroenteritli çocuklarda rotavirüs ve enterik adenovirüs antijenlerinin hızlı immunokromatografik yöntemle araştırılması. Mersin Üniv Sağlık Bilim Derg, 2012;(5):3.
  • 22. Doğan Y, Ekşi F, Karslıgil T, Bayram A. Akut Gastroenteritli hastalarda rotavirüs ve adenovirüs varlığının araştırılması. Türk Mikrobiyol Cem Derg, 2014;44:18-22.
  • 23. Gülen D, Aydın M, Uzun A, Kaya AD. Tekirdağ Devlet Hastanesi’ne başvuran gastroenteritli çocuklarda rotavirus ve adenovirus antijen varlığının araştırılması. J Pediatr Inf, 2013;7:131-5.
  • 24. Türk Dağı H, Fındık D. Akut gastroenteritli hastalarda rotavirüs ve adenovirüs antijenlerinin araştırılması. J Clin Exp Invest, 2014;5(2):256-60.
  • 25. Özer B, Jenedi K, Pehlivanoğlu C, Göçmen M. Akut gastroenteritli hastaların dışkı örneklerinde rotavirüs ve adenovirüs sıklığı. Mustafa Kemal Üniv Tıp Derg, 2014;5:1-10.
  • 26. Karagün BŞ, Gürsu HA, Korkmaz Ö, Bozdağ İ, Hasbek M. Beş yaşın altında akut gastroenteritli çocuklarda rotavirüs ve enterik adenovirüs sıklığının araştırılması. Türk Mikrobiyol Cem Derg, 2014;44(2):70-4.
  • 27. Demiray T, Topcu M, Aydemir O, et al. Prevalence of rotavirus and adenovirus in children with acute gastroenteritis. J Immunol Clin Microbiol, 2016;1(2).
  • 28. Çaycı YT, Yılmaz G, Birinci A. Akut gastroenterit vakalarında rotavirüs ve adenovirüs sıklığının araştırılması. Pam Tıp Derg, 2017;(1):61-5.
  • 29. Özdemir S, Delialioğlu N, Emekdaş G. Akut Gastroenteritli çocuklarda rotavirus, adenovirus ve astrovirus sıklığının araştırılması ve epidemiyolojik özelliklerinin değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul. 2010;44:571-8.
  • 30. de Hoog MLA,Vesikari T, Giaquinto C, et al.Report of the 5th European expert meeting on rotavirus vaccination (EEROVAC). Hum Vaccin Immunother, 2018;14(4):1027-34.
  • 31. Roman E, Wilhelmi I, Colomina J, et al. Acute viral gastroenteritis: proportion and clinical relevance of multiple infections in Spanish children. J Med Microbiol, 2003;52(Pt 5):435-40.
  • 32. Motamedifar M, Amini E, Shirazi PT. Frequency of rotavirus and adenovirus gastroenteritis among children in Shiraz, Iran. Iran Red Crescent Med J, 2013;15(8):729-33.
  • 33. Carraturo A, Catalani V,Tega L. Microbiological and epidemiological aspects of rotavirus and enteric adenovirus infections in hospitalized children in Italy. New Microbiol, 2008;31(3):329-36.
  • 34. Parashar UD, Gibson CJ, Bresee JS, Glass RI. Rotavirus and severe childhood diarrhea. Emerg Infect Dis, 2006;12(2):304-6.
  • 35. Raini SK, Nyangao J, Kombich J, et al. Humanrotavirus group a serotypes causing gastroenteritis in children less than 5 years and hiv-infected adults in viwandani slum, Nairobi. Ethiop J Health Sci, 2015;25:1.
  • 36. Boni-cisse C, Meite S, Mlan AB, et al. Genotypic characterization of rotavirus in children under 5 years circulating in Côte D’Ivoire from 2010 to 2013. Virol J, 2018;15:78.
  • 37. Inouye S, Yamashita K, Yamadera S, Yoshikawa M, Kato N, Okabe N. Surveillance of viral gastroenteritis in Japan: Pediatric cases and outbreaks incidents. J Infect Dis, 2000;181:270-4.
  • 38. World Health Organization. Diarrhea: Why Children Are Still Dying and What Can Be Done. Geneva, Switzerland: World Health Organization. 2009.
  • 39. Bernstein DI. Rotavirus overview. Pediatr Infect Dis J, 2009;28(3):50-3.
  • 40. Khoury H, Ogilvie I, El Khoury AC, Duan Y, Goetghebeur MM. Burden of rotavirus gastroenteritis in the Middle Eastern and North African pediatric population. BMC Infect Dis, 2011;(7)11:9.
There are 40 citations in total.

