Evaluation Of Antibiotic Susceptibility Of Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae and Moraxella catarrhalis Isolated From Lower Respiratory Tract Specimens

Abstract

Aim: In this study, it was aimed to determine antibiotic susceptibility rates of  Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis and Streptococcus pneumoniae strains isolated from lower respiratory tract samples of hospitalized patients and to guide empirical antibiotic treatment of respiratory tract infections.

Material and Methods: The lower respiratory tract samples sent from various clinics to the Ondokuz Mayıs University Medical Faculty Hospital Medical Microbiology Laboratory in 2015-2017 were retrospectively examined.  Identification of isolates Vitek MS (Biomerieux, France) device; antibiotic susceptibilities were determined by the Vitek 2 Compact (Biomerieux, France) instrument and disk diffusion method in Mueller-Hinton Fastidious (Biomerieux, France) agar. The sensitivity ratios obtained were evaluated according to EUCAST (European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing) criteria

Results: A total of  2427 strains isolated from lower respiratory tract specimens were examined retrospectively. 67% penicillin, 58% erythromycin resistance against Streptococcus pneumoniae isolates; 9% erythromycin, 9% cefotaxime, 3% ceftriaxone resistance to Moraxella catarrhalis; Haemophilus influenzae had 92% erythromycin and 33% cefotaxime resistance.

Conclusion: Resistance is increasing day by day against antibiotics used in routine against these three bacterial pathogens most commonly isolated in lower respiratory tract. Antibiotic susceptibility tests should be performed after the agent has been identified in order to direct treatment.

Keywords

• Haemophilus influenzae,Moraxella catarrhalis,Streptococcus pneumoniae,antibiotic resistance,lower respiratory tract infection

Alt solunum yolu örneklerinden izole edilen Streptococcus Pneumoniae, Haemophilus İnfluenzae ve Moraxella Catarrhalis suşlarının antibiyotik duyarlılığının değerlendirilmesi

Abstract

Amaç: Bu çalışmada hastanemizin ayaktan ve yatarak takip edilen hastaların alt solunum yolu örneklerinden izole edilen ve solunum yolu enfeksiyonlarının en önemli enfeksiyon etkenleri olan Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis ve Streptococcus pneumoniae suşlarının antibiyotik duyarlılık oranlarının belirlenmesi ve ampirik antibiyotik tedavisine yol göstermesi amaçlanmıştır.

Gereç ve Yöntemler: Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Tıbbi Mikrobiyooji Laboratuvarı’na 2015-2017 yıllarında çeşitli kliniklerden gönderilen alt solunum yolu örnekleri retrospektif olarak incelenmiştir. İzolatların tanımlanması Vitek MS (Biomerieux, Fransa) cihazı; antibiyotik duyarlılıkları Vitek 2 Compact  (Biomerieux, Fransa)  cihazı ve Mueller-Hinton Fastidious (Biomerieux, Fransa) agarda disk difüzyon yöntemi ile belirlenmiştir. Elde edilen duyarlılık oranları EUCAST (European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing) kriterlerine göre değerlendirilmiştir

Bulgular:  Alt solunum yolları örneklerinden izole edilen 2427 adet suş retrospektif olarak incelendi. Streptococcus pneumoniae izolatlarına karşı %67 penisilin, %58 eritromisin direnci; Moraxella catarrhalis’e %9 eritromisin, %9 sefotaksim, %3 seftriakson direnci; Haemophilus influenzae’e %92 eritromisin %33 sefotaksim direnci saptanmıştır.

Sonuç: Alt solunum yolunun en sık izole edilen bu üç bakteriyel patojene karşı rutinde kullanılan antibiyotiklere karşı her geçen gün direnç artmaktadır. Etken belirlendikten sonra antibiyotik duyarlılık testlerinin yapılması tedavinin yönlendirilmesi açısından önemlidir.

Keywords

• Haemophilus influenzae,Moraxella catarrhalis,Streptococcus pneumoniae,antibiyotik,direnç,alt solunum yolu

References

1. 1. Şenol G, Eriş F. Akciğer Enfeksiyonlarında Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis ve Streptococcus pneumoniae suşlarının izolasyon oranları ve antibiyotiklere Direnci. Toraks Dergisi 2000; 1: 46-49.
2. 2. Golden AR, Rosenthal M, Fultz B, Nichol KA, Adam HJ, Gilmour MW et al. Characterization of MDR and XDR Streptococcus pneumoniae in Canada, 2007-13. J Antimicrob Chemother 2015; 70: 2199-202.
3. 3. Ip M, Ang I, Liyanapathirana V, Ma H, Lai R. Genetic analyses of penicillin binding protein determinants in multidrug-resistant streptococcus pneumoniae serogroup 19 CC320/ 271 clone with high-level resistance to third-generation cephalosporins. Antimicrob Agents Chemother 2015; 59: 4040-45.
4. 4. Murray P, Rosenthal K, Pfaller M: Tıbbi Mikrobiyoloji kitabı, Ankara 2014.
5. 5. Hoban DJ, Doern GV, Fluit AC, Roussel-Delvallez M, Jones RN. Worldwide prevalence of antimicro¬bial resistance in Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, and Moraxella catarrha¬lis in the SENTRY antimicrobial surveillance prog¬ram 1997-1999. Clin Infect Dis 2001; 32: 81-83.
6. 6. Fluit AC, Florijn A, Verhoef J, Milatovic D. Susceptibility of European beta-lactamase-positive and negative Haemophilus influenzae isolates from the periods 1997/1998 and 2002/2003. J Antimicrob Chemother 2005; 56: 133-38.
7. 7. García-Cobos S, Moscoso M, Pumarola F, Arroyo M, Lara N, Pérez-Vázquez M et al. Frequent carriage of resistance mechanisms to β-lactams and biofilm formation in Haemophilus influenzae causing treatment failure and recurrent otitis media in young children. J Antimicrob Chemother 2014; 69: 2394-9.
8. 8.Ustaçelebi Ş Temel ve Klinik Mikrobiyoloji kitabı, Güneş Kitapevi, 1999.

9. 9. European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST)Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 5.0, http://www.eucast.org (2015)
10. 10.European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST). Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 6.0, http://www.eucast.org/fileadmin/src/media/PDFs/EUCAST_files/Breakpoint_tables/v_6.0_Breakpoint_table.pdf (2016)
11. 11. European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST). Breakpoints tables for interpretation of MICs and zone diameters, Version 7.1. http://www.eucast.org (2017) 12. Beekmann S, Heilmanna K, Richtera S, Garcia-de-Lomasb J, Doerna G. Antimicrobial resistance in Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis and group A -haemolytic streptococci in 2002–2003. International Journal of Antimicrobial Agents 2005; 25: 148–56.
12. 13. Zhang Y, Zhang F,Wang H et al. Antimicrobial susceptibility of Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae and Moraxella catarrhalis isolated from community-acquired respiratory tract infections in China: Results from the CARTIPS Antimicrobial Surveillance Program. J Glob Antimicrob Resist 2016; 5: 36-41.
13. 14. Cattoir V, Dowzicky MJ. A longitudinal assessment of antimicrobial susceptibility among important pathogens collected as part of the Tigecycline Evaluation and Surveillance Trial (T.E.S.T.) in France between 2004 and 2012. Antimicrob Resist Infect Control 2014; 3: 36.
14. 15. Maraki S, Papadakis IS. Antimicrobial resistance trends among community-acquired respiratory tract pathogens in Greece, 2009-2012. Scientific World Journal 2014; 27: 941564.
15. 16.Mamishi S, Moradkhani S, Mahmoudi S, Hosseinpour-Sadeghi R, Pourakbari B. Penicillin-Resistant trend of Streptococcus pneumoniae in Asia: a systematic review. Iran J Microbiol 2014; 6: 198-210.
16. 17. Alışkan H, Çolakoğlu Ş, Göçmen J. Solunum yolu örneklerinden izole edilen streptococcus pneumoniae ve haemophilus influenzae suşlarının antibiyotiklere dirençlerinin belirlenmesi. Cukurova Med J 2016; 41: 201-7.
17. 18. Beşli Y, Karatuna O, Akyar I. 2012-2014 Yıllarında Alt Solunum Yolu Örneklerinden İzole Edilen Streptococcus pneumoniae ve Haemophilus influenzae suşlarında antibiyotiklere Duyarlılığın Yıllara ve Yaş Gruplarına Göre Değerlendirilmesi. ANKEM Derg 2015; 29: 114-21.
18. 19. Camara M, Dieng A, Diop A et al. Antibiotic resistance of bacteria responsible of acute respiratory tract infections in children. Microbiologia Medica 2017; 32: 6489 .
19. 20. Gur D, Ozalp M, Sümerkan B et al. Prevalence of antimicrobial resistance in Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, Moraxella catarrhalis and Streptococcus pyogenes: results of a multicentre study in Turkey. Int J Antimicrob Agents 2002; 19: 207-11.
20. 21. Ilki A, Sağiroğlu P, Elgörmüş N, Söyletir G. Streptococcus pneumoniae ve Haemophilus influenzae izolatlarının antibiyotik duyarlılık paternlerindeki değişim: dört yıllık izlem. Mikrobiyol Bul 2010; 44: 169-75.
21. 22.Şener B, Gür D, Sümerkant B et al. Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, Moraxella catarrhalis and Streptococcus pyogenes’in çeşitli antibiyotiklere karşı in-vitro duyarlılıkları. Mikrobiyoloji Bült 1996; 30: 129-37.