Details

Primary Language Turkish
Journal Section Research Article
Authors

Harun Gülbudak This is me

Nurbanu Kurnaz This is me

Seda Tezcan Ülger This is me

Elif Vural Taşdemir This is me

Gulcin Bozlu This is me

Merve Türkegün This is me

Nuran Delialioğlu This is me

Publication Date June 1, 2020
Published in Issue Year 2020 Volume: 77 Issue: 2

Cite

APA Gülbudak, H., Kurnaz, N., Ülger, S. T., Vural Taşdemir, E., et al. (2020). Akut gastroenteritli hastalarda rotavirus ve enterik adenovirus sıklığının araştırılması. Türk Hijyen Ve Deneysel Biyoloji Dergisi, 77(2), 185-194.
AMA Gülbudak H, Kurnaz N, Ülger ST, Vural Taşdemir E, Bozlu G, Türkegün M, Delialioğlu N. Akut gastroenteritli hastalarda rotavirus ve enterik adenovirus sıklığının araştırılması. Turk Hij Den Biyol Derg. June 2020;77(2):185-194.
Chicago Gülbudak, Harun, Nurbanu Kurnaz, Seda Tezcan Ülger, Elif Vural Taşdemir, Gulcin Bozlu, Merve Türkegün, and Nuran Delialioğlu. “Akut Gastroenteritli Hastalarda Rotavirus Ve Enterik Adenovirus sıklığının araştırılması”. Türk Hijyen Ve Deneysel Biyoloji Dergisi 77, no. 2 (June 2020): 185-94.
EndNote Gülbudak H, Kurnaz N, Ülger ST, Vural Taşdemir E, Bozlu G, Türkegün M, Delialioğlu N (June 1, 2020) Akut gastroenteritli hastalarda rotavirus ve enterik adenovirus sıklığının araştırılması. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi 77 2 185–194.
IEEE H. Gülbudak, “Akut gastroenteritli hastalarda rotavirus ve enterik adenovirus sıklığının araştırılması”, Turk Hij Den Biyol Derg, vol. 77, no. 2, pp. 185–194, 2020.
ISNAD Gülbudak, Harun et al. “Akut Gastroenteritli Hastalarda Rotavirus Ve Enterik Adenovirus sıklığının araştırılması”. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi 77/2 (June 2020), 185-194.
JAMA Gülbudak H, Kurnaz N, Ülger ST, Vural Taşdemir E, Bozlu G, Türkegün M, Delialioğlu N. Akut gastroenteritli hastalarda rotavirus ve enterik adenovirus sıklığının araştırılması. Turk Hij Den Biyol Derg. 2020;77:185–194.
MLA Gülbudak, Harun et al. “Akut Gastroenteritli Hastalarda Rotavirus Ve Enterik Adenovirus sıklığının araştırılması”. Türk Hijyen Ve Deneysel Biyoloji Dergisi, vol. 77, no. 2, 2020, pp. 185-94.
Vancouver Gülbudak H, Kurnaz N, Ülger ST, Vural Taşdemir E, Bozlu G, Türkegün M, Delialioğlu N. Akut gastroenteritli hastalarda rotavirus ve enterik adenovirus sıklığının araştırılması. Turk Hij Den Biyol Derg. 2020;77(2):185-94.